223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_2696 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_2696  type II secretion system protein  100 
 
 
301 aa  586  1e-166  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0581937  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0249  type II secretion system protein  53.82 
 
 
313 aa  282  4.0000000000000003e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.876214 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2114  type II secretion system protein  47.93 
 
 
288 aa  236  4e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4348  type II secretion system protein  47.43 
 
 
292 aa  217  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2923  putative type II secretion system protein F  43.06 
 
 
293 aa  216  5e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6878  type II secretion system protein  42.36 
 
 
293 aa  210  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.465681  normal  0.240753 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0642  type II secretion system protein  44.91 
 
 
287 aa  210  2e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0746  type II secretion system protein  40.78 
 
 
287 aa  198  7e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.271129  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0710  putative type II secretion system protein F  40.56 
 
 
287 aa  193  3e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2307  Type II secretion system F domain protein  39.14 
 
 
298 aa  180  2e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3212  type II secretion system protein  38.67 
 
 
311 aa  139  7e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.514288 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1276  type II secretion system protein  36 
 
 
311 aa  137  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2314  type II secretion system protein  32.61 
 
 
317 aa  125  8.000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2365  hypothetical protein  38.92 
 
 
324 aa  125  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.195084  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1680  type II secretion system protein  35.2 
 
 
311 aa  124  3e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000554602 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2736  type II secretion system protein  39.2 
 
 
326 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2118  type II secretion system protein  35.37 
 
 
310 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.128736  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1107  type II secretion system protein  39.52 
 
 
323 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.107682  normal  0.160043 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1831  type II secretion system protein  36.55 
 
 
304 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1850  type II secretion system protein  34.52 
 
 
307 aa  119  7.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0102974  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1159  Type II secretion system F domain protein  39.39 
 
 
320 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3118  type II secretion system protein  38.06 
 
 
304 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.803425  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1017  von Willebrand factor type A; type II secretion system protein  39.61 
 
 
643 aa  109  6e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4615  type II secretion system protein  38.5 
 
 
301 aa  108  9.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2698  type II secretion system protein  37.29 
 
 
302 aa  108  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2911  type II secretion system protein  37.05 
 
 
306 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.604096  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2823  type II secretion system protein  42.31 
 
 
306 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2641  type II secretion system protein  37.82 
 
 
291 aa  107  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3964  type II secretion system protein  42.51 
 
 
314 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.273183 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1043  Type II secretion system F domain protein  42.06 
 
 
305 aa  106  4e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.809436  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4446  type II secretion system protein  39.31 
 
 
293 aa  106  4e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0044747 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2557  type II secretion system protein  38.1 
 
 
314 aa  103  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.59617  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1530  type II secretion system protein  38.16 
 
 
301 aa  103  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1053  type II secretion system protein  32.31 
 
 
302 aa  102  5e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4157  type II secretion system protein  36.65 
 
 
309 aa  103  5e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3420  Type II secretion system F domain protein  40 
 
 
295 aa  102  7e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.490118  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3350  type II secretion system protein  37.1 
 
 
309 aa  101  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3208  type II secretion system protein  36.42 
 
 
302 aa  102  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.544767 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2650  type II secretion system protein  36.25 
 
 
294 aa  100  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2935  type II secretion system protein  36.55 
 
 
294 aa  99.8  5e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0849088  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1500  type II secretion system protein  34.88 
 
 
319 aa  99  8e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.34697  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2352  type II secretion system protein  40.56 
 
 
313 aa  97.4  3e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0836815  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1318  type II secretion system protein  38.36 
 
 
319 aa  95.5  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4619  type II secretion system protein  38.31 
 
 
318 aa  95.1  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.340215 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2276  hypothetical protein  38.36 
 
 
296 aa  95.1  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0801  type II secretion system protein  38.46 
 
 
312 aa  95.5  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3093  type II secretion system protein  38.36 
 
 
319 aa  95.1  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2968  type II secretion system protein  38.36 
 
 
319 aa  95.5  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1754  Flp pilus assembly protein TadC  34.38 
 
 
326 aa  94.4  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0639  type II secretion system protein  36.88 
 
 
323 aa  94.4  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2649  type II secretion system protein  35.37 
 
 
323 aa  92.4  9e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1916  type II secretion system protein  36.53 
 
 
312 aa  92  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.141806  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0653  TadC protein  32.35 
 
