131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0539 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_0539  type II secretion system protein  100 
 
 		 312 aa  598  1e-170  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13140  Flp pilus assembly protein TadC  45.76 
 
 		 306 aa  186  3e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20330  Flp pilus assembly protein TadC  50.98 
 
 		 205 aa  160  2e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.400927  normal  0.182713 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1032  type II secretion system protein  41.73 
 
 		 204 aa  104  2e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3212  type II secretion system protein  29.46 
 
 		 311 aa  80.5  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.514288 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1754  type II secretion system protein  28.74 
 
 		 295 aa  78.2  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00143607  normal  0.105402 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2314  type II secretion system protein  23.73 
 
 		 317 aa  71.6  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3420  Type II secretion system F domain protein  30.46 
 
 		 295 aa  67.8  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.490118  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1850  type II secretion system protein  28.85 
 
 		 307 aa  67.4  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0102974  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1125  type II secretion system protein  29.45 
 
 		 347 aa  66.2  0.0000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.394553  normal  0.522315 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3118  type II secretion system protein  29.53 
 
 		 304 aa  66.2  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.803425  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0653  TadC protein  27.67 
 
 		 313 aa  65.1  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.179736 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0806  type II secretion system protein  25 
 
 		 316 aa  64.3  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2118  type II secretion system protein  26.67 
 
 		 310 aa  63.2  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.128736  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2641  type II secretion system protein  27.45 
 
 		 291 aa  62.4  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06191  hypothetical protein  23.85 
 
 		 280 aa  61.6  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4446  type II secretion system protein  27.81 
 
 		 293 aa  61.6  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0044747 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0793  TadC protein  28.39 
 
 		 315 aa  60.8  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2698  type II secretion system protein  28.22 
 
 		 302 aa  60.8  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1517  hypothetical protein  26.97 
 
 		 320 aa  60.5  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.205257  normal  0.198842 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4157  type II secretion system protein  28.83 
 
 		 309 aa  60.5  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2694  type II secretion system protein  26.97 
 
 		 320 aa  60.1  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1276  type II secretion system protein  24.34 
 
 		 311 aa  59.7  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4864  type II secretion system protein  29.22 
 
 		 330 aa  58.9  0.00000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2016  type II secretion system protein  26.82 
 
 		 307 aa  58.9  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1075  type II secretion system protein  28.38 
 
 		 335 aa  57.8  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.137371  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0597  type II secretion system protein  24.71 
 
 		 277 aa  57.4  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5824  type II secretion system protein  28.79 
 
 		 338 aa  57.8  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.993294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0262  hypothetical protein  23.38 
 
 		 277 aa  57.4  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000660114  hitchhiker  0.00000173551 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0680  type II secretion system protein  24.73 
 
 		 277 aa  57.4  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.532814  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2571  type II secretion system protein  24.7 
 
 		 303 aa  57  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1159  Type II secretion system F domain protein  23.14 
 
 		 320 aa  56.6  0.0000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1107  type II secretion system protein  25.23 
 
 		 323 aa  56.6  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.107682  normal  0.160043 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1916  type II secretion system protein  25.32 
 
 		 312 aa  56.2  0.0000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.141806  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03347  hypothetical protein  25 
 
 		 187 aa  55.8  0.0000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1680  type II secretion system protein  24.65 
 
 		 311 aa  55.5  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000554602 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4615  type II secretion system protein  25.81 
 
 		 301 aa  55.5  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3350  type II secretion system protein  27.24 
 
 		 309 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1017  von Willebrand factor type A; type II secretion system protein  25.35 
 
 		 643 aa  54.7  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0992  type II secretion system protein  25.28 
 
 		 326 aa  53.5  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.236675  normal  0.765371 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2935  type II secretion system protein  24.66 
 
 		 294 aa  53.5  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0849088  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2557  type II secretion system protein  22.81 
 
 		 314 aa  53.5  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.59617  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1500  type II secretion system protein  24.55 
 
 		 319 aa  53.5  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.34697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0552  type II secretion system protein  24.62 
 
 		 326 aa  53.1  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2114  type II secretion system protein  23.38 
 
 		 288 aa  53.5  0.000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1903  putative Flp pilus assembly protein TadC  24.62 
 
 		 326 aa  53.1  0.000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2650  type II secretion system protein  25.17 
 
 		 294 aa  53.1  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0586  type II secretion system protein  28.73 
 
 		 320 aa  53.1  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.180812  normal  0.546922 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2736  type II secretion system protein  27.44 
 
 		 326 aa  53.1  0.000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0300  type II secretion system protein  25.83 
 
