225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0610 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0610  type II secretion system protein  100 
 
 		 281 aa  566  1e-160  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06191  hypothetical protein  53.74 
 
 		 280 aa  321  8e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03347  hypothetical protein  61.45 
 
 		 187 aa  234  2.0000000000000002e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0374  type II secretion system protein F  44.31 
 
 		 292 aa  219  3.9999999999999997e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.249846  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0262  hypothetical protein  37.57 
 
 		 277 aa  133  3e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000660114  hitchhiker  0.00000173551 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0597  type II secretion system protein  36.99 
 
 		 277 aa  132  6e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0680  type II secretion system protein  36.99 
 
 		 277 aa  132  6e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.532814  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2016  type II secretion system protein  28.7 
 
 		 307 aa  98.6  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0311  type II secretion system protein  28.08 
 
 		 316 aa  94.4  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.563894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0728  type II secretion system protein  29.13 
 
 		 333 aa  90.9  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.552842  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2047  type II secretion system protein  31.06 
 
 		 318 aa  89.4  6e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0677944  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2694  type II secretion system protein  30.05 
 
 		 320 aa  89  9e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0900  Type II secretion system F domain protein  29.28 
 
 		 319 aa  88.2  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0672  type II secretion system protein  29.21 
 
 		 319 aa  88.6  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.139102  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1159  Type II secretion system F domain protein  27.11 
 
 		 320 aa  86.7  4e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2454  type II secretion system protein F  31.15 
 
 		 290 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0182293  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1107  type II secretion system protein  28.28 
 
 		 323 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.107682  normal  0.160043 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2046  putative fimbriae-related membrane protein  35.2 
 
 		 314 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0336894  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0639  type II secretion system protein  28.01 
 
 		 323 aa  84.7  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1675  type II secretion system protein F  35.2 
 
 		 314 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0331  type II secretion system protein F  35.2 
 
 		 314 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0097112  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1878  type II secretion system protein  35.2 
 
 		 314 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.650462  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1890  type II secretion system protein  35.2 
 
 		 314 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0830  type II secretion system protein F  35.2 
 
 		 314 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.288216  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1813  type II secretion system protein  25.73 
 
 		 426 aa  84  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00328504  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3933  type II secretion system protein  31.86 
 
 		 314 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0787436  normal  0.204466 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3426  type II secretion system protein  31.86 
 
 		 314 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.165732  normal  0.426073 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2649  type II secretion system protein  28 
 
 		 323 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1723  type II secretion system protein  25.45 
 
 		 296 aa  81.6  0.00000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3492  type II secretion system protein  25 
 
 		 313 aa  81.6  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.39955  normal  0.0861426 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2571  type II secretion system protein  23.77 
 
 		 303 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2641  type II secretion system protein  30.68 
 
 		 291 aa  81.3  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1075  type II secretion system protein  27.95 
 
 		 335 aa  80.1  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.137371  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1125  type II secretion system protein  27.43 
 
 		 347 aa  80.5  0.00000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.394553  normal  0.522315 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1754  type II secretion system protein  28.81 
 
 		 295 aa  80.1  0.00000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00143607  normal  0.105402 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2352  type II secretion system protein  26.84 
 
 		 313 aa  79.7  0.00000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0836815  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2763  type II secretion system protein  27.87 
 
 		 326 aa  80.1  0.00000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.613586 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0238  type II secretion system protein  26.84 
 
 		 322 aa  80.1  0.00000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1754  Flp pilus assembly protein TadC  27.15 
 
 		 326 aa  79.3  0.00000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1530  type II secretion system protein  24.83 
 
 		 301 aa  79  0.00000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1124  type II secretion system protein  27.05 
 
 		 331 aa  78.2  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0315206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2052  type II secretion system protein  28.32 
 
 		 314 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000269982  normal  0.0927482 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0602  type II secretion system protein  28.06 
 
 		 323 aa  78.2  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0897257  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0552  type II secretion system protein  25.59 
 
 		 326 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0300  type II secretion system protein  25.61 
 
 		 323 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1903  putative Flp pilus assembly protein TadC  25.59 
 
 		 326 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3208  type II secretion system protein  25.21 
 
 		 302 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.544767 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2557  type II secretion system protein  27.69 
 
 		 314 aa  77.4  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.59617  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1500  type II secretion system protein  27.65 
 
 		 319 aa  77.4  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.34697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0586  type II secretion system protein  31.06 
 
