167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4855 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4855  hypothetical protein  100 
 
 		 294 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4395  type II secretion system protein  91.3 
 
 		 294 aa  498  1e-140  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0644  type II secretion system protein  71.54 
 
 		 296 aa  352  4e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.807912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0844  type II secretion system protein  60.62 
 
 		 295 aa  315  4e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55860  hypothetical protein  49.57 
 
 		 303 aa  200  3e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4867  hypothetical protein  45.62 
 
 		 303 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.234691  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1638  type II secretion system protein  37.45 
 
 		 300 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.786377  normal  0.203569 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2158  type II secretion system protein  48.48 
 
 		 312 aa  146  3e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.507846  normal  0.0329173 
 
 
-
 
NC_003296  RS02590  putative tight adherence TadC related transmembrane protein  30.13 
 
 		 326 aa  112  6e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2538  hypothetical protein  30.27 
 
 		 373 aa  103  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1447  type II secretion system protein  31.15 
 
 		 330 aa  102  6e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.411469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1772  type II secretion system protein  30.31 
 
 		 340 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.233431  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1286  hypothetical protein  30.31 
 
 		 336 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.220204  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1946  hypothetical protein  30.31 
 
 		 336 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000366161  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1774  type II secretion system protein  30.31 
 
 		 336 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.162167  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0121  hypothetical protein  30.31 
 
 		 336 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00162648  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1793  type II secretion system protein  30.31 
 
 		 336 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.105995  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1044  type II secretion system protein  30.31 
 
 		 336 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1407  type II secretion system protein  28.57 
 
 		 337 aa  96.7  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2068  type II secretion system protein  32.56 
 
 		 334 aa  95.9  7e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.807622  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1728  type II secretion system protein  29.84 
 
 		 330 aa  95.9  7e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000109718 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4252  type II secretion system protein  28.63 
 
 		 329 aa  95.9  8e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.960786  normal  0.358405 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4362  type II secretion system protein  28.63 
 
 		 329 aa  95.9  8e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.653734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1661  type II secretion system protein  43.54 
 
 		 297 aa  94.7  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146099  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5413  type II secretion system protein  29.63 
 
 		 344 aa  91.3  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0382729  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2325  type II secretion system protein  36.47 
 
 		 311 aa  89.7  5e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0639  type II secretion system protein  27.83 
 
 		 323 aa  89  9e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0074  type II secretion system protein  26.34 
 
 		 315 aa  87.8  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.557722  normal  0.8398 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2794  putative tight adherence TadC related transmembrane protein  32.52 
 
 		 337 aa  87.4  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.637104  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1045  type II secretion system protein  28.82 
 
 		 321 aa  87  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1525  type II secretion system protein  28.82 
 
 		 332 aa  87  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.623315  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4449  type II secretion system protein  31.98 
 
 		 319 aa  86.7  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1501  type II secretion system protein  28.82 
 
 		 332 aa  86.3  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000870782 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2322  type II secretion system protein  28.14 
 
 		 312 aa  85.5  9e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2700  tight adherence protein TadC  28.14 
 
 		 312 aa  85.5  9e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1657  type II secretion system protein  29.63 
 
 		 336 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.374218 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002651  type II/IV secretion system protein TadC associated with Flp pilus assembly  25.94 
 
 		 313 aa  84  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2649  type II secretion system protein  29.13 
 
 		 323 aa  83.2  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1107  type II secretion system protein  24.17 
 
 		 323 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.107682  normal  0.160043 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3510  type II secretion system protein  28.31 
 
 		 297 aa  78.6  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.426579  normal  0.148834 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4665  Flp pilus assembly protein TadC  31.58 
 
 		 332 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.502777  decreased coverage  0.000679832 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0586  type II secretion system protein  27.83 
 
 		 320 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.180812  normal  0.546922 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0653  TadC protein  28.83 
 
 		 313 aa  74.7  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.179736 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0992  type II secretion system protein  25.6 
 
 		 326 aa  74.7  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.236675  normal  0.765371 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7193  putative Flp pilus assembly protein TadC  27.27 
 
 		 324 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.202721  normal  0.456008 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1124  type II secretion system protein  23.57 
 
 		 331 aa  72.8  0.000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0315206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6364  type II secretion system protein  26.52 
 
 		 324 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2557  type II secretion system protein  29.82 
 
