221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_20400 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_20400  Flp pilus assembly protein TadB  100 
 
 		 314 aa  593  1e-168  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1737  type II secretion system protein  44.69 
 
 		 311 aa  226  3e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2671  type II secretion system protein  45.52 
 
 		 313 aa  225  6e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0781  type II secretion system protein  45.42 
 
 		 316 aa  224  1e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2406  type II secretion system protein  42.67 
 
 		 312 aa  215  7e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0371172 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1031  type II secretion system protein  46.69 
 
 		 312 aa  209  4e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2789  type II secretion system protein  51.09 
 
 		 315 aa  205  6e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00278324 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5824  type II secretion system protein  50 
 
 		 338 aa  201  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.993294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1649  type II secretion system protein  41.9 
 
 		 311 aa  193  2e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.2409  hitchhiker  0.00110779 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1254  type II secretion system protein  38.94 
 
 		 312 aa  186  5e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.23353  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0858  type II secretion system protein  41.12 
 
 		 311 aa  186  6e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1237  Type II secretion system F domain protein  43.77 
 
 		 309 aa  179  4e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1211  Type II secretion system F domain protein  43.52 
 
 		 313 aa  177  2e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10340  Flp pilus assembly protein TadB  43.4 
 
 		 309 aa  177  2e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00075176  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07520  Flp pilus assembly protein TadC  41.49 
 
 		 313 aa  177  2e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3787  type II secretion system protein  41.44 
 
 		 295 aa  149  6e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0665963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1850  type II secretion system protein  34.2 
 
 		 307 aa  92.4  8e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0102974  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2118  type II secretion system protein  30.53 
 
 		 310 aa  92  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.128736  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4615  type II secretion system protein  29.63 
 
 		 301 aa  84  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2016  type II secretion system protein  32.54 
 
 		 307 aa  83.2  0.000000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2364  putative putative tight adherence TadC-like transmembrane protein  30.8 
 
 		 321 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00226483  normal  0.0303282 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3212  type II secretion system protein  26.26 
 
 		 311 aa  78.6  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.514288 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1276  type II secretion system protein  28.85 
 
 		 311 aa  78.6  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3118  type II secretion system protein  30.8 
 
 		 304 aa  77  0.0000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.803425  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0806  type II secretion system protein  27.69 
 
 		 316 aa  73.9  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2641  type II secretion system protein  32.1 
 
 		 291 aa  73.2  0.000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0793  TadC protein  29.12 
 
 		 315 aa  72.4  0.000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2021  type II secretion system protein  30.92 
 
 		 320 aa  72  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.477325  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2694  type II secretion system protein  32.51 
 
 		 320 aa  72  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2276  putative integral membrane protein  34.62 
 
 		 273 aa  71.2  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.846433  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2114  type II secretion system protein  28.74 
 
 		 288 aa  71.2  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4446  type II secretion system protein  29.78 
 
 		 293 aa  70.9  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0044747 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2650  type II secretion system protein  28.16 
 
 		 294 aa  70.5  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4157  type II secretion system protein  26.24 
 
 		 309 aa  70.1  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3420  Type II secretion system F domain protein  33.52 
 
 		 295 aa  69.7  0.00000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.490118  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2314  type II secretion system protein  26.8 
 
 		 317 aa  69.3  0.00000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3350  type II secretion system protein  30.35 
 
 		 309 aa  68.9  0.00000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1754  Flp pilus assembly protein TadC  28.99 
 
 		 326 aa  68.6  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2763  type II secretion system protein  28.14 
 
 		 326 aa  68.6  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.613586 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3426  type II secretion system protein  31.28 
 
 		 314 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.165732  normal  0.426073 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002651  type II/IV secretion system protein TadC associated with Flp pilus assembly  28.21 
 
 		 313 aa  68.6  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3208  type II secretion system protein  27.84 
 
 		 302 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.544767 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1053  type II secretion system protein  27.17 
 
 		 302 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1680  type II secretion system protein  28.46 
 
 		 311 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000554602 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2557  type II secretion system protein  31.06 
 
 		 314 aa  67  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.59617  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0602  type II secretion system protein  28.81 
 
 		 323 aa  67  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0897257  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1530  type II secretion system protein  30.46 
 
 		 301 aa  66.6  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2927  type II secretion system protein  28.95 
 
 		 292 aa  65.9  0.0000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0944491  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2486  type II secretion system protein  26.51 
 
 		 294 aa  65.1  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.766494  hitchhiker  0.000200331 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3933  type II secretion system protein  31.43 
 
