165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_4395 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_4395  type II secretion system protein  100 
 
 		 294 aa  569  1e-161  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4855  hypothetical protein  89.46 
 
 		 294 aa  518  1e-146  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0644  type II secretion system protein  70 
 
 		 296 aa  343  2e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.807912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0844  type II secretion system protein  61.56 
 
 		 295 aa  315  4e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4867  hypothetical protein  44.44 
 
 		 303 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.234691  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55860  hypothetical protein  45.3 
 
 		 303 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1638  type II secretion system protein  36.32 
 
 		 300 aa  150  2e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.786377  normal  0.203569 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2158  type II secretion system protein  47.27 
 
 		 312 aa  145  8.000000000000001e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.507846  normal  0.0329173 
 
 
-
 
NC_003296  RS02590  putative tight adherence TadC related transmembrane protein  31.38 
 
 		 326 aa  115  8.999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1447  type II secretion system protein  32.66 
 
 		 330 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.411469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2538  hypothetical protein  30.27 
 
 		 373 aa  104  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1286  hypothetical protein  30.43 
 
 		 336 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.220204  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1946  hypothetical protein  30.43 
 
 		 336 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000366161  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1774  type II secretion system protein  30.43 
 
 		 336 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.162167  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0121  hypothetical protein  30.43 
 
 		 336 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00162648  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1772  type II secretion system protein  30.43 
 
 		 340 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.233431  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1793  type II secretion system protein  30.43 
 
 		 336 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.105995  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1044  type II secretion system protein  30.43 
 
 		 336 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4362  type II secretion system protein  28.87 
 
 		 329 aa  99.4  7e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.653734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4252  type II secretion system protein  28.87 
 
 		 329 aa  99.4  7e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.960786  normal  0.358405 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1728  type II secretion system protein  32.52 
 
 		 330 aa  98.2  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000109718 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5413  type II secretion system protein  28.45 
 
 		 344 aa  95.9  7e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0382729  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2068  type II secretion system protein  33.53 
 
 		 334 aa  95.1  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.807622  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2794  putative tight adherence TadC related transmembrane protein  33.2 
 
 		 337 aa  94  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.637104  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1661  type II secretion system protein  42.86 
 
 		 297 aa  93.6  4e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146099  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1407  type II secretion system protein  29.37 
 
 		 337 aa  93.2  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1525  type II secretion system protein  29.69 
 
 		 332 aa  90.1  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.623315  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1045  type II secretion system protein  29.69 
 
 		 321 aa  90.1  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1501  type II secretion system protein  29.69 
 
 		 332 aa  89  8e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000870782 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1657  type II secretion system protein  30.86 
 
 		 336 aa  89  9e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.374218 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2325  type II secretion system protein  35.88 
 
 		 311 aa  88.2  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4449  type II secretion system protein  31.55 
 
 		 319 aa  84.3  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4665  Flp pilus assembly protein TadC  32.37 
 
 		 332 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.502777  decreased coverage  0.000679832 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2700  tight adherence protein TadC  28.67 
 
 		 312 aa  82  0.000000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2322  type II secretion system protein  28.67 
 
 		 312 aa  82  0.000000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0074  type II secretion system protein  25.1 
 
 		 315 aa  80.9  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.557722  normal  0.8398 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3510  type II secretion system protein  28.31 
 
 		 297 aa  80.9  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.426579  normal  0.148834 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0639  type II secretion system protein  26.96 
 
 		 323 aa  79.7  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0653  TadC protein  25.09 
 
 		 313 aa  79.3  0.00000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.179736 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2557  type II secretion system protein  28.31 
 
 		 314 aa  77.8  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.59617  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0793  TadC protein  29.24 
 
 		 315 aa  77  0.0000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0300  type II secretion system protein  25 
 
 		 323 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002651  type II/IV secretion system protein TadC associated with Flp pilus assembly  25.83 
 
 		 313 aa  75.9  0.0000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1107  type II secretion system protein  23.01 
 
 		 323 aa  75.9  0.0000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.107682  normal  0.160043 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2649  type II secretion system protein  29.34 
 
 		 323 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0992  type II secretion system protein  26.19 
 
 		 326 aa  75.1  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.236675  normal  0.765371 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3658  type II secretion system protein, transmembrane  31.08 
 
 		 369 aa  75.1  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0806  type II secretion system protein  24.07 
 
 		 316 aa  74.7  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1124  type II secretion system protein  23.77 
 
