177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5620 on replicon NC_011366
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011366  Rleg2_5620  type II secretion system protein  100 
 
 		 287 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7219  type II secretion system protein  96.86 
 
 		 287 aa  559  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.981655  normal  0.304711 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2922  putative type II secretion system protein F  27.31 
 
 		 282 aa  103  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.840651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4001  type II secretion system protein  28.02 
 
 		 337 aa  101  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6877  type II secretion system protein  28.57 
 
 		 282 aa  97.8  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.44202  normal  0.236488 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0747  type II secretion system protein  24.89 
 
 		 283 aa  96.3  5e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.725692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0213  component of type IV pilus  22.78 
 
 		 334 aa  88.2  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0727  type II secretion system protein  24.51 
 
 		 337 aa  88.6  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352668  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4192  type II secretion system protein  25.11 
 
 		 335 aa  88.2  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4480  type II secretion system protein  25.11 
 
 		 335 aa  86.7  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0603  type II secretion system protein  27.45 
 
 		 338 aa  86.7  5e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.512211  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0643  type II secretion system protein  22.84 
 
 		 283 aa  85.5  9e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1018  type II secretion system protein  27.8 
 
 		 336 aa  85.1  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3356  type II secretion system protein  24.48 
 
 		 336 aa  84  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2115  type II secretion system protein  26.21 
 
 		 279 aa  83.6  0.000000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0237  type II secretion system protein  25.69 
 
 		 328 aa  82.4  0.000000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.383042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0709  putative type II secretion system protein F  25.13 
 
 		 283 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4347  type II secretion system protein  25.63 
 
 		 275 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.277812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0387  type II secretion system protein  26.11 
 
 		 324 aa  79  0.00000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.88705  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1780  type II secretion system protein  23.08 
 
 		 324 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.131583 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2762  type II secretion system protein  27.11 
 
 		 333 aa  77.8  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.58237 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2926  type II secretion system protein  22.42 
 
 		 316 aa  77.4  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.194464  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0587  type II secretion system protein  26.69 
 
 		 325 aa  76.3  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.292089  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4156  type II secretion system protein  26.74 
 
 		 323 aa  75.5  0.0000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4204  type II secretion system protein  24.47 
 
 		 324 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0804917  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7035  putative pilus assembly protein  25.13 
 
 		 324 aa  75.1  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.611985 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0248  type II secretion system protein  27.88 
 
 		 290 aa  74.7  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.90531 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3351  type II secretion system protein  26.55 
 
 		 335 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5121  type II secretion system protein  24.12 
 
 		 332 aa  74.7  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0725578 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3794  type II secretion system protein  26.47 
 
 		 327 aa  72.8  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.927579  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2380  type II secretion system protein  22.9 
 
 		 322 aa  72.4  0.000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.316858  normal  0.875213 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2648  type II secretion system protein  27.47 
 
 		 325 aa  72  0.000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.846327  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2934  type II secretion system protein  20.39 
 
 		 310 aa  72.4  0.000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.898697  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2707  type II secretion system protein  25 
 
 		 323 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0671  type II secretion system protein  25.36 
 
 		 326 aa  72  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.732749  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0654  TadB protein  26.21 
 
 		 322 aa  70.9  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.179736 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1917  type II secretion system protein  24.49 
 
 		 321 aa  70.9  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.258716  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2484  type II secretion system protein  25 
 
 		 323 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4445  type II secretion system protein  22.04 
 
 		 309 aa  70.5  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00467148 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002650  flp pilus assembly protein TadB  24.78 
 
 		 322 aa  70.1  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3717  type II secretion system protein  25.4 
 
 		 324 aa  70.1  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.20351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0899  Type II secretion system F domain protein  24.4 
 
 		 326 aa  69.7  0.00000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3795  type II secretion system protein  22.99 
 
 		 325 aa  69.3  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.187172  normal  0.96616 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2412  type II secretion system protein  21.05 
 
 		 323 aa  68.9  0.00000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0297  type II secretion system protein  24.34 
 
 		 324 aa  68.6  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2275  Flp pilus assembly protein TadB  25.34 
 
 		 325 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3524  type II secretion system protein  23.51 
 
 		 324 aa  68.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4618  type II secretion system protein  24.36 
 
 		 325 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.347884 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2046  type II secretion system protein  25.82 
 
 		 325 aa  68.2  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0673516  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1529  type II secretion system protein  22.47 
 