 		 314 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0787436  normal  0.204466 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4481  type II secretion system protein  26.23 
 
 		 328 aa  64.7  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1517  hypothetical protein  27.75 
 
 		 320 aa  65.1  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.205257  normal  0.198842 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0653  TadC protein  26.14 
 
 		 313 aa  63.9  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.179736 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0212  component of type IV pilus  27.91 
 
 		 326 aa  63.5  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0639  type II secretion system protein  26.32 
 
 		 323 aa  63.5  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2365  hypothetical protein  26.75 
 
 		 324 aa  63.2  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.195084  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4618  type II secretion system protein  32.97 
 
 		 325 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.347884 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0710  putative type II secretion system protein F  28.08 
 
 		 287 aa  63.2  0.000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0249  type II secretion system protein  28.83 
 
 		 313 aa  63.2  0.000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.876214 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1017  von Willebrand factor type A; type II secretion system protein  28.25 
 
 		 643 aa  63.2  0.000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4864  type II secretion system protein  31.97 
 
 		 330 aa  62.8  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1075  type II secretion system protein  31.65 
 
 		 335 aa  62  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.137371  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1043  Type II secretion system F domain protein  34.83 
 
 		 305 aa  61.6  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.809436  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2935  type II secretion system protein  27.06 
 
 		 294 aa  61.2  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0849088  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4205  type II secretion system protein  28.95 
 
 		 324 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.125721  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1107  type II secretion system protein  27.17 
 
 		 323 aa  61.2  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.107682  normal  0.160043 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1159  Type II secretion system F domain protein  28.18 
 
 		 320 aa  61.6  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7036  putative pilus assembly protein  29.32 
 
 		 324 aa  61.6  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.452255 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3357  type II secretion system protein  26.22 
 
 		 327 aa  61.6  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2379  type II secretion system protein  25.32 
 
 		 321 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.306938  normal  0.924554 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1779  type II secretion system protein  30.14 
 
 		 324 aa  60.8  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.708691  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0300  type II secretion system protein  26.89 
 
 		 323 aa  60.8  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1125  type II secretion system protein  24.82 
 
 		 347 aa  60.5  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.394553  normal  0.522315 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0767  Type II secretion system F domain protein  27.7 
 
 		 269 aa  60.5  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2649  type II secretion system protein  28.12 
 
 		 323 aa  60.1  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4002  type II secretion system protein  27.23 
 
 		 329 aa  60.1  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0289268  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1500  type II secretion system protein  25.77 
 
 		 319 aa  60.1  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.34697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4193  type II secretion system protein  27.17 
 
 		 328 aa  60.1  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6003  type II secretion system protein  31.58 
 
 		 325 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2454  type II secretion system protein F  26.55 
 
 		 290 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0182293  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2565  Type II secretion system F domain protein  32.84 
 
 		 299 aa  58.9  0.00000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.725543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0640  type II secretion system protein  25.83 
 
 		 325 aa  59.3  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.295246 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2571  type II secretion system protein  26.27 
 
 		 303 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2736  type II secretion system protein  27.93 
 
 		 326 aa  58.5  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2923  putative type II secretion system protein F  27.27 
 
 		 293 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1018  type II secretion system protein  31.62 
 
 		 336 aa  58.9  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4619  type II secretion system protein  28.66 
 
 		 318 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.340215 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2353  type II secretion system protein  31.87 
 
 		 323 aa  58.2  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.173092  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0746  type II secretion system protein  24.46 
 
 		 287 aa  58.5  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.271129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3492  type II secretion system protein  24.48 
 
 		 313 aa  57.4  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.39955  normal  0.0861426 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1754  type II secretion system protein  27.11 
 
 		 295 aa  57.4  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00143607  normal  0.105402 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2832  type II secretion system protein  25.29 
 
 		 319 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.151252  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2352  type II secretion system protein  28.75 
 
 		 313 aa  57.4  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0836815  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0586  type II secretion system protein  27.53 
 
 		 320 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.180812  normal  0.546922 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6299  type II secretion system protein  30.92 
 
 		 325 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3525  type II secretion system protein  26.29 
 
 		 324 aa  57  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.359223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0386  type II secretion system protein  25.23 
 
 		 325 aa  57  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0074  type II secretion system protein  28 
 
 		 315 aa  57  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.557722  normal  0.8398 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5120  type II secretion system protein  27 
 
 		 321 aa  57  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.229641  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0587  type II secretion system protein  27.88 
 
 		 325 aa  56.6  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.292089  normal  0.415996 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>