141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0680 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_0680  type II secretion system protein  100 
 
 		 277 aa  543  1e-153  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.532814  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0597  type II secretion system protein  97.47 
 
 		 277 aa  511  1e-144  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0262  hypothetical protein  96.39 
 
 		 277 aa  506  9.999999999999999e-143  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000660114  hitchhiker  0.00000173551 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0610  type II secretion system protein  36.99 
 
 		 281 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0374  type II secretion system protein F  37.65 
 
 		 292 aa  128  1.0000000000000001e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.249846  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06191  hypothetical protein  27.34 
 
 		 280 aa  122  6e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03347  hypothetical protein  36.88 
 
 		 187 aa  115  7.999999999999999e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3795  type II secretion system protein  25.85 
 
 		 321 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0386  type II secretion system protein  24.8 
 
 		 325 aa  76.3  0.0000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3525  type II secretion system protein  24.58 
 
 		 324 aa  75.9  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.359223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1779  type II secretion system protein  23.35 
 
 		 324 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.708691  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0424  type II secretion system protein  24.52 
 
 		 331 aa  73.2  0.000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.628499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0793  TadC protein  27.98 
 
 		 315 aa  72.4  0.000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0296  type II secretion system protein  24.8 
 
 		 325 aa  72  0.000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4205  type II secretion system protein  23.58 
 
 		 324 aa  72  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.125721  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7036  putative pilus assembly protein  25.87 
 
 		 324 aa  70.9  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.452255 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0238  type II secretion system protein  22.22 
 
 		 322 aa  70.5  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2379  type II secretion system protein  25.57 
 
 		 321 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.306938  normal  0.924554 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1159  Type II secretion system F domain protein  26.14 
 
 		 320 aa  69.7  0.00000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0806  type II secretion system protein  24.88 
 
 		 316 aa  70.1  0.00000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3357  type II secretion system protein  24.76 
 
 		 327 aa  69.7  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3796  type II secretion system protein  28.02 
 
 		 325 aa  69.7  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.472243  normal  0.57339 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4481  type II secretion system protein  23.86 
 
 		 328 aa  68.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0602  type II secretion system protein  23.03 
 
 		 323 aa  67  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0897257  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2694  type II secretion system protein  25.68 
 
 		 320 aa  67  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0728  type II secretion system protein  25.11 
 
 		 333 aa  67  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.552842  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0212  component of type IV pilus  24.73 
 
 		 326 aa  67  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3718  type II secretion system protein  22.57 
 
 		 324 aa  66.6  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.202594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2832  type II secretion system protein  26.11 
 
 		 319 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.151252  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4193  type II secretion system protein  23.56 
 
 		 328 aa  66.6  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5120  type II secretion system protein  23.9 
 
 		 321 aa  66.2  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.229641  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1053  type II secretion system protein  24.75 
 
 		 302 aa  66.2  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1517  hypothetical protein  25.35 
 
 		 320 aa  65.9  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.205257  normal  0.198842 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1813  type II secretion system protein  23 
 
 		 426 aa  64.3  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00328504  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1754  type II secretion system protein  23.88 
 
 		 295 aa  63.9  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00143607  normal  0.105402 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2351  type II secretion system protein  21.69 
 
 		 323 aa  62.8  0.000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.357093 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3011  type II secretion system protein  24.71 
 
 		 319 aa  62.8  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0300  type II secretion system protein  22.56 
 
 		 323 aa  62.8  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0653  TadC protein  25.56 
 
 		 313 aa  62.8  0.000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.179736 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0992  type II secretion system protein  26.83 
 
 		 326 aa  62.4  0.000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.236675  normal  0.765371 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2016  type II secretion system protein  26.32 
 
 		 307 aa  62.4  0.000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4619  type II secretion system protein  22.91 
 
 		 318 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.340215 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1890  type II secretion system protein  25 
 
 		 314 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2046  putative fimbriae-related membrane protein  25 
 
 		 314 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0336894  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2454  type II secretion system protein F  24.38 
 
 		 290 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0182293  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1675  type II secretion system protein F  25 
 
 		 314 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0331  type II secretion system protein F  25 
 
 		 314 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0097112  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0830  type II secretion system protein F  25 
 
 		 314 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.288216  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1075  type II secretion system protein  23.21 
 
 		 335 aa  61.6  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.137371  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3208  type II secretion system protein  23.08 
 
 		 302 aa  61.6  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.544767 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0552  type II secretion system protein  24.22 
 
