180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1657 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1657  type II secretion system protein  100 
 
 		 336 aa  644    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.374218 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2794  putative tight adherence TadC related transmembrane protein  87.24 
 
 		 337 aa  474  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.637104  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1728  type II secretion system protein  64.97 
 
 		 330 aa  361  9e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000109718 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2538  hypothetical protein  62.54 
 
 		 373 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1447  type II secretion system protein  65.87 
 
 		 330 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.411469  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1286  hypothetical protein  63.5 
 
 		 336 aa  353  2e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.220204  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1946  hypothetical protein  63.5 
 
 		 336 aa  353  2e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000366161  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1774  type II secretion system protein  63.5 
 
 		 336 aa  353  2e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.162167  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0121  hypothetical protein  63.5 
 
 		 336 aa  353  2e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00162648  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1793  type II secretion system protein  63.5 
 
 		 336 aa  353  2e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.105995  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1044  type II secretion system protein  63.5 
 
 		 336 aa  353  2e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1772  type II secretion system protein  63.05 
 
 		 340 aa  352  4e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.233431  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1525  type II secretion system protein  60.12 
 
 		 332 aa  347  2e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.623315  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1501  type II secretion system protein  60.12 
 
 		 332 aa  345  5e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000870782 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1407  type II secretion system protein  67.41 
 
 		 337 aa  345  6e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4665  Flp pilus assembly protein TadC  59.7 
 
 		 332 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.502777  decreased coverage  0.000679832 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1045  type II secretion system protein  61.02 
 
 		 321 aa  332  5e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4449  type II secretion system protein  47.13 
 
 		 319 aa  258  1e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4252  type II secretion system protein  47.26 
 
 		 329 aa  248  8e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.960786  normal  0.358405 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4362  type II secretion system protein  47.26 
 
 		 329 aa  248  8e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.653734  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02590  putative tight adherence TadC related transmembrane protein  46.81 
 
 		 326 aa  248  1e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2068  type II secretion system protein  43.35 
 
 		 334 aa  240  2e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.807622  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5413  type II secretion system protein  43.75 
 
 		 344 aa  224  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0382729  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3658  type II secretion system protein, transmembrane  48.03 
 
 		 369 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2325  type II secretion system protein  45.02 
 
 		 311 aa  173  2.9999999999999996e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2322  type II secretion system protein  38.26 
 
 		 312 aa  154  1e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2700  tight adherence protein TadC  38.26 
 
 		 312 aa  154  1e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55860  hypothetical protein  35.34 
 
 		 303 aa  119  6e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4867  hypothetical protein  34.91 
 
 		 303 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.234691  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0639  type II secretion system protein  28.83 
 
 		 323 aa  101  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4395  type II secretion system protein  30.86 
 
 		 294 aa  99.4  7e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4855  hypothetical protein  29.63 
 
 		 294 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2649  type II secretion system protein  27.48 
 
 		 323 aa  94.7  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1916  type II secretion system protein  30.81 
 
 		 312 aa  94.4  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.141806  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1107  type II secretion system protein  28.89 
 
 		 323 aa  94.7  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.107682  normal  0.160043 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2276  hypothetical protein  32.31 
 
 		 296 aa  94.4  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0844  type II secretion system protein  30.14 
 
 		 295 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1318  type II secretion system protein  32.09 
 
 		 319 aa  93.6  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2968  type II secretion system protein  32.09 
 
 		 319 aa  93.6  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3093  type II secretion system protein  33.53 
 
 		 319 aa  93.2  6e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0650  putative tight adherence TadC-related transmembrane protein  29.15 
 
 		 315 aa  92.8  7e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.640477  normal  0.167986 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1831  type II secretion system protein  32.21 
 
 		 304 aa  92.8  8e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2698  type II secretion system protein  32.58 
 
 		 302 aa  92.4  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0992  type II secretion system protein  27.12 
 
 		 326 aa  90.9  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.236675  normal  0.765371 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1638  type II secretion system protein  33.13 
 
 		 300 aa  90.9  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.786377  normal  0.203569 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2736  type II secretion system protein  29.21 
 
 		 326 aa  91.7  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2352  type II secretion system protein  33.53 
 
 		 313 aa  90.9  3e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0836815  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7193  putative Flp pilus assembly protein TadC  29.92 
 
 		 324 aa  88.6  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.202721  normal  0.456008 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2557  type II secretion system protein  26.01 
 
 		 314 aa  87.8  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.59617  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2364  putative putative tight adherence TadC-like transmembrane protein  30 
 
 		 321 aa  88.2  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00226483  normal  0.0303282 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0793  TadC protein  31.18 
 
