232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2275 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2275  putative integral membrane protein  100 
 
 		 310 aa  609  1e-173  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.421118  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2566  Type II secretion system F domain protein  45.15 
 
 		 306 aa  193  3e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1711  type II secretion system protein  28.93 
 
 		 318 aa  107  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.806697  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0651  putative tight adherence TadB-related transmembrane protein  33.71 
 
 		 325 aa  105  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.280791 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0805  type II secretion system protein  30.92 
 
 		 332 aa  104  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0794  TadB protein  29.3 
 
 		 322 aa  102  1e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2926  type II secretion system protein  27.8 
 
 		 316 aa  102  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.194464  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1529  type II secretion system protein  27.59 
 
 		 330 aa  101  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0654  TadB protein  30.58 
 
 		 322 aa  100  3e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.179736 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2737  type II secretion system protein  27.61 
 
 		 321 aa  99.8  6e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2556  type II secretion system protein  29.57 
 
 		 325 aa  99.4  8e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.460971  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4001  type II secretion system protein  26.06 
 
 		 337 aa  99  8e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2934  type II secretion system protein  27.34 
 
 		 310 aa  98.2  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.898697  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2364  hypothetical protein  26.39 
 
 		 321 aa  94.7  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.288668  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3211  type II secretion system protein  24.8 
 
 		 332 aa  94.7  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.515921 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4156  type II secretion system protein  26.07 
 
 		 323 aa  94  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0640  type II secretion system protein  29.29 
 
 		 325 aa  94  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.295246 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4618  type II secretion system protein  28.22 
 
 		 325 aa  94.4  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.347884 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7194  Flp pilus assembly protein TadB  26.07 
 
 		 325 aa  93.6  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0666217  normal  0.429019 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2649  type II secretion system protein  28.57 
 
 		 310 aa  93.2  5e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0544  type II secretion system protein  31.4 
 
 		 325 aa  92.4  9e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6365  type II secretion system protein  24.85 
 
 		 325 aa  91.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6777  type II secretion system protein  24.85 
 
 		 325 aa  91.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.270969  normal  0.612228 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2275  Flp pilus assembly protein TadB  27.57 
 
 		 325 aa  91.3  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5325  type II secretion system protein  30.2 
 
 		 326 aa  90.9  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.61312  hitchhiker  0.00813406 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1832  type II secretion system protein  29.63 
 
 		 316 aa  91.3  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0727  type II secretion system protein  25.82 
 
 		 337 aa  90.9  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352668  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5491  type II secretion system protein  24.85 
 
 		 325 aa  90.5  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002650  flp pilus assembly protein TadB  26.71 
 
 		 322 aa  89.4  7e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1108  type II secretion system protein  27.98 
 
 		 321 aa  89  8e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.143075  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2117  type II secretion system protein  26.79 
 
 		 323 aa  89.4  8e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.215511  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0800  type II secretion system protein  30.69 
 
 		 322 aa  89  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2365  Flp pilus assembly protein TadB  26.69 
 
 		 325 aa  89  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0315564  normal  0.0552567 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0237  type II secretion system protein  25.6 
 
 		 328 aa  89  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.383042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2648  type II secretion system protein  27.2 
 
 		 325 aa  88.2  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.846327  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3794  type II secretion system protein  27.46 
 
 		 327 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.927579  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2640  type II secretion system protein  26.15 
 
 		 316 aa  87.8  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1499  type II secretion system protein  27.45 
 
 		 321 aa  87.8  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.698875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0423  type II secretion system protein  25.27 
 
 		 327 aa  87  4e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1275  type II secretion system protein  25.18 
 
 		 327 aa  86.7  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1076  type II secretion system protein  26.3 
 
 		 324 aa  85.9  8e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.195162  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1681  type II secretion system protein  23.57 
 
 		 327 aa  85.5  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000554602 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1317  Flp pilus assembly protein TadB  24.91 
 
 		 325 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3092  type II secretion system protein  25.56 
 
 		 325 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2967  type II secretion system protein  25.56 
 
 		 325 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.350744  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0587  type II secretion system protein  26.9 
 
 		 325 aa  84  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.292089  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2353  type II secretion system protein  26.49 
 
 		 323 aa  84  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.173092  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1018  type II secretion system protein  29 
 
 		 336 aa  83.2  0.000000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4395  type II secretion system protein  28.08 
 
