249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1723 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1723  type II secretion system protein  100 
 
 		 296 aa  607  9.999999999999999e-173  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002651  type II/IV secretion system protein TadC associated with Flp pilus assembly  30.17 
 
 		 313 aa  119  7e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1831  type II secretion system protein  34.7 
 
 		 304 aa  110  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1916  type II secretion system protein  31.6 
 
 		 312 aa  107  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.141806  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0653  TadC protein  30.91 
 
 		 313 aa  102  5e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.179736 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0793  TadC protein  34.18 
 
 		 315 aa  101  1e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0300  type II secretion system protein  28.27 
 
 		 323 aa  101  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0311  type II secretion system protein  30 
 
 		 316 aa  100  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.563894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0806  type II secretion system protein  28.11 
 
 		 316 aa  98.6  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2021  type II secretion system protein  28.96 
 
 		 320 aa  97.8  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.477325  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3011  type II secretion system protein  29.68 
 
 		 319 aa  98.2  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2364  putative putative tight adherence TadC-like transmembrane protein  29.6 
 
 		 321 aa  97.4  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00226483  normal  0.0303282 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1159  Type II secretion system F domain protein  34.72 
 
 		 320 aa  96.7  4e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1124  type II secretion system protein  27.12 
 
 		 331 aa  96.3  6e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0315206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1903  putative Flp pilus assembly protein TadC  25.97 
 
 		 326 aa  95.5  9e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2763  type II secretion system protein  27.9 
 
 		 326 aa  95.1  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.613586 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0552  type II secretion system protein  25.97 
 
 		 326 aa  95.5  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1754  Flp pilus assembly protein TadC  31.65 
 
 		 326 aa  94.4  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0992  type II secretion system protein  26.29 
 
 		 326 aa  94.7  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.236675  normal  0.765371 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2016  type II secretion system protein  27.62 
 
 		 307 aa  93.2  4e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2698  type II secretion system protein  26.06 
 
 		 302 aa  93.2  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3208  type II secretion system protein  25.74 
 
 		 302 aa  93.2  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.544767 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1500  type II secretion system protein  28.1 
 
 		 319 aa  93.2  5e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.34697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2557  type II secretion system protein  28.45 
 
 		 314 aa  92.4  7e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.59617  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1125  type II secretion system protein  29.65 
 
 		 347 aa  92.4  8e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.394553  normal  0.522315 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1053  type II secretion system protein  27.09 
 
 		 302 aa  92  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3933  type II secretion system protein  28.83 
 
 		 314 aa  90.9  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0787436  normal  0.204466 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2351  type II secretion system protein  26.64 
 
 		 323 aa  91.3  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.357093 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0650  putative tight adherence TadC-related transmembrane protein  30.6 
 
 		 315 aa  90.9  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.640477  normal  0.167986 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1813  type II secretion system protein  25.53 
 
 		 426 aa  90.1  4e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00328504  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3426  type II secretion system protein  28.38 
 
 		 314 aa  90.1  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.165732  normal  0.426073 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1107  type II secretion system protein  29.61 
 
 		 323 aa  89.7  5e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.107682  normal  0.160043 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2454  type II secretion system protein F  30.49 
 
 		 290 aa  89  9e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0182293  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0672  type II secretion system protein  27.4 
 
 		 319 aa  89  9e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.139102  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0543  type II secretion system protein  29.65 
 
 		 313 aa  89  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0603407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3212  type II secretion system protein  31.25 
 
 		 311 aa  88.6  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.514288 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2736  type II secretion system protein  34.67 
 
 		 326 aa  88.2  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1399  type II secretion system protein  30.06 
 
 		 299 aa  86.7  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0535811  hitchhiker  0.000124146 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7193  putative Flp pilus assembly protein TadC  32.44 
 
 		 324 aa  86.3  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.202721  normal  0.456008 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0639  type II secretion system protein  28.89 
 
 		 323 aa  86.3  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4619  type II secretion system protein  27 
 
 		 318 aa  85.5  9e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.340215 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2046  putative fimbriae-related membrane protein  33.33 
 
 		 314 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0336894  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2047  type II secretion system protein  32.03 
 
 		 318 aa  85.1  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0677944  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1524  type II secretion system protein  24.76 
 
 		 322 aa  85.1  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2314  type II secretion system protein  30.99 
 
 		 317 aa  85.1  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0830  type II secretion system protein F  33.33 
 
 		 314 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.288216  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1675  type II secretion system protein F  33.33 
 
