178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2068 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2068  type II secretion system protein  100 
 
 		 334 aa  663    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.807622  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4449  type II secretion system protein  45.02 
 
 		 319 aa  259  4e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1728  type II secretion system protein  52.65 
 
 		 330 aa  247  2e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000109718 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1447  type II secretion system protein  52.28 
 
 		 330 aa  233  3e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.411469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1407  type II secretion system protein  51.25 
 
 		 337 aa  231  1e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1525  type II secretion system protein  50.21 
 
 		 332 aa  229  3e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.623315  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1045  type II secretion system protein  50.21 
 
 		 321 aa  229  4e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1501  type II secretion system protein  50.21 
 
 		 332 aa  228  8e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000870782 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1772  type II secretion system protein  51.91 
 
 		 340 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.233431  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1286  hypothetical protein  51.91 
 
 		 336 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.220204  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1946  hypothetical protein  51.91 
 
 		 336 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000366161  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1774  type II secretion system protein  51.91 
 
 		 336 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.162167  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0121  hypothetical protein  51.91 
 
 		 336 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00162648  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1793  type II secretion system protein  51.91 
 
 		 336 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.105995  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1044  type II secretion system protein  51.91 
 
 		 336 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02590  putative tight adherence TadC related transmembrane protein  48.32 
 
 		 326 aa  220  3e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2538  hypothetical protein  50.42 
 
 		 373 aa  219  7e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4665  Flp pilus assembly protein TadC  52.1 
 
 		 332 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.502777  decreased coverage  0.000679832 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4362  type II secretion system protein  46.72 
 
 		 329 aa  210  3e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.653734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4252  type II secretion system protein  46.72 
 
 		 329 aa  210  3e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.960786  normal  0.358405 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2794  putative tight adherence TadC related transmembrane protein  50.83 
 
 		 337 aa  208  9e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.637104  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1657  type II secretion system protein  52.5 
 
 		 336 aa  208  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.374218 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5413  type II secretion system protein  46.94 
 
 		 344 aa  203  4e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0382729  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2325  type II secretion system protein  51.72 
 
 		 311 aa  189  5e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3658  type II secretion system protein, transmembrane  47.11 
 
 		 369 aa  186  4e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2700  tight adherence protein TadC  45.93 
 
 		 312 aa  159  7e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2322  type II secretion system protein  45.93 
 
 		 312 aa  159  7e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0653  TadC protein  28.48 
 
 		 313 aa  100  5e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.179736 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2557  type II secretion system protein  28.63 
 
 		 314 aa  99.8  6e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.59617  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55860  hypothetical protein  31.4 
 
 		 303 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4867  hypothetical protein  31.07 
 
 		 303 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.234691  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4855  hypothetical protein  32.56 
 
 		 294 aa  95.9  9e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4395  type II secretion system protein  33.14 
 
 		 294 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2352  type II secretion system protein  29.82 
 
 		 313 aa  92.8  7e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0836815  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0639  type II secretion system protein  28.89 
 
 		 323 aa  92.8  8e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1107  type II secretion system protein  31.07 
 
 		 323 aa  92  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.107682  normal  0.160043 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1524  type II secretion system protein  27.51 
 
 		 322 aa  89.7  7e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1318  type II secretion system protein  29.71 
 
 		 319 aa  89  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2968  type II secretion system protein  29.71 
 
 		 319 aa  89  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2276  hypothetical protein  29.14 
 
 		 296 aa  88.2  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3093  type II secretion system protein  29.71 
 
 		 319 aa  88.2  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2649  type II secretion system protein  27.19 
 
 		 323 aa  86.7  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2736  type II secretion system protein  29.65 
 
 		 326 aa  86.3  7e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1276  type II secretion system protein  28.51 
 
 		 311 aa  85.9  8e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1638  type II secretion system protein  27.32 
 
 		 300 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.786377  normal  0.203569 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0650  putative tight adherence TadC-related transmembrane protein  27.57 
 
 		 315 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.640477  normal  0.167986 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0644  type II secretion system protein  31.55 
 
 		 296 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.807912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2118  type II secretion system protein  30.56 
 
 		 310 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.128736  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0844  type II secretion system protein  28.46 
 
 		 295 aa  82.8  0.000000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1916  type II secretion system protein  31.45 
 
 		 312 aa  82  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.141806  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2365  hypothetical protein  28.64 
 
