94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5619 on replicon NC_011366
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011366  Rleg2_5619  type II secretion system protein  100 
 
 		 300 aa  592  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7218  type II secretion system protein  95.33 
 
 		 300 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.329226 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1204  type II secretion system protein  30.19 
 
 		 296 aa  81.6  0.00000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.59428  hitchhiker  0.000000109908 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1850  type II secretion system protein  28.28 
 
 		 307 aa  80.5  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0102974  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2641  type II secretion system protein  25.91 
 
 		 291 aa  76.6  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3212  type II secretion system protein  26.61 
 
 		 311 aa  75.9  0.0000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.514288 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2118  type II secretion system protein  23.28 
 
 		 310 aa  74.3  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.128736  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2923  putative type II secretion system protein F  26.67 
 
 		 293 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0249  type II secretion system protein  25.27 
 
 		 313 aa  72.8  0.000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.876214 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2114  type II secretion system protein  24.53 
 
 		 288 aa  72.8  0.000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1754  type II secretion system protein  30.05 
 
 		 295 aa  72.4  0.000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00143607  normal  0.105402 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2696  type II secretion system protein  25.47 
 
 		 301 aa  72  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0581937  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2314  type II secretion system protein  25.24 
 
 		 317 aa  71.6  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3118  type II secretion system protein  26.22 
 
 		 304 aa  68.2  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.803425  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4348  type II secretion system protein  23.96 
 
 		 292 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0300  type II secretion system protein  26.42 
 
 		 323 aa  66.6  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0746  type II secretion system protein  21.82 
 
 		 287 aa  64.7  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.271129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4446  type II secretion system protein  24.23 
 
 		 293 aa  64.3  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0044747 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0710  putative type II secretion system protein F  22.98 
 
 		 287 aa  64.3  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0642  type II secretion system protein  21.82 
 
 		 287 aa  64.7  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6878  type II secretion system protein  24.49 
 
 		 293 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.465681  normal  0.240753 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1107  type II secretion system protein  23.53 
 
 		 323 aa  63.5  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.107682  normal  0.160043 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3420  Type II secretion system F domain protein  25.32 
 
 		 295 aa  63.5  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.490118  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1276  type II secretion system protein  24.17 
 
 		 311 aa  63.2  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0653  TadC protein  26.49 
 
 		 313 aa  60.5  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.179736 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0552  type II secretion system protein  24.68 
 
 		 326 aa  60.8  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1903  putative Flp pilus assembly protein TadC  24.68 
 
 		 326 aa  59.7  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2486  type II secretion system protein  27.8 
 
 		 294 aa  60.1  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.766494  hitchhiker  0.000200331 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2736  type II secretion system protein  23.53 
 
 		 326 aa  59.7  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2365  hypothetical protein  24.02 
 
 		 324 aa  58.9  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.195084  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0992  type II secretion system protein  24.44 
 
 		 326 aa  58.2  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.236675  normal  0.765371 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1124  type II secretion system protein  24.23 
 
 		 331 aa  57.4  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0315206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0806  type II secretion system protein  24.84 
 
 		 316 aa  57.4  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2307  Type II secretion system F domain protein  23.56 
 
 		 298 aa  57.4  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1337  type II secretion system protein  24.68 
 
 		 289 aa  56.6  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1159  Type II secretion system F domain protein  24.18 
 
 		 320 aa  56.6  0.0000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3208  type II secretion system protein  25.27 
 
 		 302 aa  56.2  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.544767 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1053  type II secretion system protein  26.7 
 
 		 302 aa  55.8  0.0000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2698  type II secretion system protein  25.32 
 
 		 302 aa  55.8  0.0000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2927  type II secretion system protein  22.17 
 
 		 292 aa  55.5  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0944491  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2276  putative integral membrane protein  25.44 
 
 		 273 aa  55.1  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.846433  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2650  type II secretion system protein  24.55 
 
 		 294 aa  54.7  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2351  type II secretion system protein  26.28 
 
 		 323 aa  54.7  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.357093 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2565  Type II secretion system F domain protein  29.27 
 
 		 299 aa  54.7  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.725543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0449  type II secretion system protein  22.83 
 
 		 716 aa  53.5  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1680  type II secretion system protein  23.43 
 
 		 311 aa  53.5  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000554602 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002651  type II/IV secretion system protein TadC associated with Flp pilus assembly  23.41 
 
