167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1661 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_1661  type II secretion system protein  100 
 
 		 297 aa  563  1e-160  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146099  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1638  type II secretion system protein  31.94 
 
 		 300 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.786377  normal  0.203569 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4855  hypothetical protein  34.78 
 
 		 294 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4395  type II secretion system protein  42.31 
 
 		 294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4867  hypothetical protein  42.33 
 
 		 303 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.234691  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55860  hypothetical protein  41.72 
 
 		 303 aa  106  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2158  type II secretion system protein  38.67 
 
 		 312 aa  100  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.507846  normal  0.0329173 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5413  type II secretion system protein  31.06 
 
 		 344 aa  100  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0382729  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1728  type II secretion system protein  28.63 
 
 		 330 aa  100  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000109718 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0844  type II secretion system protein  44.16 
 
 		 295 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0644  type II secretion system protein  43.23 
 
 		 296 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.807912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2325  type II secretion system protein  36.22 
 
 		 311 aa  96.3  5e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02590  putative tight adherence TadC related transmembrane protein  30.9 
 
 		 326 aa  95.5  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1045  type II secretion system protein  31.42 
 
 		 321 aa  95.1  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1501  type II secretion system protein  31.42 
 
 		 332 aa  95.1  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000870782 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1525  type II secretion system protein  31.42 
 
 		 332 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.623315  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1407  type II secretion system protein  28.04 
 
 		 337 aa  93.6  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2794  putative tight adherence TadC related transmembrane protein  33.63 
 
 		 337 aa  90.9  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.637104  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4665  Flp pilus assembly protein TadC  32.3 
 
 		 332 aa  90.1  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.502777  decreased coverage  0.000679832 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2068  type II secretion system protein  29.67 
 
 		 334 aa  88.6  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.807622  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0653  TadC protein  30.77 
 
 		 313 aa  86.7  4e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.179736 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4362  type II secretion system protein  30.52 
 
 		 329 aa  86.7  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.653734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1657  type II secretion system protein  33.62 
 
 		 336 aa  87  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.374218 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4252  type II secretion system protein  30.52 
 
 		 329 aa  86.7  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.960786  normal  0.358405 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1447  type II secretion system protein  28.51 
 
 		 330 aa  85.5  9e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.411469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2538  hypothetical protein  34.25 
 
 		 373 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1772  type II secretion system protein  34.25 
 
 		 340 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.233431  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1286  hypothetical protein  34.25 
 
 		 336 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.220204  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1946  hypothetical protein  34.25 
 
 		 336 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000366161  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002651  type II/IV secretion system protein TadC associated with Flp pilus assembly  27.43 
 
 		 313 aa  83.6  0.000000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1774  type II secretion system protein  34.25 
 
 		 336 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.162167  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0121  hypothetical protein  34.25 
 
 		 336 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00162648  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1793  type II secretion system protein  34.25 
 
 		 336 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.105995  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1044  type II secretion system protein  34.25 
 
 		 336 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0793  TadC protein  32.05 
 
 		 315 aa  83.2  0.000000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2649  type II secretion system protein  30.72 
 
 		 323 aa  80.1  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1053  type II secretion system protein  29.07 
 
 		 302 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0074  type II secretion system protein  32.21 
 
 		 315 aa  79.3  0.00000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.557722  normal  0.8398 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0801  type II secretion system protein  31.45 
 
 		 312 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2557  type II secretion system protein  29.03 
 
 		 314 aa  78.6  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.59617  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3658  type II secretion system protein, transmembrane  29.8 
 
 		 369 aa  78.2  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2352  type II secretion system protein  32.5 
 
 		 313 aa  77.8  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0836815  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3208  type II secretion system protein  27.06 
 
 		 302 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.544767 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0650  putative tight adherence TadC-related transmembrane protein  29.31 
 
 		 315 aa  77.4  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.640477  normal  0.167986 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0992  type II secretion system protein  24.28 
 
 		 326 aa  77.4  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.236675  normal  0.765371 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2911  type II secretion system protein  33.33 
 
 		 306 aa  75.5  0.0000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.604096  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2823  type II secretion system protein  34.55 
 
 		 306 aa  75.1  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0586  type II secretion system protein  30.99 
 
 		 320 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.180812  normal  0.546922 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0639  type II secretion system protein  30.41 
 
 		 323 aa  74.3  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0543  type II secretion system protein  29.87 
 
 		 313 aa  73.6  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0603407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2322  type II secretion system protein  30.06 
 
