204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5120 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5120  type II secretion system protein  100 
 
 		 321 aa  643    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.229641  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0602  type II secretion system protein  70.22 
 
 		 323 aa  460  9.999999999999999e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0897257  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3795  type II secretion system protein  65.59 
 
 		 321 aa  423  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7036  putative pilus assembly protein  53.35 
 
 		 324 aa  325  6e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.452255 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0238  type II secretion system protein  52.73 
 
 		 322 aa  318  7.999999999999999e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2413  type II secretion system protein  53.44 
 
 		 323 aa  316  3e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3718  type II secretion system protein  57.93 
 
 		 324 aa  308  5.9999999999999995e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.202594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4205  type II secretion system protein  53.99 
 
 		 324 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.125721  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2379  type II secretion system protein  55.05 
 
 		 321 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.306938  normal  0.924554 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0424  type II secretion system protein  50.16 
 
 		 331 aa  302  6.000000000000001e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.628499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0386  type II secretion system protein  52.58 
 
 		 325 aa  298  7e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4481  type II secretion system protein  49.85 
 
 		 328 aa  298  9e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0728  type II secretion system protein  49.37 
 
 		 333 aa  298  9e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.552842  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2485  type II secretion system protein  52.96 
 
 		 323 aa  296  2e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.28616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2708  type II secretion system protein  52.96 
 
 		 323 aa  296  2e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.68845 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3357  type II secretion system protein  49.06 
 
 		 327 aa  296  2e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4193  type II secretion system protein  49.54 
 
 		 328 aa  296  4e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1779  type II secretion system protein  53.35 
 
 		 324 aa  296  4e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.708691  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0296  type II secretion system protein  53.8 
 
 		 325 aa  294  1e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3525  type II secretion system protein  53.04 
 
 		 324 aa  292  6e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.359223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0212  component of type IV pilus  50.48 
 
 		 326 aa  291  1e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4002  type II secretion system protein  48.92 
 
 		 329 aa  288  6e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0289268  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3796  type II secretion system protein  57.44 
 
 		 325 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.472243  normal  0.57339 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2832  type II secretion system protein  56.1 
 
 		 319 aa  272  7e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.151252  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4188  type II secretion system protein  48.11 
 
 		 328 aa  261  1e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1125  type II secretion system protein  37.19 
 
 		 347 aa  204  2e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.394553  normal  0.522315 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4864  type II secretion system protein  40.96 
 
 		 330 aa  204  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1075  type II secretion system protein  34.27 
 
 		 335 aa  195  8.000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.137371  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0311  type II secretion system protein  34.71 
 
 		 316 aa  151  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.563894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1159  Type II secretion system F domain protein  32.29 
 
 		 320 aa  147  3e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0653  TadC protein  30.03 
 
 		 313 aa  142  7e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.179736 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2365  hypothetical protein  30.39 
 
 		 324 aa  140  3e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.195084  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0806  type II secretion system protein  35.09 
 
 		 316 aa  139  7e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1107  type II secretion system protein  35.71 
 
 		 323 aa  139  7e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.107682  normal  0.160043 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2736  type II secretion system protein  34.92 
 
 		 326 aa  139  7.999999999999999e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0992  type II secretion system protein  34.09 
 
 		 326 aa  138  1e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.236675  normal  0.765371 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1124  type II secretion system protein  32 
 
 		 331 aa  138  1e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0315206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3011  type II secretion system protein  36.94 
 
 		 319 aa  138  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1500  type II secretion system protein  40.8 
 
 		 319 aa  138  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.34697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2694  type II secretion system protein  37.79 
 
 		 320 aa  136  5e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2763  type II secretion system protein  35.43 
 
 		 326 aa  135  8e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.613586 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2557  type II secretion system protein  40.24 
 
 		 314 aa  135  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.59617  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1754  Flp pilus assembly protein TadC  32.39 
 
 		 326 aa  133  3e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2047  type II secretion system protein  37.08 
 
 		 318 aa  133  3.9999999999999996e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0677944  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0672  type II secretion system protein  35.27 
 
 		 319 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.139102  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1524  type II secretion system protein  33.2 
 
 		 322 aa  133  3.9999999999999996e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0552  type II secretion system protein  35.43 
 
 		 326 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0300  type II secretion system protein  34.98 
 
