287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2276 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2276  putative integral membrane protein  100 
 
 		 273 aa  541  1e-153  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.846433  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2565  Type II secretion system F domain protein  46.29 
 
 		 299 aa  162  5.0000000000000005e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.725543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1850  type II secretion system protein  35.05 
 
 		 307 aa  100  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0102974  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2927  type II secretion system protein  30.52 
 
 		 292 aa  96.3  5e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0944491  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3118  type II secretion system protein  31.33 
 
 		 304 aa  96.3  5e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.803425  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1399  type II secretion system protein  33.5 
 
 		 299 aa  93.6  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0535811  hitchhiker  0.000124146 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2314  type II secretion system protein  34.97 
 
 		 317 aa  90.5  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1276  type II secretion system protein  30.9 
 
 		 311 aa  88.6  9e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3212  type II secretion system protein  28.45 
 
 		 311 aa  88.6  9e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.514288 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4446  type II secretion system protein  33.04 
 
 		 293 aa  87.4  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0044747 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3420  Type II secretion system F domain protein  34.55 
 
 		 295 aa  84  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.490118  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3350  type II secretion system protein  31.89 
 
 		 309 aa  83.2  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2118  type II secretion system protein  30.43 
 
 		 310 aa  83.2  0.000000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.128736  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1017  von Willebrand factor type A; type II secretion system protein  31.36 
 
 		 643 aa  82.8  0.000000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4615  type II secretion system protein  32.28 
 
 		 301 aa  82.4  0.000000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2641  type II secretion system protein  29.11 
 
 		 291 aa  82  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1125  type II secretion system protein  32 
 
 		 347 aa  81.3  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.394553  normal  0.522315 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2650  type II secretion system protein  33.7 
 
 		 294 aa  80.9  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4157  type II secretion system protein  28.26 
 
 		 309 aa  79.7  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2016  type II secretion system protein  32.16 
 
 		 307 aa  80.1  0.00000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1680  type II secretion system protein  31.76 
 
 		 311 aa  79.3  0.00000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000554602 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1723  type II secretion system protein  28.27 
 
 		 296 aa  78.6  0.00000000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2935  type II secretion system protein  32.72 
 
 		 294 aa  77.8  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0849088  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3780  Type II secretion system F domain protein  34.24 
 
 		 275 aa  77  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2486  type II secretion system protein  29.45 
 
 		 294 aa  76.6  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.766494  hitchhiker  0.000200331 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1107  type II secretion system protein  31.25 
 
 		 323 aa  75.9  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.107682  normal  0.160043 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2832  type II secretion system protein  32.67 
 
 		 319 aa  75.5  0.0000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.151252  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3796  type II secretion system protein  34.64 
 
 		 325 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.472243  normal  0.57339 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0212  component of type IV pilus  33.13 
 
 		 326 aa  75.1  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0728  type II secretion system protein  30.65 
 
 		 333 aa  74.3  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.552842  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4002  type II secretion system protein  33.74 
 
 		 329 aa  74.3  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0289268  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0746  type II secretion system protein  31.03 
 
 		 287 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.271129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3718  type II secretion system protein  33.78 
 
 		 324 aa  73.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.202594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4864  type II secretion system protein  38.36 
 
 		 330 aa  72.8  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2694  type II secretion system protein  33.1 
 
 		 320 aa  73.2  0.000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1779  type II secretion system protein  32.43 
 
 		 324 aa  72.8  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.708691  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0386  type II secretion system protein  30.93 
 
 		 325 aa  72.4  0.000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2379  type II secretion system protein  32.67 
 
 		 321 aa  72.4  0.000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.306938  normal  0.924554 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0992  type II secretion system protein  30.07 
 
 		 326 aa  72.4  0.000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.236675  normal  0.765371 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0296  type II secretion system protein  30.93 
 
 		 325 aa  71.6  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4205  type II secretion system protein  32.05 
 
 		 324 aa  71.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.125721  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1754  type II secretion system protein  28.09 
 
 		 295 aa  71.6  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00143607  normal  0.105402 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3525  type II secretion system protein  30.85 
 
 		 324 aa  71.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.359223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0639  type II secretion system protein  32.24 
 
 		 323 aa  72  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3492  type II secretion system protein  30.94 
 
 		 313 aa  71.6  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.39955  normal  0.0861426 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3795  type II secretion system protein  30.8 
 
 		 321 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1517  hypothetical protein  31.03 
 
 		 320 aa  70.5  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.205257  normal  0.198842 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0710  putative type II secretion system protein F  29.81 
 
