160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2406 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_2406  type II secretion system protein  100 
 
 		 312 aa  611  9.999999999999999e-175  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0371172 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2671  type II secretion system protein  70.74 
 
 		 313 aa  426  1e-118  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0781  type II secretion system protein  47.77 
 
 		 316 aa  257  2e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07520  Flp pilus assembly protein TadC  50.69 
 
 		 313 aa  248  9e-65  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1649  type II secretion system protein  46.48 
 
 		 311 aa  237  2e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.2409  hitchhiker  0.00110779 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5824  type II secretion system protein  44.62 
 
 		 338 aa  237  2e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.993294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1031  type II secretion system protein  47.18 
 
 		 312 aa  230  3e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1737  type II secretion system protein  42.58 
 
 		 311 aa  223  4.9999999999999996e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1211  Type II secretion system F domain protein  45.31 
 
 		 313 aa  212  5.999999999999999e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1237  Type II secretion system F domain protein  45.71 
 
 		 309 aa  208  8e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20400  Flp pilus assembly protein TadB  42.67 
 
 		 314 aa  206  4e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1254  type II secretion system protein  43.18 
 
 		 312 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.23353  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0858  type II secretion system protein  41.47 
 
 		 311 aa  197  3e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2789  type II secretion system protein  46.64 
 
 		 315 aa  193  3e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00278324 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10340  Flp pilus assembly protein TadB  42.36 
 
 		 309 aa  187  1e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00075176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3787  type II secretion system protein  45.67 
 
 		 295 aa  150  3e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0665963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1276  type II secretion system protein  27.36 
 
 		 311 aa  101  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3212  type II secretion system protein  28.46 
 
 		 311 aa  95.5  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.514288 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1680  type II secretion system protein  26.47 
 
 		 311 aa  94.7  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000554602 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2114  type II secretion system protein  32.9 
 
 		 288 aa  90.1  4e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2118  type II secretion system protein  30.25 
 
 		 310 aa  89  9e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.128736  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3350  type II secretion system protein  27.68 
 
 		 309 aa  84  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4615  type II secretion system protein  26.26 
 
 		 301 aa  84  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3208  type II secretion system protein  28.42 
 
 		 302 aa  82  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.544767 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1850  type II secretion system protein  28.96 
 
 		 307 aa  80.5  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0102974  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4157  type II secretion system protein  28.21 
 
 		 309 aa  80.1  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1754  Flp pilus assembly protein TadC  28.71 
 
 		 326 aa  79.3  0.00000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2698  type II secretion system protein  29.09 
 
 		 302 aa  78.6  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2641  type II secretion system protein  30.1 
 
 		 291 aa  77.8  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1053  type II secretion system protein  27.27 
 
 		 302 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1159  Type II secretion system F domain protein  27.71 
 
 		 320 aa  76.3  0.0000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2314  type II secretion system protein  24.54 
 
 		 317 aa  75.5  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3118  type II secretion system protein  31.37 
 
 		 304 aa  74.7  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.803425  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002651  type II/IV secretion system protein TadC associated with Flp pilus assembly  25.55 
 
 		 313 aa  74.7  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2486  type II secretion system protein  26.54 
 
 		 294 aa  73.9  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.766494  hitchhiker  0.000200331 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0653  TadC protein  28.82 
 
 		 313 aa  73.2  0.000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.179736 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2365  hypothetical protein  28.57 
 
 		 324 aa  72  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.195084  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2696  type II secretion system protein  28.74 
 
 		 301 aa  72  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0581937  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1124  type II secretion system protein  25.46 
 
 		 331 aa  71.2  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0315206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1107  type II secretion system protein  27.65 
 
 		 323 aa  70.5  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.107682  normal  0.160043 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1831  type II secretion system protein  24.4 
 
 		 304 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1500  type II secretion system protein  27.43 
 
 		 319 aa  69.7  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.34697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0767  Type II secretion system F domain protein  32.47 
 
 		 269 aa  67.8  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0249  type II secretion system protein  27.31 
 
 		 313 aa  67.8  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.876214 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1043  Type II secretion system F domain protein  34.38 
 
 		 305 aa  68.2  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.809436  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0992  type II secretion system protein  25.71 
 
 		 326 aa  67  0.0000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.236675  normal  0.765371 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1017  von Willebrand factor type A; type II secretion system protein  25.32 
 
 		 643 aa  67  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1399  type II secretion system protein  27.85 
 
 		 299 aa  67  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0535811  hitchhiker  0.000124146 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0552  type II secretion system protein  29.08 
 
 		 326 aa  66.6  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2736  type II secretion system protein  28.57 
 
