252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2694 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_2694  type II secretion system protein  100 
 
 
320 aa  627  1e-178  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1517  hypothetical protein  56.56 
 
 
320 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.205257  normal  0.198842 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1125  type II secretion system protein  46.63 
 
 
347 aa  168  1e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.394553  normal  0.522315 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1075  type II secretion system protein  50.3 
 
 
335 aa  165  1.0000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.137371  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4864  type II secretion system protein  38.22 
 
 
330 aa  159  6e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2016  type II secretion system protein  44.13 
 
 
307 aa  154  2e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0212  component of type IV pilus  40.88 
 
 
326 aa  152  8.999999999999999e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3795  type II secretion system protein  38.1 
 
 
321 aa  151  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3357  type II secretion system protein  39.91 
 
 
327 aa  149  8e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4481  type II secretion system protein  41.81 
 
 
328 aa  149  8e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0296  type II secretion system protein  38.43 
 
 
325 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4188  type II secretion system protein  38.89 
 
 
328 aa  147  3e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4002  type II secretion system protein  42.11 
 
 
329 aa  147  3e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0289268  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4193  type II secretion system protein  41.24 
 
 
328 aa  145  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3525  type II secretion system protein  37.44 
 
 
324 aa  146  6e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.359223  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1779  type II secretion system protein  37.07 
 
 
324 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.708691  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0386  type II secretion system protein  37.66 
 
 
325 aa  144  2e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4205  type II secretion system protein  38.03 
 
 
324 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.125721  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2454  type II secretion system protein F  43.3 
 
 
290 aa  143  4e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0182293  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3426  type II secretion system protein  39.13 
 
 
314 aa  143  4e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.165732  normal  0.426073 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2046  putative fimbriae-related membrane protein  45.81 
 
 
314 aa  142  9e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0336894  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1675  type II secretion system protein F  45.81 
 
 
314 aa  142  9e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0331  type II secretion system protein F  45.81 
 
 
314 aa  142  9e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0097112  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1890  type II secretion system protein  45.81 
 
 
314 aa  142  9e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0830  type II secretion system protein F  45.81 
 
 
314 aa  142  9e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.288216  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0238  type II secretion system protein  42.44 
 
 
322 aa  141  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3933  type II secretion system protein  39.13 
 
 
314 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0787436  normal  0.204466 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1878  type II secretion system protein  45.81 
 
 
314 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.650462  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0424  type II secretion system protein  39.52 
 
 
331 aa  139  4.999999999999999e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.628499  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3718  type II secretion system protein  41.28 
 
 
324 aa  139  6e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.202594  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0602  type II secretion system protein  40.45 
 
 
323 aa  139  7.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0897257  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2708  type II secretion system protein  36.41 
 
 
323 aa  139  8.999999999999999e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.68845 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2485  type II secretion system protein  36.41 
 
 
323 aa  139  8.999999999999999e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.28616  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2047  type II secretion system protein  43.26 
 
 
318 aa  137  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0677944  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0672  type II secretion system protein  37.96 
 
 
319 aa  137  2e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.139102  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0728  type II secretion system protein  36.36 
 
 
333 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.552842  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2379  type II secretion system protein  36.92 
 
 
321 aa  136  4e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.306938  normal  0.924554 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2052  type II secretion system protein  39.52 
 
 
314 aa  137  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000269982  normal  0.0927482 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5120  type II secretion system protein  37.79 
 
 
321 aa  136  4e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.229641  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0900  Type II secretion system F domain protein  42.22 
 
 
319 aa  135  7.000000000000001e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2413  type II secretion system protein  37.96 
 
 
323 aa  135  8e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7036  putative pilus assembly protein  40.12 
 
 
324 aa  135  8e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.452255 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0311  type II secretion system protein  34.15 
 
 
316 aa  134  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.563894  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3796  type II secretion system protein  34.11 
 
 
325 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.472243  normal  0.57339 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1500  type II secretion system protein  38.07 
 
 
319 aa  132  6e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.34697  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2365  hypothetical protein  40.48 
 
 
324 aa  130  3e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.195084  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1124  type II secretion system protein  31.69 
 
 
331 aa  130  3e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0315206  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1107  type II secretion system protein  39.78 
 
 
323 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.107682  normal  0.160043 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2832  type II secretion system protein  38.2 
 
