182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_2158 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_2158  type II secretion system protein  100 
 
 		 312 aa  593  1e-168  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.507846  normal  0.0329173 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55860  hypothetical protein  47.65 
 
 		 303 aa  155  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4867  hypothetical protein  48.82 
 
 		 303 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.234691  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4855  hypothetical protein  37.29 
 
 		 294 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4395  type II secretion system protein  47.06 
 
 		 294 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1638  type II secretion system protein  41.57 
 
 		 300 aa  142  5e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.786377  normal  0.203569 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0844  type II secretion system protein  43.75 
 
 		 295 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0644  type II secretion system protein  47.31 
 
 		 296 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.807912  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02590  putative tight adherence TadC related transmembrane protein  33.13 
 
 		 326 aa  84  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1661  type II secretion system protein  38.67 
 
 		 297 aa  83.6  0.000000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146099  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1728  type II secretion system protein  31.93 
 
 		 330 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000109718 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1501  type II secretion system protein  31.33 
 
 		 332 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000870782 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1407  type II secretion system protein  30.59 
 
 		 337 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1525  type II secretion system protein  30.72 
 
 		 332 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.623315  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2068  type II secretion system protein  31.75 
 
 		 334 aa  80.9  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.807622  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1045  type II secretion system protein  30.72 
 
 		 321 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1286  hypothetical protein  32.18 
 
 		 336 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.220204  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1946  hypothetical protein  32.18 
 
 		 336 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000366161  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1774  type II secretion system protein  32.18 
 
 		 336 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.162167  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0121  hypothetical protein  32.18 
 
 		 336 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00162648  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1772  type II secretion system protein  32.18 
 
 		 340 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.233431  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1793  type II secretion system protein  32.18 
 
 		 336 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.105995  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1044  type II secretion system protein  32.18 
 
 		 336 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1447  type II secretion system protein  30.21 
 
 		 330 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.411469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2538  hypothetical protein  31.61 
 
 		 373 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2325  type II secretion system protein  28.48 
 
 		 311 aa  78.2  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4665  Flp pilus assembly protein TadC  30.26 
 
 		 332 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.502777  decreased coverage  0.000679832 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2794  putative tight adherence TadC related transmembrane protein  30 
 
 		 337 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.637104  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0653  TadC protein  24.89 
 
 		 313 aa  75.9  0.0000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.179736 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4252  type II secretion system protein  30 
 
 		 329 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.960786  normal  0.358405 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1657  type II secretion system protein  31.13 
 
 		 336 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.374218 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4362  type II secretion system protein  30 
 
 		 329 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.653734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0374  type II secretion system protein F  25.91 
 
 		 292 aa  73.6  0.000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.249846  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0992  type II secretion system protein  23.96 
 
 		 326 aa  73.6  0.000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.236675  normal  0.765371 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0793  TadC protein  27.06 
 
 		 315 aa  73.2  0.000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2557  type II secretion system protein  29.79 
 
 		 314 aa  72  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.59617  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2322  type II secretion system protein  27.98 
 
 		 312 aa  71.6  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2700  tight adherence protein TadC  27.98 
 
 		 312 aa  71.6  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5413  type II secretion system protein  25.75 
 
 		 344 aa  70.1  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0382729  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1754  Flp pilus assembly protein TadC  26.83 
 
 		 326 aa  69.3  0.00000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1124  type II secretion system protein  26.82 
 
 		 331 aa  69.3  0.00000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0315206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0639  type II secretion system protein  27.14 
 
 		 323 aa  68.2  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0074  type II secretion system protein  30 
 
 		 315 aa  67.4  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.557722  normal  0.8398 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4449  type II secretion system protein  29.78 
 
 		 319 aa  67.4  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1318  type II secretion system protein  29.55 
 
 		 319 aa  67  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3093  type II secretion system protein  29.55 
 
 		 319 aa  67  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2968  type II secretion system protein  29.55 
 
 		 319 aa  67  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0300  type II secretion system protein  25.1 
 
 		 323 aa  67  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1903  putative Flp pilus assembly protein TadC  24.38 
 
 		 326 aa  65.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2276  hypothetical protein  28.98 
 
 		 296 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4619  type II secretion system protein  26.98 
 
 		 318 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.340215 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0552  type II secretion system protein  24.38 
 
