200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1032 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_1032  type II secretion system protein  100 
 
 		 204 aa  414  9.999999999999999e-116  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13140  Flp pilus assembly protein TadC  45.07 
 
 		 306 aa  125  4.0000000000000003e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20330  Flp pilus assembly protein TadC  39.42 
 
 		 205 aa  115  6e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.400927  normal  0.182713 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3212  type II secretion system protein  38.57 
 
 		 311 aa  99  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.514288 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0539  type II secretion system protein  40 
 
 		 312 aa  92.8  3e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3118  type II secretion system protein  31.79 
 
 		 304 aa  86.7  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.803425  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2641  type II secretion system protein  31.76 
 
 		 291 aa  86.3  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1276  type II secretion system protein  34.29 
 
 		 311 aa  82.8  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2650  type II secretion system protein  31.08 
 
 		 294 aa  82  0.000000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4446  type II secretion system protein  30.41 
 
 		 293 aa  80.9  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0044747 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1850  type II secretion system protein  31.11 
 
 		 307 aa  80.1  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0102974  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4615  type II secretion system protein  37.86 
 
 		 301 aa  80.1  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1754  type II secretion system protein  31.11 
 
 		 295 aa  78.6  0.00000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00143607  normal  0.105402 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1680  type II secretion system protein  35.34 
 
 		 311 aa  79  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000554602 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4157  type II secretion system protein  32.35 
 
 		 309 aa  77.4  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2694  type II secretion system protein  30.67 
 
 		 320 aa  77  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0793  TadC protein  33.78 
 
 		 315 aa  75.5  0.0000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0653  TadC protein  34.56 
 
 		 313 aa  75.1  0.0000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.179736 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2935  type II secretion system protein  29.73 
 
 		 294 aa  74.7  0.0000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0849088  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3350  type II secretion system protein  32.14 
 
 		 309 aa  74.7  0.0000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1159  Type II secretion system F domain protein  26.37 
 
 		 320 aa  73.6  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2118  type II secretion system protein  33.09 
 
 		 310 aa  73.6  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.128736  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2314  type II secretion system protein  29.58 
 
 		 317 aa  73.6  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1053  type II secretion system protein  35.04 
 
 		 302 aa  72.4  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1500  type II secretion system protein  28.05 
 
 		 319 aa  72.4  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.34697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0586  type II secretion system protein  32.45 
 
 		 320 aa  71.6  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.180812  normal  0.546922 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3208  type II secretion system protein  35.04 
 
 		 302 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.544767 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1916  type II secretion system protein  25.17 
 
 		 312 aa  70.9  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.141806  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0639  type II secretion system protein  34.03 
 
 		 323 aa  70.5  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1043  Type II secretion system F domain protein  36.57 
 
 		 305 aa  70.5  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.809436  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2016  type II secretion system protein  30 
 
 		 307 aa  70.1  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2486  type II secretion system protein  28.29 
 
 		 294 aa  68.9  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.766494  hitchhiker  0.000200331 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2698  type II secretion system protein  30.07 
 
 		 302 aa  69.3  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2649  type II secretion system protein  33.33 
 
 		 323 aa  68.9  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3420  Type II secretion system F domain protein  27.7 
 
 		 295 aa  68.9  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.490118  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2365  hypothetical protein  32.19 
 
 		 324 aa  68.6  0.00000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.195084  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2557  type II secretion system protein  28.67 
 
 		 314 aa  67.4  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.59617  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1237  Type II secretion system F domain protein  35.61 
 
 		 309 aa  67.4  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1530  type II secretion system protein  28.96 
 
 		 301 aa  67.8  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1517  hypothetical protein  31.72 
 
 		 320 aa  67.8  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.205257  normal  0.198842 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1399  type II secretion system protein  29.53 
 
 		 299 aa  67.4  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0535811  hitchhiker  0.000124146 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1754  Flp pilus assembly protein TadC  27.21 
 
 		 326 aa  66.6  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2352  type II secretion system protein  31.25 
 
 		 313 aa  67  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0836815  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0801  type II secretion system protein  29.66 
 
 		 312 aa  67  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1017  von Willebrand factor type A; type II secretion system protein  29.29 
 
 		 643 aa  66.6  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0806  type II secretion system protein  30.15 
 
 		 316 aa  66.2  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2763  type II secretion system protein  27.1 
 
 		 326 aa  65.5  0.0000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.613586 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2736  type II secretion system protein  29.17 
 
 		 326 aa  65.5  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1031  type II secretion system protein  37.6 
 
