128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1337 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1337  type II secretion system protein  100 
 
 		 289 aa  589  1e-167  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0505  hypothetical protein  41.75 
 
 		 241 aa  144  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0034  hypothetical protein  32.16 
 
 		 485 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1276  type II secretion system protein  30.41 
 
 		 311 aa  82.4  0.000000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2307  Type II secretion system F domain protein  25.18 
 
 		 298 aa  78.2  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2114  type II secretion system protein  31.03 
 
 		 288 aa  78.6  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3212  type II secretion system protein  30.81 
 
 		 311 aa  75.5  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.514288 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3208  type II secretion system protein  29.78 
 
 		 302 aa  72.4  0.000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.544767 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1680  type II secretion system protein  31.39 
 
 		 311 aa  72.4  0.000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000554602 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1053  type II secretion system protein  30.07 
 
 		 302 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2698  type II secretion system protein  26.72 
 
 		 302 aa  70.1  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0249  type II secretion system protein  29.24 
 
 		 313 aa  70.1  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.876214 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0296  type II secretion system protein  26.84 
 
 		 325 aa  68.6  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1850  type II secretion system protein  30.87 
 
 		 307 aa  67.8  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0102974  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4446  type II secretion system protein  27.62 
 
 		 293 aa  67.4  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0044747 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1204  type II secretion system protein  28 
 
 		 296 aa  67  0.0000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.59428  hitchhiker  0.000000109908 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2641  type II secretion system protein  29.09 
 
 		 291 aa  66.6  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1017  von Willebrand factor type A; type II secretion system protein  29.89 
 
 		 643 aa  65.5  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5120  type II secretion system protein  26 
 
 		 321 aa  64.3  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.229641  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0710  putative type II secretion system protein F  32.84 
 
 		 287 aa  63.9  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2314  type II secretion system protein  28.76 
 
 		 317 aa  63.9  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2696  type II secretion system protein  32.14 
 
 		 301 aa  63.9  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0581937  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4002  type II secretion system protein  27.39 
 
 		 329 aa  63.2  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0289268  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2557  type II secretion system protein  26.57 
 
 		 314 aa  63.2  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.59617  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4348  type II secretion system protein  29.59 
 
 		 292 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0300  type II secretion system protein  24.83 
 
 		 323 aa  62.8  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7036  putative pilus assembly protein  27.89 
 
 		 324 aa  62.8  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.452255 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1124  type II secretion system protein  23.02 
 
 		 331 aa  62.4  0.000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0315206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4188  type II secretion system protein  27.04 
 
 		 328 aa  62.4  0.000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0386  type II secretion system protein  24.88 
 
 		 325 aa  62.4  0.000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3718  type II secretion system protein  27.21 
 
 		 324 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.202594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1754  type II secretion system protein  29.44 
 
 		 295 aa  62  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00143607  normal  0.105402 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0238  type II secretion system protein  27.33 
 
 		 322 aa  61.6  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0424  type II secretion system protein  27.27 
 
 		 331 aa  61.2  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.628499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1399  type II secretion system protein  28.57 
 
 		 299 aa  60.8  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0535811  hitchhiker  0.000124146 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3011  type II secretion system protein  22.94 
 
 		 319 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1831  type II secretion system protein  25.82 
 
 		 304 aa  60.8  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2736  type II secretion system protein  26.92 
 
 		 326 aa  60.5  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3525  type II secretion system protein  27.21 
 
 		 324 aa  60.1  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.359223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2671  type II secretion system protein  23.64 
 
 		 313 aa  60.1  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0746  type II secretion system protein  28.97 
 
 		 287 aa  60.1  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.271129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2763  type II secretion system protein  25 
 
 		 326 aa  59.7  0.00000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.613586 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0642  type II secretion system protein  29.1 
 
 		 287 aa  60.1  0.00000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1779  type II secretion system protein  27.21 
 
 		 324 aa  59.7  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.708691  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1107  type II secretion system protein  27.12 
 
 		 323 aa  58.9  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.107682  normal  0.160043 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2650  type II secretion system protein  27.81 
 
 		 294 aa  58.9  0.00000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0793  TadC protein  26.14 
 
 		 315 aa  58.5  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1031  type II secretion system protein  26.58 
 
 		 312 aa  58.5  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002651  type II/IV secretion system protein TadC associated with Flp pilus assembly  27.27 
 
 		 313 aa  58.5  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3420  Type II secretion system F domain protein  27.1 
 