 		 326 aa  66.6  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1204  type II secretion system protein  26.54 
 
 		 296 aa  66.6  0.0000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.59428  hitchhiker  0.000000109908 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3420  Type II secretion system F domain protein  27.06 
 
 		 295 aa  66.6  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.490118  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1903  putative Flp pilus assembly protein TadC  29.08 
 
 		 326 aa  66.6  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2351  type II secretion system protein  24.86 
 
 		 323 aa  66.2  0.0000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.357093 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0300  type II secretion system protein  27.11 
 
 		 323 aa  66.2  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0806  type II secretion system protein  26.63 
 
 		 316 aa  65.9  0.0000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0793  TadC protein  25.44 
 
 		 315 aa  65.5  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2557  type II secretion system protein  27.69 
 
 		 314 aa  65.5  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.59617  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2021  type II secretion system protein  24.38 
 
 		 320 aa  63.5  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.477325  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2650  type II secretion system protein  26.11 
 
 		 294 aa  62.4  0.000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2352  type II secretion system protein  29.53 
 
 		 313 aa  62  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0836815  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4446  type II secretion system protein  24.75 
 
 		 293 aa  61.2  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0044747 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2911  type II secretion system protein  30.59 
 
 		 306 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.604096  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0650  putative tight adherence TadC-related transmembrane protein  29.28 
 
 		 315 aa  60.8  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.640477  normal  0.167986 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2307  Type II secretion system F domain protein  25.48 
 
 		 298 aa  60.8  0.00000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1517  hypothetical protein  28.5 
 
 		 320 aa  60.8  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.205257  normal  0.198842 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3780  Type II secretion system F domain protein  33.83 
 
 		 275 aa  60.8  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4348  type II secretion system protein  26.86 
 
 		 292 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1032  type II secretion system protein  34.13 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3964  type II secretion system protein  29.82 
 
 		 314 aa  59.7  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.273183 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2923  putative type II secretion system protein F  25.64 
 
 		 293 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0543  type II secretion system protein  29.81 
 
 		 313 aa  59.3  0.00000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0603407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2823  type II secretion system protein  30.34 
 
 		 306 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2763  type II secretion system protein  24.85 
 
 		 326 aa  58.9  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.613586 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2935  type II secretion system protein  25.64 
 
 		 294 aa  58.9  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0849088  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4619  type II secretion system protein  26.44 
 
 		 318 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.340215 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0710  putative type II secretion system protein F  26.86 
 
 		 287 aa  58.5  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2364  putative putative tight adherence TadC-like transmembrane protein  26.03 
 
 		 321 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00226483  normal  0.0303282 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2571  type II secretion system protein  23.81 
 
 		 303 aa  56.2  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3426  type II secretion system protein  26.25 
 
 		 314 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.165732  normal  0.426073 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2694  type II secretion system protein  27.27 
 
 		 320 aa  56.2  0.0000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2927  type II secretion system protein  24.26 
 
 		 292 aa  56.2  0.0000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0944491  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0672  type II secretion system protein  26.22 
 
 		 319 aa  55.8  0.0000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.139102  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6878  type II secretion system protein  24.85 
 
 		 293 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.465681  normal  0.240753 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0801  type II secretion system protein  30.72 
 
 		 312 aa  55.5  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1813  type II secretion system protein  23.39 
 
 		 426 aa  54.7  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00328504  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1530  type II secretion system protein  27.27 
 
 		 301 aa  55.1  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0424  type II secretion system protein  28.49 
 
 		 331 aa  54.3  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.628499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2016  type II secretion system protein  25.93 
 
 		 307 aa  55.1  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2115  type II secretion system protein  27.91 
 
 		 279 aa  55.1  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2640  type II secretion system protein  27.23 
 
 		 316 aa  54.7  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0482  hypothetical protein  29.05 
 
 		 193 aa  53.9  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.971848 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3933  type II secretion system protein  26.25 
 
 		 314 aa  53.9  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0787436  normal  0.204466 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2047  type II secretion system protein  28.24 
 
 		 318 aa  53.9  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0677944  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2350  type II secretion system protein  25 
 
 		 322 aa  53.5  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.363474 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1337  type II secretion system protein  25.49 
 
 		 289 aa  53.5  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0728  type II secretion system protein  24.71 
 
 		 333 aa  53.1  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.552842  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0746  type II secretion system protein  23.12 
 
 		 287 aa  53.5  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.271129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0586  type II secretion system protein  26.99 
 
 		 320 aa  53.5  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.180812  normal  0.546922 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4188  type II secretion system protein  30.59 
 
 		 328 aa  53.1  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>