252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2565 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_2565  Type II secretion system F domain protein  100 
 
 		 299 aa  576  1.0000000000000001e-163  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.725543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2276  putative integral membrane protein  46.29 
 
 		 273 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.846433  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1399  type II secretion system protein  32.44 
 
 		 299 aa  127  3e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0535811  hitchhiker  0.000124146 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1850  type II secretion system protein  35.51 
 
 		 307 aa  101  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0102974  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2314  type II secretion system protein  27.52 
 
 		 317 aa  92.4  8e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2927  type II secretion system protein  29.91 
 
 		 292 aa  80.5  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0944491  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3212  type II secretion system protein  32.86 
 
 		 311 aa  80.5  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.514288 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4157  type II secretion system protein  29.61 
 
 		 309 aa  77.4  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3118  type II secretion system protein  31.88 
 
 		 304 aa  77  0.0000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.803425  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0992  type II secretion system protein  25.14 
 
 		 326 aa  75.9  0.0000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.236675  normal  0.765371 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6003  type II secretion system protein  35.46 
 
 		 325 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6299  type II secretion system protein  34.59 
 
 		 325 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2650  type II secretion system protein  28.42 
 
 		 294 aa  73.9  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2118  type II secretion system protein  25.65 
 
 		 310 aa  74.3  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.128736  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1107  type II secretion system protein  31.53 
 
 		 323 aa  73.6  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.107682  normal  0.160043 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2115  type II secretion system protein  31.16 
 
 		 279 aa  72  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0552  type II secretion system protein  25.1 
 
 		 326 aa  71.6  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1903  putative Flp pilus assembly protein TadC  25.1 
 
 		 326 aa  71.6  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2641  type II secretion system protein  30.41 
 
 		 291 aa  71.6  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5120  type II secretion system protein  28.96 
 
 		 321 aa  70.9  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.229641  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1276  type II secretion system protein  27.86 
 
 		 311 aa  71.2  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3350  type II secretion system protein  26.69 
 
 		 309 aa  70.9  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1723  type II secretion system protein  26.37 
 
 		 296 aa  70.9  0.00000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3420  Type II secretion system F domain protein  30.13 
 
 		 295 aa  70.9  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.490118  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2640  type II secretion system protein  25.26 
 
 		 316 aa  70.5  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2698  type II secretion system protein  30.77 
 
 		 302 aa  70.1  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0300  type II secretion system protein  25.7 
 
 		 323 aa  70.1  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2763  type II secretion system protein  30.22 
 
 		 326 aa  70.1  0.00000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.613586 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7036  putative pilus assembly protein  29.8 
 
 		 324 aa  69.7  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.452255 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0806  type II secretion system protein  30.37 
 
 		 316 aa  68.9  0.00000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2365  hypothetical protein  29.11 
 
 		 324 aa  68.9  0.00000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.195084  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3525  type II secretion system protein  29.14 
 
 		 324 aa  68.9  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.359223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4002  type II secretion system protein  26.53 
 
 		 329 aa  68.6  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0289268  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4446  type II secretion system protein  27.44 
 
 		 293 aa  68.6  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0044747 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1680  type II secretion system protein  30 
 
 		 311 aa  68.6  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000554602 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1124  type II secretion system protein  29.55 
 
 		 331 aa  67.8  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0315206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5619  type II secretion system protein  25.96 
 
 		 300 aa  67.8  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1779  type II secretion system protein  27.15 
 
 		 324 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.708691  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2557  type II secretion system protein  32.62 
 
 		 314 aa  67.8  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.59617  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2351  type II secretion system protein  28 
 
 		 323 aa  67.8  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.357093 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1499  type II secretion system protein  25.83 
 
 		 321 aa  67.8  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.698875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2353  type II secretion system protein  31.58 
 
 		 323 aa  67  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.173092  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1017  von Willebrand factor type A; type II secretion system protein  28.57 
 
 		 643 aa  67.4  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4205  type II secretion system protein  28.48 
 
 		 324 aa  67  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.125721  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0587  type II secretion system protein  32.54 
 
 		 325 aa  67.4  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.292089  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1813  type II secretion system protein  26.78 
 
 		 426 aa  67  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00328504  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3718  type II secretion system protein  27.81 
 
 		 324 aa  66.6  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.202594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1031  type II secretion system protein  33.04 
 
 		 312 aa  66.6  0.0000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3795  type II secretion system protein  27.38 
 
 		 321 aa  66.2  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1125  type II secretion system protein  25.43 
 
