217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0386 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_0386  type II secretion system protein  100 
 
 		 325 aa  660    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0296  type II secretion system protein  92.92 
 
 		 325 aa  593  1e-168  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7036  putative pilus assembly protein  81.99 
 
 		 324 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.452255 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3525  type II secretion system protein  83.23 
 
 		 324 aa  526  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.359223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1779  type II secretion system protein  81.06 
 
 		 324 aa  522  1e-147  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.708691  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3718  type II secretion system protein  83.18 
 
 		 324 aa  514  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.202594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4205  type II secretion system protein  81.06 
 
 		 324 aa  511  1e-144  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.125721  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2413  type II secretion system protein  57.85 
 
 		 323 aa  375  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2485  type II secretion system protein  56.31 
 
 		 323 aa  351  1e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.28616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2708  type II secretion system protein  56.31 
 
 		 323 aa  351  1e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.68845 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0238  type II secretion system protein  57.95 
 
 		 322 aa  350  2e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2379  type II secretion system protein  57.55 
 
 		 321 aa  350  3e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.306938  normal  0.924554 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0728  type II secretion system protein  54.29 
 
 		 333 aa  342  4e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.552842  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3795  type II secretion system protein  55.78 
 
 		 321 aa  339  4e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3357  type II secretion system protein  54.01 
 
 		 327 aa  335  5e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4002  type II secretion system protein  52.8 
 
 		 329 aa  330  2e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0289268  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0424  type II secretion system protein  55.24 
 
 		 331 aa  330  2e-89  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.628499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0602  type II secretion system protein  51.71 
 
 		 323 aa  325  9e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0897257  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4481  type II secretion system protein  54.52 
 
 		 328 aa  324  1e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2832  type II secretion system protein  57.5 
 
 		 319 aa  319  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.151252  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0212  component of type IV pilus  53.75 
 
 		 326 aa  316  4e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3796  type II secretion system protein  57.01 
 
 		 325 aa  315  8e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.472243  normal  0.57339 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4193  type II secretion system protein  53.58 
 
 		 328 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5120  type II secretion system protein  52.58 
 
 		 321 aa  294  1e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.229641  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4188  type II secretion system protein  48.58 
 
 		 328 aa  278  8e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4864  type II secretion system protein  37.65 
 
 		 330 aa  211  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1125  type II secretion system protein  37.73 
 
 		 347 aa  205  8e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.394553  normal  0.522315 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1075  type II secretion system protein  36.5 
 
 		 335 aa  201  1.9999999999999998e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.137371  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2557  type II secretion system protein  38.16 
 
 		 314 aa  144  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.59617  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2694  type II secretion system protein  37.66 
 
 		 320 aa  144  2e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0311  type II secretion system protein  32.14 
 
 		 316 aa  143  4e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.563894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1754  Flp pilus assembly protein TadC  34.63 
 
 		 326 aa  142  9.999999999999999e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1159  Type II secretion system F domain protein  34.38 
 
 		 320 aa  139  8.999999999999999e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1124  type II secretion system protein  34.23 
 
 		 331 aa  136  4e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0315206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2364  putative putative tight adherence TadC-like transmembrane protein  29.36 
 
 		 321 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00226483  normal  0.0303282 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1107  type II secretion system protein  36.11 
 
 		 323 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.107682  normal  0.160043 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1517  hypothetical protein  37.65 
 
 		 320 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.205257  normal  0.198842 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2365  hypothetical protein  30.43 
 
 		 324 aa  130  3e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.195084  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2454  type II secretion system protein F  39.31 
 
 		 290 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0182293  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0992  type II secretion system protein  33.19 
 
 		 326 aa  129  6e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.236675  normal  0.765371 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2047  type II secretion system protein  39.23 
 
 		 318 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0677944  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2736  type II secretion system protein  39.77 
 
 		 326 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1500  type II secretion system protein  40 
 
 		 319 aa  127  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.34697  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0672  type II secretion system protein  39.39 
 
 		 319 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.139102  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0806  type II secretion system protein  29.52 
 
 		 316 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3011  type II secretion system protein  34.63 
 
 		 319 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0900  Type II secretion system F domain protein  39.39 
 
 		 319 aa  127  3e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2763  type II secretion system protein  33.75 
 
 		 326 aa  126  5e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.613586 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0300  type II secretion system protein  33.33 
 