 		 313 aa  53.1  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1500  type II secretion system protein  23.98 
 
 		 319 aa  53.1  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.34697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0639  type II secretion system protein  26.9 
 
 		 323 aa  52.8  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0374  type II secretion system protein F  25.16 
 
 		 292 aa  52.4  0.000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.249846  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4188  type II secretion system protein  23.64 
 
 		 328 aa  52  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2935  type II secretion system protein  25.11 
 
 		 294 aa  52  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0849088  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2649  type II secretion system protein  26.11 
 
 		 323 aa  52  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1903  type II secretion system protein  26.26 
 
 		 349 aa  52  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.697256 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4002  type II secretion system protein  23.53 
 
 		 329 aa  51.6  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0289268  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06191  hypothetical protein  25.43 
 
 		 280 aa  51.6  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4615  type II secretion system protein  26.96 
 
 		 301 aa  50.4  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2763  type II secretion system protein  29.38 
 
 		 326 aa  50.4  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.613586 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0262  hypothetical protein  21.74 
 
 		 277 aa  50.4  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000660114  hitchhiker  0.00000173551 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4619  type II secretion system protein  25 
 
 		 318 aa  49.7  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.340215 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0610  type II secretion system protein  25.99 
 
 		 281 aa  49.7  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0586  type II secretion system protein  28.65 
 
 		 320 aa  49.3  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.180812  normal  0.546922 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3357  type II secretion system protein  26.17 
 
 		 327 aa  49.3  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5326  Type II secretion system F domain protein  24.24 
 
 		 236 aa  48.9  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00292685  normal  0.534868 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0597  type II secretion system protein  21.74 
 
 		 277 aa  48.5  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2700  tight adherence protein TadC  23.57 
 
 		 312 aa  48.1  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2352  type II secretion system protein  24.03 
 
 		 313 aa  47.8  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0836815  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2322  type II secretion system protein  23.57 
 
 		 312 aa  48.1  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0543  type II secretion system protein  27.56 
 
 		 313 aa  47.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0603407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2722  type II secretion system protein  26.47 
 
 		 807 aa  47.4  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.722587 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0801  type II secretion system protein  25.49 
 
 		 312 aa  46.6  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0650  putative tight adherence TadC-related transmembrane protein  25.81 
 
 		 315 aa  46.6  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.640477  normal  0.167986 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03347  hypothetical protein  24.14 
 
 		 187 aa  46.6  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1017  von Willebrand factor type A; type II secretion system protein  22.53 
 
 		 643 aa  46.2  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1813  type II secretion system protein  22.22 
 
 		 426 aa  45.8  0.0009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00328504  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0213  component of type IV pilus  26.73 
 
 		 334 aa  45.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1499  type II secretion system protein  22.47 
 
 		 321 aa  45.8  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.698875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0728  type II secretion system protein  23.35 
 
 		 333 aa  45.8  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.552842  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2686  type II secretion system protein  27.68 
 
 		 644 aa  45.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.473115 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1530  type II secretion system protein  23.57 
 
 		 301 aa  45.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4205  type II secretion system protein  23.39 
 
 		 324 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.125721  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1916  type II secretion system protein  24.5 
 
 		 312 aa  45.1  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.141806  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0727  type II secretion system protein  26.79 
 
 		 337 aa  44.3  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352668  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1728  type II secretion system protein  25.26 
 
 		 330 aa  44.3  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000109718 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1524  type II secretion system protein  28.4 
 
 		 322 aa  44.3  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3718  type II secretion system protein  25.15 
 
 		 324 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.202594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2406  type II secretion system protein  24.64 
 
 		 312 aa  43.9  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0371172 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0880  type II secretion system protein  25.79 
 
 		 288 aa  44.3  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2353  type II secretion system protein  24.07 
 
 		 323 aa  43.1  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.173092  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1042  Type II secretion system F domain protein  29.36 
 
 		 313 aa  42.7  0.007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.205171  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4001  type II secretion system protein  26.84 
 
 		 337 aa  42.7  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0807  hypothetical protein  24.57 
 
 		 290 aa  42.7  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1205  type II secretion system protein  22.53 
 
 		 535 aa  42.7  0.007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.499257  hitchhiker  0.000000000038758 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1489  hypothetical protein  22.58 
 
 		 289 aa  42.4  0.01  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000233132  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>