145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0858 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0858  type II secretion system protein  100 
 
 		 311 aa  612  9.999999999999999e-175  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1031  type II secretion system protein  48.93 
 
 		 312 aa  243  1.9999999999999999e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2406  type II secretion system protein  41.47 
 
 		 312 aa  223  2e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0371172 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1737  type II secretion system protein  40.78 
 
 		 311 aa  204  1e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1649  type II secretion system protein  42.14 
 
 		 311 aa  202  5e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.2409  hitchhiker  0.00110779 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1237  Type II secretion system F domain protein  46.57 
 
 		 309 aa  201  9.999999999999999e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2671  type II secretion system protein  39.01 
 
 		 313 aa  197  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20400  Flp pilus assembly protein TadB  41.12 
 
 		 314 aa  193  3e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2789  type II secretion system protein  45.74 
 
 		 315 aa  192  8e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00278324 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0781  type II secretion system protein  38.14 
 
 		 316 aa  189  4e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5824  type II secretion system protein  37.74 
 
 		 338 aa  187  1e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.993294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1254  type II secretion system protein  40.45 
 
 		 312 aa  186  3e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.23353  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07520  Flp pilus assembly protein TadC  41.37 
 
 		 313 aa  179  5.999999999999999e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1211  Type II secretion system F domain protein  38.21 
 
 		 313 aa  171  2e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10340  Flp pilus assembly protein TadB  39.07 
 
 		 309 aa  150  3e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00075176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3787  type II secretion system protein  49.65 
 
 		 295 aa  132  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0665963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2114  type II secretion system protein  27.47 
 
 		 288 aa  80.9  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1850  type II secretion system protein  35.92 
 
 		 307 aa  75.5  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0102974  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3212  type II secretion system protein  27.23 
 
 		 311 aa  70.9  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.514288 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4157  type II secretion system protein  27.82 
 
 		 309 aa  70.5  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2118  type II secretion system protein  27.52 
 
 		 310 aa  69.7  0.00000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.128736  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3350  type II secretion system protein  27.15 
 
 		 309 aa  69.3  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1276  type II secretion system protein  24.27 
 
 		 311 aa  67.4  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2696  type II secretion system protein  27.7 
 
 		 301 aa  67  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0581937  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1107  type II secretion system protein  29.9 
 
 		 323 aa  67  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.107682  normal  0.160043 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2486  type II secretion system protein  25.32 
 
 		 294 aa  65.9  0.0000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.766494  hitchhiker  0.000200331 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2641  type II secretion system protein  27.7 
 
 		 291 aa  65.1  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2736  type II secretion system protein  29.07 
 
 		 326 aa  64.7  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2698  type II secretion system protein  27.11 
 
 		 302 aa  63.9  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3118  type II secretion system protein  30.87 
 
 		 304 aa  64.3  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.803425  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2923  putative type II secretion system protein F  28.24 
 
 		 293 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2307  Type II secretion system F domain protein  22.58 
 
 		 298 aa  63.2  0.000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1517  hypothetical protein  28.93 
 
 		 320 aa  63.5  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.205257  normal  0.198842 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2694  type II secretion system protein  31.39 
 
 		 320 aa  61.6  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1017  von Willebrand factor type A; type II secretion system protein  26.35 
 
 		 643 aa  60.8  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2314  type II secretion system protein  21.28 
 
 		 317 aa  60.1  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1159  Type II secretion system F domain protein  25.16 
 
 		 320 aa  60.1  0.00000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2365  hypothetical protein  27.08 
 
 		 324 aa  59.7  0.00000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.195084  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1337  type II secretion system protein  25 
 
 		 289 aa  59.7  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0710  putative type II secretion system protein F  25.88 
 
 		 287 aa  58.5  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0249  type II secretion system protein  26.28 
 
 		 313 aa  58.5  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.876214 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2021  type II secretion system protein  28.08 
 
 		 320 aa  58.9  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.477325  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4446  type II secretion system protein  26.11 
 
 		 293 aa  58.9  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0044747 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0767  Type II secretion system F domain protein  28.76 
 
 		 269 aa  58.2  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3420  Type II secretion system F domain protein  27.38 
 
 		 295 aa  58.2  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.490118  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2364  putative putative tight adherence TadC-like transmembrane protein  27.86 
 
 		 321 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00226483  normal  0.0303282 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1124  type II secretion system protein  24.44 
 
 		 331 aa  58.2  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0315206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0300  type II secretion system protein  24.25 
 
 		 323 aa  57  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4348  type II secretion system protein  23.68 
 