 		 323 aa  126  6e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3964  type II secretion system protein  34.93 
 
 		 314 aa  125  8.000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.273183 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2911  type II secretion system protein  31.88 
 
 		 306 aa  125  9e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.604096  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3492  type II secretion system protein  28.06 
 
 		 313 aa  125  1e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.39955  normal  0.0861426 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2046  putative fimbriae-related membrane protein  38.15 
 
 		 314 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0336894  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1675  type II secretion system protein F  38.15 
 
 		 314 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0331  type II secretion system protein F  38.15 
 
 		 314 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0097112  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1878  type II secretion system protein  38.15 
 
 		 314 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.650462  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1890  type II secretion system protein  38.15 
 
 		 314 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0830  type II secretion system protein F  38.15 
 
 		 314 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.288216  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2276  hypothetical protein  34.41 
 
 		 296 aa  123  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2021  type II secretion system protein  27.66 
 
 		 320 aa  124  3e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.477325  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0639  type II secretion system protein  29.15 
 
 		 323 aa  123  4e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1530  type II secretion system protein  33.63 
 
 		 301 aa  123  4e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4619  type II secretion system protein  35.43 
 
 		 318 aa  123  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.340215 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0552  type II secretion system protein  32.48 
 
 		 326 aa  122  8e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2016  type II secretion system protein  34.2 
 
 		 307 aa  122  8e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1903  putative Flp pilus assembly protein TadC  32.48 
 
 		 326 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0653  TadC protein  29.39 
 
 		 313 aa  121  9.999999999999999e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.179736 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1524  type II secretion system protein  27.91 
 
 		 322 aa  119  7e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1318  type II secretion system protein  34.01 
 
 		 319 aa  119  9e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2968  type II secretion system protein  34.01 
 
 		 319 aa  119  9e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2352  type II secretion system protein  33.04 
 
 		 313 aa  118  9.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0836815  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3093  type II secretion system protein  34.01 
 
 		 319 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2823  type II secretion system protein  33.51 
 
 		 306 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0801  type II secretion system protein  41.1 
 
 		 312 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0543  type II secretion system protein  39.26 
 
 		 313 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0603407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0793  TadC protein  37.5 
 
 		 315 aa  116  5e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002651  type II/IV secretion system protein TadC associated with Flp pilus assembly  31.06 
 
 		 313 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0650  putative tight adherence TadC-related transmembrane protein  33.21 
 
 		 315 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.640477  normal  0.167986 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1916  type II secretion system protein  28.8 
 
 		 312 aa  113  4.0000000000000004e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.141806  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3426  type II secretion system protein  31.22 
 
 		 314 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.165732  normal  0.426073 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2351  type II secretion system protein  31.36 
 
 		 323 aa  113  5e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.357093 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2571  type II secretion system protein  28.47 
 
 		 303 aa  113  5e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2052  type II secretion system protein  28.78 
 
 		 314 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000269982  normal  0.0927482 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3208  type II secretion system protein  32.89 
 
 		 302 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.544767 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2649  type II secretion system protein  27.38 
 
 		 323 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7193  putative Flp pilus assembly protein TadC  35.27 
 
 		 324 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.202721  normal  0.456008 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3212  type II secretion system protein  32.74 
 
 		 311 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.514288 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1053  type II secretion system protein  33.78 
 
 		 302 aa  109  8.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3933  type II secretion system protein  31.22 
 
 		 314 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0787436  normal  0.204466 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2314  type II secretion system protein  30.35 
 
 		 317 aa  108  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6364  type II secretion system protein  33.18 
 
 		 324 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5490  type II secretion system protein  33.18 
 
 		 324 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6776  type II secretion system protein  33.18 
 
 		 324 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.710361  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1276  type II secretion system protein  30.34 
 
 		 311 aa  106  7e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3118  type II secretion system protein  37.58 
 
 		 304 aa  105  7e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.803425  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2698  type II secretion system protein  27.37 
 
 		 302 aa  105  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6300  type II secretion system protein  38.6 
 
 		 323 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.923016 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0586  type II secretion system protein  40.49 
 
 		 320 aa  103  5e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.180812  normal  0.546922 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5326  type II secretion system protein  37.72 
 
 		 323 aa  101  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0355396 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6004  type II secretion system protein  37.43 
 
 		 324 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>