 		 323 aa  52  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0610  type II secretion system protein  23.61 
 
 		 281 aa  52  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0374  type II secretion system protein F  27.04 
 
 		 292 aa  52  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.249846  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2538  hypothetical protein  27.99 
 
 		 373 aa  51.6  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2794  putative tight adherence TadC related transmembrane protein  29.24 
 
 		 337 aa  51.2  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.637104  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3525  type II secretion system protein  25.25 
 
 		 324 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.359223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0424  type II secretion system protein  25.9 
 
 		 331 aa  51.6  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.628499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1772  type II secretion system protein  28.1 
 
 		 340 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.233431  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1053  type II secretion system protein  28.37 
 
 		 302 aa  51.2  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1286  hypothetical protein  28.1 
 
 		 336 aa  50.4  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.220204  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1946  hypothetical protein  28.1 
 
 		 336 aa  50.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000366161  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1754  Flp pilus assembly protein TadC  23.97 
 
 		 326 aa  50.8  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2352  type II secretion system protein  32.58 
 
 		 313 aa  50.8  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0836815  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3208  type II secretion system protein  25.95 
 
 		 302 aa  50.8  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.544767 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2351  type II secretion system protein  26.51 
 
 		 323 aa  50.8  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.357093 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1774  type II secretion system protein  28.1 
 
 		 336 aa  50.4  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.162167  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0121  hypothetical protein  28.1 
 
 		 336 aa  50.4  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00162648  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1793  type II secretion system protein  28.1 
 
 		 336 aa  50.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.105995  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1044  type II secretion system protein  28.1 
 
 		 336 aa  50.4  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0543  type II secretion system protein  32.61 
 
 		 313 aa  50.4  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0603407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0238  type II secretion system protein  25.15 
 
 		 322 aa  50.1  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4188  type II secretion system protein  22.84 
 
 		 328 aa  49.7  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0650  putative tight adherence TadC-related transmembrane protein  32.22 
 
 		 315 aa  49.3  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.640477  normal  0.167986 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0639  type II secretion system protein  23.28 
 
 		 323 aa  49.3  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1813  type II secretion system protein  21.39 
 
 		 426 aa  49.3  0.00008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00328504  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2911  type II secretion system protein  27.12 
 
 		 306 aa  49.3  0.00009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.604096  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0781  type II secretion system protein  27.97 
 
 		 316 aa  48.5  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1779  type II secretion system protein  23.9 
 
 		 324 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.708691  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3787  type II secretion system protein  35.96 
 
 		 295 aa  48.5  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0665963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1728  type II secretion system protein  26.52 
 
 		 330 aa  48.9  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000109718 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4002  type II secretion system protein  21.74 
 
 		 329 aa  47.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0289268  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1525  type II secretion system protein  24.4 
 
 		 332 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.623315  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3964  type II secretion system protein  31.52 
 
 		 314 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.273183 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0386  type II secretion system protein  23.38 
 
 		 325 aa  47.4  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1045  type II secretion system protein  24.4 
 
 		 321 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2927  type II secretion system protein  25 
 
 		 292 aa  47.8  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0944491  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0249  type II secretion system protein  26.67 
 
 		 313 aa  47.4  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.876214 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0311  type II secretion system protein  23.3 
 
 		 316 aa  47.4  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.563894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1501  type II secretion system protein  24.4 
 
 		 332 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000870782 
 
 
-
 
NC_003296  RS02590  putative tight adherence TadC related transmembrane protein  27.65 
 
 		 326 aa  47  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4481  type II secretion system protein  30.23 
 
 		 328 aa  47.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2047  type II secretion system protein  29.35 
 
 		 318 aa  47  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0677944  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0728  type II secretion system protein  22.49 
 
 		 333 aa  47  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.552842  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2364  putative putative tight adherence TadC-like transmembrane protein  24.76 
 
 		 321 aa  47  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00226483  normal  0.0303282 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2649  type II secretion system protein  28.09 
 
 		 323 aa  46.6  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2365  hypothetical protein  29.67 
 
 		 324 aa  47  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.195084  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0602  type II secretion system protein  22.4 
 
 		 323 aa  46.6  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0897257  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2486  type II secretion system protein  25.34 
 
 		 294 aa  46.6  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.766494  hitchhiker  0.000200331 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1657  type II secretion system protein  31.34 
 
 		 336 aa  47  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.374218 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4205  type II secretion system protein  22.44 
 
 		 324 aa  46.6  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.125721  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4193  type II secretion system protein  30.23 
 
 		 328 aa  46.6  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>