 		 287 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2485  type II secretion system protein  33.33 
 
 		 323 aa  69.3  0.00000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.28616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2413  type II secretion system protein  33.33 
 
 		 323 aa  69.3  0.00000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2708  type II secretion system protein  33.33 
 
 		 323 aa  69.3  0.00000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.68845 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2700  tight adherence protein TadC  29.41 
 
 		 312 aa  68.9  0.00000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2322  type II secretion system protein  29.41 
 
 		 312 aa  68.9  0.00000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7036  putative pilus assembly protein  31.51 
 
 		 324 aa  68.9  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.452255 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1043  Type II secretion system F domain protein  36.88 
 
 		 305 aa  68.6  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.809436  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1124  type II secretion system protein  29.41 
 
 		 331 aa  68.6  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0315206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2649  type II secretion system protein  31.82 
 
 		 323 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1159  Type II secretion system F domain protein  30.18 
 
 		 320 aa  67.8  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0642  type II secretion system protein  38.28 
 
 		 287 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2736  type II secretion system protein  30.99 
 
 		 326 aa  67.8  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1075  type II secretion system protein  29.56 
 
 		 335 aa  67.8  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.137371  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0602  type II secretion system protein  30.82 
 
 		 323 aa  67.8  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0897257  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1814  type II secretion system protein  31.14 
 
 		 285 aa  67.4  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0127821  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2698  type II secretion system protein  32 
 
 		 302 aa  67  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3357  type II secretion system protein  32.87 
 
 		 327 aa  66.2  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2308  Type II secretion system F domain protein  31.39 
 
 		 284 aa  66.2  0.0000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1916  type II secretion system protein  30.56 
 
 		 312 aa  65.9  0.0000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.141806  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5120  type II secretion system protein  32.41 
 
 		 321 aa  65.9  0.0000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.229641  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0424  type II secretion system protein  28.22 
 
 		 331 aa  65.5  0.0000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.628499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3011  type II secretion system protein  28.26 
 
 		 319 aa  65.5  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0300  type II secretion system protein  30.63 
 
 		 323 aa  64.7  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1903  putative Flp pilus assembly protein TadC  30.82 
 
 		 326 aa  65.1  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0552  type II secretion system protein  30.82 
 
 		 326 aa  65.1  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2763  type II secretion system protein  31.25 
 
 		 326 aa  65.1  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.613586 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4193  type II secretion system protein  30.92 
 
 		 328 aa  64.7  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4188  type II secretion system protein  28.29 
 
 		 328 aa  64.7  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2365  hypothetical protein  27.55 
 
 		 324 aa  64.3  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.195084  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2556  type II secretion system protein  35.85 
 
 		 325 aa  64.3  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.460971  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4481  type II secretion system protein  31.47 
 
 		 328 aa  64.7  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2571  type II secretion system protein  30.46 
 
 		 303 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0238  type II secretion system protein  31.29 
 
 		 322 aa  63.5  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4618  type II secretion system protein  29.5 
 
 		 325 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.347884 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2115  type II secretion system protein  31.53 
 
 		 279 aa  63.2  0.000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0805  type II secretion system protein  26.04 
 
 		 332 aa  62.8  0.000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5325  type II secretion system protein  33.64 
 
 		 326 aa  62  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.61312  hitchhiker  0.00813406 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1053  type II secretion system protein  29.33 
 
 		 302 aa  61.6  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2557  type II secretion system protein  29.65 
 
 		 314 aa  62  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.59617  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2114  type II secretion system protein  28.7 
 
 		 288 aa  61.6  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2046  putative fimbriae-related membrane protein  30.77 
 
 		 314 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0336894  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2307  Type II secretion system F domain protein  31.87 
 
 		 298 aa  60.8  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0331  type II secretion system protein F  30.77 
 
 		 314 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0097112  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1649  type II secretion system protein  33.55 
 
 		 311 aa  60.8  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.2409  hitchhiker  0.00110779 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3208  type II secretion system protein  29.27 
 
 		 302 aa  60.8  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.544767 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0830  type II secretion system protein F  30.77 
 
 		 314 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.288216  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1878  type II secretion system protein  30.77 
 
 		 314 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.650462  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0249  type II secretion system protein  33.93 
 
 		 313 aa  60.8  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.876214 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1890  type II secretion system protein  30.77 
 
 		 314 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1675  type II secretion system protein F  30.77 
 
 		 314 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0653  TadC protein  25.55 
 
 		 313 aa  60.5  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.179736 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2454  type II secretion system protein F  30.77 
 
 		 290 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0182293  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>