187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS02590 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS02590  putative tight adherence TadC related transmembrane protein  100 
 
 		 326 aa  652    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4362  type II secretion system protein  81.9 
 
 		 329 aa  473  1e-132  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.653734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4252  type II secretion system protein  81.9 
 
 		 329 aa  473  1e-132  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.960786  normal  0.358405 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5413  type II secretion system protein  52.65 
 
 		 344 aa  296  4e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0382729  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1728  type II secretion system protein  49.13 
 
 		 330 aa  275  6e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000109718 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1447  type II secretion system protein  50.17 
 
 		 330 aa  268  8e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.411469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1407  type II secretion system protein  50 
 
 		 337 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3658  type II secretion system protein, transmembrane  60 
 
 		 369 aa  253  3e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1045  type II secretion system protein  49.81 
 
 		 321 aa  253  3e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1525  type II secretion system protein  49.81 
 
 		 332 aa  253  3e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.623315  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1501  type II secretion system protein  49.81 
 
 		 332 aa  253  3e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000870782 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1772  type II secretion system protein  51.88 
 
 		 340 aa  251  1e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.233431  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2538  hypothetical protein  53.15 
 
 		 373 aa  251  2e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1286  hypothetical protein  46.41 
 
 		 336 aa  250  3e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.220204  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1946  hypothetical protein  46.41 
 
 		 336 aa  250  3e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000366161  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1774  type II secretion system protein  46.41 
 
 		 336 aa  250  3e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.162167  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0121  hypothetical protein  46.41 
 
 		 336 aa  250  3e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00162648  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1793  type II secretion system protein  46.41 
 
 		 336 aa  250  3e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.105995  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1044  type II secretion system protein  46.41 
 
 		 336 aa  250  3e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4449  type II secretion system protein  45.91 
 
 		 319 aa  246  4e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4665  Flp pilus assembly protein TadC  45.92 
 
 		 332 aa  240  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.502777  decreased coverage  0.000679832 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2068  type II secretion system protein  47.77 
 
 		 334 aa  230  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.807622  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2794  putative tight adherence TadC related transmembrane protein  54 
 
 		 337 aa  229  5e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.637104  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1657  type II secretion system protein  51.81 
 
 		 336 aa  228  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.374218 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2325  type II secretion system protein  50.29 
 
 		 311 aa  158  1e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2322  type II secretion system protein  40.54 
 
 		 312 aa  155  1e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2700  tight adherence protein TadC  40.54 
 
 		 312 aa  155  1e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1638  type II secretion system protein  32.6 
 
 		 300 aa  120  3e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.786377  normal  0.203569 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4395  type II secretion system protein  31.38 
 
 		 294 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4855  hypothetical protein  30.13 
 
 		 294 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0844  type II secretion system protein  30.36 
 
 		 295 aa  106  5e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1318  type II secretion system protein  32.95 
 
 		 319 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0639  type II secretion system protein  30.49 
 
 		 323 aa  105  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1107  type II secretion system protein  32.24 
 
 		 323 aa  105  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.107682  normal  0.160043 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2968  type II secretion system protein  32.95 
 
 		 319 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2276  hypothetical protein  32.95 
 
 		 296 aa  104  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3093  type II secretion system protein  32.39 
 
 		 319 aa  103  5e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55860  hypothetical protein  32.05 
 
 		 303 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0644  type II secretion system protein  33.05 
 
 		 296 aa  99.8  6e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.807912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0992  type II secretion system protein  28.02 
 
 		 326 aa  99  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.236675  normal  0.765371 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2649  type II secretion system protein  31.55 
 
 		 323 aa  97.8  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4867  hypothetical protein  33.33 
 
 		 303 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.234691  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2736  type II secretion system protein  31.71 
 
 		 326 aa  95.9  8e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0586  type II secretion system protein  30.51 
 
 		 320 aa  94.7  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.180812  normal  0.546922 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0793  TadC protein  32.75 
 
 		 315 aa  93.6  4e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2557  type II secretion system protein  24.36 
 
 		 314 aa  93.6  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.59617  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2352  type II secretion system protein  30.54 
 
 		 313 aa  92.8  7e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0836815  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3011  type II secretion system protein  30.32 
 
 		 319 aa  90.5  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2365  hypothetical protein  25.35 
 
 		 324 aa  90.1  5e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.195084  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0653  TadC protein  25.47 
 
 		 313 aa  89.4  8e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.179736 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4619  type II secretion system protein  30.34 
 