 		 326 aa  61.6  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1878  type II secretion system protein  25 
 
 		 314 aa  62  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.650462  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002651  type II/IV secretion system protein TadC associated with Flp pilus assembly  22.34 
 
 		 313 aa  61.6  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2021  type II secretion system protein  23.79 
 
 		 320 aa  61.6  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.477325  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4188  type II secretion system protein  22.93 
 
 		 328 aa  61.6  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1903  putative Flp pilus assembly protein TadC  24.22 
 
 		 326 aa  61.2  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1125  type II secretion system protein  21.1 
 
 		 347 aa  61.2  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.394553  normal  0.522315 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2708  type II secretion system protein  22.38 
 
 		 323 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.68845 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1124  type II secretion system protein  23.33 
 
 		 331 aa  61.2  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0315206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2485  type II secretion system protein  22.38 
 
 		 323 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.28616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2413  type II secretion system protein  23 
 
 		 323 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2047  type II secretion system protein  22.1 
 
 		 318 aa  60.1  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0677944  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4864  type II secretion system protein  21.47 
 
 		 330 aa  60.1  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2352  type II secretion system protein  24.07 
 
 		 313 aa  57.4  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0836815  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2557  type II secretion system protein  22.56 
 
 		 314 aa  57.4  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.59617  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2571  type II secretion system protein  22.56 
 
 		 303 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0900  Type II secretion system F domain protein  20.62 
 
 		 319 aa  57  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0672  type II secretion system protein  20.09 
 
 		 319 aa  57.4  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.139102  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1530  type II secretion system protein  21.69 
 
 		 301 aa  56.6  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1017  von Willebrand factor type A; type II secretion system protein  23.2 
 
 		 643 aa  56.6  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4002  type II secretion system protein  22.96 
 
 		 329 aa  56.2  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0289268  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0639  type II secretion system protein  23.15 
 
 		 323 aa  55.8  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1500  type II secretion system protein  23.98 
 
 		 319 aa  55.8  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.34697  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0650  putative tight adherence TadC-related transmembrane protein  18.8 
 
 		 315 aa  55.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.640477  normal  0.167986 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1916  type II secretion system protein  18.89 
 
 		 312 aa  55.5  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.141806  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0311  type II secretion system protein  22.75 
 
 		 316 aa  55.1  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.563894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2823  type II secretion system protein  23.56 
 
 		 306 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3426  type II secretion system protein  22.89 
 
 		 314 aa  54.3  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.165732  normal  0.426073 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2911  type II secretion system protein  22.62 
 
 		 306 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.604096  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0586  type II secretion system protein  22.4 
 
 		 320 aa  54.7  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.180812  normal  0.546922 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2565  Type II secretion system F domain protein  24.81 
 
 		 299 aa  53.9  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.725543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1107  type II secretion system protein  23.6 
 
 		 323 aa  53.5  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.107682  normal  0.160043 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2736  type II secretion system protein  22.54 
 
 		 326 aa  53.5  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3492  type II secretion system protein  24.58 
 
 		 313 aa  53.5  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.39955  normal  0.0861426 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3964  type II secretion system protein  21.34 
 
 		 314 aa  53.1  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.273183 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2314  type II secretion system protein  21.05 
 
 		 317 aa  53.1  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1754  Flp pilus assembly protein TadC  20.99 
 
 		 326 aa  53.1  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3093  type II secretion system protein  22.49 
 
 		 319 aa  52.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2763  type II secretion system protein  22.84 
 
 		 326 aa  52.4  0.000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.613586 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2118  type II secretion system protein  20.22 
 
 		 310 aa  52.8  0.000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.128736  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1318  type II secretion system protein  22.49 
 
 		 319 aa  52.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2968  type II secretion system protein  22.49 
 
 		 319 aa  52.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1524  type II secretion system protein  21.2 
 
 		 322 aa  52  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2698  type II secretion system protein  21.94 
 
 		 302 aa  52  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2649  type II secretion system protein  21.74 
 
 		 323 aa  50.8  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2276  hypothetical protein  22.98 
 
 		 296 aa  51.6  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0801  type II secretion system protein  19.88 
 
 		 312 aa  51.2  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6364  type II secretion system protein  21.39 
 
 		 324 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1723  type II secretion system protein  20.83 
 
 		 296 aa  50.4  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6776  type II secretion system protein  21.39 
 
 		 324 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.710361  normal  0.399772 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>