187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_03347 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_03347  hypothetical protein  100 
 
 		 187 aa  375  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06191  hypothetical protein  65.17 
 
 		 280 aa  246  1e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0610  type II secretion system protein  61.45 
 
 		 281 aa  244  4e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0374  type II secretion system protein F  49.1 
 
 		 292 aa  180  9.000000000000001e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.249846  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0597  type II secretion system protein  33.14 
 
 		 277 aa  120  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0262  hypothetical protein  31.98 
 
 		 277 aa  119  1.9999999999999998e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000660114  hitchhiker  0.00000173551 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0680  type II secretion system protein  32.57 
 
 		 277 aa  120  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.532814  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2047  type II secretion system protein  30.06 
 
 		 318 aa  90.1  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0677944  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0728  type II secretion system protein  30.22 
 
 		 333 aa  85.9  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.552842  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2016  type II secretion system protein  23.33 
 
 		 307 aa  85.5  5e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0672  type II secretion system protein  29.19 
 
 		 319 aa  84.7  7e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.139102  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0900  Type II secretion system F domain protein  29.19 
 
 		 319 aa  84.3  8e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1813  type II secretion system protein  26.19 
 
 		 426 aa  83.2  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00328504  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1125  type II secretion system protein  30.32 
 
 		 347 aa  82.4  0.000000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.394553  normal  0.522315 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0311  type II secretion system protein  27.84 
 
 		 316 aa  80.9  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.563894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1159  Type II secretion system F domain protein  28.65 
 
 		 320 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2694  type II secretion system protein  28.34 
 
 		 320 aa  79  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1530  type II secretion system protein  27.78 
 
 		 301 aa  77.8  0.00000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2352  type II secretion system protein  28.38 
 
 		 313 aa  76.6  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0836815  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1075  type II secretion system protein  30.86 
 
 		 335 aa  76.6  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.137371  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1500  type II secretion system protein  27.66 
 
 		 319 aa  76.6  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.34697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0238  type II secretion system protein  28.41 
 
 		 322 aa  76.6  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2557  type II secretion system protein  26.4 
 
 		 314 aa  75.5  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.59617  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1754  Flp pilus assembly protein TadC  28.83 
 
 		 326 aa  74.3  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0992  type II secretion system protein  26.74 
 
 		 326 aa  73.9  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.236675  normal  0.765371 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2832  type II secretion system protein  27.17 
 
 		 319 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.151252  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0801  type II secretion system protein  29.81 
 
 		 312 aa  72.8  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2763  type II secretion system protein  29.94 
 
 		 326 aa  72.8  0.000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.613586 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4619  type II secretion system protein  28 
 
 		 318 aa  72  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.340215 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2736  type II secretion system protein  26.71 
 
 		 326 aa  72  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2118  type II secretion system protein  29.94 
 
 		 310 aa  72  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.128736  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2379  type II secretion system protein  25.54 
 
 		 321 aa  71.2  0.000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.306938  normal  0.924554 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2571  type II secretion system protein  28.05 
 
 		 303 aa  71.6  0.000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2641  type II secretion system protein  30.22 
 
 		 291 aa  71.2  0.000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4864  type II secretion system protein  29.59 
 
 		 330 aa  71.2  0.000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0639  type II secretion system protein  27.33 
 
 		 323 aa  70.9  0.000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3795  type II secretion system protein  27.89 
 
 		 321 aa  70.5  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1107  type II secretion system protein  26.44 
 
 		 323 aa  70.5  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.107682  normal  0.160043 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1723  type II secretion system protein  25.15 
 
 		 296 aa  70.1  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2351  type II secretion system protein  28.67 
 
 		 323 aa  69.7  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.357093 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0602  type II secretion system protein  24.38 
 
 		 323 aa  69.3  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0897257  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1318  type II secretion system protein  25.62 
 
 		 319 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4481  type II secretion system protein  26.86 
 
 		 328 aa  68.9  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3093  type II secretion system protein  25.62 
 
 		 319 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2968  type II secretion system protein  25.62 
 
 		 319 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4193  type II secretion system protein  27.84 
 
 		 328 aa  68.6  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0552  type II secretion system protein  26.92 
 
 		 326 aa  68.6  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1524  type II secretion system protein  26.75 
 
 		 322 aa  68.2  0.00000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2365  hypothetical protein  27.44 
 
 		 324 aa  67.8  0.00000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.195084  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1903  putative Flp pilus assembly protein TadC  26.92 
 
