249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A1318 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A1318  type II secretion system protein  100 
 
 
319 aa  627  1e-179  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2968  type II secretion system protein  100 
 
 
319 aa  627  1e-179  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3093  type II secretion system protein  99.69 
 
 
319 aa  625  1e-178  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2276  hypothetical protein  96.96 
 
 
296 aa  532  1e-150  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6364  type II secretion system protein  65.73 
 
 
324 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5490  type II secretion system protein  65.73 
 
 
324 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6776  type II secretion system protein  65.73 
 
 
324 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.710361  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7193  putative Flp pilus assembly protein TadC  66.04 
 
 
324 aa  377  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.202721  normal  0.456008 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0639  type II secretion system protein  58.81 
 
 
323 aa  370  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6004  type II secretion system protein  65.73 
 
 
324 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2649  type II secretion system protein  59.56 
 
 
323 aa  363  3e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6300  type II secretion system protein  65.94 
 
 
323 aa  360  1e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.923016 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0586  type II secretion system protein  60.12 
 
 
320 aa  333  2e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.180812  normal  0.546922 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2557  type II secretion system protein  55.73 
 
 
314 aa  315  4e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.59617  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2352  type II secretion system protein  52.52 
 
 
313 aa  299  5e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0836815  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4619  type II secretion system protein  51.41 
 
 
318 aa  295  8e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.340215 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0801  type II secretion system protein  54.55 
 
 
312 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0650  putative tight adherence TadC-related transmembrane protein  50.81 
 
 
315 aa  282  6.000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.640477  normal  0.167986 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0543  type II secretion system protein  50 
 
 
313 aa  272  6e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0603407  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5326  type II secretion system protein  53.85 
 
 
323 aa  266  5e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0355396 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1530  type II secretion system protein  48.32 
 
 
301 aa  254  1.0000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0653  TadC protein  41.8 
 
 
313 aa  209  6e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.179736 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2365  hypothetical protein  42.75 
 
 
324 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.195084  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1107  type II secretion system protein  49.12 
 
 
323 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.107682  normal  0.160043 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2736  type II secretion system protein  44 
 
 
326 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0806  type II secretion system protein  38.78 
 
 
316 aa  196  5.000000000000001e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1754  Flp pilus assembly protein TadC  41.57 
 
 
326 aa  195  7e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1159  Type II secretion system F domain protein  43.4 
 
 
320 aa  194  1e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0793  TadC protein  42.53 
 
 
315 aa  193  4e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1916  type II secretion system protein  43.9 
 
 
312 aa  191  1e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.141806  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3208  type II secretion system protein  38.83 
 
 
302 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.544767 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2763  type II secretion system protein  40.53 
 
 
326 aa  186  7e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.613586 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1053  type II secretion system protein  37.79 
 
 
302 aa  183  3e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3011  type II secretion system protein  43.51 
 
 
319 aa  182  8.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3964  type II secretion system protein  45.57 
 
 
314 aa  180  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.273183 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2911  type II secretion system protein  37.94 
 
 
306 aa  176  5e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.604096  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1831  type II secretion system protein  40.82 
 
 
304 aa  175  7e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1500  type II secretion system protein  49.4 
 
 
319 aa  174  1.9999999999999998e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.34697  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2698  type II secretion system protein  43.51 
 
 
302 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2823  type II secretion system protein  40.8 
 
 
306 aa  170  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1124  type II secretion system protein  36.86 
 
 
331 aa  168  9e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0315206  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0992  type II secretion system protein  37.5 
 
 
326 aa  159  5e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.236675  normal  0.765371 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1524  type II secretion system protein  37.01 
 
 
322 aa  158  1e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2364  putative putative tight adherence TadC-like transmembrane protein  38.86 
 
 
321 aa  157  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00226483  normal  0.0303282 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0552  type II secretion system protein  38.72 
 
 
326 aa  157  3e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1903  putative Flp pilus assembly protein TadC  38.72 
 
 
326 aa  156  4e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0300  type II secretion system protein  37.92 
 
 
323 aa  153  4e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002651  type II/IV secretion system protein TadC associated with Flp pilus assembly  36.99 
 
 
313 aa  152  5e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3212  type II secretion system protein  36.22 
 
