253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1754 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_1754  type II secretion system protein  100 
 
 
295 aa  589  1e-167  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00143607  normal  0.105402 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1276  type II secretion system protein  33.19 
 
 
311 aa  133  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3212  type II secretion system protein  32.59 
 
 
311 aa  121  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.514288 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0556  type II secretion system protein  29.5 
 
 
313 aa  119  7e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.29749  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1680  type II secretion system protein  32.31 
 
 
311 aa  118  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000554602 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2314  type II secretion system protein  29.63 
 
 
317 aa  116  3.9999999999999997e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2118  type II secretion system protein  30.65 
 
 
310 aa  112  5e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.128736  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4615  type II secretion system protein  35 
 
 
301 aa  112  6e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2641  type II secretion system protein  31.42 
 
 
291 aa  112  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1159  Type II secretion system F domain protein  31.49 
 
 
320 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2698  type II secretion system protein  34.64 
 
 
302 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2935  type II secretion system protein  39.26 
 
 
294 aa  107  3e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0849088  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1916  type II secretion system protein  28.46 
 
 
312 aa  105  7e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.141806  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1017  von Willebrand factor type A; type II secretion system protein  33.71 
 
 
643 aa  105  8e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1850  type II secretion system protein  37.58 
 
 
307 aa  105  8e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0102974  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2650  type II secretion system protein  37.13 
 
 
294 aa  105  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3118  type II secretion system protein  35.58 
 
 
304 aa  104  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.803425  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2694  type II secretion system protein  35.83 
 
 
320 aa  104  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3420  Type II secretion system F domain protein  35.03 
 
 
295 aa  103  5e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.490118  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002651  type II/IV secretion system protein TadC associated with Flp pilus assembly  30.34 
 
 
313 aa  100  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1107  type II secretion system protein  31.05 
 
 
323 aa  99.4  6e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.107682  normal  0.160043 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1125  type II secretion system protein  30.38 
 
 
347 aa  99  8e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.394553  normal  0.522315 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3350  type II secretion system protein  28.62 
 
 
309 aa  97.1  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4446  type II secretion system protein  29.57 
 
 
293 aa  97.1  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0044747 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1043  Type II secretion system F domain protein  33.63 
 
 
305 aa  95.9  7e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.809436  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0880  type II secretion system protein  28.39 
 
 
288 aa  94  3e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4157  type II secretion system protein  26.18 
 
 
309 aa  93.2  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3208  type II secretion system protein  27.92 
 
 
302 aa  93.2  5e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.544767 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5120  type II secretion system protein  33.52 
 
 
321 aa  92.4  8e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.229641  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4481  type II secretion system protein  30.81 
 
 
328 aa  92.4  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2736  type II secretion system protein  30.05 
 
 
326 aa  91.3  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0793  TadC protein  31.75 
 
 
315 aa  91.3  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1053  type II secretion system protein  28.93 
 
 
302 aa  90.9  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1500  type II secretion system protein  31.55 
 
 
319 aa  90.5  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.34697  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0653  TadC protein  26.52 
 
 
313 aa  90.1  4e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.179736 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1831  type II secretion system protein  29.79 
 
 
304 aa  90.1  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3795  type II secretion system protein  28.64 
 
 
321 aa  90.1  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2557  type II secretion system protein  28.63 
 
 
314 aa  90.1  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.59617  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0710  putative type II secretion system protein F  31.28 
 
 
287 aa  90.1  4e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0639  type II secretion system protein  28 
 
 
323 aa  89.7  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0801  type II secretion system protein  30.94 
 
 
312 aa  89.7  6e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0650  putative tight adherence TadC-related transmembrane protein  28.36 
 
 
315 aa  88.6  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.640477  normal  0.167986 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1524  type II secretion system protein  29.34 
 
 
322 aa  89  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2923  putative type II secretion system protein F  30.59 
 
 
293 aa  88.6  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1075  type II secretion system protein  28.63 
 
 
335 aa  87.4  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.137371  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0602  type II secretion system protein  28.35 
 
 
323 aa  88.2  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0897257  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0806  type II secretion system protein  26.07 
 
 
316 aa  87.8  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3357  type II secretion system protein  30.36 
 
 
327 aa  87  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4193  type II secretion system protein  30.36 
 
