222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2935 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_2935  type II secretion system protein  100 
 
 		 294 aa  574  1.0000000000000001e-163  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0849088  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2650  type II secretion system protein  73.47 
 
 		 294 aa  413  1e-114  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2927  type II secretion system protein  61.3 
 
 		 292 aa  325  7e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0944491  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2641  type II secretion system protein  51.71 
 
 		 291 aa  286  2.9999999999999996e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4446  type II secretion system protein  59.64 
 
 		 293 aa  274  1.0000000000000001e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0044747 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3420  Type II secretion system F domain protein  54.01 
 
 		 295 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.490118  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1850  type II secretion system protein  46.46 
 
 		 307 aa  191  1e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0102974  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3118  type II secretion system protein  40.37 
 
 		 304 aa  173  1.9999999999999998e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.803425  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2314  type II secretion system protein  45.5 
 
 		 317 aa  167  2e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3212  type II secretion system protein  40.95 
 
 		 311 aa  160  3e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.514288 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2118  type II secretion system protein  39.22 
 
 		 310 aa  159  4e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.128736  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1276  type II secretion system protein  43.11 
 
 		 311 aa  151  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1680  type II secretion system protein  43.11 
 
 		 311 aa  145  9e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000554602 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1043  Type II secretion system F domain protein  39.5 
 
 		 305 aa  135  9.999999999999999e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.809436  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1017  von Willebrand factor type A; type II secretion system protein  40.85 
 
 		 643 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2365  hypothetical protein  37.68 
 
 		 324 aa  132  6e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.195084  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1159  Type II secretion system F domain protein  38.51 
 
 		 320 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1500  type II secretion system protein  37.5 
 
 		 319 aa  129  7.000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.34697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2698  type II secretion system protein  35.07 
 
 		 302 aa  126  5e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1107  type II secretion system protein  35.53 
 
 		 323 aa  126  5e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.107682  normal  0.160043 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0653  TadC protein  37.5 
 
 		 313 aa  124  1e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.179736 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0806  type II secretion system protein  35.98 
 
 		 316 aa  122  5e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2352  type II secretion system protein  37.65 
 
 		 313 aa  122  7e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0836815  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2763  type II secretion system protein  38.34 
 
 		 326 aa  122  7e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.613586 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1916  type II secretion system protein  38.51 
 
 		 312 aa  121  9.999999999999999e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.141806  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0746  type II secretion system protein  39.49 
 
 		 287 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.271129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0710  putative type II secretion system protein F  42.95 
 
 		 287 aa  120  3e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4188  type II secretion system protein  37.44 
 
 		 328 aa  119  4.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4157  type II secretion system protein  42.13 
 
 		 309 aa  119  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4615  type II secretion system protein  43.04 
 
 		 301 aa  119  7e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3350  type II secretion system protein  42.86 
 
 		 309 aa  119  7.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1754  Flp pilus assembly protein TadC  35.76 
 
 		 326 aa  118  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0801  type II secretion system protein  41.36 
 
 		 312 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2557  type II secretion system protein  38.04 
 
 		 314 aa  118  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.59617  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2736  type II secretion system protein  37.7 
 
 		 326 aa  117  3e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0642  type II secretion system protein  39.49 
 
 		 287 aa  116  5e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1053  type II secretion system protein  38.01 
 
 		 302 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0793  TadC protein  36.47 
 
 		 315 aa  115  8.999999999999998e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3208  type II secretion system protein  38.01 
 
 		 302 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.544767 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2649  type II secretion system protein  36.81 
 
 		 323 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0639  type II secretion system protein  36.2 
 
 		 323 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2911  type II secretion system protein  34.53 
 
 		 306 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.604096  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4002  type II secretion system protein  35.29 
 
 		 329 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0289268  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5120  type II secretion system protein  30.77 
 
 		 321 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.229641  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3964  type II secretion system protein  35.87 
 
 		 314 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.273183 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2923  putative type II secretion system protein F  38.79 
 
 		 293 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0212  component of type IV pilus  34.95 
 
 		 326 aa  110  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2823  type II secretion system protein  35.58 
 
 		 306 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0249  type II secretion system protein  39.39 
 
 		 313 aa  111  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.876214 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4193  type II secretion system protein  36.11 
 
 		 328 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3011  type II secretion system protein  36.42 
 
 		 319 aa  109  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4619  type II secretion system protein  33.73 
 
