More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3118 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_3118  type II secretion system protein  100 
 
 
304 aa  585  1e-166  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.803425  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1850  type II secretion system protein  48.79 
 
 
307 aa  227  2e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0102974  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3212  type II secretion system protein  38.56 
 
 
311 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.514288 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4446  type II secretion system protein  43.66 
 
 
293 aa  195  7e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0044747 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2935  type II secretion system protein  42.8 
 
 
294 aa  189  5e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0849088  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2118  type II secretion system protein  37.1 
 
 
310 aa  186  3e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.128736  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2314  type II secretion system protein  40.24 
 
 
317 aa  184  2.0000000000000003e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2641  type II secretion system protein  46.67 
 
 
291 aa  183  4.0000000000000006e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2650  type II secretion system protein  46.03 
 
 
294 aa  180  2e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1276  type II secretion system protein  39.15 
 
 
311 aa  179  7e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3420  Type II secretion system F domain protein  51.14 
 
 
295 aa  174  9.999999999999999e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.490118  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1680  type II secretion system protein  40.54 
 
 
311 aa  172  5.999999999999999e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000554602 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2927  type II secretion system protein  44.4 
 
 
292 aa  170  3e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0944491  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4157  type II secretion system protein  37.79 
 
 
309 aa  166  5e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4615  type II secretion system protein  38.8 
 
 
301 aa  166  5e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3350  type II secretion system protein  37.66 
 
 
309 aa  159  7e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1043  Type II secretion system F domain protein  41.91 
 
 
305 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.809436  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3964  type II secretion system protein  48.5 
 
 
314 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.273183 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1017  von Willebrand factor type A; type II secretion system protein  44.77 
 
 
643 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1107  type II secretion system protein  42.03 
 
 
323 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.107682  normal  0.160043 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1500  type II secretion system protein  41.04 
 
 
319 aa  144  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.34697  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2736  type II secretion system protein  42.46 
 
 
326 aa  144  2e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2698  type II secretion system protein  42.86 
 
 
302 aa  144  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2911  type II secretion system protein  38.56 
 
 
306 aa  142  6e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.604096  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2823  type II secretion system protein  42.22 
 
 
306 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1831  type II secretion system protein  39.9 
 
 
304 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0653  TadC protein  37.33 
 
 
313 aa  138  1e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.179736 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2365  hypothetical protein  40.78 
 
 
324 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.195084  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3011  type II secretion system protein  44.51 
 
 
319 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1159  Type II secretion system F domain protein  31.4 
 
 
320 aa  136  5e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0801  type II secretion system protein  45.4 
 
 
312 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2114  type II secretion system protein  35.94 
 
 
288 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1399  type II secretion system protein  38.14 
 
 
299 aa  132  5e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0535811  hitchhiker  0.000124146 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2557  type II secretion system protein  40.68 
 
 
314 aa  132  5e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.59617  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4188  type II secretion system protein  38.28 
 
 
328 aa  132  6e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2276  hypothetical protein  43.71 
 
 
296 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0806  type II secretion system protein  39.11 
 
 
316 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4481  type II secretion system protein  37.57 
 
 
328 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3093  type II secretion system protein  43.11 
 
 
319 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0639  type II secretion system protein  40.29 
 
 
323 aa  130  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5120  type II secretion system protein  35.71 
 
 
321 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.229641  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2352  type II secretion system protein  44.17 
 
 
313 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0836815  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1318  type II secretion system protein  43.11 
 
 
319 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2968  type II secretion system protein  43.11 
 
 
319 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3208  type II secretion system protein  39.42 
 
 
302 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.544767 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2649  type II secretion system protein  40.58 
 
 
323 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1916  type II secretion system protein  41.71 
 
 
312 aa  128  1.0000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.141806  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0746  type II secretion system protein  34.23 
 
 
287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.271129  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4864  type II secretion system protein  37.56 
 
 
330 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1075  type II secretion system protein  37.28 
 
 
335 aa  127  3e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.137371  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4193  type II secretion system protein  37.89 
 
 
328 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2923  putative type II secretion system protein F  41.14 
 
 
293 aa  125  6e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1754  Flp pilus assembly protein TadC  40.4 
 
