124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0781 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0781  type II secretion system protein  100 
 
 		 316 aa  596  1e-169  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5824  type II secretion system protein  76.18 
 
 		 338 aa  456  1e-127  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.993294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1211  Type II secretion system F domain protein  53.14 
 
 		 313 aa  262  4.999999999999999e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1649  type II secretion system protein  51.71 
 
 		 311 aa  262  6e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.2409  hitchhiker  0.00110779 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2406  type II secretion system protein  47.77 
 
 		 312 aa  254  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0371172 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1737  type II secretion system protein  49.52 
 
 		 311 aa  253  3e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2671  type II secretion system protein  47.95 
 
 		 313 aa  245  6.999999999999999e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1031  type II secretion system protein  51.04 
 
 		 312 aa  234  1.0000000000000001e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20400  Flp pilus assembly protein TadB  45.75 
 
 		 314 aa  213  4.9999999999999996e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2789  type II secretion system protein  49.15 
 
 		 315 aa  211  1e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00278324 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10340  Flp pilus assembly protein TadB  49.65 
 
 		 309 aa  210  2e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00075176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1254  type II secretion system protein  45.11 
 
 		 312 aa  203  2e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.23353  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1237  Type II secretion system F domain protein  49.12 
 
 		 309 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07520  Flp pilus assembly protein TadC  45.07 
 
 		 313 aa  190  2e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0858  type II secretion system protein  38.46 
 
 		 311 aa  165  1.0000000000000001e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3787  type II secretion system protein  41.02 
 
 		 295 aa  142  7e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0665963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3212  type II secretion system protein  31.95 
 
 		 311 aa  84.3  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.514288 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2114  type II secretion system protein  26.98 
 
 		 288 aa  78.6  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4615  type II secretion system protein  28.11 
 
 		 301 aa  78.2  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2118  type II secretion system protein  25.6 
 
 		 310 aa  77  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.128736  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0653  TadC protein  27.19 
 
 		 313 aa  75.9  0.0000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.179736 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3350  type II secretion system protein  27.72 
 
 		 309 aa  75.1  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4157  type II secretion system protein  27.82 
 
 		 309 aa  75.5  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1850  type II secretion system protein  29 
 
 		 307 aa  70.9  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0102974  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1107  type II secretion system protein  29.41 
 
 		 323 aa  69.7  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.107682  normal  0.160043 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1017  von Willebrand factor type A; type II secretion system protein  28.3 
 
 		 643 aa  68.2  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2696  type II secretion system protein  31.14 
 
 		 301 aa  68.2  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0581937  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3118  type II secretion system protein  27.45 
 
 		 304 aa  67  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.803425  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2736  type II secretion system protein  29.38 
 
 		 326 aa  67.4  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1276  type II secretion system protein  26.09 
 
 		 311 aa  64.3  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1053  type II secretion system protein  27.98 
 
 		 302 aa  64.3  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0793  TadC protein  26.26 
 
 		 315 aa  63.5  0.000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3208  type II secretion system protein  27.38 
 
 		 302 aa  63.5  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.544767 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0767  Type II secretion system F domain protein  29.61 
 
 		 269 aa  63.5  0.000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2557  type II secretion system protein  26.57 
 
 		 314 aa  62.8  0.000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.59617  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4446  type II secretion system protein  28.25 
 
 		 293 aa  62.8  0.000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0044747 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002651  type II/IV secretion system protein TadC associated with Flp pilus assembly  27.61 
 
 		 313 aa  62.4  0.000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2364  putative putative tight adherence TadC-like transmembrane protein  29.41 
 
 		 321 aa  62  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00226483  normal  0.0303282 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2641  type II secretion system protein  28.51 
 
 		 291 aa  61.6  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1204  type II secretion system protein  27.81 
 
 		 296 aa  61.6  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.59428  hitchhiker  0.000000109908 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3420  Type II secretion system F domain protein  28 
 
 		 295 aa  60.8  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.490118  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2649  type II secretion system protein  27.92 
 
 		 323 aa  60.1  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2365  hypothetical protein  28.14 
 
 		 324 aa  60.1  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.195084  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4864  type II secretion system protein  26.67 
 
 		 330 aa  60.1  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2486  type II secretion system protein  24.09 
 
 		 294 aa  60.1  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.766494  hitchhiker  0.000200331 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1399  type II secretion system protein  28.95 
 
 		 299 aa  59.3  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0535811  hitchhiker  0.000124146 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0639  type II secretion system protein  27.92 
 
 		 323 aa  58.5  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1337  type II secretion system protein  28.05 
 
 		 289 aa  58.5  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2021  type II secretion system protein  27.63 
 