 		 312 aa  65.5  0.0000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1107  type II secretion system protein  28.67 
 
 		 323 aa  65.5  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.107682  normal  0.160043 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1125  type II secretion system protein  31.37 
 
 		 347 aa  64.7  0.0000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.394553  normal  0.522315 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4864  type II secretion system protein  28.71 
 
 		 330 aa  65.1  0.0000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1524  type II secretion system protein  28.21 
 
 		 322 aa  64.7  0.0000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0300  type II secretion system protein  31.62 
 
 		 323 aa  64.7  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0238  type II secretion system protein  27.27 
 
 		 322 aa  64.7  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2823  type II secretion system protein  31.61 
 
 		 306 aa  63.5  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1903  putative Flp pilus assembly protein TadC  30.88 
 
 		 326 aa  62.8  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0552  type II secretion system protein  30.88 
 
 		 326 aa  63.2  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2571  type II secretion system protein  28.78 
 
 		 303 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3964  type II secretion system protein  30.99 
 
 		 314 aa  63.2  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.273183 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0543  type II secretion system protein  29.41 
 
 		 313 aa  62.4  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0603407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0424  type II secretion system protein  28.57 
 
 		 331 aa  62  0.000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.628499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4619  type II secretion system protein  27.92 
 
 		 318 aa  62  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.340215 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2911  type II secretion system protein  30.97 
 
 		 306 aa  61.6  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.604096  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1318  type II secretion system protein  31.94 
 
 		 319 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2968  type II secretion system protein  31.94 
 
 		 319 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1779  type II secretion system protein  23.67 
 
 		 324 aa  60.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.708691  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1075  type II secretion system protein  31.16 
 
 		 335 aa  61.2  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.137371  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2927  type II secretion system protein  29.45 
 
 		 292 aa  61.2  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0944491  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7193  putative Flp pilus assembly protein TadC  32.93 
 
 		 324 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.202721  normal  0.456008 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0386  type II secretion system protein  28.85 
 
 		 325 aa  60.1  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3011  type II secretion system protein  29.71 
 
 		 319 aa  60.5  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1204  type II secretion system protein  29.49 
 
 		 296 aa  60.1  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.59428  hitchhiker  0.000000109908 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0650  putative tight adherence TadC-related transmembrane protein  27.21 
 
 		 315 aa  59.7  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.640477  normal  0.167986 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0296  type II secretion system protein  29.93 
 
 		 325 aa  59.7  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2406  type II secretion system protein  34.13 
 
 		 312 aa  59.3  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0371172 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0602  type II secretion system protein  26.8 
 
 		 323 aa  59.7  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0897257  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4205  type II secretion system protein  26.57 
 
 		 324 aa  59.7  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.125721  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3093  type II secretion system protein  31.25 
 
 		 319 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4188  type II secretion system protein  25.37 
 
 		 328 aa  59.7  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2276  hypothetical protein  31.25 
 
 		 296 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2351  type II secretion system protein  27.89 
 
 		 323 aa  58.9  0.00000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.357093 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0249  type II secretion system protein  28.93 
 
 		 313 aa  58.9  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.876214 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7036  putative pilus assembly protein  27.27 
 
 		 324 aa  58.5  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.452255 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6364  type II secretion system protein  30.99 
 
 		 324 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0992  type II secretion system protein  26.58 
 
 		 326 aa  58.5  0.00000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.236675  normal  0.765371 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3525  type II secretion system protein  26.57 
 
 		 324 aa  58.5  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.359223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5490  type II secretion system protein  30.99 
 
 		 324 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6776  type II secretion system protein  30.99 
 
 		 324 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.710361  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2671  type II secretion system protein  32.82 
 
 		 313 aa  58.2  0.00000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0728  type II secretion system protein  26.02 
 
 		 333 aa  58.2  0.00000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.552842  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3718  type II secretion system protein  26.57 
 
 		 324 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.202594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6300  type II secretion system protein  33.54 
 
 		 323 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.923016 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5120  type II secretion system protein  26.71 
 
 		 321 aa  57.8  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.229641  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06191  hypothetical protein  26.17 
 
 		 280 aa  57.4  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2696  type II secretion system protein  27.46 
 
 		 301 aa  57  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0581937  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002651  type II/IV secretion system protein TadC associated with Flp pilus assembly  28.39 
 
 		 313 aa  57  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0781  type II secretion system protein  35.33 
 
 		 316 aa  55.8  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6004  type II secretion system protein  34.23 
 
 		 324 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1737  type II secretion system protein  32.68 
 
 		 311 aa  55.5  0.0000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>