184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_1501 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008542  Bcen2424_1525  type II secretion system protein  99.7 
 
 		 332 aa  639    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.623315  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1501  type II secretion system protein  100 
 
 		 332 aa  641    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000870782 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1045  type II secretion system protein  96.39 
 
 		 321 aa  536  1e-151  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4665  Flp pilus assembly protein TadC  89.76 
 
 		 332 aa  511  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.502777  decreased coverage  0.000679832 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1286  hypothetical protein  67.55 
 
 		 336 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.220204  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1946  hypothetical protein  67.55 
 
 		 336 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000366161  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1728  type II secretion system protein  64.44 
 
 		 330 aa  379  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000109718 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1774  type II secretion system protein  67.55 
 
 		 336 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.162167  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0121  hypothetical protein  67.55 
 
 		 336 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00162648  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1793  type II secretion system protein  67.55 
 
 		 336 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.105995  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1044  type II secretion system protein  67.55 
 
 		 336 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2538  hypothetical protein  66.76 
 
 		 373 aa  377  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1772  type II secretion system protein  66.76 
 
 		 340 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.233431  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1447  type II secretion system protein  63.82 
 
 		 330 aa  351  8e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.411469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1407  type II secretion system protein  67.92 
 
 		 337 aa  338  5e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1657  type II secretion system protein  61.04 
 
 		 336 aa  317  1e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.374218 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2794  putative tight adherence TadC related transmembrane protein  60.91 
 
 		 337 aa  315  8e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.637104  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_003296  RS02590  putative tight adherence TadC related transmembrane protein  46.99 
 
 		 326 aa  259  4e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4362  type II secretion system protein  46.73 
 
 		 329 aa  250  3e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.653734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4252  type II secretion system protein  46.73 
 
 		 329 aa  250  3e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.960786  normal  0.358405 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2068  type II secretion system protein  43.32 
 
 		 334 aa  242  7.999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.807622  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4449  type II secretion system protein  51.64 
 
 		 319 aa  239  5.999999999999999e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5413  type II secretion system protein  45.59 
 
 		 344 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0382729  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3658  type II secretion system protein, transmembrane  47.89 
 
 		 369 aa  215  8e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2700  tight adherence protein TadC  34.14 
 
 		 312 aa  154  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2322  type II secretion system protein  34.14 
 
 		 312 aa  154  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2325  type II secretion system protein  43.98 
 
 		 311 aa  152  8e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55860  hypothetical protein  32.19 
 
 		 303 aa  99.8  6e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0639  type II secretion system protein  28.05 
 
 		 323 aa  99  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0992  type II secretion system protein  27.75 
 
 		 326 aa  94.7  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.236675  normal  0.765371 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1107  type II secretion system protein  29.39 
 
 		 323 aa  94.7  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.107682  normal  0.160043 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4867  hypothetical protein  30.47 
 
 		 303 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.234691  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1831  type II secretion system protein  30.19 
 
 		 304 aa  94  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4395  type II secretion system protein  30.9 
 
 		 294 aa  92.8  8e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4855  hypothetical protein  28.82 
 
 		 294 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2557  type II secretion system protein  26.73 
 
 		 314 aa  89.4  7e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.59617  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0650  putative tight adherence TadC-related transmembrane protein  25.9 
 
 		 315 aa  89  9e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.640477  normal  0.167986 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3212  type II secretion system protein  28.12 
 
 		 311 aa  89  9e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.514288 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2649  type II secretion system protein  26.7 
 
 		 323 aa  88.6  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2698  type II secretion system protein  26.46 
 
 		 302 aa  88.6  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2365  hypothetical protein  27.93 
 
 		 324 aa  87.8  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.195084  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2736  type II secretion system protein  28.24 
 
 		 326 aa  88.2  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1638  type II secretion system protein  28.07 
 
 		 300 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.786377  normal  0.203569 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2364  putative putative tight adherence TadC-like transmembrane protein  28.44 
 
 		 321 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00226483  normal  0.0303282 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3964  type II secretion system protein  29.31 
 
 		 314 aa  84.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.273183 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0844  type II secretion system protein  29.77 
 
 		 295 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002651  type II/IV secretion system protein TadC associated with Flp pilus assembly  23.21 
 
 		 313 aa  83.6  0.000000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2352  type II secretion system protein  29.94 
 
 		 313 aa  84  0.000000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0836815  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3011  type II secretion system protein  29.8 
 