 		 331 aa  73.9  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0315206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7193  putative Flp pilus assembly protein TadC  27.23 
 
 		 324 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.202721  normal  0.456008 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5490  type II secretion system protein  26.09 
 
 		 324 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6776  type II secretion system protein  26.09 
 
 		 324 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.710361  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6364  type II secretion system protein  26.09 
 
 		 324 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1903  putative Flp pilus assembly protein TadC  23.28 
 
 		 326 aa  70.1  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2694  type II secretion system protein  24.74 
 
 		 320 aa  70.1  0.00000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3011  type II secretion system protein  25 
 
 		 319 aa  69.7  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0552  type II secretion system protein  23.28 
 
 		 326 aa  69.3  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0728  type II secretion system protein  26.43 
 
 		 333 aa  69.3  0.00000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.552842  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0586  type II secretion system protein  30.54 
 
 		 320 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.180812  normal  0.546922 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1318  type II secretion system protein  28.74 
 
 		 319 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3093  type II secretion system protein  28.74 
 
 		 319 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2968  type II secretion system protein  28.74 
 
 		 319 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2118  type II secretion system protein  29.82 
 
 		 310 aa  67.8  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.128736  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2276  hypothetical protein  28.14 
 
 		 296 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0801  type II secretion system protein  25.75 
 
 		 312 aa  65.9  0.0000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1754  Flp pilus assembly protein TadC  23.43 
 
 		 326 aa  65.1  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1159  Type II secretion system F domain protein  22.62 
 
 		 320 aa  65.1  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2021  type II secretion system protein  22.78 
 
 		 320 aa  65.5  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.477325  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1276  type II secretion system protein  25.93 
 
 		 311 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2708  type II secretion system protein  25.82 
 
 		 323 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.68845 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1916  type II secretion system protein  24.85 
 
 		 312 aa  63.9  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.141806  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2736  type II secretion system protein  23.53 
 
 		 326 aa  64.3  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2485  type II secretion system protein  25.82 
 
 		 323 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.28616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3964  type II secretion system protein  26.59 
 
 		 314 aa  63.5  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.273183 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2364  putative putative tight adherence TadC-like transmembrane protein  24.56 
 
 		 321 aa  63.2  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00226483  normal  0.0303282 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2352  type II secretion system protein  26.35 
 
 		 313 aa  62  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0836815  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0650  putative tight adherence TadC-related transmembrane protein  23.87 
 
 		 315 aa  60.8  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.640477  normal  0.167986 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4394  type II secretion system protein  24.89 
 
 		 314 aa  60.1  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6004  type II secretion system protein  26.52 
 
 		 324 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2823  type II secretion system protein  27.22 
 
 		 306 aa  59.7  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6300  type II secretion system protein  26.52 
 
 		 323 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.923016 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3208  type II secretion system protein  27.12 
 
 		 302 aa  59.3  0.00000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.544767 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4348  type II secretion system protein  26.99 
 
 		 292 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4189  type II secretion system protein  28.18 
 
 		 325 aa  59.3  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.54214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2911  type II secretion system protein  28.14 
 
 		 306 aa  58.9  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.604096  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2379  type II secretion system protein  24.12 
 
 		 321 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.306938  normal  0.924554 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1517  hypothetical protein  22.94 
 
 		 320 aa  58.5  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.205257  normal  0.198842 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4002  type II secretion system protein  26.35 
 
 		 329 aa  57.8  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0289268  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2698  type II secretion system protein  27.54 
 
 		 302 aa  57.8  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0543  type II secretion system protein  25.3 
 
 		 313 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0603407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1075  type II secretion system protein  23.4 
 
 		 335 aa  57.4  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.137371  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1500  type II secretion system protein  24.53 
 
 		 319 aa  57.4  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.34697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3212  type II secretion system protein  29.76 
 
 		 311 aa  57.4  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.514288 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2413  type II secretion system protein  25.47 
 
 		 323 aa  57  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1053  type II secretion system protein  26.32 
 
 		 302 aa  55.8  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0296  type II secretion system protein  24.53 
 
 		 325 aa  55.8  0.0000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2046  putative fimbriae-related membrane protein  27.67 
 
 		 314 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0336894  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4619  type II secretion system protein  24.55 
 
 		 318 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.340215 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2365  hypothetical protein  22.19 
 
 		 324 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.195084  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0603  type II secretion system protein  23.61 
 
 		 338 aa  55.5  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.512211  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>