 		 326 aa  65.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3658  type II secretion system protein, transmembrane  25.52 
 
 		 369 aa  63.5  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0424  type II secretion system protein  24.79 
 
 		 331 aa  63.5  0.000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.628499  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1813  type II secretion system protein  26.01 
 
 		 426 aa  62.4  0.000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00328504  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002651  type II/IV secretion system protein TadC associated with Flp pilus assembly  27.84 
 
 		 313 aa  62  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0801  type II secretion system protein  28.22 
 
 		 312 aa  61.6  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2911  type II secretion system protein  27.88 
 
 		 306 aa  60.8  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.604096  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4188  type II secretion system protein  22.41 
 
 		 328 aa  60.5  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2823  type II secretion system protein  27.81 
 
 		 306 aa  60.1  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06191  hypothetical protein  27.61 
 
 		 280 aa  59.7  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2571  type II secretion system protein  26.7 
 
 		 303 aa  59.3  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1159  Type II secretion system F domain protein  22.73 
 
 		 320 aa  59.3  0.00000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2352  type II secretion system protein  28.07 
 
 		 313 aa  58.9  0.00000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0836815  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0806  type II secretion system protein  23.4 
 
 		 316 aa  58.9  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2351  type II secretion system protein  24.71 
 
 		 323 aa  57.8  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.357093 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0586  type II secretion system protein  25.99 
 
 		 320 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.180812  normal  0.546922 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2118  type II secretion system protein  26.07 
 
 		 310 aa  58.5  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.128736  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3795  type II secretion system protein  27.8 
 
 		 321 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3510  type II secretion system protein  26.43 
 
 		 297 aa  57.4  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.426579  normal  0.148834 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1017  von Willebrand factor type A; type II secretion system protein  27.78 
 
 		 643 aa  57  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2046  putative fimbriae-related membrane protein  25 
 
 		 314 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0336894  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1723  type II secretion system protein  22.15 
 
 		 296 aa  55.1  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1675  type II secretion system protein F  25 
 
 		 314 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0331  type II secretion system protein F  25 
 
 		 314 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0097112  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1878  type II secretion system protein  25 
 
 		 314 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.650462  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1890  type II secretion system protein  25 
 
 		 314 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0830  type II secretion system protein F  25 
 
 		 314 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.288216  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3011  type II secretion system protein  25.65 
 
 		 319 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2454  type II secretion system protein F  25.33 
 
 		 290 aa  54.7  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0182293  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1916  type II secretion system protein  25.6 
 
 		 312 aa  54.7  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.141806  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0602  type II secretion system protein  24.14 
 
 		 323 aa  55.1  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0897257  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0610  type II secretion system protein  25.77 
 
 		 281 aa  55.1  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6364  type II secretion system protein  28.65 
 
 		 324 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7193  putative Flp pilus assembly protein TadC  28.93 
 
 		 324 aa  53.9  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.202721  normal  0.456008 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5490  type II secretion system protein  28.65 
 
 		 324 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6776  type II secretion system protein  28.65 
 
 		 324 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.710361  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2694  type II secretion system protein  24.43 
 
 		 320 aa  54.3  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0262  hypothetical protein  19.25 
 
 		 277 aa  53.9  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000660114  hitchhiker  0.00000173551 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03347  hypothetical protein  25.34 
 
 		 187 aa  53.5  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2485  type II secretion system protein  27.04 
 
 		 323 aa  53.1  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.28616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2365  hypothetical protein  25.14 
 
 		 324 aa  53.1  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.195084  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1530  type II secretion system protein  25.15 
 
 		 301 aa  53.1  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0237  type II secretion system protein  23.58 
 
 		 328 aa  53.1  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.383042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2708  type II secretion system protein  27.04 
 
 		 323 aa  53.1  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.68845 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4157  type II secretion system protein  27.78 
 
 		 309 aa  52.8  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1204  type II secretion system protein  25.88 
 
 		 296 aa  52.8  0.000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.59428  hitchhiker  0.000000109908 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1780  type II secretion system protein  26.87 
 
 		 324 aa  52.4  0.000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.131583 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0543  type II secretion system protein  24.4 
 
 		 313 aa  51.2  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0603407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5620  type II secretion system protein  30.36 
 
 		 287 aa  51.6  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>