 		 315 aa  87  4e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0543  type II secretion system protein  31.74 
 
 		 313 aa  87  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0603407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5490  type II secretion system protein  29.92 
 
 		 324 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6776  type II secretion system protein  29.92 
 
 		 324 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.710361  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6364  type II secretion system protein  29.92 
 
 		 324 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6004  type II secretion system protein  31.25 
 
 		 324 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2365  hypothetical protein  30.72 
 
 		 324 aa  84  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.195084  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1159  Type II secretion system F domain protein  26.7 
 
 		 320 aa  83.2  0.000000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6300  type II secretion system protein  32.34 
 
 		 323 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.923016 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002651  type II/IV secretion system protein TadC associated with Flp pilus assembly  24.34 
 
 		 313 aa  82.4  0.000000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3011  type II secretion system protein  32.37 
 
 		 319 aa  82.4  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3964  type II secretion system protein  31.42 
 
 		 314 aa  82.4  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.273183 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1903  putative Flp pilus assembly protein TadC  30.18 
 
 		 326 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0300  type II secretion system protein  30.73 
 
 		 323 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0552  type II secretion system protein  29.59 
 
 		 326 aa  80.1  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1500  type II secretion system protein  29.45 
 
 		 319 aa  79.7  0.00000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.34697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3510  type II secretion system protein  31.88 
 
 		 297 aa  79.7  0.00000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.426579  normal  0.148834 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3212  type II secretion system protein  29.06 
 
 		 311 aa  79.7  0.00000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.514288 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0806  type II secretion system protein  25.9 
 
 		 316 aa  79.7  0.00000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2021  type II secretion system protein  27.83 
 
 		 320 aa  79.3  0.00000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.477325  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2641  type II secretion system protein  34.3 
 
 		 291 aa  79.3  0.00000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0653  TadC protein  27.68 
 
 		 313 aa  79.3  0.00000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.179736 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1124  type II secretion system protein  27.12 
 
 		 331 aa  79  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0315206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2158  type II secretion system protein  30.72 
 
 		 312 aa  77.8  0.0000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.507846  normal  0.0329173 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4619  type II secretion system protein  28 
 
 		 318 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.340215 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0586  type II secretion system protein  29.34 
 
 		 320 aa  77  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.180812  normal  0.546922 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1524  type II secretion system protein  25.9 
 
 		 322 aa  76.6  0.0000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0801  type II secretion system protein  24.71 
 
 		 312 aa  76.3  0.0000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1661  type II secretion system protein  35.62 
 
 		 297 aa  75.9  0.0000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146099  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1053  type II secretion system protein  28.37 
 
 		 302 aa  75.9  0.0000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1530  type II secretion system protein  28.82 
 
 		 301 aa  75.5  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1813  type II secretion system protein  24.89 
 
 		 426 aa  75.5  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00328504  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0644  type II secretion system protein  32.58 
 
 		 296 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.807912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1075  type II secretion system protein  26.64 
 
 		 335 aa  74.3  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.137371  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4002  type II secretion system protein  28.74 
 
 		 329 aa  74.3  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0289268  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0074  type II secretion system protein  30 
 
 		 315 aa  73.9  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.557722  normal  0.8398 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1276  type II secretion system protein  29.11 
 
 		 311 aa  73.6  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1517  hypothetical protein  27.62 
 
 		 320 aa  72.8  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.205257  normal  0.198842 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2351  type II secretion system protein  26.09 
 
 		 323 aa  72.4  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.357093 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1125  type II secretion system protein  25.35 
 
 		 347 aa  71.6  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.394553  normal  0.522315 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2763  type II secretion system protein  27.35 
 
 		 326 aa  71.6  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.613586 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4446  type II secretion system protein  27.92 
 
 		 293 aa  72  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0044747 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2016  type II secretion system protein  25.99 
 
 		 307 aa  71.2  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4864  type II secretion system protein  26.21 
 
 		 330 aa  70.9  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2694  type II secretion system protein  25.93 
 
 		 320 aa  70.1  0.00000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3208  type II secretion system protein  27.27 
 
 		 302 aa  70.1  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.544767 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0728  type II secretion system protein  26.24 
 
 		 333 aa  70.1  0.00000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.552842  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0374  type II secretion system protein F  22.46 
 
 		 292 aa  70.1  0.00000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.249846  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1399  type II secretion system protein  29.01 
 
 		 299 aa  69.7  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0535811  hitchhiker  0.000124146 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5326  type II secretion system protein  31.74 
 
 		 323 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0355396 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>