195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1711 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1711  type II secretion system protein  100 
 
 		 318 aa  637    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.806697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3211  type II secretion system protein  30.79 
 
 		 332 aa  135  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.515921 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2117  type II secretion system protein  31.15 
 
 		 323 aa  125  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.215511  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4614  type II secretion system protein  36.87 
 
 		 329 aa  120  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1275  type II secretion system protein  34.4 
 
 		 327 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1681  type II secretion system protein  34.4 
 
 		 327 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000554602 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2922  putative type II secretion system protein F  30.2 
 
 		 282 aa  106  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.840651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1018  type II secretion system protein  27.96 
 
 		 336 aa  105  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2926  type II secretion system protein  27.57 
 
 		 316 aa  103  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.194464  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3351  type II secretion system protein  30.74 
 
 		 335 aa  103  5e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4865  type II secretion system protein  28 
 
 		 324 aa  103  6e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2275  putative integral membrane protein  28.32 
 
 		 310 aa  100  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.421118  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1042  Type II secretion system F domain protein  33.67 
 
 		 313 aa  100  3e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.205171  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0881  type II secretion system protein  27.66 
 
 		 296 aa  100  4e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4347  type II secretion system protein  31.63 
 
 		 275 aa  99.4  7e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.277812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6877  type II secretion system protein  27.72 
 
 		 282 aa  99  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.44202  normal  0.236488 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4156  type II secretion system protein  29.24 
 
 		 323 aa  99  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0805  type II secretion system protein  30.53 
 
 		 332 aa  98.2  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2115  type II secretion system protein  29.7 
 
 		 279 aa  97.4  3e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4445  type II secretion system protein  30.77 
 
 		 309 aa  97.4  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00467148 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1851  type II secretion system protein  29.76 
 
 		 660 aa  97.1  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00122698  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2934  type II secretion system protein  30.43 
 
 		 310 aa  96.7  5e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.898697  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4618  type II secretion system protein  30.92 
 
 		 325 aa  96.7  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.347884 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2353  type II secretion system protein  30.14 
 
 		 323 aa  96.3  7e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.173092  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1753  Flp pilus assembly protein TadB  26.98 
 
 		 325 aa  94.4  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0794  TadB protein  26.82 
 
 		 322 aa  94.4  2e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2275  Flp pilus assembly protein TadB  28.97 
 
 		 325 aa  94.4  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2648  type II secretion system protein  30.37 
 
 		 325 aa  93.6  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.846327  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2640  type II secretion system protein  24.81 
 
 		 316 aa  93.2  5e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2350  type II secretion system protein  27.92 
 
 		 322 aa  93.2  5e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.363474 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6003  type II secretion system protein  28.16 
 
 		 325 aa  93.2  5e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0640  type II secretion system protein  25.91 
 
 		 325 aa  92.8  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.295246 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1317  Flp pilus assembly protein TadB  28.97 
 
 		 325 aa  92.4  9e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0587  type II secretion system protein  26.48 
 
 		 325 aa  91.7  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.292089  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6299  type II secretion system protein  29.7 
 
 		 325 aa  92  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1499  type II secretion system protein  27.78 
 
 		 321 aa  92  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.698875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2699  type II secretion system protein  34.29 
 
 		 321 aa  91.7  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3117  type II secretion system protein  33.16 
 
 		 326 aa  92  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193846  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3092  type II secretion system protein  28.57 
 
 		 325 aa  92.4  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2967  type II secretion system protein  28.57 
 
 		 325 aa  92.4  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.350744  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5325  type II secretion system protein  29.7 
 
 		 326 aa  91.3  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.61312  hitchhiker  0.00813406 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3794  type II secretion system protein  25.08 
 
 		 327 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.927579  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2570  type II secretion system protein  35.06 
 
 		 314 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0727  type II secretion system protein  23.39 
 
 		 337 aa  91.3  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352668  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6365  type II secretion system protein  30.73 
 
 		 325 aa  89.7  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1126  type II secretion system protein  25.74 
 
 		 310 aa  89.7  6e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0371029  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5491  type II secretion system protein  26.89 
 
 		 325 aa  89.7  6e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7194  Flp pilus assembly protein TadB  25.98 
 
 		 325 aa  88.6  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0666217  normal  0.429019 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0654  TadB protein  33.33 
 
 		 322 aa  89  1e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.179736 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1917  type II secretion system protein  27.75 
 
 		 321 aa  88.2  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.258716  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2364  hypothetical protein  29.8 
 