 		 347 aa  66.2  0.0000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.394553  normal  0.522315 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0262  hypothetical protein  21.61 
 
 		 277 aa  66.2  0.0000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000660114  hitchhiker  0.00000173551 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2648  type II secretion system protein  28.31 
 
 		 325 aa  66.2  0.0000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.846327  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1159  Type II secretion system F domain protein  26.53 
 
 		 320 aa  65.9  0.0000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0597  type II secretion system protein  21.61 
 
 		 277 aa  65.9  0.0000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4615  type II secretion system protein  30.77 
 
 		 301 aa  65.5  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3208  type II secretion system protein  27.46 
 
 		 302 aa  65.1  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.544767 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5491  type II secretion system protein  31.06 
 
 		 325 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2935  type II secretion system protein  31.03 
 
 		 294 aa  65.5  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0849088  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6777  type II secretion system protein  31.06 
 
 		 325 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.270969  normal  0.612228 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1500  type II secretion system protein  29.08 
 
 		 319 aa  65.5  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.34697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0710  putative type II secretion system protein F  29.41 
 
 		 287 aa  65.1  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0642  type II secretion system protein  27.57 
 
 		 287 aa  65.5  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5824  type II secretion system protein  29.31 
 
 		 338 aa  65.5  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.993294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0653  TadC protein  28.28 
 
 		 313 aa  64.7  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.179736 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0793  TadC protein  31.03 
 
 		 315 aa  64.3  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7218  type II secretion system protein  25.6 
 
 		 300 aa  64.7  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.329226 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0386  type II secretion system protein  27.81 
 
 		 325 aa  64.7  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0639  type II secretion system protein  30.43 
 
 		 323 aa  65.1  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0602  type II secretion system protein  27.41 
 
 		 323 aa  64.7  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0897257  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6365  type II secretion system protein  31.06 
 
 		 325 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1053  type II secretion system protein  28.93 
 
 		 302 aa  64.3  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3357  type II secretion system protein  29.33 
 
 		 327 aa  64.3  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1831  type II secretion system protein  26.03 
 
 		 304 aa  63.9  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2736  type II secretion system protein  28.87 
 
 		 326 aa  63.5  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6877  type II secretion system protein  26.85 
 
 		 282 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.44202  normal  0.236488 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1043  Type II secretion system F domain protein  28.46 
 
 		 305 aa  63.2  0.000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.809436  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2923  putative type II secretion system protein F  31.03 
 
 		 293 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2021  type II secretion system protein  27.66 
 
 		 320 aa  63.2  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.477325  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1530  type II secretion system protein  25.68 
 
 		 301 aa  62.8  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4193  type II secretion system protein  28.28 
 
 		 328 aa  62.8  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3780  Type II secretion system F domain protein  31.02 
 
 		 275 aa  62.8  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2016  type II secretion system protein  27.7 
 
 		 307 aa  62.8  0.000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0643  type II secretion system protein  27.55 
 
 		 283 aa  62.4  0.000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2365  Flp pilus assembly protein TadB  27.01 
 
 		 325 aa  62.4  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0315564  normal  0.0552567 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0296  type II secretion system protein  27.81 
 
 		 325 aa  62.4  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4619  type II secretion system protein  27.43 
 
 		 318 aa  62  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.340215 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2486  type II secretion system protein  26.23 
 
 		 294 aa  62  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.766494  hitchhiker  0.000200331 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1204  type II secretion system protein  24.1 
 
 		 296 aa  62  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.59428  hitchhiker  0.000000109908 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2649  type II secretion system protein  28.39 
 
 		 323 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1754  Flp pilus assembly protein TadC  27.86 
 
 		 326 aa  61.6  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7193  putative Flp pilus assembly protein TadC  32.71 
 
 		 324 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.202721  normal  0.456008 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2694  type II secretion system protein  31.41 
 
 		 320 aa  61.2  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0238  type II secretion system protein  23.89 
 
 		 322 aa  61.2  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0640  type II secretion system protein  27.12 
 
 		 325 aa  61.2  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.295246 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5490  type II secretion system protein  31.58 
 
 		 324 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2364  putative putative tight adherence TadC-like transmembrane protein  29.5 
 
 		 321 aa  61.2  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00226483  normal  0.0303282 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0212  component of type IV pilus  26.74 
 
 		 326 aa  61.2  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0746  type II secretion system protein  25.1 
 
 		 287 aa  61.6  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.271129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6364  type II secretion system protein  31.58 
 
 		 324 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2968  type II secretion system protein  29.14 
 
 		 319 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>