 		 330 aa  67.4  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2308  Type II secretion system F domain protein  22.22 
 
 		 284 aa  67  0.0000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2350  type II secretion system protein  26.23 
 
 		 322 aa  66.2  0.0000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.363474 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1125  type II secretion system protein  24.73 
 
 		 322 aa  66.2  0.0000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0517135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2695  type II secretion system protein  27.75 
 
 		 289 aa  65.9  0.0000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0973564  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1317  Flp pilus assembly protein TadB  26.02 
 
 		 325 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4614  type II secretion system protein  23.5 
 
 		 329 aa  65.9  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3092  type II secretion system protein  26.02 
 
 		 325 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2967  type II secretion system protein  26.02 
 
 		 325 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.350744  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2556  type II secretion system protein  27.03 
 
 		 325 aa  65.5  0.0000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.460971  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1711  type II secretion system protein  25.11 
 
 		 318 aa  65.9  0.0000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.806697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1639  type II secretion system protein  24.88 
 
 		 303 aa  65.1  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.473605  normal  0.315413 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2649  type II secretion system protein  20.63 
 
 		 310 aa  64.7  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0544  type II secretion system protein  22.12 
 
 		 325 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4865  type II secretion system protein  22.4 
 
 		 324 aa  64.7  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1275  type II secretion system protein  20.81 
 
 		 327 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1076  type II secretion system protein  23.77 
 
 		 324 aa  64.7  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.195162  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1851  type II secretion system protein  23.14 
 
 		 660 aa  64.7  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00122698  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0310  type II secretion system protein  24.04 
 
 		 329 aa  64.7  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.873631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1681  type II secretion system protein  20.3 
 
 		 327 aa  64.3  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000554602 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0640  type II secretion system protein  27.19 
 
 		 325 aa  63.9  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.295246 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0301  type II secretion system protein  26.78 
 
 		 322 aa  63.9  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.83716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6365  type II secretion system protein  25.71 
 
 		 325 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5325  type II secretion system protein  26.34 
 
 		 326 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.61312  hitchhiker  0.00813406 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6777  type II secretion system protein  25.71 
 
 		 325 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.270969  normal  0.612228 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4189  type II secretion system protein  21.46 
 
 		 325 aa  62.8  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.54214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6003  type II secretion system protein  26.16 
 
 		 325 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3932  type II secretion system protein  23.42 
 
 		 325 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0420764  normal  0.280623 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7194  Flp pilus assembly protein TadB  26.44 
 
 		 325 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0666217  normal  0.429019 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2831  type II secretion system protein  21.35 
 
 		 322 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532359  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5491  type II secretion system protein  25.71 
 
 		 325 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1904  putative Flp pilus assembly protein TadB  26.23 
 
 		 322 aa  60.8  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0239588  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1753  Flp pilus assembly protein TadB  24.5 
 
 		 325 aa  60.8  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3010  type II secretion system protein  21.98 
 
 		 321 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1523  type II secretion system protein  25.39 
 
 		 328 aa  61.2  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0553  type II secretion system protein  26.23 
 
 		 322 aa  60.8  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3421  Type II secretion system F domain protein  28.46 
 
 		 310 aa  61.2  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.735611  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2693  type II secretion system protein  24.88 
 
 		 319 aa  61.2  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1042  Type II secretion system F domain protein  24.74 
 
 		 313 aa  60.8  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.205171  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3425  type II secretion system protein  22.97 
 
 		 325 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.263373  normal  0.657196 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3211  type II secretion system protein  22.34 
 
 		 332 aa  60.5  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.515921 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6299  type II secretion system protein  26.52 
 
 		 325 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2699  type II secretion system protein  27.42 
 
 		 321 aa  60.1  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3965  type II secretion system protein  23.63 
 
 		 320 aa  59.7  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.264844 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1499  type II secretion system protein  23 
 
 		 321 aa  58.9  0.00000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.698875  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3207  type II secretion system protein  20.21 
 
 		 320 aa  58.9  0.00000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.19811 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2912  type II secretion system protein  21.98 
 
 		 320 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0800  type II secretion system protein  24.29 
 
 		 322 aa  58.5  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1500  type II secretion system protein  24 
 
 		 326 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000537712 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1524  type II secretion system protein  24 
 
 		 326 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.437925  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2017  type II secretion system protein  25.9 
 
 		 319 aa  58.5  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>