 
313 aa  91.7  1e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.179736 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0793  TadC protein  36.18 
 
 
315 aa  92  1e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0543  type II secretion system protein  37.25 
 
 
313 aa  92  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0603407  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2763  type II secretion system protein  31.47 
 
 
326 aa  91.3  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.613586 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1204  type II secretion system protein  33.73 
 
 
296 aa  91.3  2e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.59428  hitchhiker  0.000000109908 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2927  type II secretion system protein  36.84 
 
 
292 aa  90.9  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0944491  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3011  type II secretion system protein  34.38 
 
 
319 aa  91.3  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0992  type II secretion system protein  29.67 
 
 
326 aa  89.4  7e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.236675  normal  0.765371 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0650  putative tight adherence TadC-related transmembrane protein  35.88 
 
 
315 aa  88.2  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.640477  normal  0.167986 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0806  type II secretion system protein  34.48 
 
 
316 aa  87  3e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1124  type II secretion system protein  27.62 
 
 
331 aa  86.7  4e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0315206  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0552  type II secretion system protein  31.21 
 
 
326 aa  86.3  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0300  type II secretion system protein  31.21 
 
 
323 aa  86.3  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2364  putative putative tight adherence TadC-like transmembrane protein  36.36 
 
 
321 aa  86.3  6e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00226483  normal  0.0303282 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1903  putative Flp pilus assembly protein TadC  31.21 
 
 
326 aa  85.9  8e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4188  type II secretion system protein  31.93 
 
 
328 aa  85.5  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6364  type II secretion system protein  35.94 
 
 
324 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2486  type II secretion system protein  30.26 
 
 
294 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.766494  hitchhiker  0.000200331 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5490  type II secretion system protein  35.94 
 
 
324 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6776  type II secretion system protein  35.94 
 
 
324 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.710361  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7193  putative Flp pilus assembly protein TadC  32.53 
 
 
324 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.202721  normal  0.456008 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3795  type II secretion system protein  31.95 
 
 
321 aa  83.6  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5326  type II secretion system protein  38.99 
 
 
323 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0355396 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1524  type II secretion system protein  34.88 
 
 
322 aa  83.2  0.000000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2571  type II secretion system protein  30 
 
 
303 aa  82.8  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2021  type II secretion system protein  35.33 
 
 
320 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.477325  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2694  type II secretion system protein  30.17 
 
 
320 aa  81.6  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0238  type II secretion system protein  32.34 
 
 
322 aa  81.3  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0424  type II secretion system protein  28.93 
 
 
331 aa  80.1  0.00000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.628499  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002651  type II/IV secretion system protein TadC associated with Flp pilus assembly  34.42 
 
 
313 aa  79.7  0.00000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2016  type II secretion system protein  31.55 
 
 
307 aa  79.7  0.00000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6004  type II secretion system protein  37.2 
 
 
324 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0602  type II secretion system protein  26.23 
 
 
323 aa  78.2  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0897257  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5824  type II secretion system protein  34.44 
 
 
338 aa  78.2  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.993294  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2351  type II secretion system protein  30.36 
 
 
323 aa  78.2  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.357093 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6300  type II secretion system protein  37.2 
 
 
323 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.923016 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4864  type II secretion system protein  34.94 
 
 
330 aa  77.4  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1125  type II secretion system protein  34.64 
 
 
347 aa  77.4  0.0000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.394553  normal  0.522315 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1517  hypothetical protein  29.38 
 
 
320 aa  77  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.205257  normal  0.198842 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1399  type II secretion system protein  29.81 
 
 
299 aa  76.6  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0535811  hitchhiker  0.000124146 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0586  type II secretion system protein  34.64 
 
 
320 aa  76.3  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.180812  normal  0.546922 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5120  type II secretion system protein  27.75 
 
 
321 aa  75.5  0.0000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.229641  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1075  type II secretion system protein  33.99 
 
 
335 aa  74.7  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.137371  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0900  Type II secretion system F domain protein  28.72 
 
 
319 aa  73.9  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1754  type II secretion system protein  26.14 
 
 
295 aa  73.9  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00143607  normal  0.105402 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0672  type II secretion system protein  28.5 
 
 
319 aa  73.2  0.000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.139102  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3718  type II secretion system protein  28.93 
 
 
324 aa  73.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.202594  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2406  type II secretion system protein  28.33 
 
 
312 aa  73.2  0.000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0371172 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>