158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1211 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1211  Type II secretion system F domain protein  100 
 
 		 313 aa  585  1e-166  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1649  type II secretion system protein  55.56 
 
 		 311 aa  290  2e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.2409  hitchhiker  0.00110779 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5824  type II secretion system protein  54.52 
 
 		 338 aa  287  2e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.993294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0781  type II secretion system protein  53.77 
 
 		 316 aa  286  2.9999999999999996e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1737  type II secretion system protein  51.16 
 
 		 311 aa  279  5e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2671  type II secretion system protein  47.04 
 
 		 313 aa  232  6e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2406  type II secretion system protein  44.66 
 
 		 312 aa  229  5e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0371172 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1254  type II secretion system protein  48.38 
 
 		 312 aa  225  7e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.23353  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1031  type II secretion system protein  49.64 
 
 		 312 aa  220  1.9999999999999999e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2789  type II secretion system protein  51.26 
 
 		 315 aa  201  9.999999999999999e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00278324 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20400  Flp pilus assembly protein TadB  43.52 
 
 		 314 aa  194  2e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1237  Type II secretion system F domain protein  51.81 
 
 		 309 aa  192  8e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10340  Flp pilus assembly protein TadB  48.04 
 
 		 309 aa  190  2e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00075176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0858  type II secretion system protein  38.79 
 
 		 311 aa  169  6e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07520  Flp pilus assembly protein TadC  43.07 
 
 		 313 aa  169  6e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3787  type II secretion system protein  45.45 
 
 		 295 aa  146  5e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0665963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1276  type II secretion system protein  29.03 
 
 		 311 aa  82  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1850  type II secretion system protein  30.4 
 
 		 307 aa  80.9  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0102974  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3212  type II secretion system protein  28.24 
 
 		 311 aa  77.4  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.514288 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2118  type II secretion system protein  25.4 
 
 		 310 aa  75.1  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.128736  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1680  type II secretion system protein  29.78 
 
 		 311 aa  75.1  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000554602 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4615  type II secretion system protein  32.1 
 
 		 301 aa  75.5  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1399  type II secretion system protein  32.69 
 
 		 299 aa  74.3  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0535811  hitchhiker  0.000124146 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1159  Type II secretion system F domain protein  29.09 
 
 		 320 aa  74.7  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1107  type II secretion system protein  27.85 
 
 		 323 aa  74.3  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.107682  normal  0.160043 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3350  type II secretion system protein  34.75 
 
 		 309 aa  72.8  0.000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4157  type II secretion system protein  35.46 
 
 		 309 aa  72.8  0.000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2698  type II secretion system protein  29.05 
 
 		 302 aa  70.5  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1017  von Willebrand factor type A; type II secretion system protein  26.67 
 
 		 643 aa  69.7  0.00000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2114  type II secretion system protein  29.14 
 
 		 288 aa  69.3  0.00000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2307  Type II secretion system F domain protein  29.53 
 
 		 298 aa  68.9  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2763  type II secretion system protein  30.57 
 
 		 326 aa  68.6  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.613586 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3118  type II secretion system protein  28.75 
 
 		 304 aa  68.2  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.803425  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002651  type II/IV secretion system protein TadC associated with Flp pilus assembly  29.45 
 
 		 313 aa  67  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2557  type II secretion system protein  27.4 
 
 		 314 aa  67  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.59617  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4348  type II secretion system protein  28.45 
 
 		 292 aa  67  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0767  Type II secretion system F domain protein  29.68 
 
 		 269 aa  66.6  0.0000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0805  type II secretion system protein  30 
 
 		 332 aa  66.6  0.0000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2736  type II secretion system protein  26.63 
 
 		 326 aa  66.6  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1831  type II secretion system protein  28.19 
 
 		 304 aa  66.2  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0806  type II secretion system protein  30.07 
 
 		 316 aa  65.9  0.0000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2696  type II secretion system protein  29.3 
 
 		 301 aa  65.9  0.0000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0581937  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0710  putative type II secretion system protein F  32.87 
 
 		 287 aa  65.9  0.0000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1754  type II secretion system protein  24.5 
 
 		 295 aa  65.5  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00143607  normal  0.105402 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0653  TadC protein  28.76 
 
 		 313 aa  64.3  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.179736 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2365  hypothetical protein  28.99 
 
 		 324 aa  65.1  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.195084  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1204  type II secretion system protein  25.64 
 
 		 296 aa  64.3  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.59428  hitchhiker  0.000000109908 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4446  type II secretion system protein  27.49 
 
 		 293 aa  64.7  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0044747 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0586  type II secretion system protein  30.77 
 
 		 320 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.180812  normal  0.546922 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7193  putative Flp pilus assembly protein TadC  29.65 
 