 		 320 aa  58.5  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.477325  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2314  type II secretion system protein  21.43 
 
 		 317 aa  58.9  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2650  type II secretion system protein  26.54 
 
 		 294 aa  58.5  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2352  type II secretion system protein  27.92 
 
 		 313 aa  57.8  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0836815  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1043  Type II secretion system F domain protein  27.24 
 
 		 305 aa  57.8  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.809436  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0806  type II secretion system protein  25.88 
 
 		 316 aa  58.5  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1680  type II secretion system protein  26.32 
 
 		 311 aa  57  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000554602 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4618  type II secretion system protein  30.96 
 
 		 325 aa  57  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.347884 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2763  type II secretion system protein  28 
 
 		 326 aa  56.2  0.0000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.613586 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1032  type II secretion system protein  35.33 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0801  type II secretion system protein  26.54 
 
 		 312 aa  55.8  0.0000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0249  type II secretion system protein  26.62 
 
 		 313 aa  55.8  0.0000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.876214 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2351  type II secretion system protein  26.57 
 
 		 323 aa  55.1  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.357093 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0710  putative type II secretion system protein F  28.57 
 
 		 287 aa  54.7  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1517  hypothetical protein  28.99 
 
 		 320 aa  54.3  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.205257  normal  0.198842 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1159  Type II secretion system F domain protein  21.51 
 
 		 320 aa  54.7  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2565  Type II secretion system F domain protein  29.23 
 
 		 299 aa  55.1  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.725543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2923  putative type II secretion system protein F  26.26 
 
 		 293 aa  54.3  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2698  type II secretion system protein  28.11 
 
 		 302 aa  54.3  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1124  type II secretion system protein  23.14 
 
 		 331 aa  54.3  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0315206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2823  type II secretion system protein  29.56 
 
 		 306 aa  53.9  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2911  type II secretion system protein  29.56 
 
 		 306 aa  53.5  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.604096  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0586  type II secretion system protein  28.57 
 
 		 320 aa  53.5  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.180812  normal  0.546922 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2935  type II secretion system protein  25.68 
 
 		 294 aa  53.1  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0849088  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4348  type II secretion system protein  25.53 
 
 		 292 aa  52.8  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1831  type II secretion system protein  24.76 
 
 		 304 aa  52.8  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2694  type II secretion system protein  29.09 
 
 		 320 aa  52.8  0.000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2016  type II secretion system protein  24.86 
 
 		 307 aa  52.8  0.000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2307  Type II secretion system F domain protein  26.05 
 
 		 298 aa  52  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0300  type II secretion system protein  26.72 
 
 		 323 aa  52  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0672  type II secretion system protein  26.13 
 
 		 319 aa  52  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.139102  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7193  putative Flp pilus assembly protein TadC  26.63 
 
 		 324 aa  50.8  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.202721  normal  0.456008 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3011  type II secretion system protein  28.11 
 
 		 319 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2047  type II secretion system protein  27.01 
 
 		 318 aa  50.8  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0677944  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0992  type II secretion system protein  22.7 
 
 		 326 aa  50.1  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.236675  normal  0.765371 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1125  type II secretion system protein  27.44 
 
 		 347 aa  50.4  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.394553  normal  0.522315 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0424  type II secretion system protein  26.81 
 
 		 331 aa  50.1  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.628499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4188  type II secretion system protein  26.55 
 
 		 328 aa  50.4  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1903  putative Flp pilus assembly protein TadC  25.86 
 
 		 326 aa  50.1  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5490  type II secretion system protein  28 
 
 		 324 aa  50.1  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6776  type II secretion system protein  28 
 
 		 324 aa  50.1  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.710361  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1500  type II secretion system protein  24.36 
 
 		 319 aa  50.1  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.34697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0552  type II secretion system protein  25.86 
 
 		 326 aa  50.1  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2379  type II secretion system protein  24.48 
 
 		 321 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.306938  normal  0.924554 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6364  type II secretion system protein  28 
 
 		 324 aa  50.1  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1754  type II secretion system protein  25.17 
 
 		 295 aa  49.3  0.00007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00143607  normal  0.105402 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1318  type II secretion system protein  27.12 
 
 		 319 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2276  hypothetical protein  27.27 
 
 		 296 aa  48.9  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0900  Type II secretion system F domain protein  26.34 
 
 		 319 aa  48.5  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1813  type II secretion system protein  23.33 
 
 		 426 aa  48.9  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00328504  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2968  type II secretion system protein  27.12 
 
 		 319 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3964  type II secretion system protein  29.05 
 
 		 314 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.273183 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>