211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3492 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_3492  type II secretion system protein  100 
 
 		 313 aa  626  1e-178  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.39955  normal  0.0861426 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2016  type II secretion system protein  44.84 
 
 		 307 aa  199  3.9999999999999996e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1125  type II secretion system protein  31.37 
 
 		 347 aa  154  1e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.394553  normal  0.522315 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4864  type II secretion system protein  40 
 
 		 330 aa  155  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1517  hypothetical protein  36.29 
 
 		 320 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.205257  normal  0.198842 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1075  type II secretion system protein  41.42 
 
 		 335 aa  142  9.999999999999999e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.137371  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2694  type II secretion system protein  37.43 
 
 		 320 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3795  type II secretion system protein  31.48 
 
 		 321 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0386  type II secretion system protein  32.67 
 
 		 325 aa  124  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4188  type II secretion system protein  38.24 
 
 		 328 aa  124  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2379  type II secretion system protein  40.34 
 
 		 321 aa  124  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.306938  normal  0.924554 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1159  Type II secretion system F domain protein  33.02 
 
 		 320 aa  123  4e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2832  type II secretion system protein  38.73 
 
 		 319 aa  122  7e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.151252  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4193  type II secretion system protein  38.86 
 
 		 328 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4481  type II secretion system protein  38.29 
 
 		 328 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1779  type II secretion system protein  36.26 
 
 		 324 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.708691  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0212  component of type IV pilus  30.19 
 
 		 326 aa  120  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7036  putative pilus assembly protein  29.03 
 
 		 324 aa  120  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.452255 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0728  type II secretion system protein  30.61 
 
 		 333 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.552842  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3357  type II secretion system protein  34.27 
 
 		 327 aa  119  6e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0602  type II secretion system protein  33.18 
 
 		 323 aa  119  6e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0897257  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0424  type II secretion system protein  36.26 
 
 		 331 aa  119  7e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.628499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3426  type II secretion system protein  35.67 
 
 		 314 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.165732  normal  0.426073 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3796  type II secretion system protein  38.15 
 
 		 325 aa  119  9e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.472243  normal  0.57339 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0296  type II secretion system protein  31.68 
 
 		 325 aa  118  9.999999999999999e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0238  type II secretion system protein  37.36 
 
 		 322 aa  118  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5120  type II secretion system protein  33.19 
 
 		 321 aa  118  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.229641  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3718  type II secretion system protein  35.26 
 
 		 324 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.202594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3933  type II secretion system protein  35.67 
 
 		 314 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0787436  normal  0.204466 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1500  type II secretion system protein  36.99 
 
 		 319 aa  116  5e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.34697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2052  type II secretion system protein  35.93 
 
 		 314 aa  116  6e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000269982  normal  0.0927482 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4002  type II secretion system protein  37.27 
 
 		 329 aa  116  6e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0289268  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0806  type II secretion system protein  32.85 
 
 		 316 aa  116  6e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2364  putative putative tight adherence TadC-like transmembrane protein  32.27 
 
 		 321 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00226483  normal  0.0303282 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2021  type II secretion system protein  34.91 
 
 		 320 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.477325  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4205  type II secretion system protein  33.95 
 
 		 324 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.125721  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3964  type II secretion system protein  33.78 
 
 		 314 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.273183 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3525  type II secretion system protein  36.59 
 
 		 324 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.359223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002651  type II/IV secretion system protein TadC associated with Flp pilus assembly  29.49 
 
 		 313 aa  113  3e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2708  type II secretion system protein  36.57 
 
 		 323 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.68845 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0672  type II secretion system protein  32.16 
 
 		 319 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.139102  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2485  type II secretion system protein  36.57 
 
 		 323 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.28616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2413  type II secretion system protein  37.87 
 
 		 323 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0793  TadC protein  34.25 
 
 		 315 aa  110  3e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2454  type II secretion system protein F  32.26 
 
 		 290 aa  110  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0182293  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0900  Type II secretion system F domain protein  34.12 
 
 		 319 aa  109  5e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2365  hypothetical protein  32.54 
 
 		 324 aa  109  6e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.195084  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2046  putative fimbriae-related membrane protein  30.2 
 
 		 314 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0336894  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1675  type II secretion system protein F  30.2 
 
 		 314 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0331  type II secretion system protein F  30.2 
 
 		 314 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0097112  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1878  type II secretion system protein  30.2 
 
