269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0586 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_0586  type II secretion system protein  100 
 
 		 320 aa  643    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.180812  normal  0.546922 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0639  type II secretion system protein  71.47 
 
 		 323 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2649  type II secretion system protein  70.85 
 
 		 323 aa  450  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2557  type II secretion system protein  58.15 
 
 		 314 aa  348  7e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.59617  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2968  type II secretion system protein  60.12 
 
 		 319 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1318  type II secretion system protein  60.12 
 
 		 319 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3093  type II secretion system protein  60.12 
 
 		 319 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2276  hypothetical protein  64.38 
 
 		 296 aa  335  7e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7193  putative Flp pilus assembly protein TadC  58.49 
 
 		 324 aa  323  3e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.202721  normal  0.456008 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6364  type II secretion system protein  59.12 
 
 		 324 aa  323  3e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5490  type II secretion system protein  58.49 
 
 		 324 aa  322  7e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6776  type II secretion system protein  58.49 
 
 		 324 aa  322  7e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.710361  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4619  type II secretion system protein  54.14 
 
 		 318 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.340215 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6004  type II secretion system protein  58.02 
 
 		 324 aa  311  7.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2352  type II secretion system protein  54.05 
 
 		 313 aa  310  2.9999999999999997e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0836815  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6300  type II secretion system protein  58.07 
 
 		 323 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.923016 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0801  type II secretion system protein  52.9 
 
 		 312 aa  288  6e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0650  putative tight adherence TadC-related transmembrane protein  50.63 
 
 		 315 aa  281  1e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.640477  normal  0.167986 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0543  type II secretion system protein  52.74 
 
 		 313 aa  275  9e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0603407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5326  type II secretion system protein  52.19 
 
 		 323 aa  260  2e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0355396 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1530  type II secretion system protein  44.34 
 
 		 301 aa  236  5.0000000000000005e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0653  TadC protein  44.57 
 
 		 313 aa  231  1e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.179736 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0806  type II secretion system protein  43.28 
 
 		 316 aa  229  6e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0793  TadC protein  43.73 
 
 		 315 aa  212  4.9999999999999996e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1159  Type II secretion system F domain protein  37.79 
 
 		 320 aa  199  6e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1754  Flp pilus assembly protein TadC  41.6 
 
 		 326 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1916  type II secretion system protein  40.93 
 
 		 312 aa  196  5.000000000000001e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.141806  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3208  type II secretion system protein  38.69 
 
 		 302 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.544767 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1053  type II secretion system protein  37.7 
 
 		 302 aa  191  1e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2736  type II secretion system protein  42.46 
 
 		 326 aa  190  2e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1107  type II secretion system protein  45.13 
 
 		 323 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.107682  normal  0.160043 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3011  type II secretion system protein  43.88 
 
 		 319 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2365  hypothetical protein  39.79 
 
 		 324 aa  185  7e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.195084  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2698  type II secretion system protein  43.57 
 
 		 302 aa  179  7e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2763  type II secretion system protein  39.93 
 
 		 326 aa  175  7e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.613586 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1500  type II secretion system protein  42.06 
 
 		 319 aa  173  2.9999999999999996e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.34697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3964  type II secretion system protein  42.74 
 
 		 314 aa  173  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.273183 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002651  type II/IV secretion system protein TadC associated with Flp pilus assembly  38.87 
 
 		 313 aa  172  5e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1831  type II secretion system protein  40 
 
 		 304 aa  171  1e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1124  type II secretion system protein  37.45 
 
 		 331 aa  163  4.0000000000000004e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0315206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2911  type II secretion system protein  38.89 
 
 		 306 aa  161  1e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.604096  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2364  putative putative tight adherence TadC-like transmembrane protein  35.29 
 
 		 321 aa  160  2e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00226483  normal  0.0303282 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0300  type II secretion system protein  38.56 
 
 		 323 aa  154  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1903  putative Flp pilus assembly protein TadC  38.3 
 
 		 326 aa  153  4e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0552  type II secretion system protein  38.3 
 
 		 326 aa  153  4e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2021  type II secretion system protein  34.04 
 
 		 320 aa  151  1e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.477325  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1524  type II secretion system protein  33.96 
 
 		 322 aa  150  3e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2351  type II secretion system protein  36.36 
 
 		 323 aa  150  3e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.357093 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3212  type II secretion system protein  37.87 
 