 		 314 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0331  type II secretion system protein F  33.33 
 
 		 314 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0097112  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1890  type II secretion system protein  33.33 
 
 		 314 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1878  type II secretion system protein  33.33 
 
 		 314 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.650462  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4864  type II secretion system protein  24.42 
 
 		 330 aa  85.1  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2365  hypothetical protein  27.9 
 
 		 324 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.195084  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2322  type II secretion system protein  31.33 
 
 		 312 aa  84.7  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2700  tight adherence protein TadC  31.33 
 
 		 312 aa  84.7  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0586  type II secretion system protein  28.51 
 
 		 320 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.180812  normal  0.546922 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1075  type II secretion system protein  32.64 
 
 		 335 aa  83.6  0.000000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.137371  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4002  type II secretion system protein  27.43 
 
 		 329 aa  82.8  0.000000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0289268  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3964  type II secretion system protein  28.57 
 
 		 314 aa  82.4  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.273183 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0900  Type II secretion system F domain protein  29.56 
 
 		 319 aa  82.4  0.000000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0728  type II secretion system protein  27.16 
 
 		 333 aa  82  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.552842  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2649  type II secretion system protein  28.44 
 
 		 323 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2276  hypothetical protein  26.47 
 
 		 296 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2052  type II secretion system protein  27.03 
 
 		 314 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000269982  normal  0.0927482 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0610  type II secretion system protein  25.45 
 
 		 281 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2911  type II secretion system protein  29.71 
 
 		 306 aa  80.9  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.604096  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1517  hypothetical protein  30.72 
 
 		 320 aa  81.3  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.205257  normal  0.198842 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1318  type II secretion system protein  26.05 
 
 		 319 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2118  type II secretion system protein  26.44 
 
 		 310 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.128736  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2968  type II secretion system protein  26.05 
 
 		 319 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3093  type II secretion system protein  26.05 
 
 		 319 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5490  type II secretion system protein  31.11 
 
 		 324 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6364  type II secretion system protein  31.11 
 
 		 324 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6776  type II secretion system protein  31.11 
 
 		 324 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.710361  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06191  hypothetical protein  24.75 
 
 		 280 aa  79.7  0.00000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2276  putative integral membrane protein  28.27 
 
 		 273 aa  78.6  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.846433  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2694  type II secretion system protein  28.41 
 
 		 320 aa  78.6  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3357  type II secretion system protein  24.3 
 
 		 327 aa  78.2  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4188  type II secretion system protein  26.64 
 
 		 328 aa  77.8  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2823  type II secretion system protein  29.82 
 
 		 306 aa  77.4  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0801  type II secretion system protein  26.02 
 
 		 312 aa  76.3  0.0000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1680  type II secretion system protein  33.33 
 
 		 311 aa  74.3  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000554602 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2352  type II secretion system protein  29.1 
 
 		 313 aa  74.3  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0836815  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1276  type II secretion system protein  31.76 
 
 		 311 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2486  type II secretion system protein  29.7 
 
 		 294 aa  74.7  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.766494  hitchhiker  0.000200331 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2708  type II secretion system protein  26.84 
 
 		 323 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.68845 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2485  type II secretion system protein  26.84 
 
 		 323 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.28616  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1530  type II secretion system protein  27.31 
 
 		 301 aa  71.2  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4481  type II secretion system protein  27.33 
 
 		 328 aa  70.5  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3796  type II secretion system protein  21.83 
 
 		 325 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.472243  normal  0.57339 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0238  type II secretion system protein  24.89 
 
 		 322 aa  70.5  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3118  type II secretion system protein  27.21 
 
 		 304 aa  70.5  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.803425  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0424  type II secretion system protein  25.23 
 
 		 331 aa  70.1  0.00000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.628499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0074  type II secretion system protein  25.54 
 
 		 315 aa  70.1  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.557722  normal  0.8398 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6004  type II secretion system protein  35.48 
 
 		 324 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3492  type II secretion system protein  26.79 
 
 		 313 aa  69.7  0.00000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.39955  normal  0.0861426 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0386  type II secretion system protein  24.43 
 
 		 325 aa  69.3  0.00000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4193  type II secretion system protein  26.62 
 
 		 328 aa  69.3  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2538  hypothetical protein  23.18 
 
 		 373 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2413  type II secretion system protein  28.76 
 
 		 323 aa  68.9  0.00000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7036  putative pilus assembly protein  25.34 
 
 		 324 aa  68.9  0.00000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.452255 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>