 
319 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.151252  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0300  type II secretion system protein  40.37 
 
 
323 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3492  type II secretion system protein  37.43 
 
 
313 aa  128  2.0000000000000002e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.39955  normal  0.0861426 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1916  type II secretion system protein  37.28 
 
 
312 aa  127  2.0000000000000002e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.141806  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2364  putative putative tight adherence TadC-like transmembrane protein  37.93 
 
 
321 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00226483  normal  0.0303282 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2021  type II secretion system protein  36.41 
 
 
320 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.477325  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0653  TadC protein  35.84 
 
 
313 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.179736 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0552  type II secretion system protein  39.13 
 
 
326 aa  126  6e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1903  putative Flp pilus assembly protein TadC  39.13 
 
 
326 aa  125  7e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2736  type II secretion system protein  38.3 
 
 
326 aa  125  1e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2763  type II secretion system protein  38.37 
 
 
326 aa  125  1e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.613586 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0992  type II secretion system protein  37.5 
 
 
326 aa  124  2e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.236675  normal  0.765371 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1754  Flp pilus assembly protein TadC  36.53 
 
 
326 aa  122  7e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0806  type II secretion system protein  35.24 
 
 
316 aa  122  9e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0650  putative tight adherence TadC-related transmembrane protein  36.02 
 
 
315 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.640477  normal  0.167986 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2557  type II secretion system protein  38.46 
 
 
314 aa  122  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.59617  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4619  type II secretion system protein  30.56 
 
 
318 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.340215 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0793  TadC protein  35.88 
 
 
315 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2352  type II secretion system protein  35.86 
 
 
313 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0836815  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0543  type II secretion system protein  36.14 
 
 
313 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0603407  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2314  type II secretion system protein  34.36 
 
 
317 aa  120  3e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1524  type II secretion system protein  33.18 
 
 
322 aa  119  7e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1159  Type II secretion system F domain protein  34.36 
 
 
320 aa  119  7e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0801  type II secretion system protein  35.77 
 
 
312 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0639  type II secretion system protein  40 
 
 
323 aa  115  6.9999999999999995e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1530  type II secretion system protein  33.8 
 
 
301 aa  115  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2649  type II secretion system protein  39.63 
 
 
323 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3964  type II secretion system protein  38.18 
 
 
314 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.273183 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3011  type II secretion system protein  36.84 
 
 
319 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2698  type II secretion system protein  35.2 
 
 
302 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2641  type II secretion system protein  33.51 
 
 
291 aa  113  5e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3212  type II secretion system protein  35.08 
 
 
311 aa  112  6e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.514288 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1276  type II secretion system protein  26.89 
 
 
311 aa  112  9e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2351  type II secretion system protein  36.9 
 
 
323 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.357093 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002651  type II/IV secretion system protein TadC associated with Flp pilus assembly  35.79 
 
 
313 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2118  type II secretion system protein  30.42 
 
 
310 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.128736  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2911  type II secretion system protein  32.57 
 
 
306 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.604096  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3118  type II secretion system protein  36.75 
 
 
304 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.803425  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2571  type II secretion system protein  34.95 
 
 
303 aa  109  6e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2823  type II secretion system protein  35 
 
 
306 aa  108  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1318  type II secretion system protein  37.43 
 
 
319 aa  105  9e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2968  type II secretion system protein  37.43 
 
 
319 aa  105  9e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2276  hypothetical protein  37.43 
 
 
296 aa  105  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3093  type II secretion system protein  37.43 
 
 
319 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1813  type II secretion system protein  31.53 
 
 
426 aa  104  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00328504  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1754  type II secretion system protein  35.83 
 
 
295 aa  104  2e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00143607  normal  0.105402 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0586  type II secretion system protein  39.76 
 
 
320 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.180812  normal  0.546922 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1831  type II secretion system protein  31.84 
 
 
304 aa  103  4e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1850  type II secretion system protein  36.1 
 
 
307 aa  101  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0102974  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1053  type II secretion system protein  29.85 
 
 
302 aa  100  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5326  type II secretion system protein  39.88 
 
 
323 aa  100  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0355396 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7193  putative Flp pilus assembly protein TadC  36.78 
 
 
324 aa  99.8  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.202721  normal  0.456008 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>