 		 317 aa  83.2  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.925008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6003  type II secretion system protein  25 
 
 		 325 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4204  type II secretion system protein  29.02 
 
 		 324 aa  82.8  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0804917  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1160  Type II secretion system F domain protein  24.63 
 
 		 323 aa  82.4  0.000000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5121  type II secretion system protein  26.33 
 
 		 332 aa  82  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0725578 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1917  type II secretion system protein  23.77 
 
 		 321 aa  82  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.258716  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6299  type II secretion system protein  24.37 
 
 		 325 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2699  type II secretion system protein  23.87 
 
 		 321 aa  82  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1780  type II secretion system protein  26.44 
 
 		 324 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.131583 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3351  type II secretion system protein  23.81 
 
 		 335 aa  81.3  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1054  type II secretion system protein  27.55 
 
 		 320 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4192  type II secretion system protein  24.57 
 
 		 335 aa  80.1  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0213  component of type IV pilus  24.37 
 
 		 334 aa  79.7  0.00000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1126  type II secretion system protein  28.11 
 
 		 310 aa  79.3  0.00000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0371029  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3421  Type II secretion system F domain protein  25.67 
 
 		 310 aa  77.8  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.735611  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0747  type II secretion system protein  24.76 
 
 		 283 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.725692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3965  type II secretion system protein  25 
 
 		 320 aa  78.2  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.264844 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4189  type II secretion system protein  24.45 
 
 		 325 aa  78.2  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.54214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3117  type II secretion system protein  28.88 
 
 		 326 aa  77.4  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193846  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4445  type II secretion system protein  23.4 
 
 		 309 aa  76.6  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00467148 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0248  type II secretion system protein  28.05 
 
 		 290 aa  77  0.0000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.90531 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0387  type II secretion system protein  26.87 
 
 		 324 aa  76.6  0.0000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.88705  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0709  putative type II secretion system protein F  27.13 
 
 		 283 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1851  type II secretion system protein  25.42 
 
 		 660 aa  75.9  0.0000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00122698  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1523  type II secretion system protein  27.66 
 
 		 328 aa  75.9  0.0000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7035  putative pilus assembly protein  24.57 
 
 		 324 aa  75.9  0.0000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.611985 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0881  type II secretion system protein  25.41 
 
 		 296 aa  75.1  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1753  Flp pilus assembly protein TadB  26.5 
 
 		 325 aa  75.1  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4614  type II secretion system protein  21.8 
 
 		 329 aa  75.5  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0643  type II secretion system protein  24.18 
 
 		 283 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0297  type II secretion system protein  27.32 
 
 		 324 aa  74.3  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4480  type II secretion system protein  24.32 
 
 		 335 aa  73.9  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3207  type II secretion system protein  27.24 
 
 		 320 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.19811 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3524  type II secretion system protein  25 
 
 		 324 aa  73.9  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2412  type II secretion system protein  26.11 
 
 		 323 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2053  type II secretion system protein  27.72 
 
 		 325 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00000824726  normal  0.0936478 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1724  type II secretion system protein  25.54 
 
 		 315 aa  73.2  0.000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3425  type II secretion system protein  26.43 
 
 		 325 aa  72  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.263373  normal  0.657196 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3932  type II secretion system protein  26.63 
 
 		 325 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0420764  normal  0.280623 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3717  type II secretion system protein  25.13 
 
 		 324 aa  71.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.20351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0603  type II secretion system protein  24.59 
 
 		 338 aa  71.2  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.512211  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2115  type II secretion system protein  26.98 
 
 		 279 aa  70.9  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1338  Flp pilus assembly protein TadB-like protein  25 
 
 		 268 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2570  type II secretion system protein  28.22 
 
 		 314 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1042  Type II secretion system F domain protein  24.62 
 
 		 313 aa  70.1  0.00000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.205171  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2922  putative type II secretion system protein F  23.53 
 
 		 282 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.840651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2707  type II secretion system protein  27.11 
 
 		 323 aa  69.3  0.00000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2484  type II secretion system protein  27.11 
 
 		 323 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0645  type II secretion system protein  27.81 
 
 		 293 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.683761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1125  type II secretion system protein  24.49 
 
 		 322 aa  67.8  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0517135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1639  type II secretion system protein  23.27 
 
 		 303 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.473605  normal  0.315413 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2831  type II secretion system protein  28.34 
 
 		 322 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532359  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>