158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2789 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2789  type II secretion system protein  100 
 
 		 315 aa  578  1e-164  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00278324 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1031  type II secretion system protein  57.79 
 
 		 312 aa  288  6e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0781  type II secretion system protein  50.64 
 
 		 316 aa  256  4e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5824  type II secretion system protein  48.9 
 
 		 338 aa  250  3e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.993294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1737  type II secretion system protein  46.41 
 
 		 311 aa  243  1.9999999999999999e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20400  Flp pilus assembly protein TadB  49.84 
 
 		 314 aa  241  9e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2671  type II secretion system protein  47.35 
 
 		 313 aa  238  6.999999999999999e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2406  type II secretion system protein  45.81 
 
 		 312 aa  235  9e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0371172 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1237  Type II secretion system F domain protein  56.58 
 
 		 309 aa  233  3e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1649  type II secretion system protein  49.09 
 
 		 311 aa  228  9e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.2409  hitchhiker  0.00110779 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1254  type II secretion system protein  51.15 
 
 		 312 aa  226  5.0000000000000005e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.23353  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0858  type II secretion system protein  44.85 
 
 		 311 aa  222  6e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1211  Type II secretion system F domain protein  49.5 
 
 		 313 aa  208  8e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10340  Flp pilus assembly protein TadB  46.5 
 
 		 309 aa  197  2.0000000000000003e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00075176  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07520  Flp pilus assembly protein TadC  44.52 
 
 		 313 aa  191  2e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3787  type II secretion system protein  59.31 
 
 		 295 aa  148  1.0000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0665963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3212  type II secretion system protein  32.92 
 
 		 311 aa  93.2  5e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.514288 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1276  type II secretion system protein  24.5 
 
 		 311 aa  81.6  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1850  type II secretion system protein  31.3 
 
 		 307 aa  79.3  0.00000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0102974  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4615  type II secretion system protein  27.78 
 
 		 301 aa  79  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2118  type II secretion system protein  27.27 
 
 		 310 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.128736  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2641  type II secretion system protein  35.15 
 
 		 291 aa  76.6  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4157  type II secretion system protein  26.92 
 
 		 309 aa  75.5  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3350  type II secretion system protein  28.01 
 
 		 309 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3118  type II secretion system protein  32.47 
 
 		 304 aa  73.6  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.803425  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1159  Type II secretion system F domain protein  27.31 
 
 		 320 aa  72.8  0.000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1680  type II secretion system protein  24.33 
 
 		 311 aa  72.4  0.000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000554602 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2763  type II secretion system protein  31.65 
 
 		 326 aa  71.6  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.613586 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2114  type II secretion system protein  29.94 
 
 		 288 aa  70.9  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2696  type II secretion system protein  32.28 
 
 		 301 aa  70.1  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0581937  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1754  Flp pilus assembly protein TadC  27.78 
 
 		 326 aa  68.6  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1831  type II secretion system protein  28.57 
 
 		 304 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4446  type II secretion system protein  31.61 
 
 		 293 aa  68.9  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0044747 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3420  Type II secretion system F domain protein  31.76 
 
 		 295 aa  67.8  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.490118  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002651  type II/IV secretion system protein TadC associated with Flp pilus assembly  30.34 
 
 		 313 aa  67.8  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0639  type II secretion system protein  30.25 
 
 		 323 aa  67.4  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0710  putative type II secretion system protein F  30.3 
 
 		 287 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1399  type II secretion system protein  30.6 
 
 		 299 aa  67  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0535811  hitchhiker  0.000124146 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2365  hypothetical protein  29.05 
 
 		 324 aa  66.2  0.0000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.195084  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2276  hypothetical protein  26.86 
 
 		 296 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2486  type II secretion system protein  22.44 
 
 		 294 aa  65.1  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.766494  hitchhiker  0.000200331 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1107  type II secretion system protein  28.24 
 
 		 323 aa  65.9  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.107682  normal  0.160043 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0249  type II secretion system protein  29.45 
 
 		 313 aa  65.5  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.876214 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0552  type II secretion system protein  26.33 
 
 		 326 aa  65.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1517  hypothetical protein  31.18 
 
 		 320 aa  65.5  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.205257  normal  0.198842 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1032  type II secretion system protein  30.61 
 
 		 204 aa  65.1  0.000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1903  putative Flp pilus assembly protein TadC  26.33 
 
 		 326 aa  65.1  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2736  type II secretion system protein  29.19 
 
 		 326 aa  64.7  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2698  type II secretion system protein  26.72 
 