 		 295 aa  58.2  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.490118  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1813  type II secretion system protein  30.17 
 
 		 426 aa  57.8  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00328504  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4157  type II secretion system protein  30.46 
 
 		 309 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2413  type II secretion system protein  28.29 
 
 		 323 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3795  type II secretion system protein  24.53 
 
 		 321 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0781  type II secretion system protein  28.05 
 
 		 316 aa  57.4  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7218  type II secretion system protein  24.68 
 
 		 300 aa  57.4  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.329226 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0602  type II secretion system protein  22.78 
 
 		 323 aa  57.4  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0897257  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2021  type II secretion system protein  25.23 
 
 		 320 aa  57.4  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.477325  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4615  type II secretion system protein  30.19 
 
 		 301 aa  57.4  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4205  type II secretion system protein  25.17 
 
 		 324 aa  57  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.125721  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5619  type II secretion system protein  24.68 
 
 		 300 aa  57  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3796  type II secretion system protein  26.44 
 
 		 325 aa  57  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.472243  normal  0.57339 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2911  type II secretion system protein  26.96 
 
 		 306 aa  56.6  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.604096  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1903  putative Flp pilus assembly protein TadC  24.08 
 
 		 326 aa  56.2  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2351  type II secretion system protein  24.18 
 
 		 323 aa  56.2  0.0000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.357093 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0552  type II secretion system protein  24.08 
 
 		 326 aa  56.2  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2118  type II secretion system protein  25.95 
 
 		 310 aa  56.2  0.0000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.128736  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2365  hypothetical protein  24.07 
 
 		 324 aa  56.2  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.195084  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1500  type II secretion system protein  25.4 
 
 		 319 aa  55.8  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.34697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1638  type II secretion system protein  25.99 
 
 		 300 aa  55.5  0.0000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.786377  normal  0.203569 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2364  putative putative tight adherence TadC-like transmembrane protein  24.64 
 
 		 321 aa  55.8  0.0000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00226483  normal  0.0303282 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1159  Type II secretion system F domain protein  25.47 
 
 		 320 aa  55.5  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0639  type II secretion system protein  25.65 
 
 		 323 aa  55.5  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2935  type II secretion system protein  27.33 
 
 		 294 aa  55.1  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0849088  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2823  type II secretion system protein  26.78 
 
 		 306 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5824  type II secretion system protein  26.26 
 
 		 338 aa  54.7  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.993294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2485  type II secretion system protein  26.88 
 
 		 323 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.28616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0212  component of type IV pilus  25.17 
 
 		 326 aa  54.3  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2708  type II secretion system protein  26.88 
 
 		 323 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.68845 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3118  type II secretion system protein  25.69 
 
 		 304 aa  53.9  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.803425  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2379  type II secretion system protein  25 
 
 		 321 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.306938  normal  0.924554 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07520  Flp pilus assembly protein TadC  25.56 
 
 		 313 aa  53.9  0.000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2927  type II secretion system protein  23.72 
 
 		 292 aa  53.5  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0944491  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0858  type II secretion system protein  24.67 
 
 		 311 aa  53.5  0.000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2832  type II secretion system protein  25 
 
 		 319 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.151252  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2406  type II secretion system protein  25.17 
 
 		 312 aa  53.1  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0371172 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1754  Flp pilus assembly protein TadC  22.04 
 
 		 326 aa  52.4  0.000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1916  type II secretion system protein  22.88 
 
 		 312 aa  52  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.141806  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2649  type II secretion system protein  24.69 
 
 		 323 aa  52  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0543  type II secretion system protein  23.49 
 
 		 313 aa  52  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0603407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2486  type II secretion system protein  24.48 
 
 		 294 aa  52  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.766494  hitchhiker  0.000200331 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2571  type II secretion system protein  21.63 
 
 		 303 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3350  type II secretion system protein  26.94 
 
 		 309 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0728  type II secretion system protein  25.17 
 
 		 333 aa  50.8  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.552842  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4394  type II secretion system protein  28.65 
 
 		 314 aa  50.4  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0992  type II secretion system protein  22.62 
 
 		 326 aa  50.1  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.236675  normal  0.765371 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0801  type II secretion system protein  26.28 
 
 		 312 aa  50.4  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0074  type II secretion system protein  26.92 
 
 		 315 aa  50.1  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.557722  normal  0.8398 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2789  type II secretion system protein  26 
 
 		 315 aa  50.1  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00278324 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2352  type II secretion system protein  24.54 
 
 		 313 aa  49.3  0.00007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0836815  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>