 
328 aa  87  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06191  hypothetical protein  27.19 
 
 
280 aa  87  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2454  type II secretion system protein F  29.46 
 
 
290 aa  86.7  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0182293  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1124  type II secretion system protein  26.72 
 
 
331 aa  85.1  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0315206  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2351  type II secretion system protein  30.72 
 
 
323 aa  85.5  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.357093 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0212  component of type IV pilus  30.34 
 
 
326 aa  85.1  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2649  type II secretion system protein  29.03 
 
 
323 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2114  type II secretion system protein  33.96 
 
 
288 aa  84.3  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0586  type II secretion system protein  30.04 
 
 
320 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.180812  normal  0.546922 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2763  type II secretion system protein  28.19 
 
 
326 aa  84.3  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.613586 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2927  type II secretion system protein  35.62 
 
 
292 aa  84.3  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0944491  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2365  hypothetical protein  29.21 
 
 
324 aa  84  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.195084  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0642  type II secretion system protein  29.44 
 
 
287 aa  84  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1517  hypothetical protein  32.2 
 
 
320 aa  83.6  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.205257  normal  0.198842 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20330  Flp pilus assembly protein TadC  32.08 
 
 
205 aa  83.6  0.000000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.400927  normal  0.182713 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0992  type II secretion system protein  25.28 
 
 
326 aa  82.8  0.000000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.236675  normal  0.765371 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3796  type II secretion system protein  28.8 
 
 
325 aa  82.4  0.000000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.472243  normal  0.57339 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2832  type II secretion system protein  28.4 
 
 
319 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.151252  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7193  putative Flp pilus assembly protein TadC  31.4 
 
 
324 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.202721  normal  0.456008 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2016  type II secretion system protein  30.43 
 
 
307 aa  82  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0746  type II secretion system protein  27.73 
 
 
287 aa  82  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.271129  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2352  type II secretion system protein  31.33 
 
 
313 aa  81.3  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0836815  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2486  type II secretion system protein  27.78 
 
 
294 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.766494  hitchhiker  0.000200331 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0424  type II secretion system protein  27.31 
 
 
331 aa  81.3  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.628499  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4348  type II secretion system protein  29.09 
 
 
292 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2379  type II secretion system protein  27.78 
 
 
321 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.306938  normal  0.924554 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0610  type II secretion system protein  28.81 
 
 
281 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6364  type II secretion system protein  30.42 
 
 
324 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5490  type II secretion system protein  30.42 
 
 
324 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6776  type II secretion system protein  30.42 
 
 
324 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.710361  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4188  type II secretion system protein  26.04 
 
 
328 aa  79  0.00000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1032  type II secretion system protein  31.11 
 
 
204 aa  78.6  0.0000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6878  type II secretion system protein  28.99 
 
 
293 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.465681  normal  0.240753 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0296  type II secretion system protein  28.57 
 
 
325 aa  77  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0830  type II secretion system protein F  28.68 
 
 
314 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.288216  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2046  putative fimbriae-related membrane protein  28.68 
 
 
314 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0336894  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2276  hypothetical protein  29 
 
 
296 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4002  type II secretion system protein  31.58 
 
 
329 aa  77.4  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0289268  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1675  type II secretion system protein F  28.68 
 
 
314 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0249  type II secretion system protein  29.33 
 
 
313 aa  77.4  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.876214 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0331  type II secretion system protein F  28.68 
 
 
314 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0097112  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2047  type II secretion system protein  28.02 
 
 
318 aa  77  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0677944  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1890  type II secretion system protein  28.68 
 
 
314 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2413  type II secretion system protein  27.84 
 
 
323 aa  77  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4864  type II secretion system protein  30.46 
 
 
330 aa  76.6  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1318  type II secretion system protein  29.73 
 
 
319 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1018  type II secretion system protein  33.59 
 
 
336 aa  76.3  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2968  type II secretion system protein  29.73 
 
 
319 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2708  type II secretion system protein  29.55 
 
 
323 aa  76.6  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.68845 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2485  type II secretion system protein  29.55 
 
 
323 aa  76.6  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.28616  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3093  type II secretion system protein  29.73 
 
 
319 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1878  type II secretion system protein  28.74 
 
 
314 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.650462  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>