212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2052 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2052  type II secretion system protein  100 
 
 
314 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000269982  normal  0.0927482 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3426  type II secretion system protein  85.35 
 
 
314 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.165732  normal  0.426073 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3933  type II secretion system protein  85.67 
 
 
314 aa  489  1e-137  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0787436  normal  0.204466 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2454  type II secretion system protein F  62.15 
 
 
290 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0182293  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2046  putative fimbriae-related membrane protein  60.96 
 
 
314 aa  291  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0336894  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1675  type II secretion system protein F  60.96 
 
 
314 aa  291  1e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0331  type II secretion system protein F  60.96 
 
 
314 aa  291  1e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0097112  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1878  type II secretion system protein  60.96 
 
 
314 aa  291  1e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.650462  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1890  type II secretion system protein  60.96 
 
 
314 aa  291  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0830  type II secretion system protein F  60.96 
 
 
314 aa  291  1e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.288216  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1517  hypothetical protein  44.07 
 
 
320 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.205257  normal  0.198842 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2016  type II secretion system protein  37.93 
 
 
307 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2694  type II secretion system protein  39.52 
 
 
320 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2365  hypothetical protein  34.47 
 
 
324 aa  138  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.195084  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4864  type II secretion system protein  35.46 
 
 
330 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3357  type II secretion system protein  30.04 
 
 
327 aa  134  3e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0212  component of type IV pilus  38.12 
 
 
326 aa  134  3e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0672  type II secretion system protein  35.75 
 
 
319 aa  132  6.999999999999999e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.139102  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1075  type II secretion system protein  34.45 
 
 
335 aa  131  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.137371  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4193  type II secretion system protein  37.43 
 
 
328 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4481  type II secretion system protein  37.43 
 
 
328 aa  129  6e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4188  type II secretion system protein  32.22 
 
 
328 aa  128  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4205  type II secretion system protein  31.67 
 
 
324 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.125721  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1124  type II secretion system protein  31.2 
 
 
331 aa  127  3e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0315206  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2832  type II secretion system protein  36.31 
 
 
319 aa  126  5e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.151252  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2379  type II secretion system protein  30.5 
 
 
321 aa  126  5e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.306938  normal  0.924554 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1500  type II secretion system protein  30.23 
 
 
319 aa  125  8.000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.34697  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2708  type II secretion system protein  32.74 
 
 
323 aa  125  9e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.68845 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2485  type II secretion system protein  32.74 
 
 
323 aa  125  9e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.28616  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2413  type II secretion system protein  33.64 
 
 
323 aa  125  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1125  type II secretion system protein  33.47 
 
 
347 aa  125  1e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.394553  normal  0.522315 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1107  type II secretion system protein  36.18 
 
 
323 aa  124  2e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.107682  normal  0.160043 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3525  type II secretion system protein  31.22 
 
 
324 aa  123  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.359223  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3795  type II secretion system protein  28.22 
 
 
321 aa  123  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0900  Type II secretion system F domain protein  37.65 
 
 
319 aa  123  5e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2736  type II secretion system protein  36.29 
 
 
326 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002651  type II/IV secretion system protein TadC associated with Flp pilus assembly  29.66 
 
 
313 aa  121  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3718  type II secretion system protein  31.67 
 
 
324 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.202594  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4002  type II secretion system protein  38.86 
 
 
329 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0289268  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0424  type II secretion system protein  31.53 
 
 
331 aa  121  1.9999999999999998e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.628499  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2021  type II secretion system protein  34.07 
 
 
320 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.477325  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1779  type II secretion system protein  30.77 
 
 
324 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.708691  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0728  type II secretion system protein  31.67 
 
 
333 aa  120  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.552842  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2364  putative putative tight adherence TadC-like transmembrane protein  33.33 
 
 
321 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00226483  normal  0.0303282 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0992  type II secretion system protein  32.93 
 
 
326 aa  120  3.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.236675  normal  0.765371 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7036  putative pilus assembly protein  29.14 
 
 
324 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.452255 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0639  type II secretion system protein  33.19 
 
 
323 aa  119  7e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0386  type II secretion system protein  31.22 
 
 
325 aa  119  7.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0238  type II secretion system protein  28.67 
 