 		 314 aa  72  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.59617  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3658  type II secretion system protein, transmembrane  28.81 
 
 		 369 aa  71.6  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5490  type II secretion system protein  26.52 
 
 		 324 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6776  type II secretion system protein  26.52 
 
 		 324 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.710361  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0793  TadC protein  28.99 
 
 		 315 aa  70.9  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1318  type II secretion system protein  29.59 
 
 		 319 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2968  type II secretion system protein  29.59 
 
 		 319 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3093  type II secretion system protein  29.59 
 
 		 319 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0300  type II secretion system protein  22.84 
 
 		 323 aa  70.1  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2276  hypothetical protein  28.99 
 
 		 296 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0806  type II secretion system protein  23.78 
 
 		 316 aa  69.7  0.00000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3011  type II secretion system protein  25 
 
 		 319 aa  68.9  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2021  type II secretion system protein  24.46 
 
 		 320 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.477325  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0801  type II secretion system protein  27.54 
 
 		 312 aa  67.8  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2694  type II secretion system protein  24.71 
 
 		 320 aa  67.4  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1903  putative Flp pilus assembly protein TadC  21.98 
 
 		 326 aa  66.2  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0552  type II secretion system protein  21.09 
 
 		 326 aa  65.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1276  type II secretion system protein  25.52 
 
 		 311 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2364  putative putative tight adherence TadC-like transmembrane protein  23.49 
 
 		 321 aa  65.1  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00226483  normal  0.0303282 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2708  type II secretion system protein  26.55 
 
 		 323 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.68845 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2485  type II secretion system protein  26.55 
 
 		 323 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.28616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0728  type II secretion system protein  26.35 
 
 		 333 aa  64.3  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.552842  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1754  Flp pilus assembly protein TadC  22.59 
 
 		 326 aa  63.9  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2736  type II secretion system protein  22.85 
 
 		 326 aa  63.5  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1159  Type II secretion system F domain protein  21.97 
 
 		 320 aa  63.5  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2118  type II secretion system protein  28.49 
 
 		 310 aa  63.5  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.128736  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6300  type II secretion system protein  28.99 
 
 		 323 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.923016 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6004  type II secretion system protein  28.99 
 
 		 324 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2352  type II secretion system protein  25.54 
 
 		 313 aa  62  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0836815  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1916  type II secretion system protein  25.15 
 
 		 312 aa  62  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.141806  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2454  type II secretion system protein F  26.61 
 
 		 290 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0182293  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3964  type II secretion system protein  27.37 
 
 		 314 aa  60.8  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.273183 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0650  putative tight adherence TadC-related transmembrane protein  22.77 
 
 		 315 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.640477  normal  0.167986 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2046  putative fimbriae-related membrane protein  28.48 
 
 		 314 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0336894  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2823  type II secretion system protein  27.22 
 
 		 306 aa  60.8  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1675  type II secretion system protein F  28.48 
 
 		 314 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0331  type II secretion system protein F  28.48 
 
 		 314 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0097112  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1878  type II secretion system protein  28.48 
 
 		 314 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.650462  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1890  type II secretion system protein  28.48 
 
 		 314 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0830  type II secretion system protein F  28.48 
 
 		 314 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.288216  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2911  type II secretion system protein  27.75 
 
 		 306 aa  60.8  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.604096  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4619  type II secretion system protein  26.9 
 
 		 318 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.340215 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4205  type II secretion system protein  26.94 
 
 		 324 aa  60.1  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.125721  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3212  type II secretion system protein  30.23 
 
 		 311 aa  59.3  0.00000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.514288 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0543  type II secretion system protein  26.51 
 
 		 313 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0603407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0296  type II secretion system protein  27.44 
 
 		 325 aa  57.8  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0212  component of type IV pilus  26.97 
 
 		 326 aa  57.8  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3208  type II secretion system protein  26.51 
 
 		 302 aa  57.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.544767 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3357  type II secretion system protein  22.88 
 
 		 327 aa  57.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0374  type II secretion system protein F  28.4 
 
 		 292 aa  57  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.249846  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4394  type II secretion system protein  25.44 
 
 		 314 aa  56.6  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4348  type II secretion system protein  25.77 
 
 		 292 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0424  type II secretion system protein  28.99 
 
 		 331 aa  56.2  0.0000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.628499  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>