 
311 aa  152  5.9999999999999996e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.514288 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3795  type II secretion system protein  33.44 
 
 
321 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3357  type II secretion system protein  36.4 
 
 
327 aa  147  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2413  type II secretion system protein  37.45 
 
 
323 aa  147  3e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2021  type II secretion system protein  36.6 
 
 
320 aa  146  5e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.477325  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2351  type II secretion system protein  35.22 
 
 
323 aa  146  6e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.357093 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2485  type II secretion system protein  35.63 
 
 
323 aa  145  1e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.28616  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2708  type II secretion system protein  35.63 
 
 
323 aa  145  1e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.68845 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2832  type II secretion system protein  31.62 
 
 
319 aa  143  5e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.151252  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1276  type II secretion system protein  36.88 
 
 
311 aa  142  5e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2379  type II secretion system protein  31.72 
 
 
321 aa  142  6e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.306938  normal  0.924554 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2118  type II secretion system protein  33.84 
 
 
310 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.128736  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0602  type II secretion system protein  30.95 
 
 
323 aa  141  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0897257  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0238  type II secretion system protein  37.5 
 
 
322 aa  141  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0212  component of type IV pilus  34.43 
 
 
326 aa  141  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4481  type II secretion system protein  35.92 
 
 
328 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0728  type II secretion system protein  36.65 
 
 
333 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.552842  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4193  type II secretion system protein  35.41 
 
 
328 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1850  type II secretion system protein  36.73 
 
 
307 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0102974  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5120  type II secretion system protein  33.47 
 
 
321 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.229641  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3796  type II secretion system protein  37.95 
 
 
325 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.472243  normal  0.57339 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1680  type II secretion system protein  36.78 
 
 
311 aa  130  3e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000554602 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1017  von Willebrand factor type A; type II secretion system protein  42.53 
 
 
643 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4615  type II secretion system protein  40.34 
 
 
301 aa  128  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4002  type II secretion system protein  35.08 
 
 
329 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0289268  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3118  type II secretion system protein  42.77 
 
 
304 aa  127  3e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.803425  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0424  type II secretion system protein  41.92 
 
 
331 aa  126  5e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.628499  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0386  type II secretion system protein  34.01 
 
 
325 aa  125  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4446  type II secretion system protein  37.25 
 
 
293 aa  123  3e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0044747 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4205  type II secretion system protein  36 
 
 
324 aa  123  4e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.125721  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2571  type II secretion system protein  35.27 
 
 
303 aa  123  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1813  type II secretion system protein  31.49 
 
 
426 aa  123  5e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00328504  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0296  type II secretion system protein  34.87 
 
 
325 aa  122  9e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4188  type II secretion system protein  34.39 
 
 
328 aa  120  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1075  type II secretion system protein  39.29 
 
 
335 aa  121  1.9999999999999998e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.137371  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1125  type II secretion system protein  31.89 
 
 
347 aa  120  3e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.394553  normal  0.522315 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2016  type II secretion system protein  32.26 
 
 
307 aa  120  3e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3525  type II secretion system protein  33.2 
 
 
324 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.359223  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4864  type II secretion system protein  34.02 
 
 
330 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3718  type II secretion system protein  34.67 
 
 
324 aa  119  6e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.202594  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1779  type II secretion system protein  32.82 
 
 
324 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.708691  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2314  type II secretion system protein  37.97 
 
 
317 aa  115  7.999999999999999e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7036  putative pilus assembly protein  33.48 
 
 
324 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.452255 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0311  type II secretion system protein  30.37 
 
 
316 aa  115  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.563894  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2641  type II secretion system protein  32.03 
 
 
291 aa  113  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2047  type II secretion system protein  38.15 
 
 
318 aa  112  7.000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0677944  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3420  Type II secretion system F domain protein  39.18 
 
 
295 aa  112  8.000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.490118  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2650  type II secretion system protein  34.04 
 
 
294 aa  112  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0642  type II secretion system protein  35.41 
 
 
287 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0900  Type II secretion system F domain protein  36.99 
 
 
319 aa  109  8.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3350  type II secretion system protein  38.03 
 
 
309 aa  108  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0672  type II secretion system protein  36.42 
 
 
319 aa  108  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.139102  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>