170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5413 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5413  type II secretion system protein  100 
 
 		 344 aa  673    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0382729  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3658  type II secretion system protein, transmembrane  61.44 
 
 		 369 aa  357  9.999999999999999e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02590  putative tight adherence TadC related transmembrane protein  52.79 
 
 		 326 aa  297  2e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4362  type II secretion system protein  52.63 
 
 		 329 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.653734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4252  type II secretion system protein  52.63 
 
 		 329 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.960786  normal  0.358405 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1728  type II secretion system protein  46.86 
 
 		 330 aa  247  2e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000109718 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1407  type II secretion system protein  48.89 
 
 		 337 aa  239  4e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1045  type II secretion system protein  49.21 
 
 		 321 aa  237  2e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1525  type II secretion system protein  49.21 
 
 		 332 aa  237  2e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.623315  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1501  type II secretion system protein  49.21 
 
 		 332 aa  236  3e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000870782 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1447  type II secretion system protein  45.36 
 
 		 330 aa  235  9e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.411469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4665  Flp pilus assembly protein TadC  48.33 
 
 		 332 aa  225  1e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.502777  decreased coverage  0.000679832 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2538  hypothetical protein  46.8 
 
 		 373 aa  223  3e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1772  type II secretion system protein  48.75 
 
 		 340 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.233431  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1286  hypothetical protein  48.75 
 
 		 336 aa  222  6e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.220204  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1946  hypothetical protein  48.75 
 
 		 336 aa  222  6e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000366161  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1774  type II secretion system protein  48.75 
 
 		 336 aa  222  6e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.162167  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0121  hypothetical protein  48.75 
 
 		 336 aa  222  6e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00162648  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1793  type II secretion system protein  48.75 
 
 		 336 aa  222  6e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.105995  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1044  type II secretion system protein  48.75 
 
 		 336 aa  222  6e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2068  type II secretion system protein  40.58 
 
 		 334 aa  217  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.807622  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4449  type II secretion system protein  47.92 
 
 		 319 aa  213  4.9999999999999996e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2794  putative tight adherence TadC related transmembrane protein  49.79 
 
 		 337 aa  211  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.637104  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1657  type II secretion system protein  50 
 
 		 336 aa  209  5e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.374218 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2325  type II secretion system protein  41.2 
 
 		 311 aa  140  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2322  type II secretion system protein  40.12 
 
 		 312 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2700  tight adherence protein TadC  40.12 
 
 		 312 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1638  type II secretion system protein  31.3 
 
 		 300 aa  105  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.786377  normal  0.203569 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0844  type II secretion system protein  30.42 
 
 		 295 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4395  type II secretion system protein  28.45 
 
 		 294 aa  100  5e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4855  hypothetical protein  29.63 
 
 		 294 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55860  hypothetical protein  27.47 
 
 		 303 aa  96.3  8e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0639  type II secretion system protein  29.59 
 
 		 323 aa  90.5  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4867  hypothetical protein  26.51 
 
 		 303 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.234691  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2736  type II secretion system protein  29.07 
 
 		 326 aa  90.1  5e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1661  type II secretion system protein  31.06 
 
 		 297 aa  87.4  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146099  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4188  type II secretion system protein  26.2 
 
 		 328 aa  86.3  8e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0992  type II secretion system protein  27.06 
 
 		 326 aa  85.5  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.236675  normal  0.765371 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1107  type II secretion system protein  29.41 
 
 		 323 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.107682  normal  0.160043 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2649  type II secretion system protein  27.38 
 
 		 323 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0728  type II secretion system protein  27.87 
 
 		 333 aa  82  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.552842  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2557  type II secretion system protein  24.86 
 
 		 314 aa  81.3  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.59617  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3011  type II secretion system protein  28.26 
 
 		 319 aa  80.9  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2365  hypothetical protein  26.63 
 
 		 324 aa  79.7  0.00000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.195084  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0806  type II secretion system protein  26.91 
 
 		 316 aa  79.3  0.00000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2352  type II secretion system protein  26.74 
 
 		 313 aa  78.6  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0836815  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0644  type II secretion system protein  30.99 
 
 		 296 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.807912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1318  type II secretion system protein  26.04 
 
 		 319 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1524  type II secretion system protein  24.66 
 
 		 322 aa  76.3  0.0000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2968  type II secretion system protein  26.04 
 
