281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1107 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1107  type II secretion system protein  100 
 
 		 323 aa  642    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.107682  normal  0.160043 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2736  type II secretion system protein  71.78 
 
 		 326 aa  426  1e-118  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2365  hypothetical protein  60.06 
 
 		 324 aa  387  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.195084  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1500  type II secretion system protein  42.76 
 
 		 319 aa  226  3e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.34697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1159  Type II secretion system F domain protein  47.56 
 
 		 320 aa  226  4e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0806  type II secretion system protein  38.17 
 
 		 316 aa  209  5e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2557  type II secretion system protein  48.86 
 
 		 314 aa  207  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.59617  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0653  TadC protein  44.3 
 
 		 313 aa  202  7e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.179736 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2352  type II secretion system protein  44.73 
 
 		 313 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0836815  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0801  type II secretion system protein  46.15 
 
 		 312 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0650  putative tight adherence TadC-related transmembrane protein  42.51 
 
 		 315 aa  196  3e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.640477  normal  0.167986 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2276  hypothetical protein  48.66 
 
 		 296 aa  192  5e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1318  type II secretion system protein  54.4 
 
 		 319 aa  192  9e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2968  type II secretion system protein  54.4 
 
 		 319 aa  192  9e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0543  type II secretion system protein  39.49 
 
 		 313 aa  190  2e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0603407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0639  type II secretion system protein  46.26 
 
 		 323 aa  191  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1916  type II secretion system protein  39.24 
 
 		 312 aa  191  2e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.141806  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0992  type II secretion system protein  42.32 
 
 		 326 aa  190  2.9999999999999997e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.236675  normal  0.765371 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3093  type II secretion system protein  53.85 
 
 		 319 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2649  type II secretion system protein  46.19 
 
 		 323 aa  188  9e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0793  TadC protein  36.39 
 
 		 315 aa  188  9e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1124  type II secretion system protein  37.9 
 
 		 331 aa  188  1e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0315206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3964  type II secretion system protein  47.58 
 
 		 314 aa  187  1e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.273183 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6364  type II secretion system protein  48.67 
 
 		 324 aa  186  6e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7193  putative Flp pilus assembly protein TadC  48.23 
 
 		 324 aa  186  6e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.202721  normal  0.456008 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5490  type II secretion system protein  48.67 
 
 		 324 aa  186  7e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6776  type II secretion system protein  48.67 
 
 		 324 aa  186  7e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.710361  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4619  type II secretion system protein  37.54 
 
 		 318 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.340215 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0300  type II secretion system protein  42.67 
 
 		 323 aa  182  7e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1831  type II secretion system protein  44.02 
 
 		 304 aa  182  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2698  type II secretion system protein  39.93 
 
 		 302 aa  181  1e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2763  type II secretion system protein  38.08 
 
 		 326 aa  181  2e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.613586 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2351  type II secretion system protein  38.43 
 
 		 323 aa  179  8e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.357093 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0552  type II secretion system protein  41.78 
 
 		 326 aa  177  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1530  type II secretion system protein  42.02 
 
 		 301 aa  177  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1903  putative Flp pilus assembly protein TadC  41.78 
 
 		 326 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3212  type II secretion system protein  43.67 
 
 		 311 aa  176  4e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.514288 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1276  type II secretion system protein  41.7 
 
 		 311 aa  172  7.999999999999999e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3011  type II secretion system protein  44.14 
 
 		 319 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1754  Flp pilus assembly protein TadC  49.7 
 
 		 326 aa  171  2e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3208  type II secretion system protein  37.41 
 
 		 302 aa  165  8e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.544767 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0586  type II secretion system protein  51.81 
 
 		 320 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.180812  normal  0.546922 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1053  type II secretion system protein  39.2 
 
 		 302 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2911  type II secretion system protein  40.25 
 
 		 306 aa  162  8.000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.604096  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6300  type II secretion system protein  45.05 
 
 		 323 aa  162  9e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.923016 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6004  type II secretion system protein  45.05 
 
 		 324 aa  159  7e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2823  type II secretion system protein  43.79 
 
 		 306 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2021  type II secretion system protein  36.03 
 
 		 320 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.477325  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1850  type II secretion system protein  45.45 
 
 		 307 aa  155  7e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0102974  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2118  type II secretion system protein  44.97 
 
 		 310 aa  155  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.128736  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1680  type II secretion system protein  41.78 
 