 		 302 aa  64.7  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2364  putative putative tight adherence TadC-like transmembrane protein  26.72 
 
 		 321 aa  64.7  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00226483  normal  0.0303282 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0653  TadC protein  26.34 
 
 		 313 aa  63.9  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.179736 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1337  type II secretion system protein  23.11 
 
 		 289 aa  64.3  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0300  type II secretion system protein  26.9 
 
 		 323 aa  63.5  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2694  type II secretion system protein  32.68 
 
 		 320 aa  63.2  0.000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1124  type II secretion system protein  28.19 
 
 		 331 aa  63.2  0.000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0315206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1318  type II secretion system protein  27.27 
 
 		 319 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2968  type II secretion system protein  27.27 
 
 		 319 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0806  type II secretion system protein  26.02 
 
 		 316 aa  62.8  0.000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1204  type II secretion system protein  26.35 
 
 		 296 aa  62.8  0.000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.59428  hitchhiker  0.000000109908 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0793  TadC protein  27.84 
 
 		 315 aa  62.4  0.000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1053  type II secretion system protein  27.33 
 
 		 302 aa  62.4  0.000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0767  Type II secretion system F domain protein  25.89 
 
 		 269 aa  62.4  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2557  type II secretion system protein  29.39 
 
 		 314 aa  61.6  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.59617  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3093  type II secretion system protein  27.27 
 
 		 319 aa  62  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7193  putative Flp pilus assembly protein TadC  28.26 
 
 		 324 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.202721  normal  0.456008 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2649  type II secretion system protein  29.38 
 
 		 323 aa  60.1  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13140  Flp pilus assembly protein TadC  32.67 
 
 		 306 aa  60.1  0.00000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2650  type II secretion system protein  26.83 
 
 		 294 aa  60.1  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1813  type II secretion system protein  24.48 
 
 		 426 aa  60.1  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00328504  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3208  type II secretion system protein  25.9 
 
 		 302 aa  59.7  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.544767 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1043  Type II secretion system F domain protein  28.8 
 
 		 305 aa  59.3  0.00000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.809436  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2307  Type II secretion system F domain protein  27.11 
 
 		 298 aa  59.3  0.00000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0238  type II secretion system protein  28.42 
 
 		 322 aa  59.3  0.00000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2927  type II secretion system protein  26.81 
 
 		 292 aa  58.5  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0944491  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2935  type II secretion system protein  26.6 
 
 		 294 aa  58.5  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0849088  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2021  type II secretion system protein  28.95 
 
 		 320 aa  58.5  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.477325  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1530  type II secretion system protein  28.48 
 
 		 301 aa  58.9  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2352  type II secretion system protein  26.51 
 
 		 313 aa  58.2  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0836815  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0586  type II secretion system protein  31.21 
 
 		 320 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.180812  normal  0.546922 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5490  type II secretion system protein  29 
 
 		 324 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6776  type II secretion system protein  29 
 
 		 324 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.710361  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0642  type II secretion system protein  27.33 
 
 		 287 aa  57.4  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1033  type II secretion system protein  25.93 
 
 		 272 aa  57.8  0.0000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6364  type II secretion system protein  29 
 
 		 324 aa  57  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0746  type II secretion system protein  23.2 
 
 		 287 aa  57  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.271129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1017  von Willebrand factor type A; type II secretion system protein  25.6 
 
 		 643 aa  56.6  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0424  type II secretion system protein  29.66 
 
 		 331 aa  56.6  0.0000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.628499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2832  type II secretion system protein  26.7 
 
 		 319 aa  56.2  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.151252  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2571  type II secretion system protein  27.43 
 
 		 303 aa  56.6  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1779  type II secretion system protein  26.95 
 
 		 324 aa  55.8  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.708691  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2115  type II secretion system protein  29.82 
 
 		 279 aa  55.5  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2565  Type II secretion system F domain protein  29.85 
 
 		 299 aa  55.5  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.725543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0801  type II secretion system protein  27.59 
 
 		 312 aa  55.1  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4002  type II secretion system protein  28.38 
 
 		 329 aa  55.1  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0289268  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4188  type II secretion system protein  26.9 
 
 		 328 aa  54.7  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7036  putative pilus assembly protein  24.7 
 
 		 324 aa  54.3  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.452255 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2379  type II secretion system protein  25.55 
 
 		 321 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.306938  normal  0.924554 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2016  type II secretion system protein  25.6 
 
 		 307 aa  53.9  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0610  type II secretion system protein  24.87 
 
 		 281 aa  53.5  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2276  putative integral membrane protein  29.94 
 
 		 273 aa  53.5  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.846433  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>