188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_1638 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_1638  type II secretion system protein  100 
 
 
300 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.786377  normal  0.203569 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4395  type II secretion system protein  36.32 
 
 
294 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4855  hypothetical protein  37.45 
 
 
294 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2158  type II secretion system protein  43.12 
 
 
312 aa  140  1.9999999999999998e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.507846  normal  0.0329173 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4867  hypothetical protein  39.55 
 
 
303 aa  138  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.234691  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55860  hypothetical protein  38.98 
 
 
303 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0844  type II secretion system protein  31.08 
 
 
295 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0644  type II secretion system protein  41.62 
 
 
296 aa  125  9e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.807912  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02590  putative tight adherence TadC related transmembrane protein  32.6 
 
 
326 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4362  type II secretion system protein  30.74 
 
 
329 aa  103  4e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.653734  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4252  type II secretion system protein  30.74 
 
 
329 aa  103  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.960786  normal  0.358405 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5413  type II secretion system protein  31.3 
 
 
344 aa  97.4  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0382729  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2700  tight adherence protein TadC  31.8 
 
 
312 aa  97.4  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2322  type II secretion system protein  31.8 
 
 
312 aa  97.4  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1661  type II secretion system protein  35.29 
 
 
297 aa  94  3e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146099  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1728  type II secretion system protein  33.97 
 
 
330 aa  93.2  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000109718 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0074  type II secretion system protein  28.63 
 
 
315 aa  92.4  9e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.557722  normal  0.8398 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2325  type II secretion system protein  30.12 
 
 
311 aa  88.6  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1447  type II secretion system protein  30.9 
 
 
330 aa  87.8  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.411469  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2794  putative tight adherence TadC related transmembrane protein  32.39 
 
 
337 aa  87.4  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.637104  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1407  type II secretion system protein  32.21 
 
 
337 aa  86.7  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2068  type II secretion system protein  27.32 
 
 
334 aa  85.5  9e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.807622  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1657  type II secretion system protein  33.13 
 
 
336 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.374218 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4449  type II secretion system protein  33.72 
 
 
319 aa  84.7  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1045  type II secretion system protein  30.57 
 
 
321 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1525  type II secretion system protein  30.57 
 
 
332 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.623315  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1501  type II secretion system protein  30.77 
 
 
332 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000870782 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4665  Flp pilus assembly protein TadC  32.21 
 
 
332 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.502777  decreased coverage  0.000679832 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3658  type II secretion system protein, transmembrane  27.52 
 
 
369 aa  82.4  0.000000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0552  type II secretion system protein  26.2 
 
 
326 aa  79.7  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1903  putative Flp pilus assembly protein TadC  26.2 
 
 
326 aa  79  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2538  hypothetical protein  30.87 
 
 
373 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0300  type II secretion system protein  26.18 
 
 
323 aa  79  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1286  hypothetical protein  30.87 
 
 
336 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.220204  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1946  hypothetical protein  30.87 
 
 
336 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000366161  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1774  type II secretion system protein  30.87 
 
 
336 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.162167  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0121  hypothetical protein  30.87 
 
 
336 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00162648  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1772  type II secretion system protein  30.87 
 
 
340 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.233431  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1793  type II secretion system protein  30.87 
 
 
336 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.105995  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1044  type II secretion system protein  30.87 
 
 
336 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1124  type II secretion system protein  22.93 
 
 
331 aa  78.2  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0315206  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3510  type II secretion system protein  25.78 
 
 
297 aa  77.8  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.426579  normal  0.148834 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0992  type II secretion system protein  24.55 
 
 
326 aa  77  0.0000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.236675  normal  0.765371 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2694  type II secretion system protein  28.06 
 
 
320 aa  77  0.0000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002651  type II/IV secretion system protein TadC associated with Flp pilus assembly  25.44 
 
 
313 aa  76.3  0.0000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0602  type II secretion system protein  26.17 
 
 
323 aa  72.8  0.000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0897257  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1107  type II secretion system protein  26.48 
 
 
323 aa  72.8  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.107682  normal  0.160043 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2557  type II secretion system protein  26.52 
 
 
314 aa  71.6  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.59617  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1517  hypothetical protein  29.07 
 
 
320 aa  72  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.205257  normal  0.198842 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2351  type II secretion system protein  26.04 
 