 		 292 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1032  type II secretion system protein  29.21 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4615  type II secretion system protein  24.37 
 
 		 301 aa  55.8  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1754  type II secretion system protein  28.38 
 
 		 295 aa  55.8  0.0000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00143607  normal  0.105402 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1204  type II secretion system protein  26.85 
 
 		 296 aa  55.8  0.0000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.59428  hitchhiker  0.000000109908 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0653  TadC protein  25 
 
 		 313 aa  55.1  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.179736 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2308  Type II secretion system F domain protein  32.46 
 
 		 284 aa  54.3  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0992  type II secretion system protein  28.03 
 
 		 326 aa  54.7  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.236675  normal  0.765371 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2557  type II secretion system protein  26.32 
 
 		 314 aa  54.3  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.59617  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2763  type II secretion system protein  27.78 
 
 		 326 aa  54.7  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.613586 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3208  type II secretion system protein  25.2 
 
 		 302 aa  55.1  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.544767 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1680  type II secretion system protein  27.07 
 
 		 311 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000554602 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2571  type II secretion system protein  27.61 
 
 		 303 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1754  Flp pilus assembly protein TadC  25.13 
 
 		 326 aa  54.3  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1916  type II secretion system protein  26.82 
 
 		 312 aa  53.1  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.141806  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2115  type II secretion system protein  28.08 
 
 		 279 aa  52.8  0.000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2649  type II secretion system protein  26.97 
 
 		 323 aa  52  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2350  type II secretion system protein  26.92 
 
 		 322 aa  51.6  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.363474 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1043  Type II secretion system F domain protein  30.6 
 
 		 305 aa  51.6  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.809436  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1903  putative Flp pilus assembly protein TadC  22.59 
 
 		 326 aa  50.8  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1813  type II secretion system protein  24.68 
 
 		 426 aa  50.8  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00328504  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2927  type II secretion system protein  27 
 
 		 292 aa  50.8  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0944491  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0793  TadC protein  25.16 
 
 		 315 aa  50.4  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1500  type II secretion system protein  24.43 
 
 		 319 aa  50.4  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.34697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6878  type II secretion system protein  26.28 
 
 		 293 aa  50.4  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.465681  normal  0.240753 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0806  type II secretion system protein  25.29 
 
 		 316 aa  50.4  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0008  Type II secretion system F domain protein  25.96 
 
 		 290 aa  50.1  0.00005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3796  type II secretion system protein  27.54 
 
 		 325 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.472243  normal  0.57339 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1053  type II secretion system protein  27.71 
 
 		 302 aa  50.1  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2650  type II secretion system protein  23.08 
 
 		 294 aa  50.1  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0552  type II secretion system protein  22.22 
 
 		 326 aa  49.7  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1125  type II secretion system protein  23.85 
 
 		 322 aa  49.3  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0517135  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0651  putative tight adherence TadB-related transmembrane protein  31.43 
 
 		 325 aa  48.5  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.280791 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2832  type II secretion system protein  26.74 
 
 		 319 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.151252  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0639  type II secretion system protein  26.32 
 
 		 323 aa  48.5  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1033  type II secretion system protein  23.76 
 
 		 272 aa  48.9  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2016  type II secretion system protein  24.38 
 
 		 307 aa  48.9  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1831  type II secretion system protein  23.57 
 
 		 304 aa  48.9  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2722  type II secretion system protein  30.15 
 
 		 807 aa  48.1  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.722587 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1125  type II secretion system protein  25.58 
 
 		 347 aa  47.8  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.394553  normal  0.522315 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0642  type II secretion system protein  22.46 
 
 		 287 aa  48.5  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4864  type II secretion system protein  27.49 
 
 		 330 aa  48.1  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1399  type II secretion system protein  22.35 
 
 		 299 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0535811  hitchhiker  0.000124146 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2379  type II secretion system protein  27.27 
 
 		 321 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.306938  normal  0.924554 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0586  type II secretion system protein  27.68 
 
 		 320 aa  48.1  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.180812  normal  0.546922 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0800  type II secretion system protein  29.21 
 
 		 322 aa  47.4  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5120  type II secretion system protein  24.42 
 
 		 321 aa  47.4  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.229641  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0556  type II secretion system protein  31.19 
 
 		 313 aa  47  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.29749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1523  type II secretion system protein  27.93 
 
 		 328 aa  46.6  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0801  type II secretion system protein  25.83 
 
 		 312 aa  46.6  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0977  type II secretion system protein  29.91 
 
 		 680 aa  46.2  0.0007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3357  type II secretion system protein  23.56 
 
 		 327 aa  46.2  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>