196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_1204 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_1204  type II secretion system protein  100 
 
 
296 aa  592  1e-168  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.59428  hitchhiker  0.000000109908 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3212  type II secretion system protein  37.28 
 
 
311 aa  126  3e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.514288 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2365  hypothetical protein  37.13 
 
 
324 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.195084  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1276  type II secretion system protein  33.92 
 
 
311 aa  116  6e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2557  type II secretion system protein  37.97 
 
 
314 aa  115  8.999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.59617  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1530  type II secretion system protein  39.16 
 
 
301 aa  115  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1159  Type II secretion system F domain protein  34.78 
 
 
320 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2736  type II secretion system protein  35.33 
 
 
326 aa  114  3e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2649  type II secretion system protein  34.69 
 
 
323 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0639  type II secretion system protein  34.18 
 
 
323 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2118  type II secretion system protein  35.71 
 
 
310 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.128736  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4619  type II secretion system protein  35.85 
 
 
318 aa  110  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.340215 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3420  Type II secretion system F domain protein  34.91 
 
 
295 aa  109  6e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.490118  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0586  type II secretion system protein  37.29 
 
 
320 aa  108  8.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.180812  normal  0.546922 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0650  putative tight adherence TadC-related transmembrane protein  37.06 
 
 
315 aa  107  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.640477  normal  0.167986 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2650  type II secretion system protein  36.84 
 
 
294 aa  105  8e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1680  type II secretion system protein  33.92 
 
 
311 aa  105  8e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000554602 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2352  type II secretion system protein  34.34 
 
 
313 aa  105  1e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0836815  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2276  hypothetical protein  34.34 
 
 
296 aa  105  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2641  type II secretion system protein  33.14 
 
 
291 aa  105  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1017  von Willebrand factor type A; type II secretion system protein  33.71 
 
 
643 aa  105  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3093  type II secretion system protein  34.34 
 
 
319 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4446  type II secretion system protein  29.02 
 
 
293 aa  103  3e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0044747 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1318  type II secretion system protein  34.34 
 
 
319 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2968  type II secretion system protein  34.34 
 
 
319 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2763  type II secretion system protein  28.57 
 
 
326 aa  102  6e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.613586 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1107  type II secretion system protein  32.93 
 
 
323 aa  102  6e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.107682  normal  0.160043 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1850  type II secretion system protein  31.52 
 
 
307 aa  102  6e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0102974  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2021  type II secretion system protein  29.9 
 
 
320 aa  102  8e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.477325  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3208  type II secretion system protein  31.84 
 
 
302 aa  102  9e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.544767 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0543  type II secretion system protein  33.33 
 
 
313 aa  101  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0603407  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1053  type II secretion system protein  32.65 
 
 
302 aa  101  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0653  TadC protein  35.37 
 
 
313 aa  101  2e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.179736 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2314  type II secretion system protein  33.54 
 
 
317 aa  101  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1500  type II secretion system protein  33.54 
 
 
319 aa  100  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.34697  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3011  type II secretion system protein  36.14 
 
 
319 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2823  type II secretion system protein  34.76 
 
 
306 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0728  type II secretion system protein  35.67 
 
 
333 aa  100  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.552842  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2698  type II secretion system protein  34.81 
 
 
302 aa  99.8  5e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2364  putative putative tight adherence TadC-like transmembrane protein  30 
 
 
321 aa  99.4  6e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00226483  normal  0.0303282 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2927  type II secretion system protein  31.56 
 
 
292 aa  99.8  6e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0944491  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2911  type II secretion system protein  34.76 
 
 
306 aa  99.8  6e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.604096  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002651  type II/IV secretion system protein TadC associated with Flp pilus assembly  32.92 
 
 
313 aa  99  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4205  type II secretion system protein  29.02 
 
 
324 aa  98.6  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.125721  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0249  type II secretion system protein  33.53 
 
 
313 aa  99  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.876214 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4002  type II secretion system protein  33.14 
 
 
329 aa  97.4  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0289268  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7036  putative pilus assembly protein  29.9 
 
 
324 aa  97.8  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.452255 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5120  type II secretion system protein  33.93 
 
 
321 aa  97.1  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.229641  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7193  putative Flp pilus assembly protein TadC  35.26 
 
 
324 aa  96.7  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.202721  normal  0.456008 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2935  type II secretion system protein  35.98 
 