 		 324 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.195084  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0300  type II secretion system protein  28.64 
 
 		 323 aa  80.5  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7193  putative Flp pilus assembly protein TadC  28.51 
 
 		 324 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.202721  normal  0.456008 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0806  type II secretion system protein  26.19 
 
 		 316 aa  80.1  0.00000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1903  putative Flp pilus assembly protein TadC  28.26 
 
 		 326 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6364  type II secretion system protein  28.77 
 
 		 324 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5490  type II secretion system protein  28.77 
 
 		 324 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1530  type II secretion system protein  27.06 
 
 		 301 aa  77.8  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6776  type II secretion system protein  28.77 
 
 		 324 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.710361  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0552  type II secretion system protein  28.26 
 
 		 326 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3208  type II secretion system protein  25.43 
 
 		 302 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.544767 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3011  type II secretion system protein  27.62 
 
 		 319 aa  77.4  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1500  type II secretion system protein  29.24 
 
 		 319 aa  77.4  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.34697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2698  type II secretion system protein  27.73 
 
 		 302 aa  77.8  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1754  Flp pilus assembly protein TadC  25.99 
 
 		 326 aa  76.6  0.0000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2158  type II secretion system protein  31.18 
 
 		 312 aa  75.9  0.0000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.507846  normal  0.0329173 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2763  type II secretion system protein  25.3 
 
 		 326 aa  75.9  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.613586 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0992  type II secretion system protein  26.22 
 
 		 326 aa  75.1  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.236675  normal  0.765371 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0586  type II secretion system protein  26.4 
 
 		 320 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.180812  normal  0.546922 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002651  type II/IV secretion system protein TadC associated with Flp pilus assembly  23.11 
 
 		 313 aa  74.3  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1680  type II secretion system protein  26.07 
 
 		 311 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000554602 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4619  type II secretion system protein  26.13 
 
 		 318 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.340215 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2911  type II secretion system protein  28.7 
 
 		 306 aa  74.3  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.604096  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3964  type II secretion system protein  28.49 
 
 		 314 aa  73.9  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.273183 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1813  type II secretion system protein  26.58 
 
 		 426 aa  73.6  0.000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00328504  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1053  type II secretion system protein  23.56 
 
 		 302 aa  72.8  0.000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1125  type II secretion system protein  25.21 
 
 		 347 aa  72.8  0.000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.394553  normal  0.522315 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0543  type II secretion system protein  26.95 
 
 		 313 aa  72.8  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0603407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6004  type II secretion system protein  27.98 
 
 		 324 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1831  type II secretion system protein  27.27 
 
 		 304 aa  72.8  0.000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1661  type II secretion system protein  29.61 
 
 		 297 aa  72  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146099  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3212  type II secretion system protein  30.23 
 
 		 311 aa  72  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.514288 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2823  type II secretion system protein  29.41 
 
 		 306 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1124  type II secretion system protein  25.43 
 
 		 331 aa  71.2  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0315206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0801  type II secretion system protein  23.25 
 
 		 312 aa  70.5  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0672  type II secretion system protein  24.35 
 
 		 319 aa  70.9  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.139102  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2021  type II secretion system protein  25.22 
 
 		 320 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.477325  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4446  type II secretion system protein  29.56 
 
 		 293 aa  70.1  0.00000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0044747 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1159  Type II secretion system F domain protein  25.68 
 
 		 320 aa  70.1  0.00000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0900  Type II secretion system F domain protein  24.21 
 
 		 319 aa  69.7  0.00000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6300  type II secretion system protein  27.38 
 
 		 323 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.923016 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2047  type II secretion system protein  25.14 
 
 		 318 aa  68.2  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0677944  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3796  type II secretion system protein  24.6 
 
 		 325 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.472243  normal  0.57339 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0793  TadC protein  25.44 
 
 		 315 aa  66.6  0.0000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4864  type II secretion system protein  23.96 
 
 		 330 aa  67  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0728  type II secretion system protein  25.21 
 
 		 333 aa  66.6  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.552842  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2364  putative putative tight adherence TadC-like transmembrane protein  24.78 
 
 		 321 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00226483  normal  0.0303282 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2694  type II secretion system protein  25.17 
 
 		 320 aa  65.5  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1723  type II secretion system protein  24.78 
 
 		 296 aa  64.7  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2314  type II secretion system protein  27.01 
 
 		 317 aa  65.1  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>