123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1254 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1254  type II secretion system protein  100 
 
 		 312 aa  588  1e-167  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.23353  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1737  type II secretion system protein  49.01 
 
 		 311 aa  258  1e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0781  type II secretion system protein  44.09 
 
 		 316 aa  220  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1211  Type II secretion system F domain protein  48.38 
 
 		 313 aa  217  2e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2406  type II secretion system protein  42.38 
 
 		 312 aa  215  8e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0371172 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1649  type II secretion system protein  47.18 
 
 		 311 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.2409  hitchhiker  0.00110779 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5824  type II secretion system protein  45.28 
 
 		 338 aa  211  9e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.993294  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2789  type II secretion system protein  51.59 
 
 		 315 aa  211  2e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00278324 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2671  type II secretion system protein  42.18 
 
 		 313 aa  206  5e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1031  type II secretion system protein  49.18 
 
 		 312 aa  202  5e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1237  Type II secretion system F domain protein  56.02 
 
 		 309 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20400  Flp pilus assembly protein TadB  39.74 
 
 		 314 aa  190  2.9999999999999997e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0858  type II secretion system protein  40.45 
 
 		 311 aa  185  1.0000000000000001e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10340  Flp pilus assembly protein TadB  45.64 
 
 		 309 aa  181  2e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00075176  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07520  Flp pilus assembly protein TadC  41.67 
 
 		 313 aa  160  3e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3787  type II secretion system protein  42.11 
 
 		 295 aa  133  3.9999999999999996e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0665963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3212  type II secretion system protein  30.59 
 
 		 311 aa  87  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.514288 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1850  type II secretion system protein  30.36 
 
 		 307 aa  74.7  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0102974  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2763  type II secretion system protein  28.83 
 
 		 326 aa  71.2  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.613586 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3118  type II secretion system protein  29.49 
 
 		 304 aa  71.2  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.803425  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4157  type II secretion system protein  31.35 
 
 		 309 aa  69.7  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1754  Flp pilus assembly protein TadC  31.74 
 
 		 326 aa  69.3  0.00000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3420  Type II secretion system F domain protein  30.54 
 
 		 295 aa  68.9  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.490118  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1276  type II secretion system protein  26.04 
 
 		 311 aa  68.9  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2641  type II secretion system protein  30 
 
 		 291 aa  67.8  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4615  type II secretion system protein  30.61 
 
 		 301 aa  67.4  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1053  type II secretion system protein  28.57 
 
 		 302 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1399  type II secretion system protein  29.9 
 
 		 299 aa  66.6  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0535811  hitchhiker  0.000124146 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3350  type II secretion system protein  31.91 
 
 		 309 aa  66.2  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4446  type II secretion system protein  26.84 
 
 		 293 aa  65.9  0.0000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0044747 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2649  type II secretion system protein  29.09 
 
 		 323 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3208  type II secretion system protein  26.92 
 
 		 302 aa  65.1  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.544767 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2307  Type II secretion system F domain protein  26.15 
 
 		 298 aa  64.7  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0639  type II secretion system protein  28.48 
 
 		 323 aa  63.9  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1204  type II secretion system protein  26.35 
 
 		 296 aa  64.3  0.000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.59428  hitchhiker  0.000000109908 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2486  type II secretion system protein  25.49 
 
 		 294 aa  61.6  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.766494  hitchhiker  0.000200331 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1159  Type II secretion system F domain protein  24.54 
 
 		 320 aa  62.4  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2696  type II secretion system protein  28.85 
 
 		 301 aa  61.6  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0581937  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1680  type II secretion system protein  26.63 
 
 		 311 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000554602 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1032  type II secretion system protein  30.71 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2365  hypothetical protein  28.8 
 
 		 324 aa  60.1  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.195084  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1043  Type II secretion system F domain protein  34.36 
 
 		 305 aa  59.7  0.00000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.809436  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002651  type II/IV secretion system protein TadC associated with Flp pilus assembly  27.81 
 
 		 313 aa  59.3  0.00000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0586  type II secretion system protein  28.48 
 
 		 320 aa  59.3  0.00000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.180812  normal  0.546922 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2736  type II secretion system protein  27.78 
 
 		 326 aa  58.9  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2557  type II secretion system protein  27.17 
 
 		 314 aa  57.8  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.59617  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2698  type II secretion system protein  27.23 
 
 		 302 aa  57.4  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0767  Type II secretion system F domain protein  27.27 
 
 		 269 aa  57.4  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2364  putative putative tight adherence TadC-like transmembrane protein  28.08 
 
