177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1031 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_1031  type II secretion system protein  100 
 
 
312 aa  589  1e-167  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1237  Type II secretion system F domain protein  61.57 
 
 
309 aa  261  1e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2789  type II secretion system protein  57.53 
 
 
315 aa  259  3e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00278324 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0781  type II secretion system protein  51.46 
 
 
316 aa  253  3e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1737  type II secretion system protein  48.86 
 
 
311 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2406  type II secretion system protein  46.3 
 
 
312 aa  244  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0371172 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0858  type II secretion system protein  48 
 
 
311 aa  238  1e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5824  type II secretion system protein  47.25 
 
 
338 aa  223  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.993294  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20400  Flp pilus assembly protein TadB  46.43 
 
 
314 aa  217  2.9999999999999998e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2671  type II secretion system protein  44.79 
 
 
313 aa  216  4e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1649  type II secretion system protein  47.46 
 
 
311 aa  213  3.9999999999999995e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.2409  hitchhiker  0.00110779 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1254  type II secretion system protein  46.58 
 
 
312 aa  201  9.999999999999999e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.23353  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1211  Type II secretion system F domain protein  48.03 
 
 
313 aa  198  7.999999999999999e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07520  Flp pilus assembly protein TadC  45.42 
 
 
313 aa  192  5e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10340  Flp pilus assembly protein TadB  44.83 
 
 
309 aa  169  4e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00075176  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3787  type II secretion system protein  43.49 
 
 
295 aa  161  1e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0665963  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3212  type II secretion system protein  31.06 
 
 
311 aa  101  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.514288 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4157  type II secretion system protein  32.53 
 
 
309 aa  94.7  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3350  type II secretion system protein  33.22 
 
 
309 aa  90.9  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4615  type II secretion system protein  28.43 
 
 
301 aa  87.8  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2118  type II secretion system protein  27.64 
 
 
310 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.128736  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1276  type II secretion system protein  25.17 
 
 
311 aa  85.5  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1680  type II secretion system protein  26.91 
 
 
311 aa  80.9  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000554602 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2314  type II secretion system protein  23.15 
 
 
317 aa  80.1  0.00000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2114  type II secretion system protein  30.28 
 
 
288 aa  78.6  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2641  type II secretion system protein  30.19 
 
 
291 aa  76.6  0.0000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1043  Type II secretion system F domain protein  32.99 
 
 
305 aa  75.9  0.0000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.809436  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002651  type II/IV secretion system protein TadC associated with Flp pilus assembly  28.34 
 
 
313 aa  75.1  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2021  type II secretion system protein  28.63 
 
 
320 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.477325  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0300  type II secretion system protein  27.01 
 
 
323 aa  71.6  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4446  type II secretion system protein  28.72 
 
 
293 aa  70.1  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0044747 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3208  type II secretion system protein  29.45 
 
 
302 aa  69.3  0.00000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.544767 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3118  type II secretion system protein  30.26 
 
 
304 aa  69.3  0.00000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.803425  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1053  type II secretion system protein  30.06 
 
 
302 aa  68.9  0.00000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1850  type II secretion system protein  28.74 
 
 
307 aa  68.9  0.00000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0102974  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0767  Type II secretion system F domain protein  30.41 
 
 
269 aa  69.3  0.00000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1124  type II secretion system protein  25.32 
 
 
331 aa  68.6  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0315206  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2696  type II secretion system protein  34.87 
 
 
301 aa  68.2  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0581937  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3420  Type II secretion system F domain protein  30.06 
 
 
295 aa  67.8  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.490118  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1754  Flp pilus assembly protein TadC  25.22 
 
 
326 aa  67.4  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2276  hypothetical protein  27.96 
 
 
296 aa  67  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0639  type II secretion system protein  28.99 
 
 
323 aa  67  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0586  type II secretion system protein  31.79 
 
 
320 aa  66.2  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.180812  normal  0.546922 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1318  type II secretion system protein  28.57 
 
 
319 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2968  type II secretion system protein  28.57 
 
 
319 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2650  type II secretion system protein  28.03 
 
 
294 aa  65.9  0.0000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1032  type II secretion system protein  37.6 
 
 
204 aa  65.9  0.0000000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3093  type II secretion system protein  28.57 
 
 
319 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2364  putative putative tight adherence TadC-like transmembrane protein  30.08 
 
 
321 aa  65.9  0.0000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00226483  normal  0.0303282 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0249  type II secretion system protein  28.27 
 
 
313 aa  65.5  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.876214 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2935  type II secretion system protein  27.63 
 
