193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2566 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_2566  Type II secretion system F domain protein  100 
 
 		 306 aa  581  1.0000000000000001e-165  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2275  putative integral membrane protein  46.18 
 
 		 310 aa  206  3e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.421118  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1711  type II secretion system protein  27.24 
 
 		 318 aa  94.4  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.806697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002650  flp pilus assembly protein TadB  27.19 
 
 		 322 aa  93.6  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0805  type II secretion system protein  27.23 
 
 		 332 aa  90.5  3e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1018  type II secretion system protein  28.38 
 
 		 336 aa  88.6  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0654  TadB protein  27.55 
 
 		 322 aa  88.2  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.179736 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0794  TadB protein  28.37 
 
 		 322 aa  85.9  8e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2699  type II secretion system protein  26.44 
 
 		 321 aa  85.5  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1499  type II secretion system protein  25.85 
 
 		 321 aa  84  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.698875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4865  type II secretion system protein  28.51 
 
 		 324 aa  84  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4445  type II secretion system protein  24.62 
 
 		 309 aa  83.6  0.000000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00467148 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2922  putative type II secretion system protein F  26.72 
 
 		 282 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.840651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0727  type II secretion system protein  23.26 
 
 		 337 aa  82.8  0.000000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352668  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0651  putative tight adherence TadB-related transmembrane protein  28.19 
 
 		 325 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.280791 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2934  type II secretion system protein  27.14 
 
 		 310 aa  81.6  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.898697  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4618  type II secretion system protein  28.08 
 
 		 325 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.347884 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0587  type II secretion system protein  27.88 
 
 		 325 aa  81.6  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.292089  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0709  putative type II secretion system protein F  24.3 
 
 		 283 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2649  type II secretion system protein  28.41 
 
 		 310 aa  80.9  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1076  type II secretion system protein  26.28 
 
 		 324 aa  80.9  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.195162  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0640  type II secretion system protein  26.98 
 
 		 325 aa  80.5  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.295246 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6877  type II secretion system protein  24.29 
 
 		 282 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.44202  normal  0.236488 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4156  type II secretion system protein  26.69 
 
 		 323 aa  80.5  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1814  type II secretion system protein  25.91 
 
 		 285 aa  79.3  0.00000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0127821  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2117  type II secretion system protein  24.16 
 
 		 323 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.215511  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3351  type II secretion system protein  27.75 
 
 		 335 aa  79  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4480  type II secretion system protein  24.77 
 
 		 335 aa  77.8  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3965  type II secretion system protein  24.88 
 
 		 320 aa  77.4  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.264844 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1832  type II secretion system protein  26.88 
 
 		 316 aa  77  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1160  Type II secretion system F domain protein  25 
 
 		 323 aa  77  0.0000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0213  component of type IV pilus  25.14 
 
 		 334 aa  77  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4192  type II secretion system protein  24.2 
 
 		 335 aa  76.6  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3421  Type II secretion system F domain protein  27.11 
 
 		 310 aa  76.3  0.0000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.735611  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3207  type II secretion system protein  25.7 
 
 		 320 aa  75.9  0.0000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.19811 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1054  type II secretion system protein  25.7 
 
 		 320 aa  76.3  0.0000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1681  type II secretion system protein  25.93 
 
 		 327 aa  75.5  0.0000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000554602 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4614  type II secretion system protein  25 
 
 		 329 aa  75.1  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2353  type II secretion system protein  27.52 
 
 		 323 aa  75.5  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.173092  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1275  type II secretion system protein  25.93 
 
 		 327 aa  75.1  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2737  type II secretion system protein  27.27 
 
 		 321 aa  75.5  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2570  type II secretion system protein  28.14 
 
 		 314 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1529  type II secretion system protein  26.34 
 
 		 330 aa  73.9  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2364  hypothetical protein  24.47 
 
 		 321 aa  73.6  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.288668  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2556  type II secretion system protein  23.24 
 
 		 325 aa  73.6  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.460971  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1917  type II secretion system protein  24.11 
 
 		 321 aa  73.6  0.000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.258716  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1851  type II secretion system protein  27.14 
 
 		 660 aa  73.2  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00122698  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0544  type II secretion system protein  30.26 
 
 		 325 aa  73.2  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2365  Flp pilus assembly protein TadB  24.39 
 
 		 325 aa  73.2  0.000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0315564  normal  0.0552567 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0747  type II secretion system protein  20.1 
 