 		 311 aa  149  5e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.514288 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0992  type II secretion system protein  35.89 
 
 		 326 aa  149  8e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.236675  normal  0.765371 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2823  type II secretion system protein  36.6 
 
 		 306 aa  146  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1276  type II secretion system protein  35.17 
 
 		 311 aa  145  6e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3357  type II secretion system protein  37.6 
 
 		 327 aa  142  9e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4193  type II secretion system protein  43.85 
 
 		 328 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4481  type II secretion system protein  44.25 
 
 		 328 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2118  type II secretion system protein  42.77 
 
 		 310 aa  140  3e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.128736  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1680  type II secretion system protein  35.59 
 
 		 311 aa  137  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000554602 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0212  component of type IV pilus  42.68 
 
 		 326 aa  136  4e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2641  type II secretion system protein  35.07 
 
 		 291 aa  135  9.999999999999999e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2485  type II secretion system protein  37.11 
 
 		 323 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.28616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2708  type II secretion system protein  37.11 
 
 		 323 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.68845 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0238  type II secretion system protein  35.37 
 
 		 322 aa  132  7.999999999999999e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5120  type II secretion system protein  34.17 
 
 		 321 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.229641  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3420  Type II secretion system F domain protein  43.71 
 
 		 295 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.490118  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0728  type II secretion system protein  41.72 
 
 		 333 aa  130  3e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.552842  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0602  type II secretion system protein  34.57 
 
 		 323 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0897257  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2379  type II secretion system protein  33.91 
 
 		 321 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.306938  normal  0.924554 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3795  type II secretion system protein  40.85 
 
 		 321 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2413  type II secretion system protein  36.61 
 
 		 323 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2016  type II secretion system protein  35.48 
 
 		 307 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2832  type II secretion system protein  33.9 
 
 		 319 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.151252  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4002  type II secretion system protein  40.61 
 
 		 329 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0289268  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4446  type II secretion system protein  36.57 
 
 		 293 aa  127  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0044747 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2454  type II secretion system protein F  36.17 
 
 		 290 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0182293  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1125  type II secretion system protein  43.83 
 
 		 347 aa  126  4.0000000000000003e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.394553  normal  0.522315 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4615  type II secretion system protein  36.36 
 
 		 301 aa  126  5e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2571  type II secretion system protein  36.52 
 
 		 303 aa  125  8.000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1075  type II secretion system protein  42.94 
 
 		 335 aa  125  8.000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.137371  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0296  type II secretion system protein  31.15 
 
 		 325 aa  125  9e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2650  type II secretion system protein  39.88 
 
 		 294 aa  125  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1017  von Willebrand factor type A; type II secretion system protein  39.77 
 
 		 643 aa  125  1e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3525  type II secretion system protein  34.41 
 
 		 324 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.359223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0424  type II secretion system protein  36.67 
 
 		 331 aa  125  1e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.628499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4864  type II secretion system protein  35.62 
 
 		 330 aa  123  5e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2314  type II secretion system protein  39.43 
 
 		 317 aa  123  5e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0386  type II secretion system protein  30.22 
 
 		 325 aa  122  6e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3796  type II secretion system protein  39.52 
 
 		 325 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.472243  normal  0.57339 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1850  type II secretion system protein  33.73 
 
 		 307 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0102974  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1204  type II secretion system protein  37.29 
 
 		 296 aa  119  6e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.59428  hitchhiker  0.000000109908 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1813  type II secretion system protein  29.96 
 
 		 426 aa  119  7.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00328504  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4205  type II secretion system protein  34.55 
 
 		 324 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.125721  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2052  type II secretion system protein  31.82 
 
 		 314 aa  119  9e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000269982  normal  0.0927482 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1779  type II secretion system protein  34.41 
 
 		 324 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.708691  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0311  type II secretion system protein  33.46 
 
 		 316 aa  118  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.563894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2046  putative fimbriae-related membrane protein  35.74 
 
 		 314 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0336894  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1890  type II secretion system protein  35.74 
 
 		 314 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3718  type II secretion system protein  34.07 
 
 		 324 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.202594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1878  type II secretion system protein  35.74 
 
 		 314 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.650462  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1675  type II secretion system protein F  35.74 
 
 		 314 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0331  type II secretion system protein F  35.74 
 
 		 314 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0097112  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>