 		 318 aa  88.6  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.340215 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2021  type II secretion system protein  27.75 
 
 		 320 aa  88.6  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.477325  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2158  type II secretion system protein  33.13 
 
 		 312 aa  88.6  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.507846  normal  0.0329173 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0300  type II secretion system protein  26.58 
 
 		 323 aa  89  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1053  type II secretion system protein  26.82 
 
 		 302 aa  87.8  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1813  type II secretion system protein  26.5 
 
 		 426 aa  88.2  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00328504  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0806  type II secretion system protein  31.14 
 
 		 316 aa  85.9  9e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1124  type II secretion system protein  25.44 
 
 		 331 aa  85.9  9e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0315206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002651  type II/IV secretion system protein TadC associated with Flp pilus assembly  25.33 
 
 		 313 aa  85.9  9e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1903  putative Flp pilus assembly protein TadC  25.68 
 
 		 326 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1075  type II secretion system protein  27.47 
 
 		 335 aa  85.1  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.137371  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0801  type II secretion system protein  26.35 
 
 		 312 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0552  type II secretion system protein  25.68 
 
 		 326 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3208  type II secretion system protein  25.84 
 
 		 302 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.544767 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1524  type II secretion system protein  25.11 
 
 		 322 aa  84.7  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2314  type II secretion system protein  25.23 
 
 		 317 aa  84.7  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3212  type II secretion system protein  29.52 
 
 		 311 aa  83.6  0.000000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.514288 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2694  type II secretion system protein  28.09 
 
 		 320 aa  82.4  0.000000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4864  type II secretion system protein  27.23 
 
 		 330 aa  82  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1125  type II secretion system protein  26.09 
 
 		 347 aa  81.3  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.394553  normal  0.522315 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0650  putative tight adherence TadC-related transmembrane protein  25.69 
 
 		 315 aa  80.5  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.640477  normal  0.167986 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7193  putative Flp pilus assembly protein TadC  30.17 
 
 		 324 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.202721  normal  0.456008 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2351  type II secretion system protein  27.33 
 
 		 323 aa  80.1  0.00000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.357093 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1500  type II secretion system protein  30.54 
 
 		 319 aa  80.1  0.00000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.34697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2698  type II secretion system protein  31.46 
 
 		 302 aa  80.1  0.00000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2118  type II secretion system protein  27.62 
 
 		 310 aa  80.1  0.00000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.128736  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1831  type II secretion system protein  23.85 
 
 		 304 aa  79.7  0.00000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1661  type II secretion system protein  29.61 
 
 		 297 aa  79.3  0.00000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146099  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2364  putative putative tight adherence TadC-like transmembrane protein  27.59 
 
 		 321 aa  79.3  0.00000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00226483  normal  0.0303282 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3964  type II secretion system protein  28.74 
 
 		 314 aa  79.3  0.00000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.273183 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0672  type II secretion system protein  27.12 
 
 		 319 aa  78.2  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.139102  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2763  type II secretion system protein  24.86 
 
 		 326 aa  78.2  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.613586 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1276  type II secretion system protein  26.42 
 
 		 311 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6004  type II secretion system protein  30.11 
 
 		 324 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0900  Type II secretion system F domain protein  27.12 
 
 		 319 aa  77  0.0000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1530  type II secretion system protein  27.88 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5490  type II secretion system protein  29.76 
 
 		 324 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6300  type II secretion system protein  30.68 
 
 		 323 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.923016 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6776  type II secretion system protein  29.76 
 
 		 324 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.710361  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6364  type II secretion system protein  29.76 
 
 		 324 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1916  type II secretion system protein  26.35 
 
 		 312 aa  76.3  0.0000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.141806  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0238  type II secretion system protein  26.58 
 
 		 322 aa  76.6  0.0000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3118  type II secretion system protein  27.16 
 
 		 304 aa  76.3  0.0000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.803425  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4188  type II secretion system protein  22.81 
 
 		 328 aa  75.5  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0543  type II secretion system protein  26.99 
 
 		 313 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0603407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1850  type II secretion system protein  30.32 
 
 		 307 aa  75.1  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0102974  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1159  Type II secretion system F domain protein  22.97 
 
 		 320 aa  75.5  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2486  type II secretion system protein  26.2 
 
 		 294 aa  74.7  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.766494  hitchhiker  0.000200331 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0386  type II secretion system protein  24.52 
 
 		 325 aa  74.3  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0728  type II secretion system protein  26.55 
 
 		 333 aa  74.7  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.552842  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>