 		 319 aa  83.2  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1318  type II secretion system protein  29.94 
 
 		 319 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2968  type II secretion system protein  29.94 
 
 		 319 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0644  type II secretion system protein  30.77 
 
 		 296 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.807912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7193  putative Flp pilus assembly protein TadC  29.55 
 
 		 324 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.202721  normal  0.456008 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3093  type II secretion system protein  29.94 
 
 		 319 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2276  hypothetical protein  30.36 
 
 		 296 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1524  type II secretion system protein  23.86 
 
 		 322 aa  81.3  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2158  type II secretion system protein  30.91 
 
 		 312 aa  81.6  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.507846  normal  0.0329173 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1500  type II secretion system protein  28.22 
 
 		 319 aa  81.3  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.34697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6364  type II secretion system protein  27.73 
 
 		 324 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4619  type II secretion system protein  28.57 
 
 		 318 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.340215 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1916  type II secretion system protein  27.59 
 
 		 312 aa  79.7  0.00000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.141806  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5490  type II secretion system protein  28.64 
 
 		 324 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6776  type II secretion system protein  28.64 
 
 		 324 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.710361  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2021  type II secretion system protein  26.22 
 
 		 320 aa  79.3  0.00000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.477325  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0653  TadC protein  25.33 
 
 		 313 aa  79  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.179736 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3208  type II secretion system protein  26.44 
 
 		 302 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.544767 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4864  type II secretion system protein  27.54 
 
 		 330 aa  77.8  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1053  type II secretion system protein  25.62 
 
 		 302 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0300  type II secretion system protein  29.17 
 
 		 323 aa  76.6  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1903  putative Flp pilus assembly protein TadC  28.57 
 
 		 326 aa  76.6  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1159  Type II secretion system F domain protein  24.77 
 
 		 320 aa  75.9  0.0000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1813  type II secretion system protein  24.66 
 
 		 426 aa  75.5  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00328504  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1661  type II secretion system protein  31.42 
 
 		 297 aa  75.1  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146099  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1124  type II secretion system protein  24.39 
 
 		 331 aa  75.5  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0315206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0552  type II secretion system protein  28.57 
 
 		 326 aa  75.5  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0806  type II secretion system protein  25.91 
 
 		 316 aa  74.7  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0586  type II secretion system protein  27.54 
 
 		 320 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.180812  normal  0.546922 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2016  type II secretion system protein  24.51 
 
 		 307 aa  74.7  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5120  type II secretion system protein  24.89 
 
 		 321 aa  74.3  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.229641  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6004  type II secretion system protein  28.14 
 
 		 324 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2351  type II secretion system protein  26.25 
 
 		 323 aa  73.2  0.000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.357093 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0543  type II secretion system protein  26.83 
 
 		 313 aa  72.8  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0603407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4188  type II secretion system protein  25.67 
 
 		 328 aa  72.4  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2641  type II secretion system protein  27.98 
 
 		 291 aa  72  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0793  TadC protein  28.07 
 
 		 315 aa  71.2  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2763  type II secretion system protein  25 
 
 		 326 aa  71.2  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.613586 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4002  type II secretion system protein  25.79 
 
 		 329 aa  71.2  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0289268  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2823  type II secretion system protein  28.4 
 
 		 306 aa  70.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1125  type II secretion system protein  26.16 
 
 		 347 aa  71.2  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.394553  normal  0.522315 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3510  type II secretion system protein  26.34 
 
 		 297 aa  70.9  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.426579  normal  0.148834 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6300  type II secretion system protein  27.54 
 
 		 323 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.923016 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1276  type II secretion system protein  25.24 
 
 		 311 aa  70.5  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2911  type II secretion system protein  28.4 
 
 		 306 aa  70.5  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.604096  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0728  type II secretion system protein  25.79 
 
 		 333 aa  69.7  0.00000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.552842  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2047  type II secretion system protein  23.67 
 
 		 318 aa  69.3  0.00000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0677944  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2314  type II secretion system protein  24.72 
 
 		 317 aa  68.2  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0424  type II secretion system protein  24.45 
 
 		 331 aa  68.2  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.628499  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1530  type II secretion system protein  27.22 
 
 		 301 aa  68.2  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3357  type II secretion system protein  22.98 
 
 		 327 aa  67.8  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1680  type II secretion system protein  25.84 
 
 		 311 aa  67.8  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000554602 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>