 		 320 aa  77  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.180812  normal  0.546922 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7193  putative Flp pilus assembly protein TadC  30.08 
 
 		 324 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.202721  normal  0.456008 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4193  type II secretion system protein  31.87 
 
 		 328 aa  77  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4864  type II secretion system protein  27.94 
 
 		 330 aa  77.4  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2911  type II secretion system protein  26.07 
 
 		 306 aa  76.6  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.604096  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1524  type II secretion system protein  26.13 
 
 		 322 aa  76.6  0.0000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0992  type II secretion system protein  26.2 
 
 		 326 aa  76.6  0.0000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.236675  normal  0.765371 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4002  type II secretion system protein  30.66 
 
 		 329 aa  76.6  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0289268  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4481  type II secretion system protein  31.06 
 
 		 328 aa  76.6  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3964  type II secretion system protein  26.84 
 
 		 314 aa  76.6  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.273183 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1318  type II secretion system protein  28.68 
 
 		 319 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2968  type II secretion system protein  28.68 
 
 		 319 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2276  hypothetical protein  28.4 
 
 		 296 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0424  type II secretion system protein  30.71 
 
 		 331 aa  76.3  0.0000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.628499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3795  type II secretion system protein  31.47 
 
 		 321 aa  76.3  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3093  type II secretion system protein  28.68 
 
 		 319 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2118  type II secretion system protein  25.62 
 
 		 310 aa  75.9  0.0000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.128736  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2823  type II secretion system protein  26.87 
 
 		 306 aa  75.5  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0806  type II secretion system protein  26.23 
 
 		 316 aa  75.1  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2314  type II secretion system protein  30.51 
 
 		 317 aa  74.3  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1053  type II secretion system protein  25.61 
 
 		 302 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4188  type II secretion system protein  27.48 
 
 		 328 aa  74.3  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0212  component of type IV pilus  29.71 
 
 		 326 aa  74.3  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002651  type II/IV secretion system protein TadC associated with Flp pilus assembly  24.01 
 
 		 313 aa  74.7  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1517  hypothetical protein  25.62 
 
 		 320 aa  74.3  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.205257  normal  0.198842 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3357  type II secretion system protein  32.87 
 
 		 327 aa  73.9  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1779  type II secretion system protein  27.5 
 
 		 324 aa  73.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.708691  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3525  type II secretion system protein  26.76 
 
 		 324 aa  72.4  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.359223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2736  type II secretion system protein  27.46 
 
 		 326 aa  72.8  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5490  type II secretion system protein  29.24 
 
 		 324 aa  72  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6776  type II secretion system protein  29.24 
 
 		 324 aa  72  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.710361  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6364  type II secretion system protein  29.24 
 
 		 324 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0801  type II secretion system protein  28.23 
 
 		 312 aa  70.9  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4394  type II secretion system protein  25.82 
 
 		 314 aa  71.2  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2351  type II secretion system protein  31.76 
 
 		 323 aa  70.9  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.357093 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0653  TadC protein  24.11 
 
 		 313 aa  70.1  0.00000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.179736 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2365  hypothetical protein  23.43 
 
 		 324 aa  70.1  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.195084  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1276  type II secretion system protein  27.27 
 
 		 311 aa  69.7  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4205  type II secretion system protein  27.36 
 
 		 324 aa  69.3  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.125721  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2832  type II secretion system protein  27.22 
 
 		 319 aa  69.3  0.00000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.151252  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0386  type II secretion system protein  26.49 
 
 		 325 aa  68.9  0.00000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1680  type II secretion system protein  27.78 
 
 		 311 aa  68.2  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000554602 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3718  type II secretion system protein  30.69 
 
 		 324 aa  68.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.202594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3011  type II secretion system protein  24.37 
 
 		 319 aa  68.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5120  type II secretion system protein  26.73 
 
 		 321 aa  67.8  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.229641  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7036  putative pilus assembly protein  29.7 
 
 		 324 aa  68.2  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.452255 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4619  type II secretion system protein  29.45 
 
 		 318 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.340215 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0650  putative tight adherence TadC-related transmembrane protein  25.7 
 
 		 315 aa  67.4  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.640477  normal  0.167986 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1916  type II secretion system protein  25.53 
 
 		 312 aa  67  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.141806  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20330  Flp pilus assembly protein TadC  26.71 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.400927  normal  0.182713 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0793  TadC protein  27.95 
 
 		 315 aa  66.6  0.0000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>