230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0767 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_0767  Type II secretion system F domain protein  100 
 
 
269 aa  527  1e-149  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2314  type II secretion system protein  28.88 
 
 
317 aa  105  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2118  type II secretion system protein  30.08 
 
 
310 aa  104  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.128736  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1276  type II secretion system protein  27.57 
 
 
311 aa  101  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3208  type II secretion system protein  31.01 
 
 
302 aa  94.4  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.544767 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2557  type II secretion system protein  27.95 
 
 
314 aa  93.2  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.59617  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1053  type II secretion system protein  30.89 
 
 
302 aa  92.4  7e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2641  type II secretion system protein  31.03 
 
 
291 aa  92  9e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1107  type II secretion system protein  30.3 
 
 
323 aa  89  7e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.107682  normal  0.160043 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3212  type II secretion system protein  28.64 
 
 
311 aa  89  7e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.514288 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1680  type II secretion system protein  27.71 
 
 
311 aa  88.2  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000554602 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2698  type II secretion system protein  30.16 
 
 
302 aa  86.7  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3118  type II secretion system protein  31.9 
 
 
304 aa  86.7  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.803425  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2736  type II secretion system protein  30.16 
 
 
326 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2486  type II secretion system protein  27.06 
 
 
294 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.766494  hitchhiker  0.000200331 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1850  type II secretion system protein  29.63 
 
 
307 aa  83.2  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0102974  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1500  type II secretion system protein  29.34 
 
 
319 aa  83.2  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.34697  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2365  hypothetical protein  27.6 
 
 
324 aa  82.8  0.000000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.195084  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2650  type II secretion system protein  29.48 
 
 
294 aa  81.3  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1124  type II secretion system protein  25.32 
 
 
331 aa  80.1  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0315206  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4157  type II secretion system protein  27.59 
 
 
309 aa  80.1  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3350  type II secretion system protein  29.37 
 
 
309 aa  79.7  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4446  type II secretion system protein  30.06 
 
 
293 aa  79.3  0.00000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0044747 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2935  type II secretion system protein  26.36 
 
 
294 aa  79.3  0.00000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0849088  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2352  type II secretion system protein  31.1 
 
 
313 aa  77.8  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0836815  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5120  type II secretion system protein  27.78 
 
 
321 aa  77.4  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.229641  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2923  putative type II secretion system protein F  30.86 
 
 
293 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3420  Type II secretion system F domain protein  30.81 
 
 
295 aa  77.8  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.490118  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1831  type II secretion system protein  29.52 
 
 
304 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1159  Type II secretion system F domain protein  23.73 
 
 
320 aa  76.6  0.0000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3795  type II secretion system protein  27.6 
 
 
321 aa  76.3  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2927  type II secretion system protein  28.81 
 
 
292 aa  75.5  0.0000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0944491  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1754  type II secretion system protein  26.11 
 
 
295 aa  75.5  0.0000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00143607  normal  0.105402 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0746  type II secretion system protein  25.77 
 
 
287 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.271129  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0642  type II secretion system protein  25.56 
 
 
287 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1017  von Willebrand factor type A; type II secretion system protein  29.63 
 
 
643 aa  74.3  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0249  type II secretion system protein  26.72 
 
 
313 aa  73.9  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.876214 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0992  type II secretion system protein  26.58 
 
 
326 aa  73.6  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.236675  normal  0.765371 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1916  type II secretion system protein  29.11 
 
 
312 aa  73.2  0.000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.141806  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2114  type II secretion system protein  28.12 
 
 
288 aa  72.8  0.000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2823  type II secretion system protein  32.53 
 
 
306 aa  72.4  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0710  putative type II secretion system protein F  27.34 
 
 
287 aa  72.4  0.000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1779  type II secretion system protein  27.22 
 
 
324 aa  72  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.708691  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3718  type II secretion system protein  26.58 
 
 
324 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.202594  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2911  type II secretion system protein  32.72 
 
 
306 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.604096  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0296  type II secretion system protein  26.88 
 
 
325 aa  70.5  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4205  type II secretion system protein  27.22 
 
 
324 aa  70.5  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.125721  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0300  type II secretion system protein  25.82 
 
 
323 aa  69.7  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2364  hypothetical protein  30.82 
 
 
321 aa  69.3  0.00000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.288668  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4615  type II secretion system protein  26.73 
 