 
294 aa  96.7  4e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0849088  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0806  type II secretion system protein  32.06 
 
 
316 aa  96.7  4e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2413  type II secretion system protein  34.81 
 
 
323 aa  96.3  5e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0801  type II secretion system protein  33.74 
 
 
312 aa  95.9  8e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5490  type II secretion system protein  35.03 
 
 
324 aa  95.9  8e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6776  type II secretion system protein  35.03 
 
 
324 aa  95.9  8e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.710361  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3357  type II secretion system protein  34.95 
 
 
327 aa  95.9  8e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3964  type II secretion system protein  33.73 
 
 
314 aa  95.9  8e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.273183 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6364  type II secretion system protein  36.05 
 
 
324 aa  95.5  9e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0602  type II secretion system protein  32.91 
 
 
323 aa  95.1  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0897257  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4615  type II secretion system protein  35.93 
 
 
301 aa  95.1  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6300  type II secretion system protein  35.39 
 
 
323 aa  95.5  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.923016 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3795  type II secretion system protein  34.59 
 
 
321 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0300  type II secretion system protein  27.54 
 
 
323 aa  95.5  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1124  type II secretion system protein  31.76 
 
 
331 aa  94.4  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0315206  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0793  TadC protein  33.15 
 
 
315 aa  94.4  2e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4188  type II secretion system protein  30.28 
 
 
328 aa  94.4  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4481  type II secretion system protein  34.59 
 
 
328 aa  94.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6004  type II secretion system protein  34.08 
 
 
324 aa  94.4  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3796  type II secretion system protein  33.53 
 
 
325 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.472243  normal  0.57339 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3118  type II secretion system protein  31.71 
 
 
304 aa  94  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.803425  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2379  type II secretion system protein  28.16 
 
 
321 aa  94  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.306938  normal  0.924554 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1125  type II secretion system protein  34.66 
 
 
347 aa  93.2  4e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.394553  normal  0.522315 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2571  type II secretion system protein  33.94 
 
 
303 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0238  type II secretion system protein  34.78 
 
 
322 aa  92.8  6e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1524  type II secretion system protein  34.59 
 
 
322 aa  92.8  7e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3718  type II secretion system protein  32.5 
 
 
324 aa  92.4  7e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.202594  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2923  putative type II secretion system protein F  29.89 
 
 
293 aa  92.4  8e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4864  type II secretion system protein  36.25 
 
 
330 aa  92.4  8e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4193  type II secretion system protein  33.96 
 
 
328 aa  92  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0552  type II secretion system protein  26.57 
 
 
326 aa  92  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1916  type II secretion system protein  29.7 
 
 
312 aa  91.3  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.141806  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1903  putative Flp pilus assembly protein TadC  26.57 
 
 
326 aa  91.3  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2832  type II secretion system protein  32.52 
 
 
319 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.151252  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3525  type II secretion system protein  35.85 
 
 
324 aa  91.3  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.359223  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0212  component of type IV pilus  33.33 
 
 
326 aa  91.3  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1831  type II secretion system protein  32.91 
 
 
304 aa  90.9  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1754  Flp pilus assembly protein TadC  29.59 
 
 
326 aa  90.5  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2696  type II secretion system protein  33.73 
 
 
301 aa  90.9  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0581937  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2485  type II secretion system protein  32.91 
 
 
323 aa  90.1  4e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.28616  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1779  type II secretion system protein  34.59 
 
 
324 aa  90.1  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.708691  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2708  type II secretion system protein  32.91 
 
 
323 aa  90.1  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.68845 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0424  type II secretion system protein  32.3 
 
 
331 aa  89.7  5e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.628499  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3350  type II secretion system protein  33.14 
 
 
309 aa  89.7  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0296  type II secretion system protein  34.18 
 
 
325 aa  89.4  6e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4157  type II secretion system protein  33.14 
 
 
309 aa  89.4  6e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2486  type II secretion system protein  33.33 
 
 
294 aa  89  8e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.766494  hitchhiker  0.000200331 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1043  Type II secretion system F domain protein  38.01 
 
 
305 aa  89  8e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.809436  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0992  type II secretion system protein  28.18 
 
 
326 aa  87.8  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.236675  normal  0.765371 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0386  type II secretion system protein  31.16 
 
 
325 aa  88.2  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2351  type II secretion system protein  28.74 
 
 
323 aa  86.3  5e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.357093 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>