 		 318 aa  109  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.340215 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4481  type II secretion system protein  36.67 
 
 		 328 aa  109  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2114  type II secretion system protein  32.29 
 
 		 288 aa  108  8.000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1754  type II secretion system protein  38.92 
 
 		 295 aa  108  1e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00143607  normal  0.105402 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0424  type II secretion system protein  37.65 
 
 		 331 aa  108  1e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.628499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0586  type II secretion system protein  38.04 
 
 		 320 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.180812  normal  0.546922 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1831  type II secretion system protein  35.22 
 
 		 304 aa  108  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3795  type II secretion system protein  30.83 
 
 		 321 aa  106  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1318  type II secretion system protein  33.33 
 
 		 319 aa  106  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4348  type II secretion system protein  36.61 
 
 		 292 aa  106  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2968  type II secretion system protein  33.33 
 
 		 319 aa  106  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2276  hypothetical protein  33.33 
 
 		 296 aa  105  6e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3093  type II secretion system protein  33.33 
 
 		 319 aa  105  6e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0602  type II secretion system protein  35.58 
 
 		 323 aa  105  8e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0897257  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6878  type II secretion system protein  38.04 
 
 		 293 aa  104  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.465681  normal  0.240753 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1075  type II secretion system protein  35.92 
 
 		 335 aa  104  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.137371  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0728  type II secretion system protein  35.09 
 
 		 333 aa  104  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.552842  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7193  putative Flp pilus assembly protein TadC  35.71 
 
 		 324 aa  103  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.202721  normal  0.456008 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1125  type II secretion system protein  36.97 
 
 		 347 aa  103  3e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.394553  normal  0.522315 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3357  type II secretion system protein  34.32 
 
 		 327 aa  103  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1530  type II secretion system protein  35.98 
 
 		 301 aa  102  5e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1204  type II secretion system protein  36.99 
 
 		 296 aa  102  5e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.59428  hitchhiker  0.000000109908 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0650  putative tight adherence TadC-related transmembrane protein  32.73 
 
 		 315 aa  102  7e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.640477  normal  0.167986 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0238  type II secretion system protein  32.99 
 
 		 322 aa  101  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002651  type II/IV secretion system protein TadC associated with Flp pilus assembly  31.05 
 
 		 313 aa  101  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1779  type II secretion system protein  34.55 
 
 		 324 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.708691  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5490  type II secretion system protein  35.53 
 
 		 324 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2694  type II secretion system protein  31.82 
 
 		 320 aa  100  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6776  type II secretion system protein  35.53 
 
 		 324 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.710361  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6364  type II secretion system protein  35.53 
 
 		 324 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0300  type II secretion system protein  31.13 
 
 		 323 aa  101  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4864  type II secretion system protein  36.36 
 
 		 330 aa  100  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2696  type II secretion system protein  36.55 
 
 		 301 aa  99.4  6e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0581937  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0543  type II secretion system protein  31.25 
 
 		 313 aa  99  8e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0603407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1399  type II secretion system protein  34.76 
 
 		 299 aa  99  9e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0535811  hitchhiker  0.000124146 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1524  type II secretion system protein  34.94 
 
 		 322 aa  98.6  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0552  type II secretion system protein  31.58 
 
 		 326 aa  97.4  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2571  type II secretion system protein  36.75 
 
 		 303 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2016  type II secretion system protein  32.93 
 
 		 307 aa  97.4  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1903  putative Flp pilus assembly protein TadC  31.58 
 
 		 326 aa  97.1  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2379  type II secretion system protein  33.33 
 
 		 321 aa  96.7  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.306938  normal  0.924554 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2307  Type II secretion system F domain protein  35.03 
 
 		 298 aa  96.3  6e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2832  type II secretion system protein  33.33 
 
 		 319 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.151252  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0992  type II secretion system protein  32.1 
 
 		 326 aa  95.1  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.236675  normal  0.765371 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0296  type II secretion system protein  31.82 
 
 		 325 aa  93.6  3e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3718  type II secretion system protein  33.5 
 
 		 324 aa  94  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.202594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3525  type II secretion system protein  33.85 
 
 		 324 aa  93.6  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.359223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1124  type II secretion system protein  31.18 
 
 		 331 aa  93.2  5e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0315206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4205  type II secretion system protein  31.55 
 
 		 324 aa  92.8  6e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.125721  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>