 
301 aa  68.9  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3964  type II secretion system protein  29.55 
 
 
314 aa  69.3  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.273183 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0639  type II secretion system protein  28.74 
 
 
323 aa  68.9  0.00000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0386  type II secretion system protein  26.25 
 
 
325 aa  68.9  0.00000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4619  type II secretion system protein  29.09 
 
 
318 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.340215 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0801  type II secretion system protein  28.51 
 
 
312 aa  68.2  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4348  type II secretion system protein  27.27 
 
 
292 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1018  type II secretion system protein  29.35 
 
 
336 aa  68.6  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1031  type II secretion system protein  30.41 
 
 
312 aa  68.6  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2649  type II secretion system protein  28.24 
 
 
323 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0728  type II secretion system protein  26.36 
 
 
333 aa  67.8  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.552842  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3357  type II secretion system protein  23.79 
 
 
327 aa  67.8  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2351  type II secretion system protein  26.54 
 
 
323 aa  67.8  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.357093 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0424  type II secretion system protein  27.39 
 
 
331 aa  67.4  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.628499  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2671  type II secretion system protein  32.68 
 
 
313 aa  67.4  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2406  type II secretion system protein  32.47 
 
 
312 aa  67.8  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0371172 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3011  type II secretion system protein  27.54 
 
 
319 aa  67.4  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1318  type II secretion system protein  28.82 
 
 
319 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6878  type II secretion system protein  30.06 
 
 
293 aa  67  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.465681  normal  0.240753 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3525  type II secretion system protein  25.95 
 
 
324 aa  67  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.359223  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3093  type II secretion system protein  28.82 
 
 
319 aa  67  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4193  type II secretion system protein  26.51 
 
 
328 aa  67  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2968  type II secretion system protein  28.82 
 
 
319 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1237  Type II secretion system F domain protein  28.85 
 
 
309 aa  66.6  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2276  hypothetical protein  28.82 
 
 
296 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0793  TadC protein  25.44 
 
 
315 aa  66.2  0.0000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2696  type II secretion system protein  28.95 
 
 
301 aa  66.2  0.0000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0581937  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2307  Type II secretion system F domain protein  26.32 
 
 
298 aa  65.9  0.0000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1529  type II secretion system protein  30.51 
 
 
330 aa  65.9  0.0000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1399  type II secretion system protein  29.7 
 
 
299 aa  64.7  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0535811  hitchhiker  0.000124146 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1649  type II secretion system protein  27.45 
 
 
311 aa  64.7  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.2409  hitchhiker  0.00110779 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0552  type II secretion system protein  24.17 
 
 
326 aa  65.1  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2021  type II secretion system protein  26.36 
 
 
320 aa  65.1  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.477325  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5824  type II secretion system protein  29.61 
 
 
338 aa  64.7  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.993294  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1903  putative Flp pilus assembly protein TadC  24.17 
 
 
326 aa  64.3  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2571  type II secretion system protein  26.21 
 
 
303 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0653  TadC protein  25.3 
 
 
313 aa  63.9  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.179736 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1125  type II secretion system protein  26.74 
 
 
347 aa  63.9  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.394553  normal  0.522315 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4481  type II secretion system protein  25.7 
 
 
328 aa  63.9  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0806  type II secretion system protein  25.88 
 
 
316 aa  63.2  0.000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2708  type II secretion system protein  27.11 
 
 
323 aa  63.2  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.68845 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1754  Flp pilus assembly protein TadC  27.44 
 
 
326 aa  63.5  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0781  type II secretion system protein  29.61 
 
 
316 aa  63.2  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2485  type II secretion system protein  27.11 
 
 
323 aa  63.2  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.28616  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2379  type II secretion system protein  26.55 
 
 
321 aa  62.8  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.306938  normal  0.924554 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1075  type II secretion system protein  24.26 
 
 
335 aa  62.8  0.000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.137371  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2763  type II secretion system protein  29.3 
 
 
326 aa  62  0.000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.613586 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7036  putative pilus assembly protein  24.68 
 
 
324 aa  62  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.452255 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1125  type II secretion system protein  28.68 
 
 
322 aa  61.6  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0517135  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4864  type II secretion system protein  23.01 
 
 
330 aa  62  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4002  type II secretion system protein  24.39 
 
 
329 aa  60.1  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0289268  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>