 		 319 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0653  TadC protein  24.91 
 
 		 313 aa  75.9  0.0000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.179736 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1125  type II secretion system protein  25.3 
 
 		 347 aa  74.7  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.394553  normal  0.522315 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0586  type II secretion system protein  24.85 
 
 		 320 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.180812  normal  0.546922 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1530  type II secretion system protein  26.04 
 
 		 301 aa  75.1  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5120  type II secretion system protein  23.77 
 
 		 321 aa  74.7  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.229641  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0793  TadC protein  26.11 
 
 		 315 aa  73.9  0.000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3093  type II secretion system protein  25.44 
 
 		 319 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2276  hypothetical protein  24.41 
 
 		 296 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2158  type II secretion system protein  25.75 
 
 		 312 aa  73.6  0.000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.507846  normal  0.0329173 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0424  type II secretion system protein  24.77 
 
 		 331 aa  73.6  0.000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.628499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4619  type II secretion system protein  23.53 
 
 		 318 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.340215 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3964  type II secretion system protein  26.47 
 
 		 314 aa  73.2  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.273183 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1903  putative Flp pilus assembly protein TadC  25.45 
 
 		 326 aa  72.8  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0552  type II secretion system protein  25.45 
 
 		 326 aa  72.8  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1075  type II secretion system protein  25.75 
 
 		 335 aa  72  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.137371  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0602  type II secretion system protein  24.32 
 
 		 323 aa  72.4  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0897257  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4002  type II secretion system protein  27.04 
 
 		 329 aa  72  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0289268  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4864  type II secretion system protein  25.16 
 
 		 330 aa  72.4  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7193  putative Flp pilus assembly protein TadC  24.28 
 
 		 324 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.202721  normal  0.456008 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3208  type II secretion system protein  23.75 
 
 		 302 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.544767 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6364  type II secretion system protein  24.69 
 
 		 324 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0300  type II secretion system protein  25.45 
 
 		 323 aa  70.5  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3357  type II secretion system protein  25.43 
 
 		 327 aa  70.5  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0296  type II secretion system protein  23.7 
 
 		 325 aa  70.1  0.00000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5490  type II secretion system protein  24.69 
 
 		 324 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6776  type II secretion system protein  24.69 
 
 		 324 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.710361  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2694  type II secretion system protein  25.6 
 
 		 320 aa  69.7  0.00000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0386  type II secretion system protein  23.47 
 
 		 325 aa  69.3  0.00000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1813  type II secretion system protein  26.35 
 
 		 426 aa  69.3  0.00000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00328504  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3718  type II secretion system protein  23.74 
 
 		 324 aa  69.3  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.202594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4205  type II secretion system protein  23.22 
 
 		 324 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.125721  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2823  type II secretion system protein  26.14 
 
 		 306 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2911  type II secretion system protein  26.14 
 
 		 306 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.604096  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4481  type II secretion system protein  26.09 
 
 		 328 aa  68.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1831  type II secretion system protein  23.81 
 
 		 304 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3525  type II secretion system protein  24.03 
 
 		 324 aa  67.8  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.359223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1159  Type II secretion system F domain protein  21.66 
 
 		 320 aa  67.4  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2118  type II secretion system protein  25.27 
 
 		 310 aa  67.8  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.128736  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6004  type II secretion system protein  25.6 
 
 		 324 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2021  type II secretion system protein  24.66 
 
 		 320 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.477325  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1779  type II secretion system protein  22.27 
 
 		 324 aa  66.6  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.708691  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1500  type II secretion system protein  24.71 
 
 		 319 aa  66.2  0.0000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.34697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1053  type II secretion system protein  24.38 
 
 		 302 aa  66.2  0.0000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3510  type II secretion system protein  26.9 
 
 		 297 aa  65.9  0.0000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.426579  normal  0.148834 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6300  type II secretion system protein  25.6 
 
 		 323 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.923016 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5326  type II secretion system protein  25.9 
 
 		 323 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0355396 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3795  type II secretion system protein  22.73 
 
 		 321 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2314  type II secretion system protein  22.96 
 
 		 317 aa  65.1  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0238  type II secretion system protein  23.79 
 
 		 322 aa  64.7  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2364  putative putative tight adherence TadC-like transmembrane protein  24.89 
 
 		 321 aa  65.1  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00226483  normal  0.0303282 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>