 
326 aa  124  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2763  type II secretion system protein  39.56 
 
 
326 aa  124  1e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.613586 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3795  type II secretion system protein  39.64 
 
 
321 aa  124  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0642  type II secretion system protein  33.78 
 
 
287 aa  124  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1053  type II secretion system protein  38.46 
 
 
302 aa  124  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0710  putative type II secretion system protein F  34.26 
 
 
287 aa  124  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0650  putative tight adherence TadC-related transmembrane protein  40.1 
 
 
315 aa  124  3e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.640477  normal  0.167986 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1125  type II secretion system protein  39.41 
 
 
347 aa  123  4e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.394553  normal  0.522315 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0424  type II secretion system protein  39.88 
 
 
331 aa  123  4e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.628499  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0602  type II secretion system protein  36.73 
 
 
323 aa  123  5e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0897257  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6364  type II secretion system protein  40.27 
 
 
324 aa  123  5e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4619  type II secretion system protein  38.29 
 
 
318 aa  122  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.340215 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0793  TadC protein  39.89 
 
 
315 aa  122  6e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5490  type II secretion system protein  40.27 
 
 
324 aa  122  6e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6776  type II secretion system protein  40.27 
 
 
324 aa  122  6e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.710361  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7193  putative Flp pilus assembly protein TadC  39.73 
 
 
324 aa  122  9e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.202721  normal  0.456008 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3357  type II secretion system protein  39.01 
 
 
327 aa  122  9e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2364  putative putative tight adherence TadC-like transmembrane protein  37.69 
 
 
321 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00226483  normal  0.0303282 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0543  type II secretion system protein  41.25 
 
 
313 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0603407  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002651  type II/IV secretion system protein TadC associated with Flp pilus assembly  32.14 
 
 
313 aa  121  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0992  type II secretion system protein  33.73 
 
 
326 aa  120  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.236675  normal  0.765371 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0249  type II secretion system protein  30.6 
 
 
313 aa  121  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.876214 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0212  component of type IV pilus  39.34 
 
 
326 aa  119  4.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1779  type II secretion system protein  33.33 
 
 
324 aa  119  9e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.708691  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1530  type II secretion system protein  40.24 
 
 
301 aa  118  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2021  type II secretion system protein  39.16 
 
 
320 aa  117  3e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.477325  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0728  type II secretion system protein  36.63 
 
 
333 aa  117  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.552842  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3796  type II secretion system protein  39.11 
 
 
325 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.472243  normal  0.57339 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0386  type II secretion system protein  32.33 
 
 
325 aa  116  5e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2486  type II secretion system protein  36.17 
 
 
294 aa  116  5e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.766494  hitchhiker  0.000200331 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3525  type II secretion system protein  33.33 
 
 
324 aa  116  6e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.359223  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0238  type II secretion system protein  38.24 
 
 
322 aa  115  7.999999999999999e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0296  type II secretion system protein  32.58 
 
 
325 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0552  type II secretion system protein  32.32 
 
 
326 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1903  putative Flp pilus assembly protein TadC  32.32 
 
 
326 aa  114  3e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2694  type II secretion system protein  36.63 
 
 
320 aa  114  3e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4002  type II secretion system protein  35.2 
 
 
329 aa  113  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0289268  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1517  hypothetical protein  34.44 
 
 
320 aa  112  6e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.205257  normal  0.198842 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2276  putative integral membrane protein  34.51 
 
 
273 aa  112  9e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.846433  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0300  type II secretion system protein  32.93 
 
 
323 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6878  type II secretion system protein  38.18 
 
 
293 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.465681  normal  0.240753 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2413  type II secretion system protein  39.31 
 
 
323 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2696  type II secretion system protein  38.06 
 
 
301 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0581937  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3718  type II secretion system protein  32.7 
 
 
324 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.202594  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4348  type II secretion system protein  35.29 
 
 
292 aa  109  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1754  type II secretion system protein  35.2 
 
 
295 aa  109  5e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00143607  normal  0.105402 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2485  type II secretion system protein  34.3 
 
 
323 aa  108  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.28616  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1124  type II secretion system protein  32.53 
 
 
331 aa  108  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0315206  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>