160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1737 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_1737  type II secretion system protein  100 
 
 
311 aa  605  9.999999999999999e-173  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0781  type II secretion system protein  49.52 
 
 
316 aa  259  3e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1211  Type II secretion system F domain protein  51.8 
 
 
313 aa  247  2e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5824  type II secretion system protein  49.04 
 
 
338 aa  242  6e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.993294  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1254  type II secretion system protein  49.01 
 
 
312 aa  238  1e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.23353  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1649  type II secretion system protein  48.07 
 
 
311 aa  236  5.0000000000000005e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.2409  hitchhiker  0.00110779 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1031  type II secretion system protein  50 
 
 
312 aa  234  2.0000000000000002e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2406  type II secretion system protein  42.77 
 
 
312 aa  219  3e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0371172 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20400  Flp pilus assembly protein TadB  44.69 
 
 
314 aa  214  9.999999999999999e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2671  type II secretion system protein  42.07 
 
 
313 aa  209  7e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2789  type II secretion system protein  47.87 
 
 
315 aa  202  5e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00278324 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1237  Type II secretion system F domain protein  49.64 
 
 
309 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10340  Flp pilus assembly protein TadB  45.26 
 
 
309 aa  186  3e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00075176  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0858  type II secretion system protein  40.52 
 
 
311 aa  184  1.0000000000000001e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07520  Flp pilus assembly protein TadC  42.66 
 
 
313 aa  168  1e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3787  type II secretion system protein  53.19 
 
 
295 aa  135  7.000000000000001e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0665963  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3212  type II secretion system protein  30.9 
 
 
311 aa  83.6  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.514288 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2557  type II secretion system protein  29.76 
 
 
314 aa  71.2  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.59617  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3118  type II secretion system protein  30.26 
 
 
304 aa  71.6  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.803425  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1276  type II secretion system protein  26.02 
 
 
311 aa  71.2  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1017  von Willebrand factor type A; type II secretion system protein  31.08 
 
 
643 aa  70.5  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4615  type II secretion system protein  29.19 
 
 
301 aa  70.9  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1204  type II secretion system protein  28.74 
 
 
296 aa  70.5  0.00000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.59428  hitchhiker  0.000000109908 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1850  type II secretion system protein  28.19 
 
 
307 aa  69.7  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0102974  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0639  type II secretion system protein  30.73 
 
 
323 aa  69.3  0.00000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2118  type II secretion system protein  24.6 
 
 
310 aa  69.3  0.00000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.128736  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0653  TadC protein  28.42 
 
 
313 aa  68.6  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.179736 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1107  type II secretion system protein  28.1 
 
 
323 aa  67.8  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.107682  normal  0.160043 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2114  type II secretion system protein  24.91 
 
 
288 aa  67.8  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2486  type II secretion system protein  28.97 
 
 
294 aa  67.4  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.766494  hitchhiker  0.000200331 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3350  type II secretion system protein  30.61 
 
 
309 aa  66.6  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2649  type II secretion system protein  30.67 
 
 
323 aa  66.2  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0806  type II secretion system protein  26.32 
 
 
316 aa  66.2  0.0000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4157  type II secretion system protein  30.87 
 
 
309 aa  66.2  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1043  Type II secretion system F domain protein  29.88 
 
 
305 aa  66.2  0.0000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.809436  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0586  type II secretion system protein  29.19 
 
 
320 aa  65.9  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.180812  normal  0.546922 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2314  type II secretion system protein  26.47 
 
 
317 aa  65.1  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1399  type II secretion system protein  29.75 
 
 
299 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0535811  hitchhiker  0.000124146 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2736  type II secretion system protein  29.38 
 
 
326 aa  65.5  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1680  type II secretion system protein  26.42 
 
 
311 aa  63.9  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000554602 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2365  hypothetical protein  29.52 
 
 
324 aa  63.5  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.195084  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2016  type II secretion system protein  25.64 
 
 
307 aa  63.2  0.000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2641  type II secretion system protein  25.64 
 
 
291 aa  62.8  0.000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0793  TadC protein  25.41 
 
 
315 aa  62  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0650  putative tight adherence TadC-related transmembrane protein  35.15 
 
 
315 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.640477  normal  0.167986 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2276  putative integral membrane protein  28.89 
 
 
273 aa  61.6  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.846433  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0374  type II secretion system protein F  26.09 
 
 
292 aa  60.8  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.249846  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0300  type II secretion system protein  31.03 
 
 
323 aa  61.2  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0728  type II secretion system protein  27.84 
 