 		 321 aa  87.4  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.288668  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4001  type II secretion system protein  28.09 
 
 		 337 aa  87.4  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1832  type II secretion system protein  28.96 
 
 		 316 aa  87.4  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3421  Type II secretion system F domain protein  33.57 
 
 		 310 aa  87.4  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.735611  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0248  type II secretion system protein  26.32 
 
 		 290 aa  87.4  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.90531 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6777  type II secretion system protein  26.27 
 
 		 325 aa  87  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.270969  normal  0.612228 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1125  type II secretion system protein  25.08 
 
 		 322 aa  86.7  5e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0517135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1205  type II secretion system protein  32.75 
 
 		 535 aa  86.7  5e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.499257  hitchhiker  0.000000000038758 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0747  type II secretion system protein  25.91 
 
 		 283 aa  85.9  7e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.725692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0237  type II secretion system protein  23.57 
 
 		 328 aa  85.9  9e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.383042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2649  type II secretion system protein  32.69 
 
 		 310 aa  85.5  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1076  type II secretion system protein  23.11 
 
 		 324 aa  84.3  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.195162  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0643  type II secretion system protein  26.26 
 
 		 283 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0544  type II secretion system protein  26.48 
 
 		 325 aa  84.3  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2737  type II secretion system protein  30.86 
 
 		 321 aa  84  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2707  type II secretion system protein  25.31 
 
 		 323 aa  82.8  0.000000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2484  type II secretion system protein  25.31 
 
 		 323 aa  82.8  0.000000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0709  putative type II secretion system protein F  22.85 
 
 		 283 aa  82.4  0.000000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1108  type II secretion system protein  28.28 
 
 		 321 aa  82  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.143075  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1054  type II secretion system protein  28.98 
 
 		 320 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0301  type II secretion system protein  26.87 
 
 		 322 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.83716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002650  flp pilus assembly protein TadB  32.62 
 
 		 322 aa  80.1  0.00000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2556  type II secretion system protein  31.03 
 
 		 325 aa  79.3  0.00000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.460971  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1529  type II secretion system protein  30.26 
 
 		 330 aa  79.3  0.00000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3207  type II secretion system protein  29.94 
 
 		 320 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.19811 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2824  type II secretion system protein  27.84 
 
 		 320 aa  78.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1904  putative Flp pilus assembly protein TadB  30.41 
 
 		 322 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0239588  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1160  Type II secretion system F domain protein  27.27 
 
 		 323 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4395  type II secretion system protein  30.26 
 
 		 317 aa  77.8  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.925008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0553  type II secretion system protein  30.41 
 
 		 322 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3965  type II secretion system protein  35.07 
 
 		 320 aa  78.2  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.264844 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0423  type II secretion system protein  18.93 
 
 		 327 aa  76.6  0.0000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2308  Type II secretion system F domain protein  24.87 
 
 		 284 aa  76.6  0.0000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1780  type II secretion system protein  24.52 
 
 		 324 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.131583 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1523  type II secretion system protein  26.46 
 
 		 328 aa  75.5  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3010  type II secretion system protein  31.85 
 
 		 321 aa  75.1  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0387  type II secretion system protein  23.11 
 
 		 324 aa  74.7  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.88705  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1755  type II secretion system protein  31.5 
 
 		 306 aa  75.1  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0468876  normal  0.156837 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2912  type II secretion system protein  30.11 
 
 		 320 aa  74.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2412  type II secretion system protein  26.44 
 
 		 323 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2566  Type II secretion system F domain protein  27.78 
 
 		 306 aa  74.3  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1754  type II secretion system protein  26.13 
 
 		 295 aa  73.9  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00143607  normal  0.105402 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0310  type II secretion system protein  30.39 
 
 		 329 aa  74.3  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.873631  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0651  putative tight adherence TadB-related transmembrane protein  25 
 
 		 325 aa  73.2  0.000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.280791 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4189  type II secretion system protein  20.83 
 
 		 325 aa  72.8  0.000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.54214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0213  component of type IV pilus  22.76 
 
 		 334 aa  71.6  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3795  type II secretion system protein  21.25 
 
 		 325 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.187172  normal  0.96616 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4192  type II secretion system protein  20.87 
 
 		 335 aa  71.6  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3491  type II secretion system protein  25.1 
 
 		 317 aa  71.6  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0435404 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2017  type II secretion system protein  25.63 
 
 		 319 aa  71.2  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>