165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3658 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_3658  type II secretion system protein, transmembrane  100 
 
 		 369 aa  715    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5413  type II secretion system protein  63.76 
 
 		 344 aa  395  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0382729  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02590  putative tight adherence TadC related transmembrane protein  60 
 
 		 326 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4362  type II secretion system protein  59.92 
 
 		 329 aa  271  9e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.653734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4252  type II secretion system protein  59.92 
 
 		 329 aa  271  9e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.960786  normal  0.358405 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1447  type II secretion system protein  49.66 
 
 		 330 aa  243  3e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.411469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1728  type II secretion system protein  47.16 
 
 		 330 aa  241  2e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000109718 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1407  type II secretion system protein  50.59 
 
 		 337 aa  237  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1525  type II secretion system protein  49.22 
 
 		 332 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.623315  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1045  type II secretion system protein  49.22 
 
 		 321 aa  234  3e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4449  type II secretion system protein  50.63 
 
 		 319 aa  233  5e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1772  type II secretion system protein  50.6 
 
 		 340 aa  232  6e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.233431  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1286  hypothetical protein  50.6 
 
 		 336 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.220204  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1501  type II secretion system protein  48.83 
 
 		 332 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000870782 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1946  hypothetical protein  50.6 
 
 		 336 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000366161  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1774  type II secretion system protein  50.6 
 
 		 336 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.162167  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0121  hypothetical protein  50.6 
 
 		 336 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00162648  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1793  type II secretion system protein  50.6 
 
 		 336 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.105995  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1044  type II secretion system protein  50.6 
 
 		 336 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4665  Flp pilus assembly protein TadC  51.35 
 
 		 332 aa  232  1e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.502777  decreased coverage  0.000679832 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2538  hypothetical protein  49.4 
 
 		 373 aa  229  4e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1657  type II secretion system protein  52.17 
 
 		 336 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.374218 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2794  putative tight adherence TadC related transmembrane protein  51.81 
 
 		 337 aa  216  4e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.637104  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2068  type II secretion system protein  39.5 
 
 		 334 aa  216  7e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.807622  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2325  type II secretion system protein  43.09 
 
 		 311 aa  143  5e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2322  type II secretion system protein  38.82 
 
 		 312 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2700  tight adherence protein TadC  38.82 
 
 		 312 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1638  type II secretion system protein  30.09 
 
 		 300 aa  97.8  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.786377  normal  0.203569 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1107  type II secretion system protein  28.57 
 
 		 323 aa  92.8  8e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.107682  normal  0.160043 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0844  type II secretion system protein  30.22 
 
 		 295 aa  92.8  8e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4395  type II secretion system protein  29.29 
 
 		 294 aa  92.8  9e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4855  hypothetical protein  28.81 
 
 		 294 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2649  type II secretion system protein  29.34 
 
 		 323 aa  87.4  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2557  type II secretion system protein  27.03 
 
 		 314 aa  87.4  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.59617  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0639  type II secretion system protein  28.41 
 
 		 323 aa  87.4  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3011  type II secretion system protein  31.06 
 
 		 319 aa  84.3  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2352  type II secretion system protein  27.17 
 
 		 313 aa  82  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0836815  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55860  hypothetical protein  28.69 
 
 		 303 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2736  type II secretion system protein  27.06 
 
 		 326 aa  80.5  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1318  type II secretion system protein  28.41 
 
 		 319 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2968  type II secretion system protein  28.41 
 
 		 319 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2276  hypothetical protein  27.84 
 
 		 296 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4867  hypothetical protein  28.29 
 
 		 303 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.234691  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1661  type II secretion system protein  30.99 
 
 		 297 aa  77.8  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146099  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3093  type II secretion system protein  27.84 
 
 		 319 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3964  type II secretion system protein  29.74 
 
 		 314 aa  77.4  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.273183 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0653  TadC protein  24.77 
 
 		 313 aa  76.3  0.0000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.179736 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2365  hypothetical protein  27.03 
 
 		 324 aa  75.9  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.195084  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0806  type II secretion system protein  24.42 
 
 		 316 aa  74.3  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1530  type II secretion system protein  27.65 
 
 		 301 aa  74.7  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0644  type II secretion system protein  29.66 
 
 		 296 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.807912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4619  type II secretion system protein  26.44 
 
 		 318 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.340215 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0586  type II secretion system protein  25.15 
 