 		 326 aa  67.8  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3011  type II secretion system protein  28.16 
 
 		 319 aa  67.8  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0806  type II secretion system protein  26.54 
 
 		 316 aa  67.8  0.00000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2649  type II secretion system protein  27.5 
 
 		 323 aa  67.4  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3208  type II secretion system protein  23.78 
 
 		 302 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.544767 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2276  hypothetical protein  25.62 
 
 		 296 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0653  TadC protein  25.7 
 
 		 313 aa  66.6  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.179736 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4188  type II secretion system protein  30.71 
 
 		 328 aa  66.6  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3964  type II secretion system protein  26.22 
 
 		 314 aa  67  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.273183 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0300  type II secretion system protein  27.66 
 
 		 323 aa  66.2  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1517  hypothetical protein  25.43 
 
 		 320 aa  65.9  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.205257  normal  0.198842 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0586  type II secretion system protein  25.28 
 
 		 320 aa  65.9  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.180812  normal  0.546922 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1124  type II secretion system protein  24.86 
 
 		 331 aa  66.2  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0315206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0793  TadC protein  27.16 
 
 		 315 aa  65.5  0.0000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20330  Flp pilus assembly protein TadC  25.81 
 
 		 205 aa  65.9  0.0000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.400927  normal  0.182713 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0424  type II secretion system protein  24.84 
 
 		 331 aa  65.9  0.0000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.628499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1053  type II secretion system protein  25.15 
 
 		 302 aa  65.9  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2314  type II secretion system protein  28.25 
 
 		 317 aa  65.5  0.0000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5120  type II secretion system protein  23.9 
 
 		 321 aa  65.1  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.229641  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1754  type II secretion system protein  27.07 
 
 		 295 aa  64.7  0.0000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00143607  normal  0.105402 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3796  type II secretion system protein  26.54 
 
 		 325 aa  64.7  0.0000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.472243  normal  0.57339 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1916  type II secretion system protein  27.97 
 
 		 312 aa  64.7  0.0000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.141806  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3357  type II secretion system protein  27.78 
 
 		 327 aa  64.3  0.0000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2823  type II secretion system protein  26.59 
 
 		 306 aa  63.2  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3525  type II secretion system protein  25 
 
 		 324 aa  63.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.359223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1779  type II secretion system protein  25.83 
 
 		 324 aa  62.4  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.708691  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4002  type II secretion system protein  23.43 
 
 		 329 aa  62.8  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0289268  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2911  type II secretion system protein  27.56 
 
 		 306 aa  62.8  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.604096  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4446  type II secretion system protein  26.67 
 
 		 293 aa  62  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0044747 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3212  type II secretion system protein  23.46 
 
 		 311 aa  62.4  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.514288 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0212  component of type IV pilus  24.14 
 
 		 326 aa  62  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4205  type II secretion system protein  24.43 
 
 		 324 aa  61.6  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.125721  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0386  type II secretion system protein  25 
 
 		 325 aa  61.6  0.000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7036  putative pilus assembly protein  25.83 
 
 		 324 aa  61.6  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.452255 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0296  type II secretion system protein  26.14 
 
 		 325 aa  60.8  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2046  putative fimbriae-related membrane protein  23.29 
 
 		 314 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0336894  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3718  type II secretion system protein  26.9 
 
 		 324 aa  60.5  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.202594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3492  type II secretion system protein  22.75 
 
 		 313 aa  60.5  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.39955  normal  0.0861426 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2708  type II secretion system protein  24.52 
 
 		 323 aa  60.5  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.68845 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1675  type II secretion system protein F  23.29 
 
 		 314 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0331  type II secretion system protein F  23.29 
 
 		 314 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0097112  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1878  type II secretion system protein  23.29 
 
 		 314 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.650462  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1890  type II secretion system protein  23.29 
 
 		 314 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0830  type II secretion system protein F  23.29 
 
 		 314 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.288216  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2485  type II secretion system protein  24.52 
 
 		 323 aa  60.5  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.28616  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0650  putative tight adherence TadC-related transmembrane protein  23.35 
 
 		 315 aa  59.7  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.640477  normal  0.167986 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6364  type II secretion system protein  25.53 
 
 		 324 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2413  type II secretion system protein  24.03 
 
 		 323 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4394  type II secretion system protein  26.59 
 
 		 314 aa  60.1  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3420  Type II secretion system F domain protein  28.57 
 
 		 295 aa  60.1  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.490118  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6776  type II secretion system protein  25.53 
 
 		 324 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.710361  normal  0.399772 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>