 
294 aa  64.7  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0849088  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2557  type II secretion system protein  26.96 
 
 
314 aa  64.3  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.59617  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0552  type II secretion system protein  28.34 
 
 
326 aa  64.3  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2649  type II secretion system protein  28.12 
 
 
323 aa  63.5  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1903  putative Flp pilus assembly protein TadC  28.34 
 
 
326 aa  63.5  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2911  type II secretion system protein  31.03 
 
 
306 aa  63.9  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.604096  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1399  type II secretion system protein  26.34 
 
 
299 aa  63.2  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0535811  hitchhiker  0.000124146 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0653  TadC protein  30 
 
 
313 aa  63.2  0.000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.179736 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1204  type II secretion system protein  25.88 
 
 
296 aa  62.8  0.000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.59428  hitchhiker  0.000000109908 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4455  type II secretion system protein  28.48 
 
 
288 aa  62.4  0.000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.21053 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0801  type II secretion system protein  25.18 
 
 
312 aa  62.4  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3011  type II secretion system protein  28.22 
 
 
319 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1107  type II secretion system protein  28.5 
 
 
323 aa  62  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.107682  normal  0.160043 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2307  Type II secretion system F domain protein  29.96 
 
 
298 aa  61.6  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1337  type II secretion system protein  26.58 
 
 
289 aa  60.5  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3964  type II secretion system protein  32.24 
 
 
314 aa  60.5  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.273183 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2698  type II secretion system protein  26.22 
 
 
302 aa  60.1  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2694  type II secretion system protein  30.07 
 
 
320 aa  60.1  0.00000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1814  type II secretion system protein  27.35 
 
 
285 aa  58.5  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0127821  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0587  type II secretion system protein  30.1 
 
 
325 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.292089  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2763  type II secretion system protein  28.47 
 
 
326 aa  58.9  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.613586 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2486  type II secretion system protein  25 
 
 
294 aa  58.9  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.766494  hitchhiker  0.000200331 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0710  putative type II secretion system protein F  28 
 
 
287 aa  58.5  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1159  Type II secretion system F domain protein  25.77 
 
 
320 aa  58.9  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1499  type II secretion system protein  27.78 
 
 
321 aa  57.4  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.698875  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0806  type II secretion system protein  25.6 
 
 
316 aa  57.4  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1517  hypothetical protein  29.17 
 
 
320 aa  57.4  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.205257  normal  0.198842 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2736  type II secretion system protein  28.65 
 
 
326 aa  56.6  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1017  von Willebrand factor type A; type II secretion system protein  25 
 
 
643 aa  56.6  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1530  type II secretion system protein  28.57 
 
 
301 aa  56.2  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0881  type II secretion system protein  29 
 
 
296 aa  56.2  0.0000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2352  type II secretion system protein  26.99 
 
 
313 aa  56.2  0.0000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0836815  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2927  type II secretion system protein  26.74 
 
 
292 aa  55.8  0.0000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0944491  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2016  type II secretion system protein  30.43 
 
 
307 aa  55.8  0.0000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4619  type II secretion system protein  25.9 
 
 
318 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.340215 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2365  hypothetical protein  27.14 
 
 
324 aa  55.5  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.195084  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2823  type II secretion system protein  30.46 
 
 
306 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0640  type II secretion system protein  29.61 
 
 
325 aa  55.5  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.295246 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06191  hypothetical protein  25.65 
 
 
280 aa  55.5  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2565  Type II secretion system F domain protein  31.74 
 
 
299 aa  55.1  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.725543  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7193  putative Flp pilus assembly protein TadC  25.81 
 
 
324 aa  54.7  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.202721  normal  0.456008 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2275  Flp pilus assembly protein TadB  26.56 
 
 
325 aa  54.7  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0992  type II secretion system protein  25.44 
 
 
326 aa  55.1  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.236675  normal  0.765371 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2648  type II secretion system protein  26.02 
 
 
325 aa  53.5  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.846327  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0793  TadC protein  25.7 
 
 
315 aa  53.5  0.000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6300  type II secretion system protein  27.91 
 
 
323 aa  53.1  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.923016 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1916  type II secretion system protein  27.65 
 
 
312 aa  53.1  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.141806  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5490  type II secretion system protein  25.4 
 
 
324 aa  52.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6776  type II secretion system protein  25.4 
 
 
324 aa  52.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.710361  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0074  type II secretion system protein  26.24 
 
 
315 aa  52.8  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.557722  normal  0.8398 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>