184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2671 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_2671  type II secretion system protein  100 
 
 		 313 aa  610  1e-173  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2406  type II secretion system protein  70.74 
 
 		 312 aa  430  1e-119  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0371172 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0781  type II secretion system protein  47.77 
 
 		 316 aa  255  5e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5824  type II secretion system protein  43.67 
 
 		 338 aa  233  4.0000000000000004e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.993294  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07520  Flp pilus assembly protein TadC  47.18 
 
 		 313 aa  229  5e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1649  type II secretion system protein  45.42 
 
 		 311 aa  226  4e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.2409  hitchhiker  0.00110779 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20400  Flp pilus assembly protein TadB  45.57 
 
 		 314 aa  222  6e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1737  type II secretion system protein  42.31 
 
 		 311 aa  212  5.999999999999999e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1211  Type II secretion system F domain protein  46.13 
 
 		 313 aa  211  1e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1031  type II secretion system protein  44.56 
 
 		 312 aa  207  1e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2789  type II secretion system protein  46.6 
 
 		 315 aa  204  2e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00278324 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1237  Type II secretion system F domain protein  44.33 
 
 		 309 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1254  type II secretion system protein  41.59 
 
 		 312 aa  193  3e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.23353  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0858  type II secretion system protein  38.78 
 
 		 311 aa  184  2.0000000000000003e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10340  Flp pilus assembly protein TadB  41.32 
 
 		 309 aa  182  8.000000000000001e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00075176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3787  type II secretion system protein  42.68 
 
 		 295 aa  154  2e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0665963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1276  type II secretion system protein  29.77 
 
 		 311 aa  93.6  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2118  type II secretion system protein  32.51 
 
 		 310 aa  93.2  5e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.128736  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3212  type II secretion system protein  25.9 
 
 		 311 aa  92.4  9e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.514288 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2114  type II secretion system protein  31.84 
 
 		 288 aa  87.4  3e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4157  type II secretion system protein  31.17 
 
 		 309 aa  84.3  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1850  type II secretion system protein  31.48 
 
 		 307 aa  82.8  0.000000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0102974  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002651  type II/IV secretion system protein TadC associated with Flp pilus assembly  28.57 
 
 		 313 aa  82.4  0.000000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4615  type II secretion system protein  33.74 
 
 		 301 aa  82.4  0.000000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1680  type II secretion system protein  29.32 
 
 		 311 aa  81.3  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000554602 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3350  type II secretion system protein  28.75 
 
 		 309 aa  80.9  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2021  type II secretion system protein  28.1 
 
 		 320 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.477325  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2698  type II secretion system protein  27.83 
 
 		 302 aa  77.8  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2486  type II secretion system protein  29.79 
 
 		 294 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.766494  hitchhiker  0.000200331 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0653  TadC protein  26.91 
 
 		 313 aa  77.4  0.0000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.179736 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2557  type II secretion system protein  29.74 
 
 		 314 aa  76.6  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.59617  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1124  type II secretion system protein  32.11 
 
 		 331 aa  77  0.0000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0315206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2641  type II secretion system protein  30.61 
 
 		 291 aa  76.6  0.0000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2307  Type II secretion system F domain protein  30.29 
 
 		 298 aa  74.3  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2365  hypothetical protein  29.86 
 
 		 324 aa  73.2  0.000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.195084  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1159  Type II secretion system F domain protein  24.68 
 
 		 320 aa  73.2  0.000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1204  type II secretion system protein  30.25 
 
 		 296 aa  72.8  0.000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.59428  hitchhiker  0.000000109908 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2364  putative putative tight adherence TadC-like transmembrane protein  24.6 
 
 		 321 aa  72.8  0.000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00226483  normal  0.0303282 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1043  Type II secretion system F domain protein  34.46 
 
 		 305 aa  72.4  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.809436  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1754  Flp pilus assembly protein TadC  32.34 
 
 		 326 aa  71.6  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1107  type II secretion system protein  29.69 
 
 		 323 aa  70.9  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.107682  normal  0.160043 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3118  type II secretion system protein  30.82 
 
 		 304 aa  70.5  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.803425  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2696  type II secretion system protein  31.41 
 
 		 301 aa  69.7  0.00000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0581937  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2923  putative type II secretion system protein F  28.99 
 
 		 293 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0249  type II secretion system protein  30.65 
 
 		 313 aa  68.9  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.876214 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2650  type II secretion system protein  29.81 
 
 		 294 aa  68.9  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0300  type II secretion system protein  29.17 
 
 		 323 aa  68.9  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1399  type II secretion system protein  29.73 
 
 		 299 aa  68.6  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0535811  hitchhiker  0.000124146 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0992  type II secretion system protein  28 
 