 		 283 aa  72.4  0.000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.725692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2926  type II secretion system protein  24.63 
 
 		 316 aa  72.4  0.000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.194464  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2648  type II secretion system protein  22.99 
 
 		 325 aa  72.4  0.000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.846327  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2308  Type II secretion system F domain protein  29.24 
 
 		 284 aa  72.4  0.000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1108  type II secretion system protein  25.31 
 
 		 321 aa  72.4  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.143075  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0603  type II secretion system protein  24.21 
 
 		 338 aa  71.2  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.512211  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4189  type II secretion system protein  23.05 
 
 		 325 aa  71.2  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.54214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5325  type II secretion system protein  26.49 
 
 		 326 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.61312  hitchhiker  0.00813406 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1042  Type II secretion system F domain protein  26.2 
 
 		 313 aa  70.5  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.205171  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0800  type II secretion system protein  27.91 
 
 		 322 aa  70.9  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4395  type II secretion system protein  25.75 
 
 		 317 aa  70.5  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.925008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2824  type II secretion system protein  27.56 
 
 		 320 aa  70.1  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0643  type II secretion system protein  20.63 
 
 		 283 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0248  type II secretion system protein  24.51 
 
 		 290 aa  70.1  0.00000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.90531 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1753  Flp pilus assembly protein TadB  24.04 
 
 		 325 aa  69.7  0.00000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2640  type II secretion system protein  21.55 
 
 		 316 aa  69.7  0.00000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4347  type II secretion system protein  24.87 
 
 		 275 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.277812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3211  type II secretion system protein  26.67 
 
 		 332 aa  69.3  0.00000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.515921 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2115  type II secretion system protein  24.88 
 
 		 279 aa  68.2  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1126  type II secretion system protein  24.09 
 
 		 310 aa  68.2  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0371029  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3010  type II secretion system protein  24.46 
 
 		 321 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20340  Flp pilus assembly protein TadB  28.5 
 
 		 332 aa  67.4  0.0000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.396755  normal  0.127493 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1317  Flp pilus assembly protein TadB  24.6 
 
 		 325 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4001  type II secretion system protein  24.54 
 
 		 337 aa  67  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3092  type II secretion system protein  24.6 
 
 		 325 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2967  type II secretion system protein  24.6 
 
 		 325 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.350744  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0237  type II secretion system protein  22.75 
 
 		 328 aa  66.6  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.383042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2912  type II secretion system protein  22.83 
 
 		 320 aa  66.2  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3356  type II secretion system protein  24.04 
 
 		 336 aa  66.2  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0301  type II secretion system protein  23.22 
 
 		 322 aa  65.9  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.83716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0538  type II secretion system protein  26.23 
 
 		 322 aa  65.5  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0297  type II secretion system protein  23.16 
 
 		 324 aa  65.5  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1904  putative Flp pilus assembly protein TadB  24.39 
 
 		 322 aa  65.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0239588  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0373  type II secretion system protein F  25 
 
 		 303 aa  65.1  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.232118  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3117  type II secretion system protein  28.66 
 
 		 326 aa  65.1  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193846  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0553  type II secretion system protein  24.39 
 
 		 322 aa  65.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1125  type II secretion system protein  25 
 
 		 322 aa  65.5  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0517135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3794  type II secretion system protein  23.7 
 
 		 327 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.927579  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0645  type II secretion system protein  28.04 
 
 		 293 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.683761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1724  type II secretion system protein  21.6 
 
 		 315 aa  64.7  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2350  type II secretion system protein  23.76 
 
 		 322 aa  65.1  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.363474 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0387  type II secretion system protein  20.9 
 
 		 324 aa  63.9  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.88705  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2707  type II secretion system protein  22.34 
 
 		 323 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2275  Flp pilus assembly protein TadB  25 
 
 		 325 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2455  pilus assembly protein, putative  22.22 
 
 		 330 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112538  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2484  type II secretion system protein  22.34 
 
 		 323 aa  63.5  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6777  type II secretion system protein  23.53 
 
 		 325 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.270969  normal  0.612228 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6365  type II secretion system protein  23.53 
 
 		 325 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6299  type II secretion system protein  25.61 
 
 		 325 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1523  type II secretion system protein  24.39 
 
 		 328 aa  62.4  0.000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1780  type II secretion system protein  23.67 
 
 		 324 aa  62.4  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.131583 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>