82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0482 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0482  hypothetical protein  100 
 
 		 193 aa  357  8e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.971848 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0216  type II secretion system protein  62.18 
 
 		 260 aa  168  6e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5326  Type II secretion system F domain protein  46.84 
 
 		 236 aa  125  4.0000000000000003e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00292685  normal  0.534868 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4419  type II secretion system protein  48.88 
 
 		 255 aa  117  9e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.219258  hitchhiker  0.00591921 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4836  type II secretion system protein  59.31 
 
 		 208 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0366  type II secretion system protein  41.94 
 
 		 240 aa  107  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00194473  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0126  putative integral membrane protein  48.78 
 
 		 246 aa  105  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0160124  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0594  Type II secretion system F domain protein  49.65 
 
 		 237 aa  105  3e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4037  type II secretion system protein  50 
 
 		 253 aa  103  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4298  type II secretion system protein  43.37 
 
 		 448 aa  100  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.273888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1980  type II secretion system protein  43.87 
 
 		 203 aa  92  4e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35900  Flp pilus assembly protein TadC  42.86 
 
 		 212 aa  91.7  6e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.630177  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0520  Type II secretion system F domain protein  44.44 
 
 		 202 aa  90.9  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.691642  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5868  type II secretion system protein  36.31 
 
 		 220 aa  86.7  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0188424  normal  0.16235 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3906  Type II secretion system F domain protein  41.91 
 
 		 197 aa  83.6  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0050  type II secretion system protein  43.26 
 
 		 234 aa  81.3  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0278  type II secretion system protein  40 
 
 		 185 aa  73.6  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0326  type II secretion system protein  40.97 
 
 		 183 aa  68.9  0.00000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.173392  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25280  Flp pilus assembly protein TadC  36.84 
 
 		 211 aa  65.9  0.0000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5190  type II secretion system protein  38.89 
 
 		 192 aa  65.1  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.139596  decreased coverage  0.0000686887 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0621  type II secretion system protein  35.81 
 
 		 179 aa  64.7  0.0000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.873004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3159  type II secretion system protein  36.99 
 
 		 200 aa  64.3  0.0000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.127663 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0731  type II secretion system protein  38.26 
 
 		 267 aa  63.5  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0847953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5405  type II secretion system protein  37.28 
 
 		 191 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.901064  normal  0.137525 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0317  type II secretion system protein  60.94 
 
 		 519 aa  59.7  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0140124  normal  0.422936 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2406  type II secretion system protein  28.67 
 
 		 312 aa  60.1  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0371172 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4889  type II secretion system protein  43.81 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.944047  normal  0.0709188 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4803  type II secretion system protein  43.81 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.646153  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3370  type II secretion system protein  37.31 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1386  type II secretion system protein  37.5 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0123649  normal  0.307577 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1530  type II secretion system protein  26.47 
 
 		 301 aa  57  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1237  Type II secretion system F domain protein  33.1 
 
 		 309 aa  56.2  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13687  alanine rich membrane protein  39.01 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.58076e-41  normal  0.106713 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1076  type II secretion system protein  28.23 
 
 		 324 aa  54.7  0.0000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.195162  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2671  type II secretion system protein  28.38 
 
 		 313 aa  54.7  0.0000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0781  type II secretion system protein  29.81 
 
 		 316 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1295  Flp pilus assembly protein  27.81 
 
 		 200 aa  53.9  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2775  Type II secretion system F domain protein  38.13 
 
 		 235 aa  52.8  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0377209  hitchhiker  0.0000124346 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2223  type II secretion system protein  27.89 
 
 		 416 aa  52.8  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.92852  normal  0.508366 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5824  type II secretion system protein  28.92 
 
 		 338 aa  52.8  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.993294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3118  type II secretion system protein  28.67 
 
 		 304 aa  52  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.803425  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1649  type II secretion system protein  26.24 
 
 		 311 aa  51.6  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.2409  hitchhiker  0.00110779 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18180  type II secretion system protein F  34.11 
 
 		 339 aa  50.4  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2641  type II secretion system protein  26.78 
 
 		 291 aa  50.1  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1126  type II secretion system protein  29.03 
 
 		 310 aa  50.1  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0371029  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0479  type II secretion system protein  42.66 
 
 		 165 aa  50.1  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00167039  hitchhiker  0.0082018 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1125  type II secretion system protein  28.4 
 
 		 322 aa  49.3  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0517135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1254  type II secretion system protein  34.25 
 
 		 312 aa  48.5  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.23353  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1032  type II secretion system protein  25.17 
 
 		 204 aa  48.1  0.00007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1850  type II secretion system protein  25.15 
 
 		 307 aa  48.1  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0102974  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1399  type II secretion system protein  28.21 
 
 		 299 aa  48.1  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0535811  hitchhiker  0.000124146 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2763  type II secretion system protein  27.81 
 
 		 326 aa  47.8  0.00009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.613586 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0680  type II secretion system protein  21.88 
 
 		 277 aa  47.4  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.532814  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3787  type II secretion system protein  31.91 
 
 		 295 aa  47.4  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0665963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0597  type II secretion system protein  22.88 
 
 		 277 aa  47.4  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1500  type II secretion system protein  28.06 
 
 		 319 aa  47.4  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.34697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0262  hypothetical protein  22.88 
 
 		 277 aa  47.8  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000660114  hitchhiker  0.00000173551 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4446  type II secretion system protein  22.46 
 
 		 293 aa  47  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0044747 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0310  type II secretion system protein  26.99 
 
 		 329 aa  47  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.873631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4188  type II secretion system protein  27.86 
 
 		 328 aa  46.6  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2696  type II secretion system protein  32.41 
 
 		 301 aa  46.6  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0581937  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1737  type II secretion system protein  27.15 
 
 		 311 aa  46.6  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4619  type II secretion system protein  27.16 
 
 		 318 aa  45.8  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.340215 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2365  hypothetical protein  29.86 
 
 		 324 aa  45.4  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.195084  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07520  Flp pilus assembly protein TadC  26.97 
 
 		 313 aa  44.7  0.0008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0992  type II secretion system protein  21.52 
 
 		 326 aa  44.7  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.236675  normal  0.765371 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4865  type II secretion system protein  27.86 
 
 		 324 aa  43.9  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0122  hypothetical protein  23.5 
 
 		 215 aa  43.1  0.002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1107  type II secretion system protein  27.03 
 
 		 323 aa  43.5  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.107682  normal  0.160043 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2021  type II secretion system protein  25 
 
 		 320 aa  43.9  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.477325  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0543  type II secretion system protein  28.57 
 
 		 313 aa  43.5  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0603407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2736  type II secretion system protein  29.05 
 
 		 326 aa  43.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10340  Flp pilus assembly protein TadB  30.07 
 
 		 309 aa  43.1  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00075176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1831  type II secretion system protein  26.06 
 
 		 304 aa  42.7  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4002  type II secretion system protein  25 
 
 		 329 aa  42.7  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0289268  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2486  type II secretion system protein  26.76 
 
 		 294 aa  42.4  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.766494  hitchhiker  0.000200331 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1813  type II secretion system protein  21.53 
 
 		 426 aa  42  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00328504  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1754  Flp pilus assembly protein TadC  24.11 
 
 		 326 aa  42  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2115  type II secretion system protein  24.76 
 
 		 279 aa  42  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0300  type II secretion system protein  23.72 
 
 		 323 aa  42  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2364  putative putative tight adherence TadC-like transmembrane protein  25.95 
 
 		 321 aa  42  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00226483  normal  0.0303282 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5326  type II secretion system protein  28.57 
 
 		 323 aa  41.6  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0355396 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>