 		 323 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1903  putative Flp pilus assembly protein TadC  35.43 
 
 		 326 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0900  Type II secretion system F domain protein  37.85 
 
 		 319 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1916  type II secretion system protein  36.93 
 
 		 312 aa  131  1.0000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.141806  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3964  type II secretion system protein  37.05 
 
 		 314 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.273183 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0639  type II secretion system protein  30.91 
 
 		 323 aa  130  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2276  hypothetical protein  33.05 
 
 		 296 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1318  type II secretion system protein  39.66 
 
 		 319 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2968  type II secretion system protein  39.66 
 
 		 319 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2641  type II secretion system protein  33.76 
 
 		 291 aa  129  8.000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2911  type II secretion system protein  34.38 
 
 		 306 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.604096  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4446  type II secretion system protein  38.16 
 
 		 293 aa  128  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0044747 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3093  type II secretion system protein  39.08 
 
 		 319 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1517  hypothetical protein  34.68 
 
 		 320 aa  126  6e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.205257  normal  0.198842 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2649  type II secretion system protein  32.64 
 
 		 323 aa  125  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0793  TadC protein  35.52 
 
 		 315 aa  125  1e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2823  type II secretion system protein  38.37 
 
 		 306 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4619  type II secretion system protein  31.67 
 
 		 318 aa  125  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.340215 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2454  type II secretion system protein F  31.23 
 
 		 290 aa  124  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0182293  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1530  type II secretion system protein  37.95 
 
 		 301 aa  123  5e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2351  type II secretion system protein  34.07 
 
 		 323 aa  122  6e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.357093 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2314  type II secretion system protein  33.64 
 
 		 317 aa  122  7e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2016  type II secretion system protein  32.6 
 
 		 307 aa  122  8e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0801  type II secretion system protein  39.88 
 
 		 312 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2046  putative fimbriae-related membrane protein  31.23 
 
 		 314 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0336894  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1675  type II secretion system protein F  31.23 
 
 		 314 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0331  type II secretion system protein F  31.23 
 
 		 314 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0097112  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1878  type II secretion system protein  31.23 
 
 		 314 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.650462  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1890  type II secretion system protein  31.23 
 
 		 314 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0830  type II secretion system protein F  31.23 
 
 		 314 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.288216  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3118  type II secretion system protein  38.41 
 
 		 304 aa  119  6e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.803425  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2352  type II secretion system protein  37.42 
 
 		 313 aa  119  7.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0836815  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2698  type II secretion system protein  33.77 
 
 		 302 aa  119  9e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3492  type II secretion system protein  33.19 
 
 		 313 aa  118  9.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.39955  normal  0.0861426 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002651  type II/IV secretion system protein TadC associated with Flp pilus assembly  33.18 
 
 		 313 aa  118  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3212  type II secretion system protein  29.33 
 
 		 311 aa  117  3e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.514288 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0543  type II secretion system protein  37.04 
 
 		 313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0603407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2118  type II secretion system protein  28.39 
 
 		 310 aa  114  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.128736  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6364  type II secretion system protein  35.59 
 
 		 324 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2364  putative putative tight adherence TadC-like transmembrane protein  26.37 
 
 		 321 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00226483  normal  0.0303282 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5490  type II secretion system protein  33.75 
 
 		 324 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6776  type II secretion system protein  33.75 
 
 		 324 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.710361  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7193  putative Flp pilus assembly protein TadC  33.74 
 
 		 324 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.202721  normal  0.456008 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0586  type II secretion system protein  37.71 
 
 		 320 aa  110  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.180812  normal  0.546922 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1276  type II secretion system protein  31.84 
 
 		 311 aa  110  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1850  type II secretion system protein  32.02 
 
 		 307 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0102974  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2021  type II secretion system protein  28.14 
 
 		 320 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.477325  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0650  putative tight adherence TadC-related transmembrane protein  29.18 
 
 		 315 aa  109  5e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.640477  normal  0.167986 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1053  type II secretion system protein  32.17 
 
 		 302 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3208  type II secretion system protein  33.05 
 
 		 302 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.544767 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2935  type II secretion system protein  30.77 
 
 		 294 aa  108  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0849088  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3420  Type II secretion system F domain protein  35.75 
 
 		 295 aa  107  4e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.490118  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2571  type II secretion system protein  30.22 
 
 		 303 aa  106  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>