 		 324 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.202721  normal  0.456008 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2364  putative putative tight adherence TadC-like transmembrane protein  28.09 
 
 		 321 aa  64.3  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00226483  normal  0.0303282 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1043  Type II secretion system F domain protein  28.46 
 
 		 305 aa  63.5  0.000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.809436  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0746  type II secretion system protein  27.75 
 
 		 287 aa  63.2  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.271129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3420  Type II secretion system F domain protein  30.2 
 
 		 295 aa  62.4  0.000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.490118  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0801  type II secretion system protein  27.31 
 
 		 312 aa  62.8  0.000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2486  type II secretion system protein  28.29 
 
 		 294 aa  62.4  0.000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.766494  hitchhiker  0.000200331 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2276  putative integral membrane protein  29.91 
 
 		 273 aa  62.4  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.846433  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5490  type II secretion system protein  29.15 
 
 		 324 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6776  type II secretion system protein  29.15 
 
 		 324 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.710361  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6364  type II secretion system protein  29.15 
 
 		 324 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2923  putative type II secretion system protein F  26.97 
 
 		 293 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0300  type II secretion system protein  24.09 
 
 		 323 aa  61.6  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2016  type II secretion system protein  26.32 
 
 		 307 aa  60.5  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1530  type II secretion system protein  29.11 
 
 		 301 aa  60.1  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2641  type II secretion system protein  28.75 
 
 		 291 aa  59.3  0.00000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1903  putative Flp pilus assembly protein TadC  23.64 
 
 		 326 aa  59.3  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0552  type II secretion system protein  23.64 
 
 		 326 aa  59.3  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1524  type II secretion system protein  28.8 
 
 		 322 aa  58.9  0.00000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2650  type II secretion system protein  28.41 
 
 		 294 aa  59.3  0.00000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0374  type II secretion system protein F  28.81 
 
 		 292 aa  58.5  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.249846  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0728  type II secretion system protein  25.87 
 
 		 333 aa  58.9  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.552842  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1075  type II secretion system protein  28.78 
 
 		 335 aa  58.2  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.137371  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0992  type II secretion system protein  24.31 
 
 		 326 aa  57.8  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.236675  normal  0.765371 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0249  type II secretion system protein  26.79 
 
 		 313 aa  57.4  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.876214 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2021  type II secretion system protein  26.8 
 
 		 320 aa  57.4  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.477325  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1124  type II secretion system protein  26.52 
 
 		 331 aa  56.6  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0315206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1500  type II secretion system protein  25.6 
 
 		 319 aa  56.6  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.34697  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2565  Type II secretion system F domain protein  29.69 
 
 		 299 aa  56.2  0.0000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.725543  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0672  type II secretion system protein  28.16 
 
 		 319 aa  56.2  0.0000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.139102  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2351  type II secretion system protein  26.57 
 
 		 323 aa  55.8  0.0000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.357093 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1318  type II secretion system protein  27.74 
 
 		 319 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0793  TadC protein  27.97 
 
 		 315 aa  55.5  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1032  type II secretion system protein  34.31 
 
 		 204 aa  55.8  0.000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2968  type II secretion system protein  27.74 
 
 		 319 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3511  type II secretion system protein  32.91 
 
 		 302 aa  55.1  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.798024  normal  0.0839848 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4864  type II secretion system protein  30.51 
 
 		 330 aa  55.1  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2276  hypothetical protein  27.75 
 
 		 296 aa  54.7  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3093  type II secretion system protein  27.74 
 
 		 319 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4188  type II secretion system protein  28.57 
 
 		 328 aa  54.3  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2927  type II secretion system protein  26.75 
 
 		 292 aa  53.9  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0944491  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0900  Type II secretion system F domain protein  27.59 
 
 		 319 aa  53.9  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4618  type II secretion system protein  32.05 
 
 		 325 aa  54.3  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.347884 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13140  Flp pilus assembly protein TadC  29.59 
 
 		 306 aa  53.9  0.000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2047  type II secretion system protein  29.41 
 
 		 318 aa  53.5  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0677944  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1125  type II secretion system protein  27.12 
 
 		 347 aa  53.1  0.000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.394553  normal  0.522315 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0642  type II secretion system protein  25.87 
 
 		 287 aa  53.5  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2911  type II secretion system protein  28.93 
 
 		 306 aa  52.4  0.000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.604096  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2935  type II secretion system protein  25.64 
 
 		 294 aa  52.4  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0849088  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6300  type II secretion system protein  27.68 
 
 		 323 aa  51.6  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.923016 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0424  type II secretion system protein  26.21 
 
 		 331 aa  50.8  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.628499  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>