 		 320 aa  73.6  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.180812  normal  0.546922 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3510  type II secretion system protein  29.59 
 
 		 297 aa  73.6  0.000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.426579  normal  0.148834 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0424  type II secretion system protein  25.79 
 
 		 331 aa  72.8  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.628499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3212  type II secretion system protein  27.24 
 
 		 311 aa  70.9  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.514288 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2021  type II secretion system protein  26.5 
 
 		 320 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.477325  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0728  type II secretion system protein  26.52 
 
 		 333 aa  69.7  0.00000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.552842  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6004  type II secretion system protein  26.4 
 
 		 324 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2364  putative putative tight adherence TadC-like transmembrane protein  24.7 
 
 		 321 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00226483  normal  0.0303282 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0793  TadC protein  26.9 
 
 		 315 aa  67.8  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1916  type II secretion system protein  24.6 
 
 		 312 aa  67.8  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.141806  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0992  type II secretion system protein  23.67 
 
 		 326 aa  67.4  0.0000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.236675  normal  0.765371 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6300  type II secretion system protein  26.4 
 
 		 323 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.923016 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1813  type II secretion system protein  24.89 
 
 		 426 aa  66.6  0.0000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00328504  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2158  type II secretion system protein  25.66 
 
 		 312 aa  65.5  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.507846  normal  0.0329173 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0074  type II secretion system protein  27.97 
 
 		 315 aa  65.5  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.557722  normal  0.8398 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7193  putative Flp pilus assembly protein TadC  25.58 
 
 		 324 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.202721  normal  0.456008 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5490  type II secretion system protein  25.28 
 
 		 324 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0602  type II secretion system protein  22.27 
 
 		 323 aa  64.7  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0897257  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6776  type II secretion system protein  25.28 
 
 		 324 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.710361  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0300  type II secretion system protein  24.87 
 
 		 323 aa  65.1  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6364  type II secretion system protein  25.28 
 
 		 324 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1831  type II secretion system protein  23.86 
 
 		 304 aa  64.3  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1125  type II secretion system protein  24.34 
 
 		 347 aa  64.3  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.394553  normal  0.522315 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4002  type II secretion system protein  25.23 
 
 		 329 aa  64.7  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0289268  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1500  type II secretion system protein  26.23 
 
 		 319 aa  64.7  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.34697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2698  type II secretion system protein  23.66 
 
 		 302 aa  64.3  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0552  type II secretion system protein  23.35 
 
 		 326 aa  63.9  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0238  type II secretion system protein  24.35 
 
 		 322 aa  63.9  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2641  type II secretion system protein  25.1 
 
 		 291 aa  64.3  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1075  type II secretion system protein  25.61 
 
 		 335 aa  63.5  0.000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.137371  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4188  type II secretion system protein  23.14 
 
 		 328 aa  63.9  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3795  type II secretion system protein  22.94 
 
 		 321 aa  63.2  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2047  type II secretion system protein  24.86 
 
 		 318 aa  63.2  0.000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0677944  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1903  putative Flp pilus assembly protein TadC  23.35 
 
 		 326 aa  63.2  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5326  type II secretion system protein  26.59 
 
 		 323 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0355396 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5120  type II secretion system protein  23.63 
 
 		 321 aa  62.4  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.229641  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4864  type II secretion system protein  24.73 
 
 		 330 aa  61.6  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2694  type II secretion system protein  25 
 
 		 320 aa  61.6  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3208  type II secretion system protein  25.29 
 
 		 302 aa  62  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.544767 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1159  Type II secretion system F domain protein  21.65 
 
 		 320 aa  61.6  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0650  putative tight adherence TadC-related transmembrane protein  24.39 
 
 		 315 aa  61.2  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.640477  normal  0.167986 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1524  type II secretion system protein  22.97 
 
 		 322 aa  61.2  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0801  type II secretion system protein  20.69 
 
 		 312 aa  61.2  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1053  type II secretion system protein  25.96 
 
 		 302 aa  61.2  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002651  type II/IV secretion system protein TadC associated with Flp pilus assembly  23.08 
 
 		 313 aa  60.8  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2823  type II secretion system protein  26.74 
 
 		 306 aa  60.1  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0386  type II secretion system protein  23.19 
 
 		 325 aa  59.7  0.00000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1850  type II secretion system protein  27.69 
 
 		 307 aa  59.3  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0102974  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>