 
322 aa  118  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3796  type II secretion system protein  31.08 
 
 
325 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.472243  normal  0.57339 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0296  type II secretion system protein  30.77 
 
 
325 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2047  type II secretion system protein  37.14 
 
 
318 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0677944  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3492  type II secretion system protein  35.93 
 
 
313 aa  117  3e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.39955  normal  0.0861426 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0602  type II secretion system protein  27.42 
 
 
323 aa  116  6e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0897257  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1159  Type II secretion system F domain protein  34.08 
 
 
320 aa  115  6e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0300  type II secretion system protein  35.59 
 
 
323 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0311  type II secretion system protein  31.78 
 
 
316 aa  115  7.999999999999999e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.563894  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1916  type II secretion system protein  35.76 
 
 
312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.141806  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1903  putative Flp pilus assembly protein TadC  36.04 
 
 
326 aa  114  3e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0552  type II secretion system protein  36.04 
 
 
326 aa  113  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2649  type II secretion system protein  37.72 
 
 
323 aa  112  6e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0586  type II secretion system protein  30.82 
 
 
320 aa  112  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.180812  normal  0.546922 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1754  Flp pilus assembly protein TadC  31.42 
 
 
326 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2698  type II secretion system protein  31.85 
 
 
302 aa  110  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0653  TadC protein  30.51 
 
 
313 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.179736 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2557  type II secretion system protein  31.49 
 
 
314 aa  109  6e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.59617  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5120  type II secretion system protein  28.12 
 
 
321 aa  108  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.229641  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3011  type II secretion system protein  34.84 
 
 
319 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2352  type II secretion system protein  36.75 
 
 
313 aa  106  6e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0836815  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0806  type II secretion system protein  34.13 
 
 
316 aa  105  1e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1318  type II secretion system protein  38.2 
 
 
319 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2968  type II secretion system protein  38.2 
 
 
319 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2276  hypothetical protein  38.2 
 
 
296 aa  104  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0543  type II secretion system protein  29.47 
 
 
313 aa  103  4e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0603407  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4619  type II secretion system protein  32.09 
 
 
318 aa  103  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.340215 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3093  type II secretion system protein  37.64 
 
 
319 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0793  TadC protein  34.55 
 
 
315 aa  102  7e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0801  type II secretion system protein  32.52 
 
 
312 aa  101  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0650  putative tight adherence TadC-related transmembrane protein  30.49 
 
 
315 aa  99.4  7e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.640477  normal  0.167986 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1530  type II secretion system protein  30.07 
 
 
301 aa  99  8e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3964  type II secretion system protein  33.47 
 
 
314 aa  98.2  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.273183 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3208  type II secretion system protein  29.71 
 
 
302 aa  98.2  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.544767 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1053  type II secretion system protein  30.69 
 
 
302 aa  95.9  8e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5490  type II secretion system protein  32.16 
 
 
324 aa  95.1  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6776  type II secretion system protein  32.16 
 
 
324 aa  95.1  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.710361  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6364  type II secretion system protein  32.16 
 
 
324 aa  95.5  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2351  type II secretion system protein  28.79 
 
 
323 aa  94.4  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.357093 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2571  type II secretion system protein  30.17 
 
 
303 aa  94  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7193  putative Flp pilus assembly protein TadC  31.72 
 
 
324 aa  92  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.202721  normal  0.456008 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2911  type II secretion system protein  34.1 
 
 
306 aa  88.6  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.604096  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2823  type II secretion system protein  34.88 
 
 
306 aa  88.2  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1831  type II secretion system protein  27.39 
 
 
304 aa  88.2  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6300  type II secretion system protein  37.72 
 
 
323 aa  87.8  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.923016 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1813  type II secretion system protein  30.48 
 
 
426 aa  86.7  5e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00328504  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6004  type II secretion system protein  37.13 
 
 
324 aa  86.3  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0374  type II secretion system protein F  29.52 
 
 
292 aa  85.9  8e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.249846  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1723  type II secretion system protein  27.03 
 
 
296 aa  84.3  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2314  type II secretion system protein  28.74 
 
 
317 aa  84.7  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5326  type II secretion system protein  35.58 
 
 
323 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0355396 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2118  type II secretion system protein  29.76 
 
 
310 aa  82  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.128736  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>