 		 321 aa  57  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00226483  normal  0.0303282 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1517  hypothetical protein  28.05 
 
 		 320 aa  56.2  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.205257  normal  0.198842 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1017  von Willebrand factor type A; type II secretion system protein  23.13 
 
 		 643 aa  55.5  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2911  type II secretion system protein  31.01 
 
 		 306 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.604096  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3011  type II secretion system protein  26.79 
 
 		 319 aa  55.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1318  type II secretion system protein  27.22 
 
 		 319 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2968  type II secretion system protein  27.22 
 
 		 319 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7193  putative Flp pilus assembly protein TadC  26.06 
 
 		 324 aa  54.3  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.202721  normal  0.456008 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3093  type II secretion system protein  27.22 
 
 		 319 aa  54.3  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4188  type II secretion system protein  25 
 
 		 328 aa  54.3  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2379  type II secretion system protein  27.86 
 
 		 321 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.306938  normal  0.924554 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2114  type II secretion system protein  24.86 
 
 		 288 aa  53.9  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2021  type II secretion system protein  26.8 
 
 		 320 aa  53.9  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.477325  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2694  type II secretion system protein  28.14 
 
 		 320 aa  53.9  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1530  type II secretion system protein  26.85 
 
 		 301 aa  53.5  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0249  type II secretion system protein  25.83 
 
 		 313 aa  53.5  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.876214 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5490  type II secretion system protein  26.97 
 
 		 324 aa  53.1  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6776  type II secretion system protein  26.97 
 
 		 324 aa  53.1  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.710361  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6364  type II secretion system protein  26.97 
 
 		 324 aa  53.1  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0710  putative type II secretion system protein F  26.07 
 
 		 287 aa  52.8  0.000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0801  type II secretion system protein  26.83 
 
 		 312 aa  52.8  0.000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1524  type II secretion system protein  27.85 
 
 		 322 aa  52.8  0.000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1831  type II secretion system protein  28.66 
 
 		 304 aa  52  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2352  type II secretion system protein  26.32 
 
 		 313 aa  51.2  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0836815  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2276  hypothetical protein  26.11 
 
 		 296 aa  51.2  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2823  type II secretion system protein  29.75 
 
 		 306 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4002  type II secretion system protein  26.7 
 
 		 329 aa  51.2  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0289268  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0424  type II secretion system protein  24.54 
 
 		 331 aa  51.6  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.628499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1107  type II secretion system protein  25.45 
 
 		 323 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.107682  normal  0.160043 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3964  type II secretion system protein  28.82 
 
 		 314 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.273183 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0238  type II secretion system protein  27.98 
 
 		 322 aa  51.6  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0212  component of type IV pilus  25.3 
 
 		 326 aa  51.6  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2276  putative integral membrane protein  30.97 
 
 		 273 aa  50.4  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.846433  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2565  Type II secretion system F domain protein  29.93 
 
 		 299 aa  50.4  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.725543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3718  type II secretion system protein  25.86 
 
 		 324 aa  49.3  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.202594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1337  type II secretion system protein  26.71 
 
 		 289 aa  48.9  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0300  type II secretion system protein  22.08 
 
 		 323 aa  48.9  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2016  type II secretion system protein  23.63 
 
 		 307 aa  48.9  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0126  putative integral membrane protein  32.52 
 
 		 246 aa  48.1  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0160124  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0728  type II secretion system protein  24.28 
 
 		 333 aa  48.5  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.552842  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6004  type II secretion system protein  26.67 
 
 		 324 aa  47.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0374  type II secretion system protein F  21.2 
 
 		 292 aa  48.1  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.249846  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1075  type II secretion system protein  25.86 
 
 		 335 aa  47.4  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.137371  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4864  type II secretion system protein  24.58 
 
 		 330 aa  47.4  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13140  Flp pilus assembly protein TadC  28.76 
 
 		 306 aa  47.4  0.0003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3780  Type II secretion system F domain protein  34.84 
 
 		 275 aa  47  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6300  type II secretion system protein  26.06 
 
 		 323 aa  47  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.923016 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1754  type II secretion system protein  24.34 
 
 		 295 aa  47  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00143607  normal  0.105402 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2832  type II secretion system protein  24.21 
 
 		 319 aa  47  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.151252  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0992  type II secretion system protein  24.31 
 
 		 326 aa  46.6  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.236675  normal  0.765371 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1125  type II secretion system protein  26.19 
 
 		 347 aa  46.6  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.394553  normal  0.522315 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1124  type II secretion system protein  22.58 
 
 		 331 aa  46.6  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0315206  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>