 		 311 aa  154  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000554602 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5326  type II secretion system protein  45.5 
 
 		 323 aa  152  7e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0355396 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002651  type II/IV secretion system protein TadC associated with Flp pilus assembly  35.84 
 
 		 313 aa  152  8e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2364  putative putative tight adherence TadC-like transmembrane protein  36.36 
 
 		 321 aa  152  1e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00226483  normal  0.0303282 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4481  type II secretion system protein  35.44 
 
 		 328 aa  149  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4193  type II secretion system protein  34.16 
 
 		 328 aa  149  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3357  type II secretion system protein  32.83 
 
 		 327 aa  149  6e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4002  type II secretion system protein  39.21 
 
 		 329 aa  149  6e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0289268  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4864  type II secretion system protein  37.28 
 
 		 330 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2016  type II secretion system protein  34.48 
 
 		 307 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0728  type II secretion system protein  33.93 
 
 		 333 aa  145  9e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.552842  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2314  type II secretion system protein  39.46 
 
 		 317 aa  143  5e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3118  type II secretion system protein  43.64 
 
 		 304 aa  142  6e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.803425  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0212  component of type IV pilus  43.71 
 
 		 326 aa  142  7e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5120  type II secretion system protein  33.97 
 
 		 321 aa  141  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.229641  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4615  type II secretion system protein  35.29 
 
 		 301 aa  141  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1017  von Willebrand factor type A; type II secretion system protein  40.7 
 
 		 643 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2641  type II secretion system protein  33.94 
 
 		 291 aa  139  4.999999999999999e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4188  type II secretion system protein  37 
 
 		 328 aa  138  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1125  type II secretion system protein  37.55 
 
 		 347 aa  138  1e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.394553  normal  0.522315 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3795  type II secretion system protein  42.35 
 
 		 321 aa  138  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4446  type II secretion system protein  37.07 
 
 		 293 aa  138  2e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0044747 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1075  type II secretion system protein  37.07 
 
 		 335 aa  137  3.0000000000000003e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.137371  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0602  type II secretion system protein  31.43 
 
 		 323 aa  137  4e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0897257  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2413  type II secretion system protein  39.3 
 
 		 323 aa  136  5e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3796  type II secretion system protein  35.8 
 
 		 325 aa  135  9e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.472243  normal  0.57339 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0386  type II secretion system protein  33.13 
 
 		 325 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0424  type II secretion system protein  36.94 
 
 		 331 aa  135  9.999999999999999e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.628499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3420  Type II secretion system F domain protein  38.46 
 
 		 295 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.490118  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2379  type II secretion system protein  33.98 
 
 		 321 aa  132  7.999999999999999e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.306938  normal  0.924554 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2485  type II secretion system protein  37.99 
 
 		 323 aa  132  7.999999999999999e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.28616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2708  type II secretion system protein  37.99 
 
 		 323 aa  132  7.999999999999999e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.68845 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2832  type II secretion system protein  32.02 
 
 		 319 aa  132  9e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.151252  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0238  type II secretion system protein  41.82 
 
 		 322 aa  131  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1524  type II secretion system protein  31.21 
 
 		 322 aa  131  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2650  type II secretion system protein  40.72 
 
 		 294 aa  131  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2694  type II secretion system protein  41.32 
 
 		 320 aa  130  3e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3718  type II secretion system protein  35.45 
 
 		 324 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.202594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0296  type II secretion system protein  31.6 
 
 		 325 aa  129  7.000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1813  type II secretion system protein  35.75 
 
 		 426 aa  128  1.0000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00328504  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4157  type II secretion system protein  39.29 
 
 		 309 aa  127  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2114  type II secretion system protein  34.01 
 
 		 288 aa  127  3e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7036  putative pilus assembly protein  40.24 
 
 		 324 aa  126  5e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.452255 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1779  type II secretion system protein  34.55 
 
 		 324 aa  125  7e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.708691  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1517  hypothetical protein  38.82 
 
 		 320 aa  125  7e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.205257  normal  0.198842 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0672  type II secretion system protein  33.18 
 
 		 319 aa  125  9e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.139102  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2454  type II secretion system protein F  35.19 
 
 		 290 aa  125  9e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0182293  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4205  type II secretion system protein  34.09 
 
 		 324 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.125721  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2571  type II secretion system protein  33.07 
 
 		 303 aa  125  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2935  type II secretion system protein  35.53 
 
 		 294 aa  124  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0849088  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>