 		 314 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.650462  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1890  type II secretion system protein  30.2 
 
 		 314 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0830  type II secretion system protein F  30.2 
 
 		 314 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.288216  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3011  type II secretion system protein  33.05 
 
 		 319 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0311  type II secretion system protein  36.24 
 
 		 316 aa  106  4e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.563894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0992  type II secretion system protein  33.72 
 
 		 326 aa  106  6e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.236675  normal  0.765371 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2047  type II secretion system protein  33.15 
 
 		 318 aa  106  6e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0677944  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2763  type II secretion system protein  32.47 
 
 		 326 aa  106  6e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.613586 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0653  TadC protein  31.49 
 
 		 313 aa  104  2e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.179736 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2736  type II secretion system protein  33.7 
 
 		 326 aa  104  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1754  Flp pilus assembly protein TadC  27.71 
 
 		 326 aa  102  7e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1107  type II secretion system protein  29.58 
 
 		 323 aa  102  9e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.107682  normal  0.160043 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1916  type II secretion system protein  33.16 
 
 		 312 aa  102  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.141806  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1903  putative Flp pilus assembly protein TadC  31.98 
 
 		 326 aa  100  4e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0552  type II secretion system protein  31.98 
 
 		 326 aa  100  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2571  type II secretion system protein  31.75 
 
 		 303 aa  99  9e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0300  type II secretion system protein  32.54 
 
 		 323 aa  97.4  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4619  type II secretion system protein  29.44 
 
 		 318 aa  95.9  8e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.340215 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1524  type II secretion system protein  31.84 
 
 		 322 aa  95.9  9e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2823  type II secretion system protein  36.65 
 
 		 306 aa  95.1  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2911  type II secretion system protein  35.75 
 
 		 306 aa  95.1  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.604096  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2314  type II secretion system protein  24.39 
 
 		 317 aa  94.7  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3212  type II secretion system protein  31.18 
 
 		 311 aa  94.7  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.514288 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4446  type II secretion system protein  28.99 
 
 		 293 aa  93.6  4e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0044747 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06191  hypothetical protein  26.95 
 
 		 280 aa  93.2  5e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2557  type II secretion system protein  28.42 
 
 		 314 aa  92.4  8e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.59617  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1124  type II secretion system protein  29.41 
 
 		 331 aa  92  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0315206  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1530  type II secretion system protein  27.72 
 
 		 301 aa  91.7  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2352  type II secretion system protein  31.14 
 
 		 313 aa  90.9  3e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0836815  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3420  Type II secretion system F domain protein  31.72 
 
 		 295 aa  90.9  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.490118  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1017  von Willebrand factor type A; type II secretion system protein  33.15 
 
 		 643 aa  90.1  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1276  type II secretion system protein  27.43 
 
 		 311 aa  88.2  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0650  putative tight adherence TadC-related transmembrane protein  27.34 
 
 		 315 aa  87.4  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.640477  normal  0.167986 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2118  type II secretion system protein  28.9 
 
 		 310 aa  87.4  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.128736  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2641  type II secretion system protein  27.98 
 
 		 291 aa  85.5  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0639  type II secretion system protein  27.36 
 
 		 323 aa  85.1  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2698  type II secretion system protein  30.29 
 
 		 302 aa  84.7  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0543  type II secretion system protein  24.6 
 
 		 313 aa  84  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0603407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2935  type II secretion system protein  30 
 
 		 294 aa  84  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0849088  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2927  type II secretion system protein  30.48 
 
 		 292 aa  82.8  0.000000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0944491  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2649  type II secretion system protein  29.76 
 
 		 323 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0586  type II secretion system protein  32.74 
 
 		 320 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.180812  normal  0.546922 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0610  type II secretion system protein  25 
 
 		 281 aa  82  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1680  type II secretion system protein  26.01 
 
 		 311 aa  81.3  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000554602 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2351  type II secretion system protein  27.88 
 
 		 323 aa  81.3  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.357093 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3118  type II secretion system protein  33.77 
 
 		 304 aa  81.6  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.803425  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2650  type II secretion system protein  29.09 
 
 		 294 aa  81.6  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1318  type II secretion system protein  31.14 
 
 		 319 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6300  type II secretion system protein  33.33 
 
 		 323 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.923016 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2968  type II secretion system protein  31.14 
 
 		 319 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>