 
323 aa  70.9  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.357093 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1053  type II secretion system protein  25.74 
 
 
302 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2736  type II secretion system protein  25.44 
 
 
326 aa  69.3  0.00000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4619  type II secretion system protein  26.94 
 
 
318 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.340215 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3208  type II secretion system protein  24.92 
 
 
302 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.544767 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0653  TadC protein  23.67 
 
 
313 aa  67.4  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.179736 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5120  type II secretion system protein  24.59 
 
 
321 aa  67.4  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.229641  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2454  type II secretion system protein F  29.52 
 
 
290 aa  67  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0182293  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2021  type II secretion system protein  21.58 
 
 
320 aa  67  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.477325  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2698  type II secretion system protein  24.55 
 
 
302 aa  66.6  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2046  putative fimbriae-related membrane protein  29.52 
 
 
314 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0336894  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1675  type II secretion system protein F  29.52 
 
 
314 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0331  type II secretion system protein F  29.52 
 
 
314 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0097112  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1878  type II secretion system protein  29.52 
 
 
314 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.650462  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1890  type II secretion system protein  29.52 
 
 
314 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0830  type II secretion system protein F  29.52 
 
 
314 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.288216  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3795  type II secretion system protein  24.31 
 
 
321 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1813  type II secretion system protein  29.19 
 
 
426 aa  65.5  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00328504  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0728  type II secretion system protein  24.03 
 
 
333 aa  65.1  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.552842  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0543  type II secretion system protein  27.21 
 
 
313 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0603407  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4188  type II secretion system protein  23.23 
 
 
328 aa  63.9  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0424  type II secretion system protein  24.7 
 
 
331 aa  63.5  0.000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.628499  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2486  type II secretion system protein  28.24 
 
 
294 aa  63.5  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.766494  hitchhiker  0.000200331 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2649  type II secretion system protein  24.69 
 
 
323 aa  63.2  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1276  type II secretion system protein  26.26 
 
 
311 aa  63.2  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1159  Type II secretion system F domain protein  22.5 
 
 
320 aa  62.8  0.000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3011  type II secretion system protein  24.55 
 
 
319 aa  62.4  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1754  Flp pilus assembly protein TadC  25 
 
 
326 aa  62.4  0.000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2365  hypothetical protein  21.33 
 
 
324 aa  62.4  0.000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.195084  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2314  type II secretion system protein  25 
 
 
317 aa  62.4  0.000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1850  type II secretion system protein  28.34 
 
 
307 aa  62  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0102974  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0793  TadC protein  23.93 
 
 
315 aa  62  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2364  putative putative tight adherence TadC-like transmembrane protein  24.08 
 
 
321 aa  62  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00226483  normal  0.0303282 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0806  type II secretion system protein  24.55 
 
 
316 aa  61.2  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3964  type II secretion system protein  25.99 
 
 
314 aa  60.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.273183 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0639  type II secretion system protein  23.95 
 
 
323 aa  60.1  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0672  type II secretion system protein  21.64 
 
 
319 aa  59.7  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.139102  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1500  type II secretion system protein  23.53 
 
 
319 aa  59.3  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.34697  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0900  Type II secretion system F domain protein  21.64 
 
 
319 aa  59.3  0.00000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0650  putative tight adherence TadC-related transmembrane protein  24.87 
 
 
315 aa  58.9  0.00000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.640477  normal  0.167986 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2823  type II secretion system protein  24.58 
 
 
306 aa  58.9  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3212  type II secretion system protein  27.27 
 
 
311 aa  58.5  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.514288 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3093  type II secretion system protein  24.7 
 
 
319 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0801  type II secretion system protein  24.1 
 
 
312 aa  57.8  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2911  type II secretion system protein  24.57 
 
 
306 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.604096  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1318  type II secretion system protein  24.3 
 
 
319 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2307  Type II secretion system F domain protein  28.14 
 
 
298 aa  57.4  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1337  type II secretion system protein  25.99 
 
 
289 aa  57.4  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2968  type II secretion system protein  24.3 
 
 
319 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2118  type II secretion system protein  22.03 
 
 
310 aa  57.4  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.128736  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1916  type II secretion system protein  22.78 
 
 
312 aa  57  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.141806  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>