 		 312 aa  73.6  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2700  tight adherence protein TadC  30.06 
 
 		 312 aa  73.6  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2736  type II secretion system protein  28.66 
 
 		 326 aa  73.2  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1107  type II secretion system protein  26.67 
 
 		 323 aa  73.2  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.107682  normal  0.160043 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3795  type II secretion system protein  27.45 
 
 		 321 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4449  type II secretion system protein  29.22 
 
 		 319 aa  71.2  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0806  type II secretion system protein  29.61 
 
 		 316 aa  71.2  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1318  type II secretion system protein  29.94 
 
 		 319 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1500  type II secretion system protein  27.87 
 
 		 319 aa  70.5  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.34697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2968  type II secretion system protein  29.94 
 
 		 319 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2276  hypothetical protein  29.94 
 
 		 296 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3093  type II secretion system protein  29.94 
 
 		 319 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2351  type II secretion system protein  27.11 
 
 		 323 aa  69.7  0.00000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.357093 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3011  type II secretion system protein  27.46 
 
 		 319 aa  69.3  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3212  type II secretion system protein  28.33 
 
 		 311 aa  68.9  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.514288 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2365  hypothetical protein  27.17 
 
 		 324 aa  68.6  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.195084  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0602  type II secretion system protein  25 
 
 		 323 aa  68.2  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0897257  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2694  type II secretion system protein  29.28 
 
 		 320 aa  68.9  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5120  type II secretion system protein  25.63 
 
 		 321 aa  68.2  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.229641  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1159  Type II secretion system F domain protein  24.54 
 
 		 320 aa  67.8  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1124  type II secretion system protein  25.81 
 
 		 331 aa  67  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0315206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4619  type II secretion system protein  29.41 
 
 		 318 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.340215 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2021  type II secretion system protein  29.74 
 
 		 320 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.477325  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1916  type II secretion system protein  25.47 
 
 		 312 aa  65.5  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.141806  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1754  type II secretion system protein  27.27 
 
 		 295 aa  65.5  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00143607  normal  0.105402 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0728  type II secretion system protein  23.38 
 
 		 333 aa  65.1  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.552842  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1125  type II secretion system protein  26.19 
 
 		 347 aa  65.1  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.394553  normal  0.522315 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0300  type II secretion system protein  26.14 
 
 		 323 aa  64.7  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1276  type II secretion system protein  26.69 
 
 		 311 aa  64.3  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3964  type II secretion system protein  30.54 
 
 		 314 aa  63.9  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.273183 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0552  type II secretion system protein  25.57 
 
 		 326 aa  63.5  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2364  putative putative tight adherence TadC-like transmembrane protein  32.24 
 
 		 321 aa  63.5  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00226483  normal  0.0303282 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1903  putative Flp pilus assembly protein TadC  25.57 
 
 		 326 aa  63.2  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1723  type II secretion system protein  23.04 
 
 		 296 aa  62.8  0.000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4446  type II secretion system protein  29.33 
 
 		 293 aa  62.8  0.000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0044747 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1524  type II secretion system protein  26.61 
 
 		 322 aa  62.8  0.000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2314  type II secretion system protein  24.54 
 
 		 317 aa  62.4  0.000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0311  type II secretion system protein  27.94 
 
 		 316 aa  62.4  0.000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.563894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2118  type II secretion system protein  23.21 
 
 		 310 aa  61.6  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.128736  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2696  type II secretion system protein  29.29 
 
 		 301 aa  62  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0581937  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2016  type II secretion system protein  27.12 
 
 		 307 aa  61.2  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3510  type II secretion system protein  26.35 
 
 		 297 aa  61.6  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.426579  normal  0.148834 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0249  type II secretion system protein  29.78 
 
 		 313 aa  60.8  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.876214 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1754  Flp pilus assembly protein TadC  24.24 
 
 		 326 aa  60.1  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2698  type II secretion system protein  26.28 
 
 		 302 aa  60.5  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1831  type II secretion system protein  24.47 
 
 		 304 aa  59.7  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3420  Type II secretion system F domain protein  31.69 
 
 		 295 aa  58.9  0.00000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.490118  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2641  type II secretion system protein  26.54 
 
 		 291 aa  59.3  0.00000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0296  type II secretion system protein  26.34 
 
 		 325 aa  58.5  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2047  type II secretion system protein  28.25 
 
 		 318 aa  57.8  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0677944  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>