 		 326 aa  67.8  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.236675  normal  0.765371 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0806  type II secretion system protein  26.96 
 
 		 316 aa  67.8  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2351  type II secretion system protein  28.79 
 
 		 323 aa  68.2  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.357093 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0767  Type II secretion system F domain protein  32.68 
 
 		 269 aa  67.8  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1831  type II secretion system protein  26.67 
 
 		 304 aa  66.6  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0552  type II secretion system protein  30.28 
 
 		 326 aa  67  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1903  putative Flp pilus assembly protein TadC  30.28 
 
 		 326 aa  66.6  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2016  type II secretion system protein  28.81 
 
 		 307 aa  66.6  0.0000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2736  type II secretion system protein  32.14 
 
 		 326 aa  66.6  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3011  type II secretion system protein  30.39 
 
 		 319 aa  66.2  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4348  type II secretion system protein  27.38 
 
 		 292 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0793  TadC protein  27.01 
 
 		 315 aa  64.7  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3964  type II secretion system protein  33.19 
 
 		 314 aa  64.3  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.273183 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3420  Type II secretion system F domain protein  28.12 
 
 		 295 aa  64.7  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.490118  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2763  type II secretion system protein  28.14 
 
 		 326 aa  63.9  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.613586 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3426  type II secretion system protein  28.51 
 
 		 314 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.165732  normal  0.426073 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4446  type II secretion system protein  26.83 
 
 		 293 aa  63.5  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0044747 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0650  putative tight adherence TadC-related transmembrane protein  29.1 
 
 		 315 aa  63.2  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.640477  normal  0.167986 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2352  type II secretion system protein  29.53 
 
 		 313 aa  63.2  0.000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0836815  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4619  type II secretion system protein  27.93 
 
 		 318 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.340215 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1017  von Willebrand factor type A; type II secretion system protein  25.32 
 
 		 643 aa  62.8  0.000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2649  type II secretion system protein  29.52 
 
 		 323 aa  62  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0602  type II secretion system protein  26.83 
 
 		 323 aa  61.6  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0897257  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2935  type II secretion system protein  29.38 
 
 		 294 aa  62.4  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0849088  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1500  type II secretion system protein  29.07 
 
 		 319 aa  61.2  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.34697  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0543  type II secretion system protein  30.63 
 
 		 313 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0603407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6878  type II secretion system protein  26.79 
 
 		 293 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.465681  normal  0.240753 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1075  type II secretion system protein  28.11 
 
 		 335 aa  60.5  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.137371  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3933  type II secretion system protein  28.51 
 
 		 314 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0787436  normal  0.204466 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2911  type II secretion system protein  29.7 
 
 		 306 aa  60.5  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.604096  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0586  type II secretion system protein  31.43 
 
 		 320 aa  59.7  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.180812  normal  0.546922 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0746  type II secretion system protein  24.38 
 
 		 287 aa  58.5  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.271129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4002  type II secretion system protein  29.9 
 
 		 329 aa  58.9  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0289268  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4618  type II secretion system protein  30.28 
 
 		 325 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.347884 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1517  hypothetical protein  25.84 
 
 		 320 aa  58.5  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.205257  normal  0.198842 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1032  type II secretion system protein  31.03 
 
 		 204 aa  57.8  0.0000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0710  putative type II secretion system protein F  25.9 
 
 		 287 aa  57.8  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0642  type II secretion system protein  25 
 
 		 287 aa  58.5  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4864  type II secretion system protein  24.76 
 
 		 330 aa  58.2  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2927  type II secretion system protein  27.04 
 
 		 292 aa  57  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0944491  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2694  type II secretion system protein  28.72 
 
 		 320 aa  57  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0801  type II secretion system protein  26.67 
 
 		 312 aa  56.2  0.0000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2454  type II secretion system protein F  27.43 
 
 		 290 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0182293  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0728  type II secretion system protein  25.68 
 
 		 333 aa  56.2  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.552842  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0587  type II secretion system protein  29.41 
 
 		 325 aa  56.2  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.292089  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7193  putative Flp pilus assembly protein TadC  27.16 
 
 		 324 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.202721  normal  0.456008 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2823  type II secretion system protein  28.48 
 
 		 306 aa  56.2  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0238  type II secretion system protein  28.51 
 
 		 322 aa  55.8  0.0000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2276  putative integral membrane protein  32.74 
 
 		 273 aa  55.8  0.0000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.846433  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6364  type II secretion system protein  27.16 
 
 		 324 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5490  type II secretion system protein  27.16 
 
 		 324 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6776  type II secretion system protein  27.16 
 
 		 324 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.710361  normal  0.399772 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>