 
333 aa  59.7  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.552842  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5490  type II secretion system protein  26.86 
 
 
324 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6776  type II secretion system protein  26.86 
 
 
324 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.710361  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0710  putative type II secretion system protein F  27.78 
 
 
287 aa  59.7  0.00000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2307  Type II secretion system F domain protein  25.95 
 
 
298 aa  59.3  0.00000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6364  type II secretion system protein  26.86 
 
 
324 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4446  type II secretion system protein  26.53 
 
 
293 aa  58.9  0.00000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0044747 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1318  type II secretion system protein  26.4 
 
 
319 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2968  type II secretion system protein  26.4 
 
 
319 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7193  putative Flp pilus assembly protein TadC  26.29 
 
 
324 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.202721  normal  0.456008 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0587  type II secretion system protein  31.54 
 
 
325 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.292089  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13140  Flp pilus assembly protein TadC  32.85 
 
 
306 aa  58.2  0.0000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3208  type II secretion system protein  24.31 
 
 
302 aa  58.2  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.544767 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3093  type II secretion system protein  26.4 
 
 
319 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2352  type II secretion system protein  26.42 
 
 
313 aa  57.8  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0836815  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6300  type II secretion system protein  28.57 
 
 
323 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.923016 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0767  Type II secretion system F domain protein  29.87 
 
 
269 aa  57  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2276  hypothetical protein  26.4 
 
 
296 aa  57  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2763  type II secretion system protein  26.64 
 
 
326 aa  57  0.0000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.613586 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0249  type II secretion system protein  27.95 
 
 
313 aa  57  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.876214 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4618  type II secretion system protein  28.08 
 
 
325 aa  57  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.347884 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1517  hypothetical protein  28.22 
 
 
320 aa  56.6  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.205257  normal  0.198842 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1124  type II secretion system protein  25.67 
 
 
331 aa  56.6  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0315206  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6004  type II secretion system protein  28.57 
 
 
324 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2379  type II secretion system protein  27.36 
 
 
321 aa  56.6  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.306938  normal  0.924554 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002651  type II/IV secretion system protein TadC associated with Flp pilus assembly  25.13 
 
 
313 aa  56.2  0.0000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0640  type II secretion system protein  27.09 
 
 
325 aa  55.8  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.295246 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1053  type II secretion system protein  24.48 
 
 
302 aa  55.8  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3420  Type II secretion system F domain protein  26.45 
 
 
295 aa  55.8  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.490118  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1813  type II secretion system protein  23.42 
 
 
426 aa  55.8  0.0000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00328504  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1159  Type II secretion system F domain protein  24.68 
 
 
320 aa  55.8  0.0000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1032  type II secretion system protein  32.68 
 
 
204 aa  55.5  0.000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4619  type II secretion system protein  26.59 
 
 
318 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.340215 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4002  type II secretion system protein  27.59 
 
 
329 aa  54.7  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0289268  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0642  type II secretion system protein  23.79 
 
 
287 aa  55.1  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1831  type II secretion system protein  26.99 
 
 
304 aa  53.9  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1075  type II secretion system protein  29.07 
 
 
335 aa  53.5  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.137371  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4188  type II secretion system protein  28 
 
 
328 aa  53.5  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0746  type II secretion system protein  22.85 
 
 
287 aa  53.5  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.271129  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2650  type II secretion system protein  24.53 
 
 
294 aa  53.5  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0543  type II secretion system protein  30 
 
 
313 aa  53.1  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0603407  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2021  type II secretion system protein  24.08 
 
 
320 aa  52.8  0.000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.477325  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1125  type II secretion system protein  28.02 
 
 
347 aa  52.8  0.000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.394553  normal  0.522315 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2694  type II secretion system protein  29.75 
 
 
320 aa  52.8  0.000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1530  type II secretion system protein  26.85 
 
 
301 aa  52  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4864  type II secretion system protein  28.42 
 
 
330 aa  52  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2696  type II secretion system protein  26.97 
 
 
301 aa  52  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0581937  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2648  type II secretion system protein  27.69 
 
 
325 aa  51.6  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.846327  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1903  putative Flp pilus assembly protein TadC  27.01 
 
 
326 aa  51.2  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0424  type II secretion system protein  27.81 
 
 
331 aa  51.2  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.628499  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2927  type II secretion system protein  23.67 
 
 
292 aa  51.2  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0944491  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0552  type II secretion system protein  27.01 
 
 
326 aa  51.6  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>